MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_5

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013368	GTC	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751920
2	NC_013368	CAG	2	6	127	132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751920
3	NC_013368	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751920
4	NC_013368	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751922
5	NC_013368	AAC	2	6	324	329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751922
6	NC_013368	CCG	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751922
7	NC_013368	TGG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751922
8	NC_013368	GAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751922
9	NC_013368	CTG	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751923
10	NC_013368	AAT	2	6	1056	1061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751923
11	NC_013368	AGG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751923
12	NC_013368	GGT	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751923
13	NC_013368	GAA	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751923
14	NC_013368	AAC	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751923
15	NC_013368	CGG	2	6	1510	1515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751923
16	NC_013368	GCT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751923
17	NC_013368	GCG	2	6	1642	1647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751923
18	NC_013368	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751923
19	NC_013368	GAA	3	9	1791	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751923
20	NC_013368	GCA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
21	NC_013368	GCA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
22	NC_013368	CAG	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
23	NC_013368	CAG	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
24	NC_013368	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013368	TTG	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751924
26	NC_013368	TCA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751924
27	NC_013368	GGT	2	6	2456	2461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013368	TTG	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013368	CAG	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013368	CGG	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751925
31	NC_013368	TGG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751925
32	NC_013368	CTT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013368	GTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013368	TGT	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013368	GTG	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
36	NC_013368	AGG	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751926
37	NC_013368	TCA	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751926
38	NC_013368	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
39	NC_013368	ATT	2	6	3276	3281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
40	NC_013368	GTG	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
41	NC_013368	GCT	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
42	NC_013368	CAG	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
43	NC_013368	TAA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751926
44	NC_013368	TAT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
45	NC_013368	GTC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
46	NC_013368	GAA	2	6	3792	3797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751926
47	NC_013368	TAA	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751926
48	NC_013368	ATG	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
49	NC_013368	GTG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
50	NC_013368	GAT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
51	NC_013368	CCT	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260751926
52	NC_013368	ATG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
53	NC_013368	CTG	3	9	4195	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
54	NC_013368	AGA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751926
55	NC_013368	CGA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
56	NC_013368	CAG	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
57	NC_013368	TAG	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
58	NC_013368	ATC	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751926
59	NC_013368	ACG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
60	NC_013368	TGG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
61	NC_013368	TGC	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
62	NC_013368	AAC	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751926
63	NC_013368	GAG	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751926
64	NC_013368	ATT	2	6	5185	5190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751927
65	NC_013368	GTT	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751927
66	NC_013368	GCT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751927
67	NC_013368	TGA	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751927
68	NC_013368	CAT	3	9	5592	5600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751928
69	NC_013368	TCT	2	6	5647	5652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013368	CTG	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013368	CGG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013368	GGA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013368	CTC	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013368	GCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013368	GCA	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751929
76	NC_013368	AGA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751929
77	NC_013368	AGG	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751929
78	NC_013368	TGA	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751929
79	NC_013368	GCG	2	6	6269	6274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013368	CGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.