MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009

Total Repeats: 3517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013353	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	260842241
2	NC_013353	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	260842242
3	NC_013353	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	260842245
4	NC_013353	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	260842248
5	NC_013353	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	260842249
6	NC_013353	CGCGC	2	10	12053	12062	0 %	0 %	40 %	60 %	260842251
7	NC_013353	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	260842257
8	NC_013353	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	260842257
9	NC_013353	GTTTT	2	10	20575	20584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013353	ATTGC	2	10	22953	22962	20 %	40 %	20 %	20 %	260842259
11	NC_013353	TTAAT	2	10	23588	23597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013353	CAGTA	2	10	29863	29872	40 %	20 %	20 %	20 %	260842266
13	NC_013353	ATTTA	2	10	32420	32429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013353	ATGTT	2	10	32471	32480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013353	GCGAA	2	10	35658	35667	40 %	0 %	40 %	20 %	260842270
16	NC_013353	CCGTT	2	10	36552	36561	0 %	40 %	20 %	40 %	260842270
17	NC_013353	CACGG	2	10	36929	36938	20 %	0 %	40 %	40 %	260842270
18	NC_013353	CGAAT	2	10	39638	39647	40 %	20 %	20 %	20 %	260842275
19	NC_013353	CCATG	2	10	41176	41185	20 %	20 %	20 %	40 %	260842276
20	NC_013353	CCGTA	2	10	42822	42831	20 %	20 %	20 %	40 %	260842277
21	NC_013353	GTACA	2	10	43312	43321	40 %	20 %	20 %	20 %	260842277
22	NC_013353	TTAAA	2	10	43560	43569	60 %	40 %	0 %	0 %	260842277
23	NC_013353	ACCCA	2	10	44303	44312	40 %	0 %	0 %	60 %	260842278
24	NC_013353	TTTGA	2	10	45930	45939	20 %	60 %	20 %	0 %	260842279
25	NC_013353	CGGCG	2	10	46181	46190	0 %	0 %	60 %	40 %	260842279
26	NC_013353	AATCA	2	10	46463	46472	60 %	20 %	0 %	20 %	260842280
27	NC_013353	CGGTT	2	10	47418	47427	0 %	40 %	40 %	20 %	260842281
28	NC_013353	TGGCG	2	10	49110	49119	0 %	20 %	60 %	20 %	260842283
29	NC_013353	TGCAC	2	10	50872	50881	20 %	20 %	20 %	40 %	260842284
30	NC_013353	AGGGC	2	10	51957	51966	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013353	GGCGC	2	10	51991	52000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013353	GAAAC	2	10	52804	52813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013353	AACGT	2	10	54716	54725	40 %	20 %	20 %	20 %	260842287
34	NC_013353	GCGTC	2	10	57700	57709	0 %	20 %	40 %	40 %	260842290
35	NC_013353	ATGTT	2	10	58514	58523	20 %	60 %	20 %	0 %	260842291
36	NC_013353	CTTCG	2	10	58947	58956	0 %	40 %	20 %	40 %	260842291
37	NC_013353	TGCGT	2	10	59233	59242	0 %	40 %	40 %	20 %	260842291
38	NC_013353	AAAGT	2	10	64967	64976	60 %	20 %	20 %	0 %	260842294
39	NC_013353	AGTCG	2	10	65936	65945	20 %	20 %	40 %	20 %	260842295
40	NC_013353	GGTGA	2	10	67215	67224	20 %	20 %	60 %	0 %	260842295
41	NC_013353	TCGCG	2	10	69853	69862	0 %	20 %	40 %	40 %	260842297
42	NC_013353	TAGTG	2	10	77331	77340	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013353	GATGG	2	10	78219	78228	20 %	20 %	60 %	0 %	260842304
44	NC_013353	ATTTT	2	10	79047	79056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013353	CTGGA	2	10	80119	80128	20 %	20 %	40 %	20 %	260842306
46	NC_013353	CCTGG	2	10	81693	81702	0 %	20 %	40 %	40 %	260842308
47	NC_013353	CTGGT	2	10	83412	83421	0 %	40 %	40 %	20 %	260842309
48	NC_013353	GACCG	2	10	83960	83969	20 %	0 %	40 %	40 %	260842310
49	NC_013353	ATGTT	2	10	86509	86518	20 %	60 %	20 %	0 %	260842312
50	NC_013353	TGCAT	2	10	87451	87460	20 %	40 %	20 %	20 %	260842313
51	NC_013353	ATTCC	2	10	87621	87630	20 %	40 %	0 %	40 %	260842313
52	NC_013353	AGTTC	2	10	92714	92723	20 %	40 %	20 %	20 %	260842318
53	NC_013353	CGTGG	2	10	94087	94096	0 %	20 %	60 %	20 %	260842320
54	NC_013353	TATCG	2	10	94594	94603	20 %	40 %	20 %	20 %	260842320
55	NC_013353	GCCTG	2	10	98926	98935	0 %	20 %	40 %	40 %	260842324
56	NC_013353	GTTTG	2	10	99370	99379	0 %	60 %	40 %	0 %	260842324
57	NC_013353	ACCGT	2	10	100839	100848	20 %	20 %	20 %	40 %	260842325
58	NC_013353	ATCAG	2	10	102612	102621	40 %	20 %	20 %	20 %	260842327
59	NC_013353	AGCCG	2	10	104380	104389	20 %	0 %	40 %	40 %	260842328
60	NC_013353	GCGCA	2	10	106708	106717	20 %	0 %	40 %	40 %	260842330
61	NC_013353	TGGCG	2	10	107702	107711	0 %	20 %	60 %	20 %	260842331
62	NC_013353	CCGGC	2	10	110672	110681	0 %	0 %	40 %	60 %	260842334
63	NC_013353	CGCGG	2	10	113881	113890	0 %	0 %	60 %	40 %	260842337
64	NC_013353	ATCCC	2	10	116125	116134	20 %	20 %	0 %	60 %	260842340
65	NC_013353	CATCG	2	10	116138	116147	20 %	20 %	20 %	40 %	260842340
66	NC_013353	TAACG	2	10	116832	116841	40 %	20 %	20 %	20 %	260842340
67	NC_013353	ATGCC	2	10	117291	117300	20 %	20 %	20 %	40 %	260842340
68	NC_013353	AATGC	2	10	118574	118583	40 %	20 %	20 %	20 %	260842341
69	NC_013353	TCTGT	2	10	119520	119529	0 %	60 %	20 %	20 %	260842343
70	NC_013353	GCATG	2	10	120613	120622	20 %	20 %	40 %	20 %	260842344
71	NC_013353	AGCAG	2	10	121951	121960	40 %	0 %	40 %	20 %	260842346
72	NC_013353	TCAGC	2	10	122819	122828	20 %	20 %	20 %	40 %	260842346
73	NC_013353	CGAAG	2	10	123866	123875	40 %	0 %	40 %	20 %	260842347
74	NC_013353	ACACG	2	10	123999	124008	40 %	0 %	20 %	40 %	260842347
75	NC_013353	TCGCG	2	10	124260	124269	0 %	20 %	40 %	40 %	260842347
76	NC_013353	GCATC	2	10	124350	124359	20 %	20 %	20 %	40 %	260842347
77	NC_013353	GACTG	2	10	125668	125677	20 %	20 %	40 %	20 %	260842348
78	NC_013353	AGAGC	2	10	126078	126087	40 %	0 %	40 %	20 %	260842348
79	NC_013353	GGTTG	2	10	132007	132016	0 %	40 %	60 %	0 %	260842351
80	NC_013353	TCTGG	2	10	134653	134662	0 %	40 %	40 %	20 %	260842352
81	NC_013353	GGGCA	2	10	136065	136074	20 %	0 %	60 %	20 %	260842353
82	NC_013353	CAGCG	2	10	136344	136353	20 %	0 %	40 %	40 %	260842354
83	NC_013353	GGCTG	2	10	139055	139064	0 %	20 %	60 %	20 %	260842357
84	NC_013353	CCGTC	2	10	143174	143183	0 %	20 %	20 %	60 %	260842359
85	NC_013353	GTGAA	2	10	143184	143193	40 %	20 %	40 %	0 %	260842359
86	NC_013353	GGCAT	2	10	143346	143355	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013353	GTTCA	2	10	143571	143580	20 %	40 %	20 %	20 %	260842360
88	NC_013353	ATCCA	2	10	143897	143906	40 %	20 %	0 %	40 %	260842360
89	NC_013353	GTAAG	2	10	144110	144119	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013353	CTTTA	2	10	145160	145169	20 %	60 %	0 %	20 %	260842362
91	NC_013353	TGGCG	2	10	145387	145396	0 %	20 %	60 %	20 %	260842362
92	NC_013353	TCCTC	2	10	145830	145839	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_013353	CGGGC	2	10	146575	146584	0 %	0 %	60 %	40 %	260842364
94	NC_013353	TTTCA	2	10	147700	147709	20 %	60 %	0 %	20 %	260842365
95	NC_013353	GGGAG	2	10	149025	149034	20 %	0 %	80 %	0 %	260842366
96	NC_013353	TGAAG	2	10	150923	150932	40 %	20 %	40 %	0 %	260842368
97	NC_013353	ACCGC	2	10	151028	151037	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013353	GCGGT	2	10	151047	151056	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013353	TTTGC	2	10	158013	158022	0 %	60 %	20 %	20 %	260842375
100	NC_013353	AAATT	2	10	158454	158463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013353	GCGAG	2	10	159821	159830	20 %	0 %	60 %	20 %	260842377
102	NC_013353	GGCGT	2	10	160259	160268	0 %	20 %	60 %	20 %	260842377
103	NC_013353	ATCAG	2	10	160897	160906	40 %	20 %	20 %	20 %	260842378
104	NC_013353	ACCAC	2	10	163162	163171	40 %	0 %	0 %	60 %	260842381
105	NC_013353	GGCGT	2	10	164865	164874	0 %	20 %	60 %	20 %	260842382
106	NC_013353	CGACG	2	10	165904	165913	20 %	0 %	40 %	40 %	260842382
107	NC_013353	TTATC	2	10	168816	168825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013353	AAAAC	2	10	169891	169900	80 %	0 %	0 %	20 %	260842384
109	NC_013353	TGGTT	2	10	170148	170157	0 %	60 %	40 %	0 %	260842384
110	NC_013353	AACCT	2	10	172229	172238	40 %	20 %	0 %	40 %	260842386
111	NC_013353	TGGTC	2	10	172271	172280	0 %	40 %	40 %	20 %	260842386
112	NC_013353	TGGCG	2	10	173516	173525	0 %	20 %	60 %	20 %	260842387
113	NC_013353	CGGCG	2	10	174146	174155	0 %	0 %	60 %	40 %	260842387
114	NC_013353	TGGTG	2	10	174158	174167	0 %	40 %	60 %	0 %	260842387
115	NC_013353	TTCCA	2	10	174757	174766	20 %	40 %	0 %	40 %	260842387
116	NC_013353	GGTCC	2	10	179080	179089	0 %	20 %	40 %	40 %	260842392
117	NC_013353	ACGGG	2	10	180997	181006	20 %	0 %	60 %	20 %	260842394
118	NC_013353	GTGAT	2	10	183156	183165	20 %	40 %	40 %	0 %	260842395
119	NC_013353	GTGAT	2	10	183447	183456	20 %	40 %	40 %	0 %	260842395
120	NC_013353	TACGT	2	10	183692	183701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013353	TGGCC	2	10	185417	185426	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013353	GCCAG	2	10	187163	187172	20 %	0 %	40 %	40 %	260842399
123	NC_013353	GTTCT	2	10	188604	188613	0 %	60 %	20 %	20 %	260842399
124	NC_013353	CTGAA	2	10	190596	190605	40 %	20 %	20 %	20 %	260842401
125	NC_013353	AAGCG	2	10	190660	190669	40 %	0 %	40 %	20 %	260842401
126	NC_013353	TGGTG	2	10	192566	192575	0 %	40 %	60 %	0 %	260842403
127	NC_013353	TGCAC	2	10	192692	192701	20 %	20 %	20 %	40 %	260842403
128	NC_013353	TGCGC	2	10	193085	193094	0 %	20 %	40 %	40 %	260842403
129	NC_013353	AAATA	2	10	193307	193316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013353	GTCTG	2	10	193392	193401	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013353	CATGG	2	10	194928	194937	20 %	20 %	40 %	20 %	260842405
132	NC_013353	CAGAT	2	10	195967	195976	40 %	20 %	20 %	20 %	260842406
133	NC_013353	ACTTT	2	10	196100	196109	20 %	60 %	0 %	20 %	260842406
134	NC_013353	GACGT	2	10	200020	200029	20 %	20 %	40 %	20 %	260842409
135	NC_013353	CGACG	2	10	201847	201856	20 %	0 %	40 %	40 %	260842411
136	NC_013353	ATGCC	2	10	204415	204424	20 %	20 %	20 %	40 %	260842414
137	NC_013353	GGATG	2	10	204677	204686	20 %	20 %	60 %	0 %	260842414
138	NC_013353	TGGCC	2	10	205741	205750	0 %	20 %	40 %	40 %	260842416
139	NC_013353	GTAAC	2	10	206484	206493	40 %	20 %	20 %	20 %	260842416
140	NC_013353	AGCCG	2	10	207112	207121	20 %	0 %	40 %	40 %	260842416
141	NC_013353	GGTGG	2	10	207221	207230	0 %	20 %	80 %	0 %	260842416
142	NC_013353	TTAAC	2	10	215364	215373	40 %	40 %	0 %	20 %	260842423
143	NC_013353	TGCGC	2	10	216576	216585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013353	ACGGT	2	10	218231	218240	20 %	20 %	40 %	20 %	260842426
145	NC_013353	TGATT	2	10	221073	221082	20 %	60 %	20 %	0 %	260842429
146	NC_013353	CGGTT	2	10	224036	224045	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013353	TAATT	2	10	233088	233097	40 %	60 %	0 %	0 %	260842436
148	NC_013353	ACTTA	2	10	235058	235067	40 %	40 %	0 %	20 %	260842438
149	NC_013353	ACTGG	2	10	236026	236035	20 %	20 %	40 %	20 %	260842439
150	NC_013353	CGCGG	2	10	237071	237080	0 %	0 %	60 %	40 %	260842441
151	NC_013353	TTTAA	2	10	239452	239461	40 %	60 %	0 %	0 %	260842443
152	NC_013353	TGATC	2	10	240807	240816	20 %	40 %	20 %	20 %	260842445
153	NC_013353	CCAGA	2	10	242581	242590	40 %	0 %	20 %	40 %	260842447
154	NC_013353	CGCTG	2	10	246842	246851	0 %	20 %	40 %	40 %	260842448
155	NC_013353	GCGCA	2	10	249283	249292	20 %	0 %	40 %	40 %	260842450
156	NC_013353	GGGCA	2	10	252029	252038	20 %	0 %	60 %	20 %	260842452
157	NC_013353	ATTTC	2	10	252539	252548	20 %	60 %	0 %	20 %	260842452
158	NC_013353	CCAGC	2	10	254771	254780	20 %	0 %	20 %	60 %	260842455
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162	NC_013353	ACCGG	2	10	257878	257887	20 %	0 %	40 %	40 %	260842457
163	NC_013353	AAAAT	2	10	260409	260418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013353	TAATC	2	10	260619	260628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013353	ACTGT	2	10	261678	261687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_013353	AAGGC	2	10	263691	263700	40 %	0 %	40 %	20 %	260842462
167	NC_013353	GCCCG	2	10	264164	264173	0 %	0 %	40 %	60 %	260842463
168	NC_013353	TGACC	2	10	266030	266039	20 %	20 %	20 %	40 %	260842463
169	NC_013353	AGCGC	2	10	267218	267227	20 %	0 %	40 %	40 %	260842463
170	NC_013353	GGTGT	2	10	267276	267285	0 %	40 %	60 %	0 %	260842463
171	NC_013353	AGCAA	2	10	268169	268178	60 %	0 %	20 %	20 %	260842463
172	NC_013353	GGGCA	2	10	268734	268743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013353	AAAAG	2	10	269212	269221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013353	GTAAC	2	10	269573	269582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013353	ATATT	2	10	269695	269704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013353	GATGC	2	10	276200	276209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_013353	AAACG	2	10	277771	277780	60 %	0 %	20 %	20 %	260842470
178	NC_013353	TTGCT	2	10	278776	278785	0 %	60 %	20 %	20 %	260842473
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181	NC_013353	CGATG	2	10	282420	282429	20 %	20 %	40 %	20 %	260842477
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195	NC_013353	TGTTA	2	10	309810	309819	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013353	GCGTG	2	10	311441	311450	0 %	20 %	60 %	20 %	260842504
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199	NC_013353	GCGCC	2	10	314687	314696	0 %	0 %	40 %	60 %	260842504
200	NC_013353	TACCG	2	10	316009	316018	20 %	20 %	20 %	40 %	260842505
201	NC_013353	GCGTG	2	10	317220	317229	0 %	20 %	60 %	20 %	260842506
202	NC_013353	CAAAA	2	10	320294	320303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_013353	ATTAG	2	10	320327	320336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
204	NC_013353	ATGTT	2	10	324087	324096	20 %	60 %	20 %	0 %	260842513
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207	NC_013353	ATAAA	2	10	325477	325486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_013353	AAAAT	2	10	325539	325548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_013353	GCAGG	2	10	326458	326467	20 %	0 %	60 %	20 %	260842515
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212	NC_013353	ATTTT	2	10	331814	331823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_013353	TCTGA	2	10	336213	336222	20 %	40 %	20 %	20 %	260842519
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230	NC_013353	TGCGC	2	10	366979	366988	0 %	20 %	40 %	40 %	260842544
231	NC_013353	AAGCG	2	10	370571	370580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
232	NC_013353	AATTC	2	10	372819	372828	40 %	40 %	0 %	20 %	260842551
233	NC_013353	CGCAG	2	10	372837	372846	20 %	0 %	40 %	40 %	260842551
234	NC_013353	AGACC	2	10	373833	373842	40 %	0 %	20 %	40 %	260842551
235	NC_013353	TGACC	2	10	374556	374565	20 %	20 %	20 %	40 %	260842551
236	NC_013353	TTGCG	2	10	375769	375778	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
237	NC_013353	TTTTC	2	10	375882	375891	0 %	80 %	0 %	20 %	260842552
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249	NC_013353	ATCAT	2	10	391931	391940	40 %	40 %	0 %	20 %	260842568
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251	NC_013353	GCACA	2	10	396935	396944	40 %	0 %	20 %	40 %	260842573
252	NC_013353	ACGGA	2	10	397110	397119	40 %	0 %	40 %	20 %	260842573
253	NC_013353	GTTGA	2	10	404187	404196	20 %	40 %	40 %	0 %	260842577
254	NC_013353	AAATC	2	10	404665	404674	60 %	20 %	0 %	20 %	260842578
255	NC_013353	CTTCT	2	10	405776	405785	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_013353	GATGG	2	10	408383	408392	20 %	20 %	60 %	0 %	260842583
257	NC_013353	CGCTG	2	10	408700	408709	0 %	20 %	40 %	40 %	260842583
258	NC_013353	GCAAC	2	10	409950	409959	40 %	0 %	20 %	40 %	260842584
259	NC_013353	CAAAG	2	10	411193	411202	60 %	0 %	20 %	20 %	260842585
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261	NC_013353	ACGCA	2	10	415130	415139	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_013353	CTTTC	2	10	418237	418246	0 %	60 %	0 %	40 %	260842594
263	NC_013353	CAAAC	2	10	418756	418765	60 %	0 %	0 %	40 %	260842594
264	NC_013353	TCTTT	2	10	420650	420659	0 %	80 %	0 %	20 %	260842595
265	NC_013353	CGTCG	2	10	428275	428284	0 %	20 %	40 %	40 %	260842600
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267	NC_013353	CAAAG	2	10	428876	428885	60 %	0 %	20 %	20 %	260842601
268	NC_013353	TGGCT	2	10	429707	429716	0 %	40 %	40 %	20 %	260842601
269	NC_013353	CCTGG	2	10	430248	430257	0 %	20 %	40 %	40 %	260842601
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379	NC_013353	CCGTA	2	10	631401	631410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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382	NC_013353	TTTTC	2	10	634197	634206	0 %	80 %	0 %	20 %	260842796
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387	NC_013353	GTCAG	2	10	647165	647174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
388	NC_013353	GTTTT	2	10	648440	648449	0 %	80 %	20 %	0 %	260842811
389	NC_013353	GCAGT	2	10	650390	650399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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395	NC_013353	TAATC	2	10	656135	656144	40 %	40 %	0 %	20 %	260842815
396	NC_013353	GCAAT	2	10	657340	657349	40 %	20 %	20 %	20 %	260842816
397	NC_013353	GGCGC	2	10	661178	661187	0 %	0 %	60 %	40 %	260842819
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399	NC_013353	CATTC	2	10	663867	663876	20 %	40 %	0 %	40 %	260842822
400	NC_013353	TGAAC	2	10	664191	664200	40 %	20 %	20 %	20 %	260842822
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