MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 3753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013361	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	260853215
2	NC_013361	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	260853216
3	NC_013361	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	260853221
4	NC_013361	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	260853222
5	NC_013361	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	260853224
6	NC_013361	CCGAT	2	10	16492	16501	20 %	20 %	20 %	40 %	260853230
7	NC_013361	AGCGA	2	10	16880	16889	40 %	0 %	40 %	20 %	260853230
8	NC_013361	GTTTT	2	10	19298	19307	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013361	ATTGC	2	10	21684	21693	20 %	40 %	20 %	20 %	260853232
10	NC_013361	TTAAT	2	10	22319	22328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013361	CAGTA	2	10	28594	28603	40 %	20 %	20 %	20 %	260853239
12	NC_013361	ATTTA	2	10	31151	31160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013361	GCGAA	2	10	34389	34398	40 %	0 %	40 %	20 %	260853243
14	NC_013361	CCGTT	2	10	35283	35292	0 %	40 %	20 %	40 %	260853243
15	NC_013361	CACGG	2	10	35660	35669	20 %	0 %	40 %	40 %	260853243
16	NC_013361	CGAAT	2	10	38369	38378	40 %	20 %	20 %	20 %	260853248
17	NC_013361	CCATG	2	10	39907	39916	20 %	20 %	20 %	40 %	260853249
18	NC_013361	CCGTA	2	10	41553	41562	20 %	20 %	20 %	40 %	260853250
19	NC_013361	TTAAA	2	10	42291	42300	60 %	40 %	0 %	0 %	260853250
20	NC_013361	ACCCA	2	10	43034	43043	40 %	0 %	0 %	60 %	260853251
21	NC_013361	TTTGA	2	10	44661	44670	20 %	60 %	20 %	0 %	260853252
22	NC_013361	CGGCG	2	10	44912	44921	0 %	0 %	60 %	40 %	260853252
23	NC_013361	AATCA	2	10	45194	45203	60 %	20 %	0 %	20 %	260853253
24	NC_013361	CGGTT	2	10	46149	46158	0 %	40 %	40 %	20 %	260853254
25	NC_013361	TGGCG	2	10	47841	47850	0 %	20 %	60 %	20 %	260853256
26	NC_013361	TGCAC	2	10	49603	49612	20 %	20 %	20 %	40 %	260853257
27	NC_013361	AGGGC	2	10	50688	50697	20 %	0 %	60 %	20 %	260853258
28	NC_013361	GGCGC	2	10	50722	50731	0 %	0 %	60 %	40 %	260853258
29	NC_013361	GAAAC	2	10	51535	51544	60 %	0 %	20 %	20 %	260853258
30	NC_013361	ACATC	2	10	52529	52538	40 %	20 %	0 %	40 %	260853261
31	NC_013361	ACAGA	2	10	52826	52835	60 %	0 %	20 %	20 %	260853261
32	NC_013361	AACGT	2	10	54801	54810	40 %	20 %	20 %	20 %	260853264
33	NC_013361	GCGTC	2	10	57785	57794	0 %	20 %	40 %	40 %	260853267
34	NC_013361	ATGTT	2	10	58599	58608	20 %	60 %	20 %	0 %	260853268
35	NC_013361	CTTCG	2	10	59032	59041	0 %	40 %	20 %	40 %	260853268
36	NC_013361	TGCGT	2	10	59318	59327	0 %	40 %	40 %	20 %	260853268
37	NC_013361	AAAGT	2	10	65052	65061	60 %	20 %	20 %	0 %	260853271
38	NC_013361	AGTCG	2	10	66021	66030	20 %	20 %	40 %	20 %	260853272
39	NC_013361	GGTGA	2	10	67300	67309	20 %	20 %	60 %	0 %	260853272
40	NC_013361	TCGCG	2	10	69907	69916	0 %	20 %	40 %	40 %	260853274
41	NC_013361	TAGTG	2	10	77385	77394	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013361	TTGCT	2	10	77537	77546	0 %	60 %	20 %	20 %	260853281
43	NC_013361	GATGG	2	10	78273	78282	20 %	20 %	60 %	0 %	260853281
44	NC_013361	ATTTT	2	10	79101	79110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013361	CTGGA	2	10	80173	80182	20 %	20 %	40 %	20 %	260853283
46	NC_013361	CCTGG	2	10	81747	81756	0 %	20 %	40 %	40 %	260853285
47	NC_013361	CTGGT	2	10	83466	83475	0 %	40 %	40 %	20 %	260853286
48	NC_013361	GACCG	2	10	84014	84023	20 %	0 %	40 %	40 %	260853287
49	NC_013361	ATGTT	2	10	86563	86572	20 %	60 %	20 %	0 %	260853289
50	NC_013361	TGCAT	2	10	87505	87514	20 %	40 %	20 %	20 %	260853290
51	NC_013361	ATTCC	2	10	87675	87684	20 %	40 %	0 %	40 %	260853290
52	NC_013361	AGTTC	2	10	92768	92777	20 %	40 %	20 %	20 %	260853295
53	NC_013361	CGTGG	2	10	94141	94150	0 %	20 %	60 %	20 %	260853297
54	NC_013361	TATCG	2	10	94648	94657	20 %	40 %	20 %	20 %	260853297
55	NC_013361	GCCTG	2	10	98980	98989	0 %	20 %	40 %	40 %	260853301
56	NC_013361	GTTTG	2	10	99424	99433	0 %	60 %	40 %	0 %	260853301
57	NC_013361	ACCGT	2	10	100893	100902	20 %	20 %	20 %	40 %	260853302
58	NC_013361	ATCAG	2	10	102666	102675	40 %	20 %	20 %	20 %	260853304
59	NC_013361	AGCCG	2	10	104434	104443	20 %	0 %	40 %	40 %	260853305
60	NC_013361	GCGCA	2	10	106762	106771	20 %	0 %	40 %	40 %	260853307
61	NC_013361	TGGCG	2	10	107756	107765	0 %	20 %	60 %	20 %	260853308
62	NC_013361	CCGGC	2	10	110726	110735	0 %	0 %	40 %	60 %	260853311
63	NC_013361	GAAAG	2	10	114340	114349	60 %	0 %	40 %	0 %	260853313
64	NC_013361	CGCGG	2	10	115214	115223	0 %	0 %	60 %	40 %	260853315
65	NC_013361	ATCCC	2	10	117458	117467	20 %	20 %	0 %	60 %	260853318
66	NC_013361	CATCG	2	10	117471	117480	20 %	20 %	20 %	40 %	260853318
67	NC_013361	TAACG	2	10	118165	118174	40 %	20 %	20 %	20 %	260853318
68	NC_013361	ATGCC	2	10	118624	118633	20 %	20 %	20 %	40 %	260853318
69	NC_013361	AATGC	2	10	119907	119916	40 %	20 %	20 %	20 %	260853319
70	NC_013361	TCTGT	2	10	120853	120862	0 %	60 %	20 %	20 %	260853321
71	NC_013361	GCATG	2	10	121946	121955	20 %	20 %	40 %	20 %	260853322
72	NC_013361	AGCAG	2	10	123284	123293	40 %	0 %	40 %	20 %	260853324
73	NC_013361	TCAGC	2	10	124152	124161	20 %	20 %	20 %	40 %	260853324
74	NC_013361	CGAAG	2	10	125199	125208	40 %	0 %	40 %	20 %	260853325
75	NC_013361	ACACG	2	10	125332	125341	40 %	0 %	20 %	40 %	260853325
76	NC_013361	TCGCG	2	10	125593	125602	0 %	20 %	40 %	40 %	260853325
77	NC_013361	GCATC	2	10	125683	125692	20 %	20 %	20 %	40 %	260853325
78	NC_013361	GACTG	2	10	127001	127010	20 %	20 %	40 %	20 %	260853326
79	NC_013361	AGAGC	2	10	127411	127420	40 %	0 %	40 %	20 %	260853326
80	NC_013361	GGTTG	2	10	133340	133349	0 %	40 %	60 %	0 %	260853329
81	NC_013361	TCTGG	2	10	135986	135995	0 %	40 %	40 %	20 %	260853330
82	NC_013361	GGGCA	2	10	137397	137406	20 %	0 %	60 %	20 %	260853331
83	NC_013361	CAGCG	2	10	137676	137685	20 %	0 %	40 %	40 %	260853332
84	NC_013361	ACGAC	2	10	138956	138965	40 %	0 %	20 %	40 %	260853333
85	NC_013361	GGCTG	2	10	140387	140396	0 %	20 %	60 %	20 %	260853335
86	NC_013361	CCGTC	2	10	144506	144515	0 %	20 %	20 %	60 %	260853337
87	NC_013361	GTGAA	2	10	144516	144525	40 %	20 %	40 %	0 %	260853337
88	NC_013361	GGCAT	2	10	144678	144687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013361	GTTCA	2	10	144903	144912	20 %	40 %	20 %	20 %	260853338
90	NC_013361	ATCCA	2	10	145229	145238	40 %	20 %	0 %	40 %	260853338
91	NC_013361	GTAAG	2	10	145442	145451	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013361	CTTTA	2	10	146492	146501	20 %	60 %	0 %	20 %	260853340
93	NC_013361	TGGCG	2	10	146719	146728	0 %	20 %	60 %	20 %	260853340
94	NC_013361	TCCTC	2	10	147162	147171	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_013361	CGGGC	2	10	147907	147916	0 %	0 %	60 %	40 %	260853342
96	NC_013361	TTTCA	2	10	149032	149041	20 %	60 %	0 %	20 %	260853343
97	NC_013361	GGGAG	2	10	150357	150366	20 %	0 %	80 %	0 %	260853344
98	NC_013361	TGAAG	2	10	152255	152264	40 %	20 %	40 %	0 %	260853346
99	NC_013361	GCGGT	2	10	152379	152388	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013361	TTTGC	2	10	159345	159354	0 %	60 %	20 %	20 %	260853352
101	NC_013361	AAATT	2	10	159786	159795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013361	GCGAG	2	10	161153	161162	20 %	0 %	60 %	20 %	260853354
103	NC_013361	GGCGT	2	10	161591	161600	0 %	20 %	60 %	20 %	260853354
104	NC_013361	ATCAG	2	10	162229	162238	40 %	20 %	20 %	20 %	260853355
105	NC_013361	ACCAC	2	10	164494	164503	40 %	0 %	0 %	60 %	260853358
106	NC_013361	GGCGT	2	10	166197	166206	0 %	20 %	60 %	20 %	260853359
107	NC_013361	CGACG	2	10	167236	167245	20 %	0 %	40 %	40 %	260853359
108	NC_013361	TTATC	2	10	170084	170093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013361	AAAAC	2	10	171159	171168	80 %	0 %	0 %	20 %	260853361
110	NC_013361	TGGTT	2	10	171416	171425	0 %	60 %	40 %	0 %	260853361
111	NC_013361	AACCT	2	10	173497	173506	40 %	20 %	0 %	40 %	260853363
112	NC_013361	TGGTC	2	10	173539	173548	0 %	40 %	40 %	20 %	260853363
113	NC_013361	TGGCG	2	10	174784	174793	0 %	20 %	60 %	20 %	260853364
114	NC_013361	CGGCG	2	10	175495	175504	0 %	0 %	60 %	40 %	260853364
115	NC_013361	TTCCA	2	10	176025	176034	20 %	40 %	0 %	40 %	260853364
116	NC_013361	GGTCC	2	10	180348	180357	0 %	20 %	40 %	40 %	260853369
117	NC_013361	ACGGG	2	10	182265	182274	20 %	0 %	60 %	20 %	260853371
118	NC_013361	GTGAT	2	10	184424	184433	20 %	40 %	40 %	0 %	260853372
119	NC_013361	GTGAT	2	10	184715	184724	20 %	40 %	40 %	0 %	260853372
120	NC_013361	TACGT	2	10	184960	184969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013361	TGGCC	2	10	186681	186690	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013361	CCACG	2	10	186858	186867	20 %	0 %	20 %	60 %	260853375
123	NC_013361	GCCAG	2	10	189144	189153	20 %	0 %	40 %	40 %	260853377
124	NC_013361	GTTCT	2	10	190585	190594	0 %	60 %	20 %	20 %	260853377
125	NC_013361	CTGAA	2	10	192577	192586	40 %	20 %	20 %	20 %	260853379
126	NC_013361	AAGCG	2	10	192641	192650	40 %	0 %	40 %	20 %	260853379
127	NC_013361	TGGTG	2	10	194547	194556	0 %	40 %	60 %	0 %	260853381
128	NC_013361	TGCAC	2	10	194673	194682	20 %	20 %	20 %	40 %	260853381
129	NC_013361	TGCGC	2	10	195066	195075	0 %	20 %	40 %	40 %	260853381
130	NC_013361	AAATA	2	10	195288	195297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013361	GTCTG	2	10	195373	195382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013361	CATGG	2	10	196909	196918	20 %	20 %	40 %	20 %	260853383
133	NC_013361	CAGAT	2	10	197948	197957	40 %	20 %	20 %	20 %	260853384
134	NC_013361	ACTTT	2	10	198081	198090	20 %	60 %	0 %	20 %	260853384
135	NC_013361	GTTGG	2	10	198492	198501	0 %	40 %	60 %	0 %	260853385
136	NC_013361	GACGT	2	10	202001	202010	20 %	20 %	40 %	20 %	260853387
137	NC_013361	CGACG	2	10	203828	203837	20 %	0 %	40 %	40 %	260853389
138	NC_013361	ATGCC	2	10	206396	206405	20 %	20 %	20 %	40 %	260853392
139	NC_013361	GGATG	2	10	206658	206667	20 %	20 %	60 %	0 %	260853392
140	NC_013361	TGGCC	2	10	207722	207731	0 %	20 %	40 %	40 %	260853394
141	NC_013361	GTAAC	2	10	208465	208474	40 %	20 %	20 %	20 %	260853394
142	NC_013361	AGCCG	2	10	209093	209102	20 %	0 %	40 %	40 %	260853394
143	NC_013361	GGTGG	2	10	209202	209211	0 %	20 %	80 %	0 %	260853394
144	NC_013361	TTAAC	2	10	217345	217354	40 %	40 %	0 %	20 %	260853401
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147	NC_013361	TGATT	2	10	224332	224341	20 %	60 %	20 %	0 %	260853408
148	NC_013361	CGGTT	2	10	227295	227304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013361	ACAAT	2	10	235912	235921	60 %	20 %	0 %	20 %	260853415
150	NC_013361	GTGAA	2	10	236300	236309	40 %	20 %	40 %	0 %	260853415
151	NC_013361	TAATT	2	10	236484	236493	40 %	60 %	0 %	0 %	260853415
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153	NC_013361	ACTGG	2	10	239422	239431	20 %	20 %	40 %	20 %	260853418
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156	NC_013361	TGATC	2	10	244202	244211	20 %	40 %	20 %	20 %	260853424
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160	NC_013361	CGCTG	2	10	250237	250246	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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163	NC_013361	GGGCA	2	10	255514	255523	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_013361	ATTTC	2	10	256023	256032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013361	TGACC	2	10	258128	258137	20 %	20 %	20 %	40 %	260853431
166	NC_013361	GGTGT	2	10	259374	259383	0 %	40 %	60 %	0 %	260853431
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168	NC_013361	GGGCA	2	10	260831	260840	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
169	NC_013361	AAAAG	2	10	261310	261319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013361	GTAAC	2	10	261671	261680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_013361	ATATT	2	10	261793	261802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_013361	GCATC	2	10	273989	273998	20 %	20 %	20 %	40 %	260853444
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181	NC_013361	AATTA	2	10	278714	278723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013361	CTGCG	2	10	279162	279171	0 %	20 %	40 %	40 %	260853451
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187	NC_013361	ATCGC	2	10	289273	289282	20 %	20 %	20 %	40 %	260853459
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194	NC_013361	GCCGC	2	10	306078	306087	0 %	0 %	40 %	60 %	260853480
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203	NC_013361	AAAGC	2	10	324169	324178	60 %	0 %	20 %	20 %	260853500
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220	NC_013361	TTGAT	2	10	350301	350310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_013361	ATAAA	2	10	365078	365087	80 %	20 %	0 %	0 %	260853539
232	NC_013361	AAAAT	2	10	365140	365149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013361	GCAGG	2	10	366057	366066	20 %	0 %	60 %	20 %	260853540
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237	NC_013361	TCTGA	2	10	375812	375821	20 %	40 %	20 %	20 %	260853544
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239	NC_013361	ATGGC	2	10	380317	380326	20 %	20 %	40 %	20 %	260853547
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249	NC_013361	CACGG	2	10	395140	395149	20 %	0 %	40 %	40 %	260853560
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251	NC_013361	CGAAG	2	10	397940	397949	40 %	0 %	40 %	20 %	260853562
252	NC_013361	GTGGC	2	10	401399	401408	0 %	20 %	60 %	20 %	260853565
253	NC_013361	GAATA	2	10	402896	402905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_013361	TGATG	2	10	403716	403725	20 %	40 %	40 %	0 %	260853566
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257	NC_013361	CGCAG	2	10	410515	410524	20 %	0 %	40 %	40 %	260853573
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259	NC_013361	TGACC	2	10	412234	412243	20 %	20 %	20 %	40 %	260853573
260	NC_013361	TTGCG	2	10	413447	413456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_013361	TTTTC	2	10	413560	413569	0 %	80 %	0 %	20 %	260853574
262	NC_013361	CCGGT	2	10	415708	415717	0 %	20 %	40 %	40 %	260853576
263	NC_013361	TACGT	2	10	416744	416753	20 %	40 %	20 %	20 %	260853576
264	NC_013361	GCGAA	2	10	416863	416872	40 %	0 %	40 %	20 %	260853576
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499	NC_013361	CAGGG	2	10	798712	798721	20 %	0 %	60 %	20 %	260853927
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