MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Edwardsiella ictaluri 93-146 chromosome

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012779	TCTAC	2	10	1800	1809	20 %	40 %	0 %	40 %	238917985
2	NC_012779	GCAGC	2	10	7015	7024	20 %	0 %	40 %	40 %	238917988
3	NC_012779	TGAGT	2	10	9909	9918	20 %	40 %	40 %	0 %	238917993
4	NC_012779	GCCGC	2	10	10036	10045	0 %	0 %	40 %	60 %	238917993
5	NC_012779	CTGCT	2	10	12459	12468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012779	GCGCG	2	10	13089	13098	0 %	0 %	60 %	40 %	238917996
7	NC_012779	TGGCA	2	10	16495	16504	20 %	20 %	40 %	20 %	238918000
8	NC_012779	TTGCA	2	10	17621	17630	20 %	40 %	20 %	20 %	238918002
9	NC_012779	CCCAG	2	10	20633	20642	20 %	0 %	20 %	60 %	238918007
10	NC_012779	CTGAA	2	10	22322	22331	40 %	20 %	20 %	20 %	238918008
11	NC_012779	GGCGC	2	10	22527	22536	0 %	0 %	60 %	40 %	238918008
12	NC_012779	GCCAG	2	10	23703	23712	20 %	0 %	40 %	40 %	238918009
13	NC_012779	TGCGG	2	10	28528	28537	0 %	20 %	60 %	20 %	238918012
14	NC_012779	TTCGG	2	10	29772	29781	0 %	40 %	40 %	20 %	238918013
15	NC_012779	AGGGA	2	10	32487	32496	40 %	0 %	60 %	0 %	238918017
16	NC_012779	AAAAT	2	10	33624	33633	80 %	20 %	0 %	0 %	238918020
17	NC_012779	ACAAA	2	10	34185	34194	80 %	0 %	0 %	20 %	238918022
18	NC_012779	TGACC	2	10	35289	35298	20 %	20 %	20 %	40 %	238918023
19	NC_012779	GCGCG	2	10	39335	39344	0 %	0 %	60 %	40 %	238918026
20	NC_012779	GCAAC	2	10	43543	43552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012779	GCTGC	2	10	44872	44881	0 %	20 %	40 %	40 %	238918029
22	NC_012779	TGATT	2	10	49990	49999	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012779	TGGCG	2	10	52008	52017	0 %	20 %	60 %	20 %	238918041
24	NC_012779	CAGGT	2	10	52079	52088	20 %	20 %	40 %	20 %	238918041
25	NC_012779	TCTGC	2	10	54877	54886	0 %	40 %	20 %	40 %	417358933
26	NC_012779	CTGCC	2	10	56551	56560	0 %	20 %	20 %	60 %	238918046
27	NC_012779	TGGCG	2	10	57956	57965	0 %	20 %	60 %	20 %	238918047
28	NC_012779	CAGTG	2	10	58170	58179	20 %	20 %	40 %	20 %	238918047
29	NC_012779	AATTG	2	10	60387	60396	40 %	40 %	20 %	0 %	238918049
30	NC_012779	TTGTT	2	10	61506	61515	0 %	80 %	20 %	0 %	238918050
31	NC_012779	GGGGT	2	10	62796	62805	0 %	20 %	80 %	0 %	238918052
32	NC_012779	CAGCG	2	10	63274	63283	20 %	0 %	40 %	40 %	238918052
33	NC_012779	TATCA	2	10	64696	64705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012779	TGATG	2	10	67111	67120	20 %	40 %	40 %	0 %	238918055
35	NC_012779	GCTGG	2	10	69507	69516	0 %	20 %	60 %	20 %	238918057
36	NC_012779	TCCGG	2	10	70526	70535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012779	TATGG	2	10	70604	70613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012779	GGTGC	2	10	71260	71269	0 %	20 %	60 %	20 %	238918058
39	NC_012779	CTGCC	2	10	73263	73272	0 %	20 %	20 %	60 %	238918060
40	NC_012779	CGATG	2	10	74142	74151	20 %	20 %	40 %	20 %	238918061
41	NC_012779	CGGCC	2	10	74994	75003	0 %	0 %	40 %	60 %	238918061
42	NC_012779	CGATC	2	10	75279	75288	20 %	20 %	20 %	40 %	238918061
43	NC_012779	AACGC	2	10	77473	77482	40 %	0 %	20 %	40 %	238918063
44	NC_012779	GCCGT	2	10	77683	77692	0 %	20 %	40 %	40 %	238918063
45	NC_012779	CAGCG	2	10	80009	80018	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012779	GGCGC	2	10	80863	80872	0 %	0 %	60 %	40 %	417358934
47	NC_012779	GCGAC	2	10	81520	81529	20 %	0 %	40 %	40 %	417358934
48	NC_012779	AGACC	2	10	82825	82834	40 %	0 %	20 %	40 %	238918067
49	NC_012779	TGCAT	2	10	83541	83550	20 %	40 %	20 %	20 %	238918067
50	NC_012779	CGCGG	2	10	83760	83769	0 %	0 %	60 %	40 %	417358935
51	NC_012779	AGGCC	2	10	84654	84663	20 %	0 %	40 %	40 %	417358935
52	NC_012779	TCACG	2	10	86624	86633	20 %	20 %	20 %	40 %	238918070
53	NC_012779	CGGCG	2	10	86818	86827	0 %	0 %	60 %	40 %	238918070
54	NC_012779	CGATG	2	10	87094	87103	20 %	20 %	40 %	20 %	238918070
55	NC_012779	ATCTG	2	10	87680	87689	20 %	40 %	20 %	20 %	238918071
56	NC_012779	CCGAC	2	10	89948	89957	20 %	0 %	20 %	60 %	417358936
57	NC_012779	TCGGC	2	10	92117	92126	0 %	20 %	40 %	40 %	417358937
58	NC_012779	GGATC	2	10	92277	92286	20 %	20 %	40 %	20 %	417358937
59	NC_012779	GCTGG	2	10	93012	93021	0 %	20 %	60 %	20 %	417358937
60	NC_012779	CTGCA	2	10	95726	95735	20 %	20 %	20 %	40 %	238918078
61	NC_012779	GCGCC	2	10	97233	97242	0 %	0 %	40 %	60 %	238918080
62	NC_012779	GCAGC	2	10	98103	98112	20 %	0 %	40 %	40 %	238918080
63	NC_012779	GTTAA	2	10	100618	100627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012779	GCGCG	2	10	101662	101671	0 %	0 %	60 %	40 %	238918083
65	NC_012779	CGGCG	2	10	102754	102763	0 %	0 %	60 %	40 %	238918084
66	NC_012779	GCTCA	2	10	103150	103159	20 %	20 %	20 %	40 %	238918084
67	NC_012779	GCAGC	2	10	104490	104499	20 %	0 %	40 %	40 %	238918085
68	NC_012779	ATGCC	2	10	104557	104566	20 %	20 %	20 %	40 %	238918085
69	NC_012779	ACCGC	2	10	106464	106473	20 %	0 %	20 %	60 %	238918087
70	NC_012779	GCCGC	2	10	108425	108434	0 %	0 %	40 %	60 %	238918087
71	NC_012779	TCAGC	2	10	110758	110767	20 %	20 %	20 %	40 %	238918092
72	NC_012779	GCGCC	2	10	111008	111017	0 %	0 %	40 %	60 %	238918092
73	NC_012779	GCCGG	2	10	112066	112075	0 %	0 %	60 %	40 %	238918093
74	NC_012779	GCCGC	2	10	112448	112457	0 %	0 %	40 %	60 %	238918094
75	NC_012779	ACTGT	2	10	113350	113359	20 %	40 %	20 %	20 %	238918094
76	NC_012779	GTGAT	2	10	115893	115902	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012779	CAGAG	2	10	117168	117177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012779	GGGTG	2	10	118590	118599	0 %	20 %	80 %	0 %	238918097
79	NC_012779	AGCAC	2	10	120451	120460	40 %	0 %	20 %	40 %	238918098
80	NC_012779	GCAGA	2	10	120765	120774	40 %	0 %	40 %	20 %	238918098
81	NC_012779	GGCCA	2	10	121742	121751	20 %	0 %	40 %	40 %	238918100
82	NC_012779	GGCTC	2	10	121936	121945	0 %	20 %	40 %	40 %	238918100
83	NC_012779	CGGCG	2	10	123402	123411	0 %	0 %	60 %	40 %	417358939
84	NC_012779	TGCGT	2	10	125424	125433	0 %	40 %	40 %	20 %	238918103
85	NC_012779	TCACG	2	10	125899	125908	20 %	20 %	20 %	40 %	238918103
86	NC_012779	CCGGG	2	10	126480	126489	0 %	0 %	60 %	40 %	238918103
87	NC_012779	CTGTC	2	10	127032	127041	0 %	40 %	20 %	40 %	238918104
88	NC_012779	AGCGT	2	10	127399	127408	20 %	20 %	40 %	20 %	238918104
89	NC_012779	TGGAT	2	10	127543	127552	20 %	40 %	40 %	0 %	238918104
90	NC_012779	GGCTG	2	10	128302	128311	0 %	20 %	60 %	20 %	238918105
91	NC_012779	AGCTG	2	10	129018	129027	20 %	20 %	40 %	20 %	238918105
92	NC_012779	ACTGA	2	10	132103	132112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012779	TGCTG	2	10	134018	134027	0 %	40 %	40 %	20 %	238918108
94	NC_012779	GGCCG	2	10	136333	136342	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_012779	GGTGA	2	10	139511	139520	20 %	20 %	60 %	0 %	238918116
96	NC_012779	GCGGG	2	10	140434	140443	0 %	0 %	80 %	20 %	238918117
97	NC_012779	ACAGC	2	10	142050	142059	40 %	0 %	20 %	40 %	238918118
98	NC_012779	TGAAG	2	10	142585	142594	40 %	20 %	40 %	0 %	238918119
99	NC_012779	GCGTT	2	10	142748	142757	0 %	40 %	40 %	20 %	238918120
100	NC_012779	GATCT	2	10	145014	145023	20 %	40 %	20 %	20 %	238918123
101	NC_012779	CAATA	2	10	146468	146477	60 %	20 %	0 %	20 %	238918124
102	NC_012779	GTGCG	2	10	147065	147074	0 %	20 %	60 %	20 %	238918125
103	NC_012779	GCGCT	2	10	149081	149090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012779	CGTAT	2	10	149832	149841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012779	CGTAC	2	10	150589	150598	20 %	20 %	20 %	40 %	238918128
106	NC_012779	GCTGT	2	10	151710	151719	0 %	40 %	40 %	20 %	238918129
107	NC_012779	AGCGA	2	10	157455	157464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012779	ATTGC	2	10	159037	159046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012779	GACCC	2	10	159555	159564	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_012779	TGTTC	2	10	159825	159834	0 %	60 %	20 %	20 %	238918133
111	NC_012779	GGTTT	2	10	165117	165126	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012779	GATCA	2	10	167011	167020	40 %	20 %	20 %	20 %	238918140
113	NC_012779	AGTGA	2	10	167676	167685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012779	AGATG	2	10	171206	171215	40 %	20 %	40 %	0 %	238918142
115	NC_012779	GGTAA	2	10	171645	171654	40 %	20 %	40 %	0 %	238918142
116	NC_012779	GTACT	2	10	173512	173521	20 %	40 %	20 %	20 %	238918143
117	NC_012779	CGATC	2	10	174588	174597	20 %	20 %	20 %	40 %	238918143
118	NC_012779	GTCTG	2	10	175107	175116	0 %	40 %	40 %	20 %	238918143
119	NC_012779	GACTG	2	10	182021	182030	20 %	20 %	40 %	20 %	238918147
120	NC_012779	TCTGG	2	10	183249	183258	0 %	40 %	40 %	20 %	238918149
121	NC_012779	TGCGC	2	10	184979	184988	0 %	20 %	40 %	40 %	238918152
122	NC_012779	GCAAA	2	10	185990	185999	60 %	0 %	20 %	20 %	238918152
123	NC_012779	GCTGG	2	10	186575	186584	0 %	20 %	60 %	20 %	238918153
124	NC_012779	AGCGA	2	10	191472	191481	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012779	ATTGC	2	10	193054	193063	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012779	ATCGG	2	10	194519	194528	20 %	20 %	40 %	20 %	238918155
127	NC_012779	CAGCG	2	10	197782	197791	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012779	GCGTG	2	10	198798	198807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012779	TGAGC	2	10	201951	201960	20 %	20 %	40 %	20 %	238918164
130	NC_012779	CTGGA	2	10	202168	202177	20 %	20 %	40 %	20 %	238918164
131	NC_012779	TTTGA	2	10	202737	202746	20 %	60 %	20 %	0 %	238918165
132	NC_012779	GATCT	2	10	202779	202788	20 %	40 %	20 %	20 %	238918165
133	NC_012779	ACGCG	2	10	203213	203222	20 %	0 %	40 %	40 %	238918166
134	NC_012779	GATGC	2	10	203926	203935	20 %	20 %	40 %	20 %	238918166
135	NC_012779	CTGTT	2	10	204995	205004	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012779	GCCTG	2	10	207802	207811	0 %	20 %	40 %	40 %	238918168
137	NC_012779	CCTAC	2	10	209807	209816	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012779	GCCGC	2	10	209868	209877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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249	NC_012779	GCGTT	2	10	387473	387482	0 %	40 %	40 %	20 %	238918340
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