MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	CAAAGA	2	12	939	950	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254667449
2	NC_013010	AAATAA	2	12	3580	3591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254667450
3	NC_013010	GCGAAG	2	12	4476	4487	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254667451
4	NC_013010	TTTTCC	2	12	5663	5674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254667452
5	NC_013010	ATGGAC	2	12	6833	6844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254667452
6	NC_013010	AGGGGG	2	12	6972	6983	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	254667452
7	NC_013010	ATAAGG	2	12	8479	8490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254667454
8	NC_013010	TAGAGG	2	12	9647	9658	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	254667456
9	NC_013010	ATTTTA	2	12	16762	16773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254667465
10	NC_013010	TTTATG	2	12	19286	19297	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254667466
11	NC_013010	TTCTGT	2	12	23200	23211	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254667468
12	NC_013010	TATCCA	2	12	26267	26278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667474
13	NC_013010	GTGTCA	2	12	26465	26476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254667474
14	NC_013010	GCAGCG	2	12	27878	27889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254667478
15	NC_013010	CTCTTT	2	12	28428	28439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254667479
16	NC_013010	GACAGC	2	12	28892	28903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667480
17	NC_013010	TTCTGC	2	12	29182	29193	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	254667481
18	NC_013010	ACCGGA	2	12	40609	40620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667495
19	NC_013010	TCCTCT	2	12	42851	42862	0 %	50 %	0 %	50 %	254667500
20	NC_013010	TCAGCA	2	12	44780	44791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254667504
21	NC_013010	GCAGAA	2	12	45186	45197	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254667504
22	NC_013010	TACCGC	2	12	45210	45221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254667504
23	NC_013010	TGCTAC	6	36	46090	46125	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254667506
24	NC_013010	TCAGCC	2	12	47135	47146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254667507
25	NC_013010	GGCGCT	2	12	48147	48158	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254667509
26	NC_013010	CAGGTG	2	12	48178	48189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254667509
27	NC_013010	GCCGGA	2	12	48519	48530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254667509
28	NC_013010	CACTGG	2	12	49913	49924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254667510
29	NC_013010	TGGCAG	2	12	50589	50600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	254667511
30	NC_013010	GGAAAA	2	12	53610	53621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254667514
31	NC_013010	CTTATC	2	12	54804	54815	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013010	TGGATT	2	12	62362	62373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	254667518
33	NC_013010	ATAAAA	2	12	62893	62904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254667518
34	NC_013010	CGTATT	2	12	64678	64689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	254667518
35	NC_013010	CGGGAG	2	12	67219	67230	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254667521
36	NC_013010	AACACG	2	12	67370	67381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254667522
37	NC_013010	TGGGGA	2	12	67637	67648	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	254667522
38	NC_013010	ATAGAT	2	12	74739	74750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254667535
39	NC_013010	GCAGAA	2	12	80130	80141	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254667543
40	NC_013010	AAAGCA	2	12	82524	82535	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254667544
41	NC_013010	AAGGAC	2	12	83949	83960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254667544
42	NC_013010	GCACCT	2	12	92895	92906	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254667556
43	NC_013010	GAAGAC	2	12	93176	93187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254667556
44	NC_013010	GTTTTT	2	12	94253	94264	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.