MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009

Total Repeats: 112059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013353	TAAA	2	8	22847	22854	75 %	25 %	0 %	0 %	260842259
502	NC_013353	T	6	6	22860	22865	0 %	100 %	0 %	0 %	260842259
503	NC_013353	ATT	2	6	22912	22917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260842259
504	NC_013353	ATC	2	6	22926	22931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842259
505	NC_013353	GAG	2	6	22939	22944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260842259
506	NC_013353	ATTGC	2	10	22953	22962	20 %	40 %	20 %	20 %	260842259
507	NC_013353	T	8	8	22987	22994	0 %	100 %	0 %	0 %	260842259
508	NC_013353	T	7	7	23027	23033	0 %	100 %	0 %	0 %	260842259
509	NC_013353	TGA	2	6	23074	23079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842259
510	NC_013353	TA	3	6	23129	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	260842259
511	NC_013353	A	6	6	23170	23175	100 %	0 %	0 %	0 %	260842259
512	NC_013353	TCA	2	6	23242	23247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842259
513	NC_013353	A	7	7	23286	23292	100 %	0 %	0 %	0 %	260842259
514	NC_013353	TC	3	6	23341	23346	0 %	50 %	0 %	50 %	260842259
515	NC_013353	A	7	7	23361	23367	100 %	0 %	0 %	0 %	260842259
516	NC_013353	TGA	2	6	23368	23373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842259
517	NC_013353	A	6	6	23409	23414	100 %	0 %	0 %	0 %	260842259
518	NC_013353	TCA	2	6	23416	23421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842259
519	NC_013353	TATT	2	8	23486	23493	25 %	75 %	0 %	0 %	260842259
520	NC_013353	CAT	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842259
521	NC_013353	CTA	2	6	23504	23509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842259
522	NC_013353	TGA	2	6	23575	23580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013353	TTAAT	2	10	23588	23597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013353	ACT	2	6	23613	23618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013353	TTG	2	6	23680	23685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013353	ATT	2	6	23689	23694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013353	TAA	2	6	23704	23709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013353	GT	3	6	23955	23960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013353	TC	3	6	23961	23966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_013353	CAT	2	6	23970	23975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013353	AGC	2	6	23979	23984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013353	A	7	7	23991	23997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013353	TTG	2	6	24052	24057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260842260
534	NC_013353	AGC	2	6	24117	24122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842260
535	NC_013353	GCA	2	6	24166	24171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842260
536	NC_013353	TGA	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842260
537	NC_013353	CAT	2	6	24222	24227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842260
538	NC_013353	GC	3	6	24274	24279	0 %	0 %	50 %	50 %	260842260
539	NC_013353	CTT	2	6	24369	24374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013353	GCA	2	6	24492	24497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842261
541	NC_013353	TTC	2	6	24508	24513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260842261
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543	NC_013353	CATA	2	8	24651	24658	50 %	25 %	0 %	25 %	260842262
544	NC_013353	AAG	2	6	24677	24682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260842262
545	NC_013353	GT	3	6	24684	24689	0 %	50 %	50 %	0 %	260842262
546	NC_013353	CG	3	6	24730	24735	0 %	0 %	50 %	50 %	260842262
547	NC_013353	GAA	2	6	24754	24759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260842262
548	NC_013353	GCGCAA	2	12	24762	24773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842262
549	NC_013353	GGTGAT	2	12	24780	24791	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260842262
550	NC_013353	TGCG	2	8	24907	24914	0 %	25 %	50 %	25 %	260842262
551	NC_013353	TCA	2	6	24953	24958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842262
552	NC_013353	TCT	2	6	24963	24968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260842262
553	NC_013353	TGA	2	6	25005	25010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842262
554	NC_013353	TTA	2	6	25048	25053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260842262
555	NC_013353	GCGT	2	8	25115	25122	0 %	25 %	50 %	25 %	260842262
556	NC_013353	CAG	2	6	25125	25130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842262
557	NC_013353	TCTGGC	2	12	25164	25175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842262
558	NC_013353	TGA	2	6	25227	25232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842262
559	NC_013353	CAG	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842262
560	NC_013353	AGT	2	6	25452	25457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842262
561	NC_013353	A	7	7	25465	25471	100 %	0 %	0 %	0 %	260842262
562	NC_013353	AGC	2	6	25481	25486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842262
563	NC_013353	TGA	2	6	25527	25532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842262
564	NC_013353	CCGC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	25 %	75 %	260842262
565	NC_013353	T	6	6	25549	25554	0 %	100 %	0 %	0 %	260842262
566	NC_013353	TGA	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842263
567	NC_013353	TGA	3	9	25716	25724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842263
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570	NC_013353	A	7	7	25759	25765	100 %	0 %	0 %	0 %	260842263
571	NC_013353	ATG	2	6	25778	25783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842263
572	NC_013353	CCT	2	6	25786	25791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260842263
573	NC_013353	GCA	2	6	25802	25807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842263
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577	NC_013353	CG	3	6	26116	26121	0 %	0 %	50 %	50 %	260842263
578	NC_013353	ATC	2	6	26131	26136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260842263
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580	NC_013353	CTGC	2	8	26356	26363	0 %	25 %	25 %	50 %	260842263
581	NC_013353	TGC	2	6	26525	26530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
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584	NC_013353	GCT	2	6	26772	26777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
585	NC_013353	GC	3	6	26789	26794	0 %	0 %	50 %	50 %	260842263
586	NC_013353	TGC	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
587	NC_013353	GCA	2	6	26814	26819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842263
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592	NC_013353	TGCG	2	8	26906	26913	0 %	25 %	50 %	25 %	260842263
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594	NC_013353	GTG	2	6	27138	27143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842263
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598	NC_013353	TGA	2	6	27464	27469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842263
599	NC_013353	TGC	2	6	27558	27563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
600	NC_013353	TCG	2	6	27573	27578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
601	NC_013353	CG	3	6	27591	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	260842263
602	NC_013353	CTG	2	6	27601	27606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
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610	NC_013353	CAG	2	6	28258	28263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842263
611	NC_013353	GCT	2	6	28325	28330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842263
612	NC_013353	CGGTGA	2	12	28404	28415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260842263
613	NC_013353	TGA	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842263
614	NC_013353	GCTG	2	8	28465	28472	0 %	25 %	50 %	25 %	260842264
615	NC_013353	TGG	2	6	28477	28482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842264
616	NC_013353	GCA	2	6	28507	28512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842264
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618	NC_013353	GCG	2	6	28599	28604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842264
619	NC_013353	GCG	2	6	28624	28629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842264
620	NC_013353	TGA	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260842264
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622	NC_013353	GGC	2	6	28749	28754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842264
623	NC_013353	GC	3	6	28753	28758	0 %	0 %	50 %	50 %	260842264
624	NC_013353	T	6	6	28898	28903	0 %	100 %	0 %	0 %	260842264
625	NC_013353	A	6	6	28917	28922	100 %	0 %	0 %	0 %	260842264
626	NC_013353	AAT	2	6	28924	28929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260842264
627	NC_013353	TGC	2	6	28957	28962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013353	CGA	2	6	29072	29077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842265
629	NC_013353	CAC	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260842265
630	NC_013353	CAA	2	6	29102	29107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260842265
631	NC_013353	ACC	2	6	29196	29201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260842265
632	NC_013353	GCG	2	6	29220	29225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842265
633	NC_013353	CCG	2	6	29264	29269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260842265
634	NC_013353	ATGG	2	8	29325	29332	25 %	25 %	50 %	0 %	260842265
635	NC_013353	TTG	2	6	29528	29533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260842266
636	NC_013353	AT	3	6	29563	29568	50 %	50 %	0 %	0 %	260842266
637	NC_013353	GAA	2	6	29806	29811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260842266
638	NC_013353	CAGTA	2	10	29863	29872	40 %	20 %	20 %	20 %	260842266
639	NC_013353	TG	3	6	29913	29918	0 %	50 %	50 %	0 %	260842266
640	NC_013353	TGG	2	6	30119	30124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842266
641	NC_013353	CTC	2	6	30138	30143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260842266
642	NC_013353	CG	3	6	30187	30192	0 %	0 %	50 %	50 %	260842266
643	NC_013353	TTGA	2	8	30196	30203	25 %	50 %	25 %	0 %	260842266
644	NC_013353	TGG	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842266
645	NC_013353	GCA	2	6	30312	30317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260842266
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649	NC_013353	T	6	6	30466	30471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_013353	GCC	2	6	30540	30545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260842267
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654	NC_013353	TTG	2	6	30754	30759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260842267
655	NC_013353	TGG	2	6	30841	30846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842267
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663	NC_013353	TCCC	2	8	31453	31460	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
664	NC_013353	TGGC	2	8	31494	31501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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682	NC_013353	ATGTT	2	10	32471	32480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
683	NC_013353	TGT	2	6	32530	32535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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687	NC_013353	ATA	2	6	32680	32685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_013353	GCC	2	6	32735	32740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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750	NC_013353	GCGAA	2	10	35658	35667	40 %	0 %	40 %	20 %	260842270
751	NC_013353	ACCG	2	8	35675	35682	25 %	0 %	25 %	50 %	260842270
752	NC_013353	A	6	6	35685	35690	100 %	0 %	0 %	0 %	260842270
753	NC_013353	CGG	3	9	35701	35709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842270
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755	NC_013353	CGG	2	6	35932	35937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842270
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757	NC_013353	GCT	2	6	35972	35977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842270
758	NC_013353	AGA	2	6	36022	36027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260842270
759	NC_013353	CTGAAA	2	12	36059	36070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260842270
760	NC_013353	TGG	2	6	36141	36146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842270
761	NC_013353	CGTC	2	8	36149	36156	0 %	25 %	25 %	50 %	260842270
762	NC_013353	CGG	2	6	36166	36171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842270
763	NC_013353	CGG	2	6	36225	36230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842270
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781	NC_013353	GTG	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260842270
782	NC_013353	GGC	2	6	36886	36891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260842270
783	NC_013353	CTG	2	6	36896	36901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260842270
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789	NC_013353	ATA	2	6	37225	37230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260842270
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802	NC_013353	AAGA	2	8	37791	37798	75 %	0 %	25 %	0 %	260842272
803	NC_013353	CGC	2	6	37799	37804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260842272
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806	NC_013353	TGT	2	6	37927	37932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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