MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	ATTTTA	2	12	485	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260763803
2	NC_013369	TTCTGT	2	12	6923	6934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260763806
3	NC_013369	CAGCGG	2	12	8305	8316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260763809
4	NC_013369	TCCAGT	2	12	10809	10820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013369	AGCCCG	2	12	10990	11001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013369	TGCTGA	2	12	12590	12601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013369	GCAGAA	2	12	12899	12910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013369	GTGTCC	2	12	13036	13047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013369	TTTTTC	2	12	13572	13583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260763815
10	NC_013369	CTGCCG	2	12	17971	17982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260763818
11	NC_013369	TGCCGG	2	12	19832	19843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013369	TGCGTA	2	12	20322	20333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260763820
13	NC_013369	GTGAAA	2	12	20739	20750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260763820
14	NC_013369	TGATAT	2	12	23854	23865	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260763821
15	NC_013369	TTTTAT	2	12	24213	24224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	260763821
16	NC_013369	AAATCC	2	12	24743	24754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	260763821
17	NC_013369	ATATTT	2	12	27616	27627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260763821
18	NC_013369	TCCGCC	2	12	32538	32549	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013369	CCAGTT	2	12	33413	33424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013369	AGCCAG	2	12	37354	37365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013369	AGCCGC	2	12	39241	39252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013369	AGCCGC	2	12	41069	41080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013369	CCAGCT	2	12	41343	41354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013369	TATCCA	2	12	45608	45619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260763827
25	NC_013369	GTGTCA	2	12	45806	45817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260763827
26	NC_013369	GCAGAA	2	12	47805	47816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260763829
27	NC_013369	ACTGGA	2	12	55422	55433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260763837
28	NC_013369	GGCTGT	2	12	56481	56492	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260763840
29	NC_013369	CCCGTA	2	12	60675	60686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260763845
30	NC_013369	TGCTGA	2	12	68773	68784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013369	GCAGAA	2	12	69082	69093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013369	GTGTCC	2	12	69219	69230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013369	TTTTTC	2	12	69755	69766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260763854
34	NC_013369	AGCCGC	2	12	75296	75307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013369	GCACCT	2	12	76363	76374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260763860
36	NC_013369	TCCTGC	2	12	82190	82201	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260763864

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.