MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 3386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	218698421
2	NC_011750	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	218698422
3	NC_011750	CGCAG	2	10	8245	8254	20 %	0 %	40 %	40 %	218698427
4	NC_011750	CGTAC	2	10	9673	9682	20 %	20 %	20 %	40 %	218698428
5	NC_011750	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011750	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	218698435
7	NC_011750	CGGAC	2	10	17978	17987	20 %	0 %	40 %	40 %	218698435
8	NC_011750	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011750	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011750	AAATG	2	10	19545	19554	60 %	20 %	20 %	0 %	218698436
11	NC_011750	CTCAT	2	10	19810	19819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011750	CCGAT	2	10	20302	20311	20 %	20 %	20 %	40 %	218698437
13	NC_011750	AGCGA	2	10	20690	20699	40 %	0 %	40 %	20 %	218698437
14	NC_011750	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	218698437
15	NC_011750	GTTTT	2	10	23107	23116	0 %	80 %	20 %	0 %	218698440
16	NC_011750	TTTAT	2	10	24163	24172	20 %	80 %	0 %	0 %	218698440
17	NC_011750	AATGT	2	10	25639	25648	40 %	40 %	20 %	0 %	218698441
18	NC_011750	TGCAA	2	10	25852	25861	40 %	20 %	20 %	20 %	218698441
19	NC_011750	ATAAA	2	10	25923	25932	80 %	20 %	0 %	0 %	218698441
20	NC_011750	TAAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	218698441
21	NC_011750	GTAAT	2	10	28248	28257	40 %	40 %	20 %	0 %	218698443
22	NC_011750	TTAAT	2	10	28572	28581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011750	CAGTA	2	10	34847	34856	40 %	20 %	20 %	20 %	218698449
24	NC_011750	GCGAA	2	10	40642	40651	40 %	0 %	40 %	20 %	218698453
25	NC_011750	CCGTT	2	10	41536	41545	0 %	40 %	20 %	40 %	218698453
26	NC_011750	CACGG	2	10	41913	41922	20 %	0 %	40 %	40 %	218698453
27	NC_011750	GATGC	2	10	42904	42913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011750	CGAAT	2	10	44655	44664	40 %	20 %	20 %	20 %	218698457
29	NC_011750	CCATG	2	10	46192	46201	20 %	20 %	20 %	40 %	218698458
30	NC_011750	CCGTA	2	10	47838	47847	20 %	20 %	20 %	40 %	218698459
31	NC_011750	TTAAA	2	10	48576	48585	60 %	40 %	0 %	0 %	218698459
32	NC_011750	ACCCA	2	10	49319	49328	40 %	0 %	0 %	60 %	218698460
33	NC_011750	TTTGA	2	10	50945	50954	20 %	60 %	20 %	0 %	218698461
34	NC_011750	CGGCG	2	10	51196	51205	0 %	0 %	60 %	40 %	218698461
35	NC_011750	AATCA	2	10	51478	51487	60 %	20 %	0 %	20 %	218698462
36	NC_011750	CGGTT	2	10	52433	52442	0 %	40 %	40 %	20 %	218698463
37	NC_011750	TGGCG	2	10	54124	54133	0 %	20 %	60 %	20 %	218698465
38	NC_011750	TGCAC	2	10	55886	55895	20 %	20 %	20 %	40 %	218698466
39	NC_011750	GAAAC	2	10	57818	57827	60 %	0 %	20 %	20 %	218698467
40	NC_011750	AATCC	2	10	58987	58996	40 %	20 %	0 %	40 %	218698470
41	NC_011750	AACGT	2	10	60291	60300	40 %	20 %	20 %	20 %	218698472
42	NC_011750	GCGTC	2	10	63275	63284	0 %	20 %	40 %	40 %	218698475
43	NC_011750	ATGTT	2	10	64089	64098	20 %	60 %	20 %	0 %	218698476
44	NC_011750	CTTCG	2	10	64522	64531	0 %	40 %	20 %	40 %	218698476
45	NC_011750	TGCGT	2	10	64808	64817	0 %	40 %	40 %	20 %	218698476
46	NC_011750	CGTGG	2	10	67985	67994	0 %	20 %	60 %	20 %	218698479
47	NC_011750	GTTCA	2	10	68401	68410	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011750	AAAGT	2	10	71978	71987	60 %	20 %	20 %	0 %	218698481
49	NC_011750	GTGCT	2	10	73241	73250	0 %	40 %	40 %	20 %	218698482
50	NC_011750	GGTGA	2	10	74225	74234	20 %	20 %	60 %	0 %	218698482
51	NC_011750	CAGCG	2	10	75508	75517	20 %	0 %	40 %	40 %	218698484
52	NC_011750	TTGAT	2	10	77588	77597	20 %	60 %	20 %	0 %	218698485
53	NC_011750	TTTTC	2	10	81197	81206	0 %	80 %	0 %	20 %	218698487
54	NC_011750	AAAGC	2	10	81501	81510	60 %	0 %	20 %	20 %	218698488
55	NC_011750	TAGTG	2	10	86051	86060	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011750	GGCAA	2	10	86476	86485	40 %	0 %	40 %	20 %	218698493
57	NC_011750	TTGCT	2	10	87212	87221	0 %	60 %	20 %	20 %	218698494
58	NC_011750	GATGG	2	10	87948	87957	20 %	20 %	60 %	0 %	218698494
59	NC_011750	ATTTT	2	10	88776	88785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011750	GGGAG	2	10	88940	88949	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011750	CGCCA	2	10	89004	89013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011750	CCTGG	2	10	90201	90210	0 %	20 %	40 %	40 %	218698496
63	NC_011750	GACCG	2	10	92468	92477	20 %	0 %	40 %	40 %	218698498
64	NC_011750	ATGTT	2	10	95016	95025	20 %	60 %	20 %	0 %	218698500
65	NC_011750	AAAAC	2	10	95431	95440	80 %	0 %	0 %	20 %	218698500
66	NC_011750	TGCAT	2	10	95956	95965	20 %	40 %	20 %	20 %	218698501
67	NC_011750	ATTCC	2	10	96126	96135	20 %	40 %	0 %	40 %	218698501
68	NC_011750	AGTTC	2	10	101219	101228	20 %	40 %	20 %	20 %	218698505
69	NC_011750	TATCG	2	10	103099	103108	20 %	40 %	20 %	20 %	218698507
70	NC_011750	GGGCT	2	10	106971	106980	0 %	20 %	60 %	20 %	218698510
71	NC_011750	TCTGG	2	10	108678	108687	0 %	40 %	40 %	20 %	218698512
72	NC_011750	ACCGT	2	10	109344	109353	20 %	20 %	20 %	40 %	218698512
73	NC_011750	ATCAG	2	10	111117	111126	40 %	20 %	20 %	20 %	218698514
74	NC_011750	AGCCG	2	10	112885	112894	20 %	0 %	40 %	40 %	218698515
75	NC_011750	GCGCA	2	10	115213	115222	20 %	0 %	40 %	40 %	218698517
76	NC_011750	TGGCG	2	10	116208	116217	0 %	20 %	60 %	20 %	218698518
77	NC_011750	CGCGG	2	10	122384	122393	0 %	0 %	60 %	40 %	218698523
78	NC_011750	CATCG	2	10	124641	124650	20 %	20 %	20 %	40 %	218698526
79	NC_011750	TAACG	2	10	125335	125344	40 %	20 %	20 %	20 %	218698526
80	NC_011750	ATGCC	2	10	125794	125803	20 %	20 %	20 %	40 %	218698526
81	NC_011750	AATGC	2	10	127077	127086	40 %	20 %	20 %	20 %	218698527
82	NC_011750	TCTGT	2	10	128023	128032	0 %	60 %	20 %	20 %	218698529
83	NC_011750	AGCAG	2	10	130454	130463	40 %	0 %	40 %	20 %	218698532
84	NC_011750	CGAAG	2	10	132369	132378	40 %	0 %	40 %	20 %	218698533
85	NC_011750	ACACG	2	10	132502	132511	40 %	0 %	20 %	40 %	218698533
86	NC_011750	TCGCG	2	10	132763	132772	0 %	20 %	40 %	40 %	218698533
87	NC_011750	GCATC	2	10	132853	132862	20 %	20 %	20 %	40 %	218698533
88	NC_011750	GACTG	2	10	134171	134180	20 %	20 %	40 %	20 %	218698534
89	NC_011750	AGAGC	2	10	134581	134590	40 %	0 %	40 %	20 %	218698534
90	NC_011750	AGGCG	2	10	139736	139745	20 %	0 %	60 %	20 %	218698537
91	NC_011750	TCTGG	2	10	143135	143144	0 %	40 %	40 %	20 %	218698538
92	NC_011750	GGGCA	2	10	144546	144555	20 %	0 %	60 %	20 %	218698539
93	NC_011750	CAGCG	2	10	144825	144834	20 %	0 %	40 %	40 %	218698540
94	NC_011750	ACGAC	2	10	146105	146114	40 %	0 %	20 %	40 %	218698541
95	NC_011750	TTCAG	2	10	150293	150302	20 %	40 %	20 %	20 %	218698544
96	NC_011750	AGCGC	2	10	150863	150872	20 %	0 %	40 %	40 %	218698544
97	NC_011750	CCGTC	2	10	151655	151664	0 %	20 %	20 %	60 %	218698545
98	NC_011750	GTGAA	2	10	151665	151674	40 %	20 %	40 %	0 %	218698545
99	NC_011750	GGCAT	2	10	151827	151836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011750	GTTCA	2	10	152052	152061	20 %	40 %	20 %	20 %	218698546
101	NC_011750	ATCCA	2	10	152378	152387	40 %	20 %	0 %	40 %	218698546
102	NC_011750	GTAAG	2	10	152591	152600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011750	TTTAT	2	10	153642	153651	20 %	80 %	0 %	0 %	218698548
104	NC_011750	ATTTG	2	10	154254	154263	20 %	60 %	20 %	0 %	218698548
105	NC_011750	TCCTC	2	10	154311	154320	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_011750	CGGGC	2	10	155056	155065	0 %	0 %	60 %	40 %	218698550
107	NC_011750	TTTCA	2	10	156181	156190	20 %	60 %	0 %	20 %	218698551
108	NC_011750	TGTGG	2	10	161945	161954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011750	AAATT	2	10	168540	168549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011750	GCGAG	2	10	169908	169917	20 %	0 %	60 %	20 %	218698564
111	NC_011750	TGGCG	2	10	170345	170354	0 %	20 %	60 %	20 %	218698564
112	NC_011750	ACCAC	2	10	173249	173258	40 %	0 %	0 %	60 %	218698568
113	NC_011750	GGCGT	2	10	174952	174961	0 %	20 %	60 %	20 %	218698569
114	NC_011750	CTGCG	2	10	178025	178034	0 %	20 %	40 %	40 %	218698570
115	NC_011750	TTATC	2	10	178801	178810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011750	GCAAA	2	10	180057	180066	60 %	0 %	20 %	20 %	218698571
117	NC_011750	TGGCG	2	10	180403	180412	0 %	20 %	60 %	20 %	218698571
118	NC_011750	AACCT	2	10	182220	182229	40 %	20 %	0 %	40 %	218698573
119	NC_011750	TGGTC	2	10	182262	182271	0 %	40 %	40 %	20 %	218698573
120	NC_011750	TGGCG	2	10	183507	183516	0 %	20 %	60 %	20 %	218698574
121	NC_011750	CGGCG	2	10	184137	184146	0 %	0 %	60 %	40 %	218698574
122	NC_011750	TTCCA	2	10	184748	184757	20 %	40 %	0 %	40 %	218698574
123	NC_011750	GGTCC	2	10	189071	189080	0 %	20 %	40 %	40 %	218698579
124	NC_011750	ACGGG	2	10	190988	190997	20 %	0 %	60 %	20 %	218698581
125	NC_011750	GTGAT	2	10	193147	193156	20 %	40 %	40 %	0 %	218698582
126	NC_011750	GTGAT	2	10	193438	193447	20 %	40 %	40 %	0 %	218698582
127	NC_011750	TACGT	2	10	193683	193692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011750	TGGCC	2	10	195373	195382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011750	GCCAG	2	10	197122	197131	20 %	0 %	40 %	40 %	218698586
130	NC_011750	GCTGT	2	10	197476	197485	0 %	40 %	40 %	20 %	218698586
131	NC_011750	GGCGT	2	10	197960	197969	0 %	20 %	60 %	20 %	218698586
132	NC_011750	GTTCT	2	10	198563	198572	0 %	60 %	20 %	20 %	218698586
133	NC_011750	CTGAA	2	10	200555	200564	40 %	20 %	20 %	20 %	218698588
134	NC_011750	AAGCG	2	10	200619	200628	40 %	0 %	40 %	20 %	218698588
135	NC_011750	TGGTG	2	10	202402	202411	0 %	40 %	60 %	0 %	218698590
136	NC_011750	TGCAC	2	10	202528	202537	20 %	20 %	20 %	40 %	218698590
137	NC_011750	TGCGC	2	10	202921	202930	0 %	20 %	40 %	40 %	218698590
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150	NC_011750	CCACG	2	10	224324	224333	20 %	0 %	20 %	60 %	218698609
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259	NC_011750	ATTTT	2	10	412338	412347	20 %	80 %	0 %	0 %	218698786
260	NC_011750	GGGAA	2	10	412852	412861	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
261	NC_011750	CTGCT	2	10	413360	413369	0 %	40 %	20 %	40 %	218698787
262	NC_011750	GCATT	2	10	413412	413421	20 %	40 %	20 %	20 %	218698787
263	NC_011750	AACAT	2	10	413562	413571	60 %	20 %	0 %	20 %	218698787
264	NC_011750	TTTTG	2	10	417357	417366	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_011750	CGGTA	2	10	421641	421650	20 %	20 %	40 %	20 %	218698795
267	NC_011750	TGATC	2	10	424766	424775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_011750	CACGC	2	10	426208	426217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
269	NC_011750	AAGGT	2	10	428158	428167	40 %	20 %	40 %	0 %	218698797
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273	NC_011750	CTTAC	2	10	431217	431226	20 %	40 %	0 %	40 %	218698800
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277	NC_011750	GTTAT	2	10	434142	434151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_011750	CGTAT	2	10	450382	450391	20 %	40 %	20 %	20 %	218698817
288	NC_011750	CTGAG	2	10	453555	453564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_011750	CCATT	2	10	454724	454733	20 %	40 %	0 %	40 %	218698821
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307	NC_011750	AAATC	2	10	485696	485705	60 %	20 %	0 %	20 %	218698850
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