MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 117329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013361	CAA	2	6	192207	192212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_013361	GC	3	6	192246	192251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_013361	AAC	2	6	192312	192317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013361	AC	4	8	192316	192323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_013361	TA	3	6	192396	192401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013361	CAT	2	6	192530	192535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853379
4007	NC_013361	CTGAA	2	10	192577	192586	40 %	20 %	20 %	20 %	260853379
4008	NC_013361	AAGCG	2	10	192641	192650	40 %	0 %	40 %	20 %	260853379
4009	NC_013361	GCT	2	6	192660	192665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853379
4010	NC_013361	TTC	2	6	192681	192686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853379
4011	NC_013361	GCTG	2	8	192697	192704	0 %	25 %	50 %	25 %	260853379
4012	NC_013361	AAGA	2	8	192804	192811	75 %	0 %	25 %	0 %	260853379
4013	NC_013361	AAG	2	6	192934	192939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853379
4014	NC_013361	AAC	2	6	192942	192947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853379
4015	NC_013361	ACG	3	9	193021	193029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853379
4016	NC_013361	TGC	2	6	193064	193069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853379
4017	NC_013361	GAA	2	6	193113	193118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853379
4018	NC_013361	TAA	2	6	193137	193142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853379
4019	NC_013361	GGC	2	6	193182	193187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_013361	GAGC	2	8	193233	193240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_013361	GCG	2	6	193256	193261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013361	GTA	2	6	193296	193301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013361	ATG	2	6	193454	193459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853380
4024	NC_013361	A	6	6	193466	193471	100 %	0 %	0 %	0 %	260853380
4025	NC_013361	ACTG	2	8	193474	193481	25 %	25 %	25 %	25 %	260853380
4026	NC_013361	AGC	2	6	193540	193545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4027	NC_013361	A	6	6	193547	193552	100 %	0 %	0 %	0 %	260853380
4028	NC_013361	TGC	2	6	193564	193569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4029	NC_013361	CAT	2	6	193609	193614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853380
4030	NC_013361	GACT	2	8	193633	193640	25 %	25 %	25 %	25 %	260853380
4031	NC_013361	GAA	3	9	193742	193750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853380
4032	NC_013361	CGC	2	6	193793	193798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853380
4033	NC_013361	TGC	2	6	193801	193806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4034	NC_013361	TGC	2	6	193864	193869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4035	NC_013361	TGC	2	6	193915	193920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4036	NC_013361	AAGC	2	8	193921	193928	50 %	0 %	25 %	25 %	260853380
4037	NC_013361	TCA	2	6	193935	193940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853380
4038	NC_013361	AGA	2	6	193945	193950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853380
4039	NC_013361	GAAA	2	8	194020	194027	75 %	0 %	25 %	0 %	260853380
4040	NC_013361	GAA	2	6	194056	194061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853380
4041	NC_013361	CGTT	2	8	194094	194101	0 %	50 %	25 %	25 %	260853380
4042	NC_013361	GCT	2	6	194128	194133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4043	NC_013361	GACT	2	8	194203	194210	25 %	25 %	25 %	25 %	260853380
4044	NC_013361	GCA	2	6	194213	194218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4045	NC_013361	TGC	2	6	194224	194229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853380
4046	NC_013361	GCC	2	6	194262	194267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_013361	CTT	2	6	194277	194282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_013361	GAAA	2	8	194386	194393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_013361	TGGTG	2	10	194547	194556	0 %	40 %	60 %	0 %	260853381
4050	NC_013361	TGG	2	6	194559	194564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853381
4051	NC_013361	TGCAC	2	10	194673	194682	20 %	20 %	20 %	40 %	260853381
4052	NC_013361	ACAGCT	2	12	194738	194749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260853381
4053	NC_013361	CAA	2	6	194775	194780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853381
4054	NC_013361	GTG	2	6	194785	194790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853381
4055	NC_013361	CT	3	6	194794	194799	0 %	50 %	0 %	50 %	260853381
4056	NC_013361	ACC	2	6	194824	194829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853381
4057	NC_013361	CAG	2	6	194834	194839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853381
4058	NC_013361	TGCGC	2	10	195066	195075	0 %	20 %	40 %	40 %	260853381
4059	NC_013361	AAG	2	6	195095	195100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853381
4060	NC_013361	AAT	2	6	195116	195121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853381
4061	NC_013361	ATAA	2	8	195133	195140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013361	TTG	2	6	195195	195200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013361	GC	3	6	195222	195227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_013361	AAATA	2	10	195288	195297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013361	TAA	2	6	195301	195306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013361	TG	4	8	195362	195369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013361	GTCTG	2	10	195373	195382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_013361	CTG	2	6	195517	195522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853382
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4072	NC_013361	GAA	2	6	195730	195735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853382
4073	NC_013361	CGT	2	6	195736	195741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853382
4074	NC_013361	TCGT	2	8	195758	195765	0 %	50 %	25 %	25 %	260853382
4075	NC_013361	CGT	2	6	195805	195810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853382
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4077	NC_013361	ACTG	2	8	195897	195904	25 %	25 %	25 %	25 %	260853382
4078	NC_013361	TGC	2	6	195906	195911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853382
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4082	NC_013361	GGC	2	6	196018	196023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_013361	GCA	2	6	196104	196109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853383
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4085	NC_013361	TGG	2	6	196158	196163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853383
4086	NC_013361	TC	3	6	196206	196211	0 %	50 %	0 %	50 %	260853383
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4091	NC_013361	TGC	2	6	196393	196398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853383
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4093	NC_013361	GTG	2	6	196592	196597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853383
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4095	NC_013361	TGG	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853383
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4099	NC_013361	CAGT	2	8	196817	196824	25 %	25 %	25 %	25 %	260853383
4100	NC_013361	CATGG	2	10	196909	196918	20 %	20 %	40 %	20 %	260853383
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4105	NC_013361	TG	3	6	197180	197185	0 %	50 %	50 %	0 %	260853383
4106	NC_013361	CG	3	6	197212	197217	0 %	0 %	50 %	50 %	260853383
4107	NC_013361	AG	3	6	197273	197278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013361	AGT	2	6	197335	197340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013361	T	8	8	197380	197387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013361	A	6	6	197434	197439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013361	TGT	2	6	197447	197452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853384
4112	NC_013361	A	6	6	197538	197543	100 %	0 %	0 %	0 %	260853384
4113	NC_013361	TCCG	2	8	197587	197594	0 %	25 %	25 %	50 %	260853384
4114	NC_013361	CAA	2	6	197616	197621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853384
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4121	NC_013361	G	7	7	198028	198034	0 %	0 %	100 %	0 %	260853384
4122	NC_013361	ACTTT	2	10	198081	198090	20 %	60 %	0 %	20 %	260853384
4123	NC_013361	CGT	2	6	198163	198168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853384
4124	NC_013361	CGG	2	6	198171	198176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853384
4125	NC_013361	TGA	2	6	198189	198194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853384
4126	NC_013361	CGT	2	6	198258	198263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853385
4127	NC_013361	GTT	2	6	198273	198278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853385
4128	NC_013361	GCC	2	6	198285	198290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853385
4129	NC_013361	TGG	2	6	198314	198319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853385
4130	NC_013361	TTG	2	6	198409	198414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853385
4131	NC_013361	TCA	2	6	198456	198461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853385
4132	NC_013361	GTTGG	2	10	198492	198501	0 %	40 %	60 %	0 %	260853385
4133	NC_013361	GCA	2	6	198544	198549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853385
4134	NC_013361	CTT	2	6	198606	198611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853385
4135	NC_013361	ACG	2	6	198644	198649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853385
4136	NC_013361	GCT	2	6	198675	198680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853385
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4138	NC_013361	GGT	2	6	198988	198993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853385
4139	NC_013361	TGCT	2	8	199038	199045	0 %	50 %	25 %	25 %	260853385
4140	NC_013361	TGT	2	6	199046	199051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853385
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4144	NC_013361	AAT	2	6	199353	199358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853386
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4147	NC_013361	CTGG	2	8	199433	199440	0 %	25 %	50 %	25 %	260853386
4148	NC_013361	TAT	2	6	199445	199450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853386
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4152	NC_013361	CGG	2	6	199653	199658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853386
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4154	NC_013361	CGG	2	6	199783	199788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853386
4155	NC_013361	CAAG	2	8	199789	199796	50 %	0 %	25 %	25 %	260853386
4156	NC_013361	TCG	2	6	200065	200070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853386
4157	NC_013361	TGA	2	6	200095	200100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853386
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4161	NC_013361	G	6	6	200292	200297	0 %	0 %	100 %	0 %	260853386
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4163	NC_013361	CTG	2	6	200385	200390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853386
4164	NC_013361	TC	3	6	200425	200430	0 %	50 %	0 %	50 %	260853386
4165	NC_013361	AGTT	2	8	200440	200447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_013361	GAA	2	6	200450	200455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_013361	ATA	2	6	200459	200464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_013361	GCT	2	6	200497	200502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853387
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4188	NC_013361	GTC	2	6	201707	201712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853387
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4199	NC_013361	GTT	2	6	202349	202354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853387
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4203	NC_013361	GAT	2	6	202574	202579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853387
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4207	NC_013361	GTAGTG	2	12	202920	202931	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4208	NC_013361	TTA	2	6	203034	203039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853388
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4232	NC_013361	TGA	2	6	204479	204484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853389
4233	NC_013361	CAA	2	6	204525	204530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853389
4234	NC_013361	TTA	2	6	204601	204606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_013361	ACT	2	6	204644	204649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853390
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4237	NC_013361	GAA	2	6	204737	204742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853390
4238	NC_013361	GC	3	6	204754	204759	0 %	0 %	50 %	50 %	260853390
4239	NC_013361	A	6	6	204763	204768	100 %	0 %	0 %	0 %	260853390
4240	NC_013361	TTC	2	6	204788	204793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853390
4241	NC_013361	TAC	2	6	204911	204916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853390
4242	NC_013361	GC	3	6	204935	204940	0 %	0 %	50 %	50 %	260853390
4243	NC_013361	A	6	6	204993	204998	100 %	0 %	0 %	0 %	260853390
4244	NC_013361	CGC	2	6	205001	205006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853390
4245	NC_013361	AGT	2	6	205048	205053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853390
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4364	NC_013361	TGA	2	6	211409	211414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853395
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4366	NC_013361	CG	3	6	211437	211442	0 %	0 %	50 %	50 %	260853395
4367	NC_013361	TCG	2	6	211462	211467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853395
4368	NC_013361	GTC	2	6	211489	211494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853395
4369	NC_013361	TGA	2	6	211498	211503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853395
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4372	NC_013361	ATC	2	6	211629	211634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853395
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4375	NC_013361	GGC	2	6	211776	211781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853395
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4377	NC_013361	TGC	2	6	211816	211821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853395
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4384	NC_013361	TCG	2	6	212081	212086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853395
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4387	NC_013361	AAGG	2	8	212193	212200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_013361	AGG	2	6	212208	212213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_013361	CAT	2	6	212224	212229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853396
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4392	NC_013361	ATCA	2	8	212426	212433	50 %	25 %	0 %	25 %	260853396
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4403	NC_013361	CGC	2	6	212908	212913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853396
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4429	NC_013361	CCG	2	6	214606	214611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853397
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4432	NC_013361	CGC	2	6	214817	214822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4433	NC_013361	CAT	2	6	214867	214872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853398
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4439	NC_013361	TGG	2	6	215094	215099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853398
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4448	NC_013361	CTG	2	6	215546	215551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853398
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4470	NC_013361	TCAT	2	8	216465	216472	25 %	50 %	0 %	25 %	260853399
4471	NC_013361	TGC	2	6	216510	216515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853400
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4473	NC_013361	TTCA	2	8	216558	216565	25 %	50 %	0 %	25 %	260853400
4474	NC_013361	CCT	2	6	216670	216675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4475	NC_013361	CCT	2	6	216805	216810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4476	NC_013361	CT	3	6	216905	216910	0 %	50 %	0 %	50 %	260853401
4477	NC_013361	GC	3	6	216918	216923	0 %	0 %	50 %	50 %	260853401
4478	NC_013361	ATG	2	6	216948	216953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853401
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4482	NC_013361	GCG	2	6	217097	217102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853401
4483	NC_013361	GCG	2	6	217161	217166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853401
4484	NC_013361	TGG	2	6	217173	217178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853401
4485	NC_013361	TG	3	6	217197	217202	0 %	50 %	50 %	0 %	260853401
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4487	NC_013361	AAT	2	6	217332	217337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853401
4488	NC_013361	TTAAC	2	10	217345	217354	40 %	40 %	0 %	20 %	260853401
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4491	NC_013361	GCA	2	6	217453	217458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853402
4492	NC_013361	TAA	2	6	217462	217467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853402
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4497	NC_013361	AAC	2	6	217666	217671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853402
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4499	NC_013361	AAG	2	6	217797	217802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_013361	A	6	6	217815	217820	100 %	0 %	0 %	0 %	260853403

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