MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 117329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013361	CAACAG	2	12	168536	168547	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260853360
3502	NC_013361	ATT	2	6	168548	168553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853360
3503	NC_013361	TC	3	6	168618	168623	0 %	50 %	0 %	50 %	260853360
3504	NC_013361	CAGC	2	8	168626	168633	25 %	0 %	25 %	50 %	260853360
3505	NC_013361	TC	3	6	168691	168696	0 %	50 %	0 %	50 %	260853360
3506	NC_013361	GCC	2	6	168752	168757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853360
3507	NC_013361	GAA	2	6	168778	168783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
3508	NC_013361	GTC	2	6	168821	168826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3509	NC_013361	GTG	2	6	168837	168842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3510	NC_013361	GGT	2	6	168860	168865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3511	NC_013361	CGT	2	6	168908	168913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3512	NC_013361	AGCC	2	8	168959	168966	25 %	0 %	25 %	50 %	260853360
3513	NC_013361	ATG	2	6	169050	169055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853360
3514	NC_013361	CGT	2	6	169058	169063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3515	NC_013361	TGG	2	6	169089	169094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3516	NC_013361	CTGC	2	8	169151	169158	0 %	25 %	25 %	50 %	260853360
3517	NC_013361	TGC	2	6	169221	169226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3518	NC_013361	GCG	2	6	169284	169289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853360
3519	NC_013361	GGC	2	6	169390	169395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853360
3520	NC_013361	GCA	2	6	169417	169422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3521	NC_013361	GGT	2	6	169423	169428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3522	NC_013361	GTC	2	6	169443	169448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3523	NC_013361	CAA	2	6	169501	169506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853360
3524	NC_013361	GCA	2	6	169539	169544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3525	NC_013361	AAC	2	6	169574	169579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853360
3526	NC_013361	CGC	2	6	169653	169658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853360
3527	NC_013361	AGA	2	6	169675	169680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
3528	NC_013361	ACG	2	6	169704	169709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3529	NC_013361	TTTG	2	8	169715	169722	0 %	75 %	25 %	0 %	260853360
3530	NC_013361	CAG	2	6	169778	169783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3531	NC_013361	GCA	3	9	169792	169800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3532	NC_013361	TCT	2	6	169826	169831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853360
3533	NC_013361	GCA	2	6	169837	169842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3534	NC_013361	GTA	2	6	169920	169925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853360
3535	NC_013361	CTTT	2	8	170001	170008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_013361	GTT	2	6	170016	170021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013361	TTATC	2	10	170084	170093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3538	NC_013361	TAA	2	6	170098	170103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013361	GTA	2	6	170204	170209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853361
3540	NC_013361	AGA	2	6	170263	170268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853361
3541	NC_013361	ACCGTT	2	12	170276	170287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260853361
3542	NC_013361	CTG	2	6	170319	170324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3543	NC_013361	GCG	2	6	170333	170338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853361
3544	NC_013361	TGT	2	6	170401	170406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853361
3545	NC_013361	CCG	2	6	170409	170414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853361
3546	NC_013361	AAG	2	6	170448	170453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853361
3547	NC_013361	ACC	2	6	170511	170516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853361
3548	NC_013361	GGC	2	6	170684	170689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853361
3549	NC_013361	ACC	2	6	170717	170722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853361
3550	NC_013361	AAG	2	6	170733	170738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853361
3551	NC_013361	GAT	2	6	170801	170806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853361
3552	NC_013361	CAG	2	6	170858	170863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3553	NC_013361	AGA	2	6	170872	170877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853361
3554	NC_013361	GAT	2	6	170918	170923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853361
3555	NC_013361	CCTT	2	8	170937	170944	0 %	50 %	0 %	50 %	260853361
3556	NC_013361	TTA	2	6	170974	170979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853361
3557	NC_013361	GAA	2	6	171058	171063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853361
3558	NC_013361	AAAAC	2	10	171159	171168	80 %	0 %	0 %	20 %	260853361
3559	NC_013361	CGT	2	6	171283	171288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3560	NC_013361	TGA	3	9	171289	171297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853361
3561	NC_013361	CTG	2	6	171368	171373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3562	NC_013361	TATGCG	2	12	171388	171399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260853361
3563	NC_013361	TGGTT	2	10	171416	171425	0 %	60 %	40 %	0 %	260853361
3564	NC_013361	ACG	2	6	171426	171431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3565	NC_013361	AAAC	2	8	171536	171543	75 %	0 %	0 %	25 %	260853361
3566	NC_013361	GAC	2	6	171646	171651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3567	NC_013361	TGA	2	6	171661	171666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853361
3568	NC_013361	GTG	3	9	171684	171692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853361
3569	NC_013361	CTT	2	6	171753	171758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853361
3570	NC_013361	CAA	2	6	171886	171891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853361
3571	NC_013361	CTT	2	6	171916	171921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853361
3572	NC_013361	GCG	2	6	171974	171979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853361
3573	NC_013361	ACC	2	6	172034	172039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853361
3574	NC_013361	TAC	2	6	172042	172047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853361
3575	NC_013361	CTT	2	6	172111	172116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853361
3576	NC_013361	GGT	2	6	172151	172156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853361
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3578	NC_013361	GCT	2	6	172320	172325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3579	NC_013361	GCT	2	6	172338	172343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853361
3580	NC_013361	GCAACC	2	12	172370	172381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260853361
3581	NC_013361	TCA	2	6	172620	172625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853362
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3584	NC_013361	GCA	2	6	172716	172721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853362
3585	NC_013361	TCC	2	6	172725	172730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853362
3586	NC_013361	CGTG	2	8	172746	172753	0 %	25 %	50 %	25 %	260853362
3587	NC_013361	TGG	2	6	172757	172762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853362
3588	NC_013361	GC	3	6	172787	172792	0 %	0 %	50 %	50 %	260853362
3589	NC_013361	TC	3	6	172884	172889	0 %	50 %	0 %	50 %	260853362
3590	NC_013361	GGC	2	6	172891	172896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853362
3591	NC_013361	TGG	2	6	172925	172930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853362
3592	NC_013361	CGA	2	6	172956	172961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853362
3593	NC_013361	CCA	2	6	172986	172991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853362
3594	NC_013361	TGC	2	6	173054	173059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853362
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3597	NC_013361	GCG	2	6	173153	173158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853362
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3599	NC_013361	TGC	2	6	173214	173219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853362
3600	NC_013361	TGA	2	6	173239	173244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853362
3601	NC_013361	GTT	2	6	173300	173305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853363
3602	NC_013361	CGG	2	6	173329	173334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853363
3603	NC_013361	CTG	2	6	173385	173390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853363
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3605	NC_013361	AACCT	2	10	173497	173506	40 %	20 %	0 %	40 %	260853363
3606	NC_013361	CTG	2	6	173511	173516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853363
3607	NC_013361	CGT	2	6	173530	173535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853363
3608	NC_013361	TGGTC	2	10	173539	173548	0 %	40 %	40 %	20 %	260853363
3609	NC_013361	GCA	2	6	173688	173693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853363
3610	NC_013361	GCA	2	6	173728	173733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853363
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3612	NC_013361	CTG	2	6	173772	173777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853363
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3615	NC_013361	ATCG	2	8	173910	173917	25 %	25 %	25 %	25 %	260853363
3616	NC_013361	GGC	2	6	173921	173926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853363
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3618	NC_013361	CAGT	2	8	174229	174236	25 %	25 %	25 %	25 %	260853364
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3620	NC_013361	GAT	2	6	174280	174285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853364
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3852	NC_013361	TCA	2	6	184929	184934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3853	NC_013361	TACGT	2	10	184960	184969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3854	NC_013361	GGA	2	6	184997	185002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3855	NC_013361	TGGC	2	8	185007	185014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3856	NC_013361	CAT	2	6	185061	185066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853373
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3859	NC_013361	ATG	2	6	185341	185346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853373
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3985	NC_013361	ACG	2	6	191466	191471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853378
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4000	NC_013361	AT	4	8	192080	192087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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