MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 117329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013361	TTAAT	2	10	22319	22328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013361	ACT	2	6	22344	22349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013361	TTG	2	6	22411	22416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013361	ATT	2	6	22420	22425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013361	TAA	2	6	22435	22440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013361	GT	3	6	22686	22691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013361	TC	3	6	22692	22697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_013361	CAT	2	6	22701	22706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013361	AGC	2	6	22710	22715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013361	A	7	7	22722	22728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013361	TTG	2	6	22783	22788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853233
512	NC_013361	AGC	2	6	22848	22853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853233
513	NC_013361	GCA	2	6	22897	22902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853233
514	NC_013361	TGA	2	6	22940	22945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853233
515	NC_013361	CAT	2	6	22953	22958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853233
516	NC_013361	GC	3	6	23005	23010	0 %	0 %	50 %	50 %	260853233
517	NC_013361	CTT	2	6	23100	23105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013361	GCA	2	6	23223	23228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853234
519	NC_013361	TTC	2	6	23239	23244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853234
520	NC_013361	CTT	2	6	23276	23281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853234
521	NC_013361	CATA	2	8	23382	23389	50 %	25 %	0 %	25 %	260853235
522	NC_013361	AAG	2	6	23408	23413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853235
523	NC_013361	GT	3	6	23415	23420	0 %	50 %	50 %	0 %	260853235
524	NC_013361	CG	3	6	23461	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	260853235
525	NC_013361	GAA	2	6	23485	23490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853235
526	NC_013361	GCGCAA	2	12	23493	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
527	NC_013361	GGTGAT	2	12	23511	23522	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260853235
528	NC_013361	TGCG	2	8	23638	23645	0 %	25 %	50 %	25 %	260853235
529	NC_013361	TCA	2	6	23684	23689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853235
530	NC_013361	TCT	2	6	23694	23699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853235
531	NC_013361	TGA	2	6	23736	23741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853235
532	NC_013361	TTA	2	6	23779	23784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853235
533	NC_013361	GCGT	2	8	23846	23853	0 %	25 %	50 %	25 %	260853235
534	NC_013361	CAG	2	6	23856	23861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
535	NC_013361	TCTGGC	2	12	23895	23906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853235
536	NC_013361	TGA	2	6	23958	23963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853235
537	NC_013361	CAG	2	6	24124	24129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
538	NC_013361	AGT	2	6	24183	24188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853235
539	NC_013361	A	7	7	24196	24202	100 %	0 %	0 %	0 %	260853235
540	NC_013361	AGC	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853235
541	NC_013361	TGA	2	6	24258	24263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853235
542	NC_013361	CCGC	2	8	24269	24276	0 %	0 %	25 %	75 %	260853235
543	NC_013361	T	6	6	24280	24285	0 %	100 %	0 %	0 %	260853235
544	NC_013361	TGA	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
545	NC_013361	TGA	3	9	24447	24455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
546	NC_013361	CAT	2	6	24465	24470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853236
547	NC_013361	A	6	6	24481	24486	100 %	0 %	0 %	0 %	260853236
548	NC_013361	A	7	7	24490	24496	100 %	0 %	0 %	0 %	260853236
549	NC_013361	ATG	2	6	24509	24514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
550	NC_013361	CCT	2	6	24517	24522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853236
551	NC_013361	GCA	2	6	24533	24538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853236
552	NC_013361	CTGG	2	8	24626	24633	0 %	25 %	50 %	25 %	260853236
553	NC_013361	CCG	3	9	24701	24709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853236
554	NC_013361	CAT	2	6	24840	24845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853236
555	NC_013361	CG	3	6	24847	24852	0 %	0 %	50 %	50 %	260853236
556	NC_013361	ATC	2	6	24862	24867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853236
557	NC_013361	GCGGAA	2	12	24934	24945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260853236
558	NC_013361	CTGC	2	8	25087	25094	0 %	25 %	25 %	50 %	260853236
559	NC_013361	TGC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
560	NC_013361	GAC	2	6	25369	25374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853236
561	NC_013361	TCG	2	6	25493	25498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
562	NC_013361	GCT	2	6	25503	25508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
563	NC_013361	GC	3	6	25520	25525	0 %	0 %	50 %	50 %	260853236
564	NC_013361	TGC	2	6	25526	25531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
565	NC_013361	GCA	2	6	25545	25550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853236
566	NC_013361	TGC	2	6	25561	25566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
567	NC_013361	ATC	2	6	25585	25590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853236
568	NC_013361	CG	3	6	25594	25599	0 %	0 %	50 %	50 %	260853236
569	NC_013361	CGC	2	6	25601	25606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853236
570	NC_013361	TGCG	2	8	25637	25644	0 %	25 %	50 %	25 %	260853236
571	NC_013361	GAA	2	6	25828	25833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853236
572	NC_013361	GTG	2	6	25869	25874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853236
573	NC_013361	TGT	2	6	25977	25982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853236
574	NC_013361	TGGT	2	8	26049	26056	0 %	50 %	50 %	0 %	260853236
575	NC_013361	CGC	2	6	26183	26188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853236
576	NC_013361	TGA	2	6	26195	26200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
577	NC_013361	TGC	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
578	NC_013361	TCG	2	6	26304	26309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
579	NC_013361	CG	3	6	26322	26327	0 %	0 %	50 %	50 %	260853236
580	NC_013361	CTG	2	6	26332	26337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
581	NC_013361	TGG	2	6	26390	26395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853236
582	NC_013361	CAT	2	6	26535	26540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853236
583	NC_013361	CGT	2	6	26581	26586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
584	NC_013361	TGA	2	6	26661	26666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
585	NC_013361	GTGG	2	8	26842	26849	0 %	25 %	75 %	0 %	260853236
586	NC_013361	GGC	2	6	26892	26897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853236
587	NC_013361	CTG	2	6	26978	26983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
588	NC_013361	CAG	2	6	26989	26994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853236
589	NC_013361	GCT	2	6	27056	27061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853236
590	NC_013361	CGGTGA	2	12	27135	27146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260853236
591	NC_013361	TGA	2	6	27163	27168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853236
592	NC_013361	GCTG	2	8	27196	27203	0 %	25 %	50 %	25 %	260853237
593	NC_013361	TGG	2	6	27208	27213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853237
594	NC_013361	GCA	2	6	27238	27243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853237
595	NC_013361	TCC	2	6	27253	27258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853237
596	NC_013361	GCG	2	6	27330	27335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853237
597	NC_013361	GCG	2	6	27355	27360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853237
598	NC_013361	TGA	2	6	27418	27423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853237
599	NC_013361	ATT	2	6	27474	27479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853237
600	NC_013361	GGC	2	6	27480	27485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853237
601	NC_013361	GC	3	6	27484	27489	0 %	0 %	50 %	50 %	260853237
602	NC_013361	T	6	6	27629	27634	0 %	100 %	0 %	0 %	260853237
603	NC_013361	A	6	6	27648	27653	100 %	0 %	0 %	0 %	260853237
604	NC_013361	AAT	2	6	27655	27660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853237
605	NC_013361	TGC	2	6	27688	27693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013361	GAT	2	6	27804	27809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853238
607	NC_013361	CAC	2	6	27812	27817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853238
608	NC_013361	CAA	2	6	27833	27838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853238
609	NC_013361	ACC	2	6	27927	27932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853238
610	NC_013361	GCG	2	6	27951	27956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853238
611	NC_013361	CCG	2	6	27995	28000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853238
612	NC_013361	ATGG	2	8	28056	28063	25 %	25 %	50 %	0 %	260853238
613	NC_013361	TTG	2	6	28259	28264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853239
614	NC_013361	AT	3	6	28294	28299	50 %	50 %	0 %	0 %	260853239
615	NC_013361	GAA	2	6	28537	28542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853239
616	NC_013361	CAGTA	2	10	28594	28603	40 %	20 %	20 %	20 %	260853239
617	NC_013361	TG	3	6	28644	28649	0 %	50 %	50 %	0 %	260853239
618	NC_013361	TGG	2	6	28850	28855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853239
619	NC_013361	CTC	2	6	28869	28874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853239
620	NC_013361	CG	3	6	28918	28923	0 %	0 %	50 %	50 %	260853239
621	NC_013361	TTGA	2	8	28927	28934	25 %	50 %	25 %	0 %	260853239
622	NC_013361	TGG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853239
623	NC_013361	GCA	2	6	29043	29048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853239
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625	NC_013361	GAA	2	6	29086	29091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853239
626	NC_013361	AGC	2	6	29155	29160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013361	T	6	6	29197	29202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013361	GCC	2	6	29271	29276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853240
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761	NC_013361	GGC	2	6	35617	35622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
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877	NC_013361	CCGTA	2	10	41553	41562	20 %	20 %	20 %	40 %	260853250
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