MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CAAAA	2	10	497	506	80 %	0 %	0 %	20 %	260871128
2	NC_013370	GAAAA	2	10	1201	1210	80 %	0 %	20 %	0 %	260871129
3	NC_013370	CCTGG	2	10	1688	1697	0 %	20 %	40 %	40 %	260871129
4	NC_013370	GCGCG	2	10	2114	2123	0 %	0 %	60 %	40 %	260871130
5	NC_013370	GGTAA	2	10	2162	2171	40 %	20 %	40 %	0 %	260871130
6	NC_013370	ATGAA	2	10	2344	2353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013370	CTGAA	2	10	3288	3297	40 %	20 %	20 %	20 %	260871131
8	NC_013370	CTTTT	2	10	4375	4384	0 %	80 %	0 %	20 %	260871134
9	NC_013370	CTGTG	2	10	6621	6630	0 %	40 %	40 %	20 %	260871137
10	NC_013370	CATTT	2	10	8202	8211	20 %	60 %	0 %	20 %	260871137
11	NC_013370	TGGAT	2	10	10831	10840	20 %	40 %	40 %	0 %	260871137
12	NC_013370	TTATT	3	15	16356	16370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013370	AGCTA	2	10	18177	18186	40 %	20 %	20 %	20 %	260871145
14	NC_013370	AAAAG	2	10	25624	25633	80 %	0 %	20 %	0 %	260871153
15	NC_013370	CAATA	2	10	26134	26143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013370	TTTAG	2	10	26202	26211	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013370	ATGTT	2	10	26301	26310	20 %	60 %	20 %	0 %	260871155
18	NC_013370	ATTGG	2	10	26556	26565	20 %	40 %	40 %	0 %	260871155
19	NC_013370	TTGTA	2	10	26857	26866	20 %	60 %	20 %	0 %	260871155
20	NC_013370	CGGAA	2	10	31472	31481	40 %	0 %	40 %	20 %	260871159
21	NC_013370	TACCG	2	10	32740	32749	20 %	20 %	20 %	40 %	260871160
22	NC_013370	GACGC	2	10	35877	35886	20 %	0 %	40 %	40 %	260871162
23	NC_013370	CGCAT	2	10	37764	37773	20 %	20 %	20 %	40 %	260871163
24	NC_013370	AAGCA	2	10	39546	39555	60 %	0 %	20 %	20 %	260871166
25	NC_013370	CAGAA	2	10	41615	41624	60 %	0 %	20 %	20 %	260871170
26	NC_013370	ACGCC	2	10	47074	47083	20 %	0 %	20 %	60 %	260871178
27	NC_013370	ACAGC	2	10	47148	47157	40 %	0 %	20 %	40 %	260871178
28	NC_013370	TTGAA	2	10	48101	48110	40 %	40 %	20 %	0 %	260871178
29	NC_013370	AGCAC	2	10	48427	48436	40 %	0 %	20 %	40 %	260871179
30	NC_013370	CTGAA	2	10	48447	48456	40 %	20 %	20 %	20 %	260871179
31	NC_013370	ATTTT	2	10	50348	50357	20 %	80 %	0 %	0 %	260871180
32	NC_013370	TGCTG	2	10	50664	50673	0 %	40 %	40 %	20 %	260871180
33	NC_013370	CTCGA	2	10	51019	51028	20 %	20 %	20 %	40 %	260871180
34	NC_013370	TTTTC	2	10	61789	61798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013370	GTTGC	2	10	62662	62671	0 %	40 %	40 %	20 %	260871193
36	NC_013370	GTCAT	2	10	67869	67878	20 %	40 %	20 %	20 %	260871200
37	NC_013370	CAGTA	2	10	68273	68282	40 %	20 %	20 %	20 %	260871200
38	NC_013370	GGTTC	2	10	69684	69693	0 %	40 %	40 %	20 %	260871202
39	NC_013370	AATGA	2	10	77418	77427	60 %	20 %	20 %	0 %	260871213
40	NC_013370	AAGAT	2	10	78758	78767	60 %	20 %	20 %	0 %	260871214
41	NC_013370	GCAGG	2	10	80666	80675	20 %	0 %	60 %	20 %	260871218
42	NC_013370	CGACA	2	10	80997	81006	40 %	0 %	20 %	40 %	260871219
43	NC_013370	AGCGC	2	10	82762	82771	20 %	0 %	40 %	40 %	260871223
44	NC_013370	TCATC	2	10	87141	87150	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013370	CGCGC	2	10	89629	89638	0 %	0 %	40 %	60 %	260871236
46	NC_013370	CTGAT	2	10	92916	92925	20 %	40 %	20 %	20 %	260871239
47	NC_013370	TTCAG	2	10	95467	95476	20 %	40 %	20 %	20 %	260871243

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.