MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	AAGC	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	281427818
2	NC_013655	AGTG	2	8	105	112	25 %	25 %	50 %	0 %	281427818
3	NC_013655	GAAC	2	8	1011	1018	50 %	0 %	25 %	25 %	281427818
4	NC_013655	ACGC	2	8	1308	1315	25 %	0 %	25 %	50 %	281427818
5	NC_013655	GAAG	2	8	1476	1483	50 %	0 %	50 %	0 %	281427818
6	NC_013655	TCAG	2	8	1577	1584	25 %	25 %	25 %	25 %	281427818
7	NC_013655	CTGG	2	8	1886	1893	0 %	25 %	50 %	25 %	281427818
8	NC_013655	GAGG	2	8	2843	2850	25 %	0 %	75 %	0 %	281427820
9	NC_013655	GGCG	2	8	3608	3615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013655	ACTG	2	8	4266	4273	25 %	25 %	25 %	25 %	281427823
11	NC_013655	GGGA	2	8	4568	4575	25 %	0 %	75 %	0 %	281427824
12	NC_013655	CTGA	2	8	4619	4626	25 %	25 %	25 %	25 %	281427824
13	NC_013655	GGGA	2	8	4854	4861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013655	GAAA	2	8	5426	5433	75 %	0 %	25 %	0 %	281427825
15	NC_013655	ATTT	2	8	5458	5465	25 %	75 %	0 %	0 %	281427825
16	NC_013655	ATTT	2	8	6713	6720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013655	AAAT	2	8	6930	6937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013655	ATAA	2	8	7015	7022	75 %	25 %	0 %	0 %	281427827
19	NC_013655	ATTA	2	8	7437	7444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013655	TAAA	2	8	7593	7600	75 %	25 %	0 %	0 %	281427828
21	NC_013655	ACAG	2	8	8081	8088	50 %	0 %	25 %	25 %	281427828
22	NC_013655	TGAG	2	8	8324	8331	25 %	25 %	50 %	0 %	281427829
23	NC_013655	TATT	2	8	8910	8917	25 %	75 %	0 %	0 %	281427830
24	NC_013655	ACCA	2	8	9013	9020	50 %	0 %	0 %	50 %	281427831
25	NC_013655	CTGG	2	8	9819	9826	0 %	25 %	50 %	25 %	281427832
26	NC_013655	CCGT	2	8	10287	10294	0 %	25 %	25 %	50 %	281427833
27	NC_013655	CAGC	2	8	10501	10508	25 %	0 %	25 %	50 %	281427833
28	NC_013655	GCCA	2	8	10511	10518	25 %	0 %	25 %	50 %	281427833
29	NC_013655	TCTG	2	8	10671	10678	0 %	50 %	25 %	25 %	281427834
30	NC_013655	AACA	2	8	10861	10868	75 %	0 %	0 %	25 %	281427834
31	NC_013655	TGCC	2	8	10988	10995	0 %	25 %	25 %	50 %	281427834
32	NC_013655	TGTT	2	8	12126	12133	0 %	75 %	25 %	0 %	281427835
33	NC_013655	ATGT	2	8	12377	12384	25 %	50 %	25 %	0 %	281427835
34	NC_013655	GAAG	2	8	12469	12476	50 %	0 %	50 %	0 %	281427835
35	NC_013655	AACA	2	8	12544	12551	75 %	0 %	0 %	25 %	281427835
36	NC_013655	ATGC	2	8	12639	12646	25 %	25 %	25 %	25 %	281427836
37	NC_013655	TCCT	2	8	12676	12683	0 %	50 %	0 %	50 %	281427836
38	NC_013655	TTTA	2	8	13146	13153	25 %	75 %	0 %	0 %	281427838
39	NC_013655	CCCG	2	8	13508	13515	0 %	0 %	25 %	75 %	281427838
40	NC_013655	ATTA	2	8	13639	13646	50 %	50 %	0 %	0 %	281427838
41	NC_013655	GTGA	2	8	13782	13789	25 %	25 %	50 %	0 %	281427839
42	NC_013655	AAAT	2	8	13858	13865	75 %	25 %	0 %	0 %	281427839
43	NC_013655	AAAT	2	8	14069	14076	75 %	25 %	0 %	0 %	281427840
44	NC_013655	CTGA	2	8	14275	14282	25 %	25 %	25 %	25 %	281427840
45	NC_013655	AGAA	2	8	14897	14904	75 %	0 %	25 %	0 %	281427842
46	NC_013655	ATGA	2	8	15305	15312	50 %	25 %	25 %	0 %	281427843
47	NC_013655	TGGT	2	8	15450	15457	0 %	50 %	50 %	0 %	281427843
48	NC_013655	TCCG	2	8	16150	16157	0 %	25 %	25 %	50 %	281427843
49	NC_013655	CACC	2	8	16509	16516	25 %	0 %	0 %	75 %	281427843
50	NC_013655	TGGG	2	8	17106	17113	0 %	25 %	75 %	0 %	281427843
51	NC_013655	CCGT	2	8	17122	17129	0 %	25 %	25 %	50 %	281427843
52	NC_013655	TTCC	2	8	17527	17534	0 %	50 %	0 %	50 %	281427843
53	NC_013655	CTGG	2	8	17725	17732	0 %	25 %	50 %	25 %	281427843
54	NC_013655	AGCC	2	8	18015	18022	25 %	0 %	25 %	50 %	281427844
55	NC_013655	CGTC	2	8	18409	18416	0 %	25 %	25 %	50 %	281427845
56	NC_013655	AGTC	2	8	18925	18932	25 %	25 %	25 %	25 %	281427846
57	NC_013655	GACG	2	8	19048	19055	25 %	0 %	50 %	25 %	281427846
58	NC_013655	GGAC	2	8	19284	19291	25 %	0 %	50 %	25 %	281427846
59	NC_013655	TTCA	2	8	21071	21078	25 %	50 %	0 %	25 %	281427849
60	NC_013655	GTGG	2	8	21664	21671	0 %	25 %	75 %	0 %	281427849
61	NC_013655	CAAA	2	8	22254	22261	75 %	0 %	0 %	25 %	281427849
62	NC_013655	GTCT	2	8	22307	22314	0 %	50 %	25 %	25 %	281427849
63	NC_013655	CAGG	2	8	22580	22587	25 %	0 %	50 %	25 %	281427849
64	NC_013655	CTGA	2	8	22819	22826	25 %	25 %	25 %	25 %	281427850
65	NC_013655	AAAT	2	8	22959	22966	75 %	25 %	0 %	0 %	281427851
66	NC_013655	GTAT	2	8	23769	23776	25 %	50 %	25 %	0 %	281427852
67	NC_013655	CAGT	2	8	23848	23855	25 %	25 %	25 %	25 %	281427852
68	NC_013655	TGTT	2	8	23896	23903	0 %	75 %	25 %	0 %	281427852
69	NC_013655	AAAT	2	8	24145	24152	75 %	25 %	0 %	0 %	281427853
70	NC_013655	GGGA	2	8	24170	24177	25 %	0 %	75 %	0 %	281427853
71	NC_013655	GGCA	2	8	24823	24830	25 %	0 %	50 %	25 %	281427855
72	NC_013655	GGAT	2	8	25133	25140	25 %	25 %	50 %	0 %	281427855
73	NC_013655	GGAT	2	8	25358	25365	25 %	25 %	50 %	0 %	281427856
74	NC_013655	TGAA	2	8	25404	25411	50 %	25 %	25 %	0 %	281427856
75	NC_013655	GAAA	2	8	25442	25449	75 %	0 %	25 %	0 %	281427856
76	NC_013655	ATGT	2	8	25662	25669	25 %	50 %	25 %	0 %	281427857
77	NC_013655	AGGG	2	8	25803	25810	25 %	0 %	75 %	0 %	281427857
78	NC_013655	GTGA	2	8	26782	26789	25 %	25 %	50 %	0 %	281427858
79	NC_013655	CCGC	2	8	27134	27141	0 %	0 %	25 %	75 %	281427858
80	NC_013655	GGAG	2	8	27175	27182	25 %	0 %	75 %	0 %	281427858
81	NC_013655	TGAA	2	8	27190	27197	50 %	25 %	25 %	0 %	281427858
82	NC_013655	CAGC	2	8	27988	27995	25 %	0 %	25 %	50 %	281427859
83	NC_013655	GTCC	2	8	28250	28257	0 %	25 %	25 %	50 %	281427859
84	NC_013655	GGCA	2	8	28541	28548	25 %	0 %	50 %	25 %	281427859
85	NC_013655	GATG	2	8	28703	28710	25 %	25 %	50 %	0 %	281427859
86	NC_013655	ATTG	2	8	29148	29155	25 %	50 %	25 %	0 %	281427859
87	NC_013655	CTGG	2	8	30090	30097	0 %	25 %	50 %	25 %	281427860
88	NC_013655	TGAG	2	8	30676	30683	25 %	25 %	50 %	0 %	281427861
89	NC_013655	AATC	2	8	31270	31277	50 %	25 %	0 %	25 %	281427861
90	NC_013655	AAAT	2	8	31371	31378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013655	AAAT	2	8	31402	31409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013655	GACT	2	8	32132	32139	25 %	25 %	25 %	25 %	281427862
93	NC_013655	GAAT	2	8	32539	32546	50 %	25 %	25 %	0 %	281427864
94	NC_013655	AGAA	2	8	32751	32758	75 %	0 %	25 %	0 %	281427864
95	NC_013655	CCCG	2	8	33869	33876	0 %	0 %	25 %	75 %	281427866
96	NC_013655	ATGG	2	8	34548	34555	25 %	25 %	50 %	0 %	281427866
97	NC_013655	GTCT	2	8	34702	34709	0 %	50 %	25 %	25 %	281427866
98	NC_013655	GAAA	2	8	34712	34719	75 %	0 %	25 %	0 %	281427866
99	NC_013655	AATA	2	8	34903	34910	75 %	25 %	0 %	0 %	281427866
100	NC_013655	CCAG	2	8	35047	35054	25 %	0 %	25 %	50 %	281427867
101	NC_013655	GACA	2	8	35278	35285	50 %	0 %	25 %	25 %	281427867
102	NC_013655	TCTG	2	8	35385	35392	0 %	50 %	25 %	25 %	281427867
103	NC_013655	GGCT	2	8	35960	35967	0 %	25 %	50 %	25 %	281427867
104	NC_013655	GGCA	2	8	36993	37000	25 %	0 %	50 %	25 %	281427868
105	NC_013655	CGGA	2	8	37346	37353	25 %	0 %	50 %	25 %	281427868
106	NC_013655	CGCA	2	8	37870	37877	25 %	0 %	25 %	50 %	281427868
107	NC_013655	GTCC	2	8	38136	38143	0 %	25 %	25 %	50 %	281427868
108	NC_013655	CCGT	2	8	38253	38260	0 %	25 %	25 %	50 %	281427868
109	NC_013655	TCGC	2	8	38376	38383	0 %	25 %	25 %	50 %	281427868
110	NC_013655	CTGG	2	8	38877	38884	0 %	25 %	50 %	25 %	281427868
111	NC_013655	ACCG	2	8	38915	38922	25 %	0 %	25 %	50 %	281427868
112	NC_013655	CCGG	2	8	39081	39088	0 %	0 %	50 %	50 %	281427868
113	NC_013655	GCGA	2	8	39110	39117	25 %	0 %	50 %	25 %	281427868
114	NC_013655	GGGC	2	8	39217	39224	0 %	0 %	75 %	25 %	281427868
115	NC_013655	CCTG	2	8	39237	39244	0 %	25 %	25 %	50 %	281427868
116	NC_013655	CGGT	2	8	40052	40059	0 %	25 %	50 %	25 %	281427868
117	NC_013655	CAGG	2	8	41473	41480	25 %	0 %	50 %	25 %	281427868
118	NC_013655	GCTG	2	8	42021	42028	0 %	25 %	50 %	25 %	281427868
119	NC_013655	GTGG	2	8	42657	42664	0 %	25 %	75 %	0 %	281427869
120	NC_013655	CAGC	2	8	43442	43449	25 %	0 %	25 %	50 %	281427870
121	NC_013655	TGAA	2	8	43489	43496	50 %	25 %	25 %	0 %	281427870
122	NC_013655	TGCC	2	8	44444	44451	0 %	25 %	25 %	50 %	281427871
123	NC_013655	GGAA	2	8	44705	44712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013655	GAAT	2	8	45463	45470	50 %	25 %	25 %	0 %	281427873
125	NC_013655	TAAA	2	8	45626	45633	75 %	25 %	0 %	0 %	281427873
126	NC_013655	TCAT	2	8	45649	45656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013655	TAAT	2	8	45898	45905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013655	GCCA	2	8	46342	46349	25 %	0 %	25 %	50 %	281427875
129	NC_013655	AGGC	2	8	46399	46406	25 %	0 %	50 %	25 %	281427875
130	NC_013655	GGCA	2	8	47100	47107	25 %	0 %	50 %	25 %	281427876
131	NC_013655	CTGA	2	8	47197	47204	25 %	25 %	25 %	25 %	281427876
132	NC_013655	GTAG	2	8	48327	48334	25 %	25 %	50 %	0 %	281427877
133	NC_013655	TTAT	2	8	49269	49276	25 %	75 %	0 %	0 %	281427878
134	NC_013655	TTTC	2	8	49461	49468	0 %	75 %	0 %	25 %	281427878
135	NC_013655	CGGG	2	8	50304	50311	0 %	0 %	75 %	25 %	281427878
136	NC_013655	TTCT	2	8	51422	51429	0 %	75 %	0 %	25 %	281427880
137	NC_013655	ATTC	2	8	51634	51641	25 %	50 %	0 %	25 %	281427880
138	NC_013655	GAAA	2	8	52102	52109	75 %	0 %	25 %	0 %	281427881
139	NC_013655	TGGC	2	8	52206	52213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013655	GCTC	2	8	52405	52412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013655	TACC	2	8	52830	52837	25 %	25 %	0 %	50 %	281427882
142	NC_013655	CCGA	2	8	52873	52880	25 %	0 %	25 %	50 %	281427882
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.