MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	260752013
2	NC_013365	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	260752013
3	NC_013365	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	260752019
4	NC_013365	AG	3	6	6019	6024	50 %	0 %	50 %	0 %	260752020
5	NC_013365	GT	3	6	6360	6365	0 %	50 %	50 %	0 %	260752020
6	NC_013365	TC	3	6	8327	8332	0 %	50 %	0 %	50 %	260752023
7	NC_013365	CA	3	6	9654	9659	50 %	0 %	0 %	50 %	260752024
8	NC_013365	TA	3	6	12167	12172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013365	CT	3	6	13066	13071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013365	TA	3	6	13773	13778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013365	TC	3	6	13873	13878	0 %	50 %	0 %	50 %	260752025
12	NC_013365	CG	3	6	14255	14260	0 %	0 %	50 %	50 %	260752025
13	NC_013365	AC	3	6	14451	14456	50 %	0 %	0 %	50 %	260752025
14	NC_013365	AT	3	6	15745	15750	50 %	50 %	0 %	0 %	260752026
15	NC_013365	AT	4	8	16639	16646	50 %	50 %	0 %	0 %	260752027
16	NC_013365	TG	3	6	18059	18064	0 %	50 %	50 %	0 %	260752030
17	NC_013365	AC	3	6	18711	18716	50 %	0 %	0 %	50 %	260752030
18	NC_013365	GT	3	6	19142	19147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013365	GA	3	6	20613	20618	50 %	0 %	50 %	0 %	260752032
20	NC_013365	AG	3	6	20819	20824	50 %	0 %	50 %	0 %	260752032
21	NC_013365	GA	3	6	22327	22332	50 %	0 %	50 %	0 %	260752034
22	NC_013365	AG	3	6	22508	22513	50 %	0 %	50 %	0 %	260752034
23	NC_013365	TC	3	6	22668	22673	0 %	50 %	0 %	50 %	260752035
24	NC_013365	AT	3	6	23758	23763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013365	CT	3	6	23976	23981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013365	CT	3	6	24786	24791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013365	TC	4	8	25970	25977	0 %	50 %	0 %	50 %	260752036
28	NC_013365	TC	3	6	27108	27113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013365	GA	3	6	29069	29074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013365	GA	3	6	29085	29090	50 %	0 %	50 %	0 %	260752038
31	NC_013365	AG	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	260752039
32	NC_013365	GA	3	6	31160	31165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013365	TG	3	6	32064	32069	0 %	50 %	50 %	0 %	260752040
34	NC_013365	TA	3	6	32273	32278	50 %	50 %	0 %	0 %	260752040
35	NC_013365	AT	3	6	32306	32311	50 %	50 %	0 %	0 %	260752041
36	NC_013365	TG	3	6	33279	33284	0 %	50 %	50 %	0 %	260752041
37	NC_013365	CG	3	6	33607	33612	0 %	0 %	50 %	50 %	260752041
38	NC_013365	GT	3	6	34022	34027	0 %	50 %	50 %	0 %	260752041
39	NC_013365	AG	3	6	34131	34136	50 %	0 %	50 %	0 %	260752041
40	NC_013365	CA	3	6	36307	36312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013365	TG	3	6	36723	36728	0 %	50 %	50 %	0 %	260752042
42	NC_013365	TG	3	6	39187	39192	0 %	50 %	50 %	0 %	260752044
43	NC_013365	AC	3	6	39230	39235	50 %	0 %	0 %	50 %	260752044
44	NC_013365	AG	4	8	41538	41545	50 %	0 %	50 %	0 %	260752048
45	NC_013365	AG	3	6	42802	42807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013365	AG	3	6	42949	42954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013365	GC	3	6	43655	43660	0 %	0 %	50 %	50 %	260752049
48	NC_013365	TA	4	8	45466	45473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013365	AC	3	6	45771	45776	50 %	0 %	0 %	50 %	260752050
50	NC_013365	AG	3	6	45914	45919	50 %	0 %	50 %	0 %	260752050
51	NC_013365	AC	3	6	46096	46101	50 %	0 %	0 %	50 %	260752050
52	NC_013365	GA	4	8	46563	46570	50 %	0 %	50 %	0 %	260752051
53	NC_013365	GA	3	6	46691	46696	50 %	0 %	50 %	0 %	260752051
54	NC_013365	TA	3	6	46974	46979	50 %	50 %	0 %	0 %	260752052
55	NC_013365	GT	3	6	47050	47055	0 %	50 %	50 %	0 %	260752052
56	NC_013365	TA	3	6	48128	48133	50 %	50 %	0 %	0 %	260752053
57	NC_013365	AT	3	6	49080	49085	50 %	50 %	0 %	0 %	260752054
58	NC_013365	CT	3	6	50272	50277	0 %	50 %	0 %	50 %	260752055
59	NC_013365	GA	3	6	50710	50715	50 %	0 %	50 %	0 %	260752056
60	NC_013365	GT	3	6	51767	51772	0 %	50 %	50 %	0 %	260752056
61	NC_013365	AT	3	6	52619	52624	50 %	50 %	0 %	0 %	260752057
62	NC_013365	AG	3	6	52948	52953	50 %	0 %	50 %	0 %	260752058
63	NC_013365	AT	3	6	53433	53438	50 %	50 %	0 %	0 %	260752058
64	NC_013365	TG	3	6	53471	53476	0 %	50 %	50 %	0 %	260752058
65	NC_013365	AG	3	6	55618	55623	50 %	0 %	50 %	0 %	260752060
66	NC_013365	TA	3	6	55785	55790	50 %	50 %	0 %	0 %	260752060
67	NC_013365	TG	3	6	57668	57673	0 %	50 %	50 %	0 %	260752062
68	NC_013365	AT	3	6	58110	58115	50 %	50 %	0 %	0 %	260752063
69	NC_013365	TA	4	8	58192	58199	50 %	50 %	0 %	0 %	260752063
70	NC_013365	TC	3	6	58560	58565	0 %	50 %	0 %	50 %	260752063
71	NC_013365	TC	3	6	59226	59231	0 %	50 %	0 %	50 %	260752064
72	NC_013365	TA	3	6	60108	60113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013365	CA	3	6	60374	60379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013365	TG	3	6	61466	61471	0 %	50 %	50 %	0 %	260752067
75	NC_013365	TA	3	6	61721	61726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013365	GA	3	6	64002	64007	50 %	0 %	50 %	0 %	260752071
77	NC_013365	GA	3	6	64352	64357	50 %	0 %	50 %	0 %	260752072
78	NC_013365	TG	3	6	64482	64487	0 %	50 %	50 %	0 %	260752072
79	NC_013365	CA	4	8	64991	64998	50 %	0 %	0 %	50 %	260752072
80	NC_013365	TG	3	6	65302	65307	0 %	50 %	50 %	0 %	260752073
81	NC_013365	AT	3	6	65926	65931	50 %	50 %	0 %	0 %	260752074
82	NC_013365	TG	3	6	66425	66430	0 %	50 %	50 %	0 %	260752074
83	NC_013365	GA	3	6	66486	66491	50 %	0 %	50 %	0 %	260752074
84	NC_013365	GA	3	6	66798	66803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013365	AC	3	6	66980	66985	50 %	0 %	0 %	50 %	260752075
86	NC_013365	AG	3	6	68522	68527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013365	TC	3	6	68812	68817	0 %	50 %	0 %	50 %	260752078
88	NC_013365	TG	3	6	71721	71726	0 %	50 %	50 %	0 %	260752081
89	NC_013365	GT	3	6	72321	72326	0 %	50 %	50 %	0 %	260752082
90	NC_013365	AC	3	6	75147	75152	50 %	0 %	0 %	50 %	260752087
91	NC_013365	CA	3	6	75796	75801	50 %	0 %	0 %	50 %	260752087
92	NC_013365	GA	3	6	76919	76924	50 %	0 %	50 %	0 %	260752089
93	NC_013365	TG	3	6	78296	78301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013365	TC	3	6	78477	78482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013365	GT	3	6	78615	78620	0 %	50 %	50 %	0 %	260752091
96	NC_013365	AT	3	6	79310	79315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013365	GA	3	6	80427	80432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013365	AT	3	6	80731	80736	50 %	50 %	0 %	0 %	260752095
99	NC_013365	GT	3	6	81351	81356	0 %	50 %	50 %	0 %	260752095
100	NC_013365	TG	3	6	81394	81399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013365	TG	3	6	81745	81750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013365	AG	3	6	81821	81826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013365	TC	3	6	81846	81851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013365	TC	3	6	82190	82195	0 %	50 %	0 %	50 %	260752096
105	NC_013365	CG	3	6	83005	83010	0 %	0 %	50 %	50 %	260752098
106	NC_013365	AC	4	8	85234	85241	50 %	0 %	0 %	50 %	260752099
107	NC_013365	CT	3	6	85651	85656	0 %	50 %	0 %	50 %	260752100
108	NC_013365	TC	3	6	85739	85744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013365	CA	3	6	85816	85821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013365	GA	3	6	88076	88081	50 %	0 %	50 %	0 %	260752103
111	NC_013365	TG	3	6	89266	89271	0 %	50 %	50 %	0 %	260752104
112	NC_013365	TA	3	6	89607	89612	50 %	50 %	0 %	0 %	260752104
113	NC_013365	TG	3	6	90346	90351	0 %	50 %	50 %	0 %	260752106
114	NC_013365	GA	3	6	90418	90423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013365	CA	3	6	90873	90878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013365	CT	3	6	91425	91430	0 %	50 %	0 %	50 %	260752107
117	NC_013365	CA	3	6	92577	92582	50 %	0 %	0 %	50 %	260752107
118	NC_013365	TC	3	6	92613	92618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013365	GT	3	6	92962	92967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013365	AT	3	6	95477	95482	50 %	50 %	0 %	0 %	260752111
121	NC_013365	GA	3	6	97155	97160	50 %	0 %	50 %	0 %	260752113
122	NC_013365	GC	3	6	99307	99312	0 %	0 %	50 %	50 %	260752116
123	NC_013365	GC	3	6	99953	99958	0 %	0 %	50 %	50 %	260752117
124	NC_013365	GC	3	6	100402	100407	0 %	0 %	50 %	50 %	260752119
125	NC_013365	TG	3	6	101259	101264	0 %	50 %	50 %	0 %	260752120
126	NC_013365	AC	3	6	101825	101830	50 %	0 %	0 %	50 %	260752120
127	NC_013365	GC	3	6	101906	101911	0 %	0 %	50 %	50 %	260752120
128	NC_013365	CG	3	6	101937	101942	0 %	0 %	50 %	50 %	260752120
129	NC_013365	AC	3	6	101947	101952	50 %	0 %	0 %	50 %	260752120
130	NC_013365	CG	4	8	102274	102281	0 %	0 %	50 %	50 %	260752120
131	NC_013365	CG	3	6	102298	102303	0 %	0 %	50 %	50 %	260752120
132	NC_013365	GC	3	6	102712	102717	0 %	0 %	50 %	50 %	260752121
133	NC_013365	CG	3	6	102839	102844	0 %	0 %	50 %	50 %	260752121
134	NC_013365	GC	3	6	103125	103130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013365	GC	3	6	103200	103205	0 %	0 %	50 %	50 %	260752122
136	NC_013365	GC	3	6	103598	103603	0 %	0 %	50 %	50 %	260752122
137	NC_013365	GC	3	6	103997	104002	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
138	NC_013365	GC	3	6	104327	104332	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
139	NC_013365	CG	3	6	105031	105036	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
140	NC_013365	TC	3	6	105557	105562	0 %	50 %	0 %	50 %	260752124
141	NC_013365	CG	3	6	105675	105680	0 %	0 %	50 %	50 %	260752124
142	NC_013365	AT	3	6	107006	107011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013365	TC	3	6	107417	107422	0 %	50 %	0 %	50 %	260752126
144	NC_013365	CG	3	6	107535	107540	0 %	0 %	50 %	50 %	260752126
145	NC_013365	GA	3	6	108017	108022	50 %	0 %	50 %	0 %	260752127
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.