MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	A	6	6	927	932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013362	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013362	T	6	6	1910	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013362	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	260751933
5	NC_013362	T	8	8	5392	5399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013362	T	7	7	5404	5410	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
7	NC_013362	T	6	6	5501	5506	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
8	NC_013362	A	6	6	5594	5599	100 %	0 %	0 %	0 %	260751936
9	NC_013362	T	7	7	5772	5778	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
10	NC_013362	T	6	6	6007	6012	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
11	NC_013362	T	6	6	6064	6069	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
12	NC_013362	T	6	6	6327	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
13	NC_013362	T	6	6	6591	6596	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
14	NC_013362	A	6	6	7650	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	260751938
15	NC_013362	G	6	6	7995	8000	0 %	0 %	100 %	0 %	260751938
16	NC_013362	T	6	6	8296	8301	0 %	100 %	0 %	0 %	260751939
17	NC_013362	A	6	6	8665	8670	100 %	0 %	0 %	0 %	260751940
18	NC_013362	T	7	7	12278	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	260751948
19	NC_013362	T	6	6	12763	12768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013362	A	6	6	12783	12788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013362	A	6	6	13078	13083	100 %	0 %	0 %	0 %	260751949
22	NC_013362	A	6	6	13586	13591	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
23	NC_013362	A	7	7	14018	14024	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
24	NC_013362	A	6	6	14187	14192	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
25	NC_013362	C	6	6	14822	14827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_013362	G	6	6	14840	14845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013362	A	6	6	16724	16729	100 %	0 %	0 %	0 %	260751953
28	NC_013362	A	7	7	22354	22360	100 %	0 %	0 %	0 %	260751963
29	NC_013362	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013362	T	6	6	22510	22515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013362	T	6	6	22629	22634	0 %	100 %	0 %	0 %	260751964
32	NC_013362	A	6	6	23379	23384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013362	T	6	6	23849	23854	0 %	100 %	0 %	0 %	260751965
34	NC_013362	T	6	6	24166	24171	0 %	100 %	0 %	0 %	260751965
35	NC_013362	A	6	6	24422	24427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013362	T	7	7	24468	24474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013362	A	6	6	24563	24568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013362	A	6	6	24620	24625	100 %	0 %	0 %	0 %	260751966
39	NC_013362	A	6	6	24945	24950	100 %	0 %	0 %	0 %	260751966
40	NC_013362	T	7	7	25282	25288	0 %	100 %	0 %	0 %	260751967
41	NC_013362	T	6	6	25527	25532	0 %	100 %	0 %	0 %	260751967
42	NC_013362	A	7	7	25656	25662	100 %	0 %	0 %	0 %	260751967
43	NC_013362	A	6	6	25677	25682	100 %	0 %	0 %	0 %	260751967
44	NC_013362	T	7	7	26237	26243	0 %	100 %	0 %	0 %	260751969
45	NC_013362	A	6	6	26746	26751	100 %	0 %	0 %	0 %	260751970
46	NC_013362	A	6	6	26755	26760	100 %	0 %	0 %	0 %	260751970
47	NC_013362	A	6	6	27454	27459	100 %	0 %	0 %	0 %	260751971
48	NC_013362	T	7	7	27488	27494	0 %	100 %	0 %	0 %	260751972
49	NC_013362	G	6	6	28988	28993	0 %	0 %	100 %	0 %	260751973
50	NC_013362	G	6	6	29892	29897	0 %	0 %	100 %	0 %	260751974
51	NC_013362	A	7	7	30511	30517	100 %	0 %	0 %	0 %	260751976
52	NC_013362	A	6	6	30867	30872	100 %	0 %	0 %	0 %	260751977
53	NC_013362	T	6	6	31197	31202	0 %	100 %	0 %	0 %	260751977
54	NC_013362	A	6	6	31612	31617	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
55	NC_013362	A	6	6	31932	31937	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
56	NC_013362	A	6	6	32055	32060	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
57	NC_013362	A	6	6	32178	32183	100 %	0 %	0 %	0 %	260751980
58	NC_013362	G	7	7	32353	32359	0 %	0 %	100 %	0 %	260751980
59	NC_013362	T	6	6	32837	32842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013362	A	7	7	33375	33381	100 %	0 %	0 %	0 %	260751982
61	NC_013362	G	6	6	33910	33915	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
62	NC_013362	G	6	6	34445	34450	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
63	NC_013362	A	6	6	35505	35510	100 %	0 %	0 %	0 %	260751983
64	NC_013362	T	6	6	35666	35671	0 %	100 %	0 %	0 %	260751983
65	NC_013362	A	6	6	37424	37429	100 %	0 %	0 %	0 %	260751985
66	NC_013362	T	6	6	39597	39602	0 %	100 %	0 %	0 %	260751989
67	NC_013362	G	6	6	39942	39947	0 %	0 %	100 %	0 %	260751989
68	NC_013362	T	6	6	40981	40986	0 %	100 %	0 %	0 %	260751990
69	NC_013362	C	6	6	41213	41218	0 %	0 %	0 %	100 %	260751991
70	NC_013362	A	6	6	41380	41385	100 %	0 %	0 %	0 %	260751991
71	NC_013362	T	7	7	42058	42064	0 %	100 %	0 %	0 %	260751992
72	NC_013362	A	7	7	42737	42743	100 %	0 %	0 %	0 %	260751993
73	NC_013362	T	6	6	42842	42847	0 %	100 %	0 %	0 %	260751994
74	NC_013362	T	6	6	42910	42915	0 %	100 %	0 %	0 %	260751994
75	NC_013362	T	6	6	43289	43294	0 %	100 %	0 %	0 %	260751995
76	NC_013362	A	6	6	43599	43604	100 %	0 %	0 %	0 %	260751996
77	NC_013362	A	6	6	43621	43626	100 %	0 %	0 %	0 %	260751996
78	NC_013362	T	6	6	43688	43693	0 %	100 %	0 %	0 %	260751996
79	NC_013362	T	6	6	43714	43719	0 %	100 %	0 %	0 %	260751996
80	NC_013362	G	6	6	43901	43906	0 %	0 %	100 %	0 %	260751996
81	NC_013362	T	6	6	44319	44324	0 %	100 %	0 %	0 %	260751997
82	NC_013362	T	6	6	45909	45914	0 %	100 %	0 %	0 %	260751998
83	NC_013362	G	6	6	47232	47237	0 %	0 %	100 %	0 %	260751998
84	NC_013362	A	7	7	48334	48340	100 %	0 %	0 %	0 %	260751999
85	NC_013362	A	7	7	48490	48496	100 %	0 %	0 %	0 %	260751999
86	NC_013362	A	7	7	48693	48699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013362	A	7	7	48717	48723	100 %	0 %	0 %	0 %	260752000
88	NC_013362	C	6	6	49714	49719	0 %	0 %	0 %	100 %	260752001
89	NC_013362	T	7	7	50534	50540	0 %	100 %	0 %	0 %	260752002
90	NC_013362	A	6	6	50920	50925	100 %	0 %	0 %	0 %	260752002
91	NC_013362	G	6	6	52405	52410	0 %	0 %	100 %	0 %	260752002
92	NC_013362	G	6	6	52735	52740	0 %	0 %	100 %	0 %	260752003
93	NC_013362	G	6	6	54311	54316	0 %	0 %	100 %	0 %	260752003
94	NC_013362	A	6	6	54751	54756	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
95	NC_013362	A	6	6	55447	55452	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
96	NC_013362	T	6	6	58608	58613	0 %	100 %	0 %	0 %	260752004
97	NC_013362	A	7	7	58884	58890	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
98	NC_013362	C	6	6	58994	58999	0 %	0 %	0 %	100 %	260752005
99	NC_013362	A	6	6	59071	59076	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
100	NC_013362	A	8	8	59279	59286	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
101	NC_013362	A	6	6	59627	59632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013362	T	6	6	59687	59692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013362	T	6	6	59868	59873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013362	A	6	6	60889	60894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013362	A	6	6	61576	61581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013362	T	6	6	61740	61745	0 %	100 %	0 %	0 %	260752009
107	NC_013362	A	6	6	62751	62756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.