MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 117329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013361	TGG	2	6	144570	144575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853337
3002	NC_013361	CTG	2	6	144635	144640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853337
3003	NC_013361	GGCAT	2	10	144678	144687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3004	NC_013361	TGG	2	6	144764	144769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853338
3005	NC_013361	GCA	2	6	144788	144793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853338
3006	NC_013361	CGT	2	6	144797	144802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853338
3007	NC_013361	TGG	2	6	144866	144871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853338
3008	NC_013361	GTTCA	2	10	144903	144912	20 %	40 %	20 %	20 %	260853338
3009	NC_013361	CA	3	6	144911	144916	50 %	0 %	0 %	50 %	260853338
3010	NC_013361	GCA	2	6	144989	144994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853338
3011	NC_013361	GTT	2	6	144999	145004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853338
3012	NC_013361	CGC	3	9	145043	145051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853338
3013	NC_013361	ATA	2	6	145069	145074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853338
3014	NC_013361	ATCCA	2	10	145229	145238	40 %	20 %	0 %	40 %	260853338
3015	NC_013361	A	6	6	145275	145280	100 %	0 %	0 %	0 %	260853338
3016	NC_013361	CCA	2	6	145295	145300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853338
3017	NC_013361	TTG	2	6	145321	145326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853338
3018	NC_013361	TGA	2	6	145328	145333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853338
3019	NC_013361	AAT	2	6	145375	145380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013361	GTAAG	2	10	145442	145451	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013361	A	7	7	145491	145497	100 %	0 %	0 %	0 %	260853339
3022	NC_013361	GGC	2	6	145506	145511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853339
3023	NC_013361	TAT	2	6	145607	145612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853339
3024	NC_013361	CT	3	6	145616	145621	0 %	50 %	0 %	50 %	260853339
3025	NC_013361	TAAA	2	8	145624	145631	75 %	25 %	0 %	0 %	260853339
3026	NC_013361	CGGG	2	8	145637	145644	0 %	0 %	75 %	25 %	260853339
3027	NC_013361	GCA	2	6	145745	145750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853339
3028	NC_013361	CAGG	2	8	145764	145771	25 %	0 %	50 %	25 %	260853339
3029	NC_013361	TAC	2	6	145773	145778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853339
3030	NC_013361	AGC	2	6	145825	145830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853339
3031	NC_013361	AACG	2	8	145851	145858	50 %	0 %	25 %	25 %	260853339
3032	NC_013361	ACT	2	6	145928	145933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853339
3033	NC_013361	CGA	2	6	145940	145945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853339
3034	NC_013361	ACCG	2	8	145946	145953	25 %	0 %	25 %	50 %	260853339
3035	NC_013361	CGC	2	6	145974	145979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853339
3036	NC_013361	CAC	2	6	146018	146023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853339
3037	NC_013361	CAT	2	6	146024	146029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853339
3038	NC_013361	CAC	2	6	146033	146038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853339
3039	NC_013361	AC	3	6	146037	146042	50 %	0 %	0 %	50 %	260853339
3040	NC_013361	GAA	2	6	146049	146054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853339
3041	NC_013361	ATT	2	6	146082	146087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853339
3042	NC_013361	TGG	2	6	146101	146106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853339
3043	NC_013361	GCT	2	6	146126	146131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853339
3044	NC_013361	TGC	2	6	146245	146250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853339
3045	NC_013361	TGTT	2	8	146344	146351	0 %	75 %	25 %	0 %	260853339
3046	NC_013361	ATG	2	6	146384	146389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853339
3047	NC_013361	GCC	2	6	146470	146475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853340
3048	NC_013361	TCA	2	6	146478	146483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853340
3049	NC_013361	CTTTA	2	10	146492	146501	20 %	60 %	0 %	20 %	260853340
3050	NC_013361	ATG	2	6	146585	146590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853340
3051	NC_013361	TCA	2	6	146624	146629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853340
3052	NC_013361	T	6	6	146630	146635	0 %	100 %	0 %	0 %	260853340
3053	NC_013361	GCT	2	6	146665	146670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853340
3054	NC_013361	ATT	2	6	146696	146701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853340
3055	NC_013361	CGG	2	6	146713	146718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853340
3056	NC_013361	TGGCG	2	10	146719	146728	0 %	20 %	60 %	20 %	260853340
3057	NC_013361	TGTT	2	8	146736	146743	0 %	75 %	25 %	0 %	260853340
3058	NC_013361	T	6	6	146771	146776	0 %	100 %	0 %	0 %	260853340
3059	NC_013361	CGG	2	6	146829	146834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853340
3060	NC_013361	GCC	2	6	146965	146970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853340
3061	NC_013361	ATG	2	6	147048	147053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853340
3062	NC_013361	TGG	2	6	147081	147086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853340
3063	NC_013361	ACGTGG	2	12	147130	147141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260853340
3064	NC_013361	TCCTC	2	10	147162	147171	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3065	NC_013361	GAG	2	6	147185	147190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013361	CAA	2	6	147214	147219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_013361	AGG	2	6	147247	147252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013361	A	6	6	147322	147327	100 %	0 %	0 %	0 %	260853341
3069	NC_013361	CTT	2	6	147337	147342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853341
3070	NC_013361	ATG	2	6	147397	147402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853341
3071	NC_013361	TCT	2	6	147443	147448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853341
3072	NC_013361	ATT	2	6	147489	147494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853341
3073	NC_013361	GAT	2	6	147555	147560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853341
3074	NC_013361	TGGG	2	8	147614	147621	0 %	25 %	75 %	0 %	260853341
3075	NC_013361	AGT	2	6	147631	147636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853341
3076	NC_013361	CAA	3	9	147646	147654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853341
3077	NC_013361	A	7	7	147653	147659	100 %	0 %	0 %	0 %	260853341
3078	NC_013361	GTT	2	6	147737	147742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013361	T	6	6	147756	147761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013361	ACAA	2	8	147767	147774	75 %	0 %	0 %	25 %	260853342
3081	NC_013361	CTG	2	6	147787	147792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853342
3082	NC_013361	TGC	2	6	147855	147860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853342
3083	NC_013361	CGGGC	2	10	147907	147916	0 %	0 %	60 %	40 %	260853342
3084	NC_013361	TTA	2	6	147948	147953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853342
3085	NC_013361	CAA	2	6	148050	148055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853342
3086	NC_013361	GC	3	6	148241	148246	0 %	0 %	50 %	50 %	260853342
3087	NC_013361	GAA	2	6	148306	148311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853342
3088	NC_013361	CGA	2	6	148334	148339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853342
3089	NC_013361	GAA	2	6	148431	148436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853342
3090	NC_013361	GGT	2	6	148461	148466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853342
3091	NC_013361	TGA	2	6	148476	148481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853342
3092	NC_013361	TGT	2	6	148551	148556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853342
3093	NC_013361	T	6	6	148671	148676	0 %	100 %	0 %	0 %	260853342
3094	NC_013361	CGC	2	6	148756	148761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853342
3095	NC_013361	GCA	2	6	148837	148842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853342
3096	NC_013361	GTT	2	6	148908	148913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853342
3097	NC_013361	TTTCA	2	10	149032	149041	20 %	60 %	0 %	20 %	260853343
3098	NC_013361	CTT	2	6	149085	149090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853343
3099	NC_013361	GAT	2	6	149116	149121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853343
3100	NC_013361	GCC	2	6	149150	149155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853343
3101	NC_013361	AAT	2	6	149170	149175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853343
3102	NC_013361	GCA	2	6	149358	149363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853343
3103	NC_013361	CAG	2	6	149493	149498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013361	GCT	2	6	149560	149565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_013361	ACA	2	6	149629	149634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_013361	GATG	2	8	149649	149656	25 %	25 %	50 %	0 %	260853344
3107	NC_013361	ATG	2	6	149675	149680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853344
3108	NC_013361	AG	3	6	149808	149813	50 %	0 %	50 %	0 %	260853344
3109	NC_013361	TGT	2	6	149880	149885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853344
3110	NC_013361	AAGC	2	8	149898	149905	50 %	0 %	25 %	25 %	260853344
3111	NC_013361	ATG	2	6	149929	149934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853344
3112	NC_013361	TGC	2	6	149946	149951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853344
3113	NC_013361	TGG	2	6	149993	149998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853344
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3115	NC_013361	ACG	2	6	150084	150089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853344
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3118	NC_013361	ACT	2	6	150177	150182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853344
3119	NC_013361	AGTT	2	8	150269	150276	25 %	50 %	25 %	0 %	260853344
3120	NC_013361	TGC	2	6	150293	150298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853344
3121	NC_013361	GA	3	6	150342	150347	50 %	0 %	50 %	0 %	260853344
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3123	NC_013361	ATG	2	6	150370	150375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853344
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3248	NC_013361	TTA	2	6	156933	156938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853350
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3355	NC_013361	ATCAG	2	10	162229	162238	40 %	20 %	20 %	20 %	260853355
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3359	NC_013361	TCG	2	6	162352	162357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853355
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3368	NC_013361	GCG	2	6	162736	162741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853355
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3370	NC_013361	TG	3	6	162799	162804	0 %	50 %	50 %	0 %	260853355
3371	NC_013361	A	6	6	162823	162828	100 %	0 %	0 %	0 %	260853355
3372	NC_013361	AGCC	2	8	162881	162888	25 %	0 %	25 %	50 %	260853356
3373	NC_013361	CAGC	2	8	162908	162915	25 %	0 %	25 %	50 %	260853356
3374	NC_013361	GC	3	6	162948	162953	0 %	0 %	50 %	50 %	260853356
3375	NC_013361	T	6	6	163020	163025	0 %	100 %	0 %	0 %	260853356
3376	NC_013361	TCT	2	6	163031	163036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853356
3377	NC_013361	CTT	2	6	163094	163099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853356
3378	NC_013361	GCT	2	6	163135	163140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853356
3379	NC_013361	ACG	2	6	163209	163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853356
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3381	NC_013361	CTT	2	6	163325	163330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853356
3382	NC_013361	TG	3	6	163449	163454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3383	NC_013361	TTAC	2	8	163500	163507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3384	NC_013361	TAC	2	6	163510	163515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853357
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3388	NC_013361	GC	3	6	163641	163646	0 %	0 %	50 %	50 %	260853357
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3393	NC_013361	GT	3	6	164020	164025	0 %	50 %	50 %	0 %	260853357
3394	NC_013361	A	6	6	164158	164163	100 %	0 %	0 %	0 %	260853357
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3402	NC_013361	TCA	2	6	164529	164534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853358
3403	NC_013361	TCCG	2	8	164563	164570	0 %	25 %	25 %	50 %	260853358
3404	NC_013361	CGG	2	6	164644	164649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853358
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3407	NC_013361	GAA	2	6	164807	164812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3408	NC_013361	GTC	2	6	164837	164842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
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3467	NC_013361	TCT	3	9	167327	167335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3480	NC_013361	GCT	2	6	167773	167778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
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3485	NC_013361	ATC	2	6	167928	167933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853360
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3490	NC_013361	GTTT	2	8	168033	168040	0 %	75 %	25 %	0 %	260853360
3491	NC_013361	TGG	2	6	168069	168074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3492	NC_013361	AGA	2	6	168091	168096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
3493	NC_013361	CCG	2	6	168165	168170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853360
3494	NC_013361	CGAA	2	8	168258	168265	50 %	0 %	25 %	25 %	260853360
3495	NC_013361	CG	3	6	168289	168294	0 %	0 %	50 %	50 %	260853360
3496	NC_013361	GCG	2	6	168351	168356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853360
3497	NC_013361	AGA	2	6	168412	168417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
3498	NC_013361	CAG	2	6	168431	168436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3499	NC_013361	TGC	2	6	168522	168527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3500	NC_013361	CTG	2	6	168530	168535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360

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