MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	CA	3	6	1274	1279	50 %	0 %	0 %	50 %	260751932
2	NC_013362	CT	3	6	1554	1559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013362	TA	3	6	1734	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013362	CT	3	6	1873	1878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013362	CG	3	6	1986	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	260751933
6	NC_013362	CA	3	6	2053	2058	50 %	0 %	0 %	50 %	260751933
7	NC_013362	TC	3	6	2173	2178	0 %	50 %	0 %	50 %	260751933
8	NC_013362	CA	4	8	2179	2186	50 %	0 %	0 %	50 %	260751933
9	NC_013362	AG	3	6	3311	3316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013362	AT	3	6	3647	3652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013362	GC	4	8	4567	4574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013362	CA	3	6	4842	4847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013362	CA	3	6	4879	4884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013362	AT	3	6	4928	4933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013362	CG	3	6	5084	5089	0 %	0 %	50 %	50 %	260751935
16	NC_013362	AT	3	6	5359	5364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013362	CT	3	6	5465	5470	0 %	50 %	0 %	50 %	260751936
18	NC_013362	GA	3	6	5695	5700	50 %	0 %	50 %	0 %	260751936
19	NC_013362	GT	3	6	7015	7020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013362	AC	3	6	7424	7429	50 %	0 %	0 %	50 %	260751938
21	NC_013362	TG	3	6	7629	7634	0 %	50 %	50 %	0 %	260751938
22	NC_013362	CA	3	6	8958	8963	50 %	0 %	0 %	50 %	260751940
23	NC_013362	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	260751942
24	NC_013362	TG	3	6	10483	10488	0 %	50 %	50 %	0 %	260751943
25	NC_013362	CG	3	6	12180	12185	0 %	0 %	50 %	50 %	260751948
26	NC_013362	CA	3	6	12673	12678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013362	CG	3	6	13514	13519	0 %	0 %	50 %	50 %	260751951
28	NC_013362	GA	3	6	13689	13694	50 %	0 %	50 %	0 %	260751951
29	NC_013362	GC	3	6	14898	14903	0 %	0 %	50 %	50 %	260751952
30	NC_013362	TG	3	6	15089	15094	0 %	50 %	50 %	0 %	260751952
31	NC_013362	CG	3	6	15481	15486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013362	AG	3	6	17122	17127	50 %	0 %	50 %	0 %	260751954
33	NC_013362	AT	3	6	17182	17187	50 %	50 %	0 %	0 %	260751955
34	NC_013362	TG	4	8	18358	18365	0 %	50 %	50 %	0 %	260751955
35	NC_013362	CG	3	6	18991	18996	0 %	0 %	50 %	50 %	260751955
36	NC_013362	TC	3	6	19446	19451	0 %	50 %	0 %	50 %	260751956
37	NC_013362	AC	3	6	20373	20378	50 %	0 %	0 %	50 %	260751958
38	NC_013362	TG	3	6	20386	20391	0 %	50 %	50 %	0 %	260751958
39	NC_013362	TG	3	6	20925	20930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013362	GT	4	8	21072	21079	0 %	50 %	50 %	0 %	260751959
41	NC_013362	GT	3	6	21085	21090	0 %	50 %	50 %	0 %	260751959
42	NC_013362	CG	3	6	21389	21394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013362	AT	3	6	22672	22677	50 %	50 %	0 %	0 %	260751964
44	NC_013362	TA	4	8	23529	23536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013362	TG	4	8	23597	23604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013362	GT	3	6	24463	24468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013362	GA	3	6	24663	24668	50 %	0 %	50 %	0 %	260751966
48	NC_013362	TC	3	6	24844	24849	0 %	50 %	0 %	50 %	260751966
49	NC_013362	AG	3	6	24907	24912	50 %	0 %	50 %	0 %	260751966
50	NC_013362	TG	4	8	25156	25163	0 %	50 %	50 %	0 %	260751967
51	NC_013362	TG	3	6	25866	25871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013362	AG	3	6	26009	26014	50 %	0 %	50 %	0 %	260751968
53	NC_013362	AG	3	6	26119	26124	50 %	0 %	50 %	0 %	260751968
54	NC_013362	CT	3	6	26977	26982	0 %	50 %	0 %	50 %	260751971
55	NC_013362	AT	3	6	27189	27194	50 %	50 %	0 %	0 %	260751971
56	NC_013362	GC	3	6	28133	28138	0 %	0 %	50 %	50 %	260751972
57	NC_013362	GC	3	6	29196	29201	0 %	0 %	50 %	50 %	260751973
58	NC_013362	AT	3	6	32125	32130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013362	AT	3	6	32402	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	260751981
60	NC_013362	AT	3	6	32807	32812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013362	CT	3	6	32906	32911	0 %	50 %	0 %	50 %	260751982
62	NC_013362	CG	3	6	33139	33144	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
63	NC_013362	GT	3	6	33575	33580	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
64	NC_013362	GC	3	6	34163	34168	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
65	NC_013362	AG	3	6	34169	34174	50 %	0 %	50 %	0 %	260751982
66	NC_013362	TG	3	6	34432	34437	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
67	NC_013362	GC	3	6	34638	34643	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
68	NC_013362	CA	3	6	35057	35062	50 %	0 %	0 %	50 %	260751982
69	NC_013362	CG	3	6	35106	35111	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
70	NC_013362	AC	3	6	37650	37655	50 %	0 %	0 %	50 %	260751986
71	NC_013362	CA	3	6	39987	39992	50 %	0 %	0 %	50 %	260751989
72	NC_013362	TC	3	6	42213	42218	0 %	50 %	0 %	50 %	260751992
73	NC_013362	AT	3	6	42952	42957	50 %	50 %	0 %	0 %	260751994
74	NC_013362	CA	3	6	43517	43522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013362	AT	4	8	43671	43678	50 %	50 %	0 %	0 %	260751996
76	NC_013362	CA	3	6	44096	44101	50 %	0 %	0 %	50 %	260751997
77	NC_013362	AC	3	6	44854	44859	50 %	0 %	0 %	50 %	260751997
78	NC_013362	AC	3	6	46011	46016	50 %	0 %	0 %	50 %	260751998
79	NC_013362	GT	3	6	46644	46649	0 %	50 %	50 %	0 %	260751998
80	NC_013362	CA	3	6	46828	46833	50 %	0 %	0 %	50 %	260751998
81	NC_013362	TA	3	6	48383	48388	50 %	50 %	0 %	0 %	260751999
82	NC_013362	CT	3	6	48410	48415	0 %	50 %	0 %	50 %	260751999
83	NC_013362	TC	3	6	49853	49858	0 %	50 %	0 %	50 %	260752001
84	NC_013362	TG	4	8	49962	49969	0 %	50 %	50 %	0 %	260752001
85	NC_013362	AT	3	6	50727	50732	50 %	50 %	0 %	0 %	260752002
86	NC_013362	AC	3	6	51347	51352	50 %	0 %	0 %	50 %	260752002
87	NC_013362	TG	3	6	51687	51692	0 %	50 %	50 %	0 %	260752002
88	NC_013362	CT	4	8	52102	52109	0 %	50 %	0 %	50 %	260752002
89	NC_013362	AC	3	6	53096	53101	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
90	NC_013362	AG	3	6	54413	54418	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
91	NC_013362	CA	3	6	55004	55009	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
92	NC_013362	GA	3	6	55503	55508	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
93	NC_013362	GC	3	6	55547	55552	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
94	NC_013362	CA	3	6	55625	55630	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
95	NC_013362	CG	3	6	55710	55715	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
96	NC_013362	GA	3	6	57367	57372	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
97	NC_013362	AG	3	6	59296	59301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013362	CA	3	6	60458	60463	50 %	0 %	0 %	50 %	260752007
99	NC_013362	GT	3	6	60772	60777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013362	TA	3	6	61633	61638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013362	AT	3	6	61649	61654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013362	AG	3	6	61811	61816	50 %	0 %	50 %	0 %	260752009
103	NC_013362	CA	3	6	61866	61871	50 %	0 %	0 %	50 %	260752009
104	NC_013362	AG	3	6	62358	62363	50 %	0 %	50 %	0 %	260752010
105	NC_013362	TG	3	6	62982	62987	0 %	50 %	50 %	0 %	260752011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.