MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 105005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011750	AAT	2	6	145701	145706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698541
3002	NC_011750	GA	3	6	145714	145719	50 %	0 %	50 %	0 %	218698541
3003	NC_011750	CGT	2	6	145730	145735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3004	NC_011750	ATG	2	6	145759	145764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698541
3005	NC_011750	CCG	2	6	145765	145770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698541
3006	NC_011750	CGC	2	6	145785	145790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698541
3007	NC_011750	CTT	2	6	145847	145852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698541
3008	NC_011750	CTG	2	6	145854	145859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3009	NC_011750	CGA	2	6	145883	145888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3010	NC_011750	CTGG	2	8	146001	146008	0 %	25 %	50 %	25 %	218698541
3011	NC_011750	TCG	2	6	146032	146037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3012	NC_011750	TCG	2	6	146059	146064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3013	NC_011750	ACGAC	2	10	146105	146114	40 %	0 %	20 %	40 %	218698541
3014	NC_011750	CCA	2	6	146129	146134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698541
3015	NC_011750	GCA	2	6	146174	146179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698541
3016	NC_011750	CGC	3	9	146189	146197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698541
3017	NC_011750	TCA	2	6	146249	146254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698541
3018	NC_011750	GGT	2	6	146283	146288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698541
3019	NC_011750	TAC	2	6	146292	146297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698541
3020	NC_011750	GCG	2	6	146326	146331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698541
3021	NC_011750	T	8	8	146436	146443	0 %	100 %	0 %	0 %	218698541
3022	NC_011750	CCT	2	6	146460	146465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_011750	A	7	7	146480	146486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011750	ATA	2	6	146496	146501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011750	ATT	2	6	146555	146560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698542
3026	NC_011750	T	6	6	146607	146612	0 %	100 %	0 %	0 %	218698542
3027	NC_011750	AATGCC	2	12	146622	146633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218698542
3028	NC_011750	A	6	6	146718	146723	100 %	0 %	0 %	0 %	218698542
3029	NC_011750	CGA	2	6	146734	146739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698542
3030	NC_011750	TTC	2	6	146776	146781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698542
3031	NC_011750	AGA	2	6	146924	146929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698542
3032	NC_011750	GCGA	2	8	146946	146953	25 %	0 %	50 %	25 %	218698542
3033	NC_011750	CGA	2	6	146956	146961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698542
3034	NC_011750	ATT	2	6	146964	146969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698542
3035	NC_011750	CGT	2	6	147075	147080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698543
3036	NC_011750	GCG	2	6	147150	147155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3037	NC_011750	CTG	2	6	147285	147290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698543
3038	NC_011750	CGG	2	6	147295	147300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3039	NC_011750	CAAC	2	8	147341	147348	50 %	0 %	0 %	50 %	218698543
3040	NC_011750	CGG	2	6	147404	147409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3041	NC_011750	ATT	2	6	147420	147425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698543
3042	NC_011750	CTG	2	6	147479	147484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698543
3043	NC_011750	GCTG	2	8	147533	147540	0 %	25 %	50 %	25 %	218698543
3044	NC_011750	TGG	2	6	147544	147549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698543
3045	NC_011750	TGC	2	6	147580	147585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698543
3046	NC_011750	TGA	2	6	147602	147607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
3047	NC_011750	A	6	6	147630	147635	100 %	0 %	0 %	0 %	218698543
3048	NC_011750	GATT	2	8	147653	147660	25 %	50 %	25 %	0 %	218698543
3049	NC_011750	TGA	2	6	147673	147678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
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3051	NC_011750	TGGC	2	8	147752	147759	0 %	25 %	50 %	25 %	218698543
3052	NC_011750	CGCT	2	8	147792	147799	0 %	25 %	25 %	50 %	218698543
3053	NC_011750	CCA	2	6	147808	147813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698543
3054	NC_011750	CGG	2	6	147848	147853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3055	NC_011750	GGTGAA	2	12	147869	147880	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218698543
3056	NC_011750	TGG	2	6	147919	147924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698543
3057	NC_011750	ACA	2	6	147934	147939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698543
3058	NC_011750	GCCT	2	8	148075	148082	0 %	25 %	25 %	50 %	218698543
3059	NC_011750	CT	3	6	148125	148130	0 %	50 %	0 %	50 %	218698543
3060	NC_011750	ATG	2	6	148149	148154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
3061	NC_011750	GGAT	2	8	148201	148208	25 %	25 %	50 %	0 %	218698543
3062	NC_011750	GAT	2	6	148217	148222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
3063	NC_011750	CGG	2	6	148262	148267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3064	NC_011750	CCA	2	6	148280	148285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698543
3065	NC_011750	GCG	3	9	148335	148343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698543
3066	NC_011750	ATG	2	6	148386	148391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
3067	NC_011750	CG	3	6	148464	148469	0 %	0 %	50 %	50 %	218698543
3068	NC_011750	GAT	2	6	148595	148600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698543
3069	NC_011750	TC	3	6	148648	148653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_011750	CAT	2	6	148674	148679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698544
3071	NC_011750	CAA	2	6	148695	148700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698544
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3076	NC_011750	GCG	2	6	148877	148882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698544
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3079	NC_011750	GCG	2	6	148983	148988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698544
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3082	NC_011750	GCT	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698544
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3099	NC_011750	CTT	2	6	150468	150473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698544
3100	NC_011750	AGGC	2	8	150546	150553	25 %	0 %	50 %	25 %	218698544
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3104	NC_011750	ACC	2	6	150680	150685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698544
3105	NC_011750	GAA	2	6	150757	150762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698544
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3108	NC_011750	AGCGC	2	10	150863	150872	20 %	0 %	40 %	40 %	218698544
3109	NC_011750	GTA	2	6	150928	150933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698544
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3111	NC_011750	CCAG	2	8	150954	150961	25 %	0 %	25 %	50 %	218698544
3112	NC_011750	TGC	2	6	150994	150999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698544
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3114	NC_011750	TAG	2	6	151088	151093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011750	AATT	2	8	151095	151102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011750	TG	3	6	151116	151121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011750	TCA	2	6	151126	151131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_011750	TTA	2	6	151143	151148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011750	GAAT	2	8	151160	151167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011750	TTG	2	6	151199	151204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011750	GTC	2	6	151326	151331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698545
3122	NC_011750	TGG	2	6	151374	151379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698545
3123	NC_011750	CTG	2	6	151382	151387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698545
3124	NC_011750	TTTATG	2	12	151397	151408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218698545
3125	NC_011750	CCA	2	6	151485	151490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698545
3126	NC_011750	TTG	2	6	151551	151556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698545
3127	NC_011750	ATC	2	6	151562	151567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698545
3128	NC_011750	GCT	2	6	151642	151647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698545
3129	NC_011750	CCGTC	2	10	151655	151664	0 %	20 %	20 %	60 %	218698545
3130	NC_011750	GTGAA	2	10	151665	151674	40 %	20 %	40 %	0 %	218698545
3131	NC_011750	TGG	2	6	151719	151724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698545
3132	NC_011750	CTG	2	6	151784	151789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698545
3133	NC_011750	GGCAT	2	10	151827	151836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3134	NC_011750	TGG	2	6	151913	151918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698546
3135	NC_011750	GCA	2	6	151937	151942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698546
3136	NC_011750	CGT	2	6	151946	151951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698546
3137	NC_011750	TGG	2	6	152015	152020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698546
3138	NC_011750	GTTCA	2	10	152052	152061	20 %	40 %	20 %	20 %	218698546
3139	NC_011750	CA	3	6	152060	152065	50 %	0 %	0 %	50 %	218698546
3140	NC_011750	GCA	2	6	152138	152143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698546
3141	NC_011750	GTT	2	6	152148	152153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698546
3142	NC_011750	CGC	3	9	152192	152200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698546
3143	NC_011750	ATA	2	6	152218	152223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698546
3144	NC_011750	ATCCA	2	10	152378	152387	40 %	20 %	0 %	40 %	218698546
3145	NC_011750	TTGCGC	2	12	152403	152414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698546
3146	NC_011750	A	6	6	152424	152429	100 %	0 %	0 %	0 %	218698546
3147	NC_011750	CCA	2	6	152444	152449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698546
3148	NC_011750	TTG	2	6	152470	152475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698546
3149	NC_011750	TGA	2	6	152477	152482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698546
3150	NC_011750	AAT	2	6	152524	152529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_011750	GTAAG	2	10	152591	152600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_011750	A	7	7	152640	152646	100 %	0 %	0 %	0 %	218698547
3153	NC_011750	GGC	2	6	152655	152660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698547
3154	NC_011750	TAT	2	6	152756	152761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698547
3155	NC_011750	CT	3	6	152765	152770	0 %	50 %	0 %	50 %	218698547
3156	NC_011750	TAAA	2	8	152773	152780	75 %	25 %	0 %	0 %	218698547
3157	NC_011750	CGGG	2	8	152786	152793	0 %	0 %	75 %	25 %	218698547
3158	NC_011750	GCA	2	6	152894	152899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698547
3159	NC_011750	TAC	2	6	152922	152927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698547
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3161	NC_011750	AACG	2	8	153000	153007	50 %	0 %	25 %	25 %	218698547
3162	NC_011750	CGGG	2	8	153022	153029	0 %	0 %	75 %	25 %	218698547
3163	NC_011750	CTG	2	6	153078	153083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698547
3164	NC_011750	CGA	2	6	153089	153094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698547
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3166	NC_011750	CGC	2	6	153123	153128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698547
3167	NC_011750	CAC	2	6	153167	153172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698547
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3169	NC_011750	AC	3	6	153186	153191	50 %	0 %	0 %	50 %	218698547
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3175	NC_011750	TGTT	2	8	153493	153500	0 %	75 %	25 %	0 %	218698547
3176	NC_011750	ATG	2	6	153533	153538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698547
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3179	NC_011750	ATG	2	6	153734	153739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698548
3180	NC_011750	TCA	2	6	153773	153778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698548
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3182	NC_011750	GCT	2	6	153814	153819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698548
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3190	NC_011750	ATTTG	2	10	154254	154263	20 %	60 %	20 %	0 %	218698548
3191	NC_011750	TCCTC	2	10	154311	154320	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3192	NC_011750	GAG	2	6	154334	154339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3193	NC_011750	GAC	2	6	154344	154349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3194	NC_011750	AGG	2	6	154396	154401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3195	NC_011750	TTA	2	6	154421	154426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698549
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3200	NC_011750	TCT	2	6	154592	154597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698549
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3202	NC_011750	AGT	2	6	154780	154785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698549
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3205	NC_011750	GTT	2	6	154886	154891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3206	NC_011750	T	6	6	154905	154910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3207	NC_011750	ACAA	2	8	154916	154923	75 %	0 %	0 %	25 %	218698550
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3224	NC_011750	GCA	2	6	155986	155991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698550
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3228	NC_011750	TTTCA	2	10	156181	156190	20 %	60 %	0 %	20 %	218698551
3229	NC_011750	CTT	2	6	156234	156239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698551
3230	NC_011750	GAT	2	6	156265	156270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698551
3231	NC_011750	GCC	2	6	156299	156304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698551
3232	NC_011750	AAT	2	6	156319	156324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698551
3233	NC_011750	GCA	2	6	156507	156512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698551
3234	NC_011750	CAG	2	6	156642	156647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3235	NC_011750	GCT	2	6	156709	156714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3236	NC_011750	GGC	2	6	156731	156736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_011750	GAC	2	6	156738	156743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_011750	GC	3	6	156745	156750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3239	NC_011750	ACA	2	6	156778	156783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_011750	GATG	2	8	156798	156805	25 %	25 %	50 %	0 %	218698552
3241	NC_011750	ATG	2	6	156824	156829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698552
3242	NC_011750	ATGC	2	8	156850	156857	25 %	25 %	25 %	25 %	218698552
3243	NC_011750	TG	3	6	156911	156916	0 %	50 %	50 %	0 %	218698552
3244	NC_011750	GAA	2	6	156955	156960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698552
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3493	NC_011750	ACG	2	6	169229	169234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698564
3494	NC_011750	GAC	2	6	169252	169257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698564
3495	NC_011750	ACG	3	9	169262	169270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698564
3496	NC_011750	TTC	2	6	169280	169285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698564
3497	NC_011750	TGG	2	6	169316	169321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698564
3498	NC_011750	CCA	2	6	169343	169348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698564
3499	NC_011750	CAG	2	6	169436	169441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698564
3500	NC_011750	GAC	2	6	169462	169467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698564

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