MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli 55989 chromosome

Total Repeats: 3411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011748	CGCTG	2	10	705	714	0 %	20 %	40 %	40 %	218693478
2	NC_011748	ATTGC	2	10	3408	3417	20 %	40 %	20 %	20 %	218693479
3	NC_011748	CGCAG	2	10	8372	8381	20 %	0 %	40 %	40 %	218693484
4	NC_011748	CGTAC	2	10	9800	9809	20 %	20 %	20 %	40 %	218693485
5	NC_011748	CGCGC	2	10	10787	10796	0 %	0 %	40 %	60 %	218693487
6	NC_011748	TCAGG	2	10	14678	14687	20 %	20 %	40 %	20 %	218693490
7	NC_011748	CCGAT	2	10	16504	16513	20 %	20 %	20 %	40 %	218693491
8	NC_011748	AGCGA	2	10	16892	16901	40 %	0 %	40 %	20 %	218693491
9	NC_011748	GTTTT	2	10	19310	19319	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011748	TTTAT	2	10	20366	20375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011748	ATTGC	2	10	21688	21697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011748	TTAAT	2	10	22322	22331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011748	CAGTA	2	10	28597	28606	40 %	20 %	20 %	20 %	218693500
14	NC_011748	ATTTA	2	10	31154	31163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011748	GCGAA	2	10	34392	34401	40 %	0 %	40 %	20 %	218693504
16	NC_011748	CCGTT	2	10	35286	35295	0 %	40 %	20 %	40 %	218693504
17	NC_011748	CACGG	2	10	35663	35672	20 %	0 %	40 %	40 %	218693504
18	NC_011748	CGAAT	2	10	38372	38381	40 %	20 %	20 %	20 %	218693509
19	NC_011748	CCATG	2	10	39910	39919	20 %	20 %	20 %	40 %	218693510
20	NC_011748	CCGTA	2	10	41556	41565	20 %	20 %	20 %	40 %	218693511
21	NC_011748	GTACA	2	10	42046	42055	40 %	20 %	20 %	20 %	218693511
22	NC_011748	TTAAA	2	10	42294	42303	60 %	40 %	0 %	0 %	218693511
23	NC_011748	ACCCA	2	10	43037	43046	40 %	0 %	0 %	60 %	218693512
24	NC_011748	TTTGA	2	10	44664	44673	20 %	60 %	20 %	0 %	218693513
25	NC_011748	CGGCG	2	10	44915	44924	0 %	0 %	60 %	40 %	218693513
26	NC_011748	AATCA	2	10	45197	45206	60 %	20 %	0 %	20 %	218693514
27	NC_011748	CGGTT	2	10	46152	46161	0 %	40 %	40 %	20 %	218693515
28	NC_011748	TGGCG	2	10	47844	47853	0 %	20 %	60 %	20 %	218693517
29	NC_011748	TGCAC	2	10	49606	49615	20 %	20 %	20 %	40 %	218693518
30	NC_011748	AGGGC	2	10	50691	50700	20 %	0 %	60 %	20 %	218693519
31	NC_011748	GGCGC	2	10	50725	50734	0 %	0 %	60 %	40 %	218693519
32	NC_011748	GAAAC	2	10	51538	51547	60 %	0 %	20 %	20 %	218693519
33	NC_011748	AACGT	2	10	53450	53459	40 %	20 %	20 %	20 %	218693522
34	NC_011748	GCGTC	2	10	56434	56443	0 %	20 %	40 %	40 %	218693525
35	NC_011748	ATGTT	2	10	57248	57257	20 %	60 %	20 %	0 %	218693526
36	NC_011748	CTTCG	2	10	57681	57690	0 %	40 %	20 %	40 %	218693526
37	NC_011748	TGCGT	2	10	57967	57976	0 %	40 %	40 %	20 %	218693526
38	NC_011748	AAAGT	2	10	63701	63710	60 %	20 %	20 %	0 %	218693529
39	NC_011748	AGTCG	2	10	64670	64679	20 %	20 %	40 %	20 %	218693530
40	NC_011748	GGTGA	2	10	65949	65958	20 %	20 %	60 %	0 %	218693530
41	NC_011748	TCGCG	2	10	68556	68565	0 %	20 %	40 %	40 %	218693532
42	NC_011748	TAGTG	2	10	76034	76043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011748	GATGG	2	10	76922	76931	20 %	20 %	60 %	0 %	218693539
44	NC_011748	ATTTT	2	10	77750	77759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011748	CTGGA	2	10	78822	78831	20 %	20 %	40 %	20 %	218693540
46	NC_011748	CTGGT	2	10	82115	82124	0 %	40 %	40 %	20 %	218693543
47	NC_011748	GACCG	2	10	82663	82672	20 %	0 %	40 %	40 %	218693544
48	NC_011748	ATGTT	2	10	85212	85221	20 %	60 %	20 %	0 %	218693546
49	NC_011748	TGCAT	2	10	86154	86163	20 %	40 %	20 %	20 %	218693547
50	NC_011748	ATTCC	2	10	86324	86333	20 %	40 %	0 %	40 %	218693547
51	NC_011748	AGTTC	2	10	91417	91426	20 %	40 %	20 %	20 %	218693551
52	NC_011748	CGTGG	2	10	92790	92799	0 %	20 %	60 %	20 %	218693553
53	NC_011748	TATCG	2	10	93297	93306	20 %	40 %	20 %	20 %	218693553
54	NC_011748	GCCTG	2	10	97629	97638	0 %	20 %	40 %	40 %	218693557
55	NC_011748	ACCGT	2	10	99542	99551	20 %	20 %	20 %	40 %	218693558
56	NC_011748	ATCAG	2	10	101315	101324	40 %	20 %	20 %	20 %	218693560
57	NC_011748	AGCCG	2	10	103083	103092	20 %	0 %	40 %	40 %	218693561
58	NC_011748	GCGCA	2	10	105411	105420	20 %	0 %	40 %	40 %	218693563
59	NC_011748	TGGCG	2	10	106405	106414	0 %	20 %	60 %	20 %	218693564
60	NC_011748	CCGGC	2	10	109375	109384	0 %	0 %	40 %	60 %	218693567
61	NC_011748	CGCGG	2	10	112584	112593	0 %	0 %	60 %	40 %	218693569
62	NC_011748	ATCCC	2	10	114828	114837	20 %	20 %	0 %	60 %	218693572
63	NC_011748	CATCG	2	10	114841	114850	20 %	20 %	20 %	40 %	218693572
64	NC_011748	TAACG	2	10	115535	115544	40 %	20 %	20 %	20 %	218693572
65	NC_011748	ATGCC	2	10	115994	116003	20 %	20 %	20 %	40 %	218693572
66	NC_011748	AATGC	2	10	117277	117286	40 %	20 %	20 %	20 %	218693573
67	NC_011748	TCTGT	2	10	118223	118232	0 %	60 %	20 %	20 %	218693575
68	NC_011748	GCATG	2	10	119316	119325	20 %	20 %	40 %	20 %	218693576
69	NC_011748	AGCAG	2	10	120654	120663	40 %	0 %	40 %	20 %	218693578
70	NC_011748	TCAGC	2	10	121522	121531	20 %	20 %	20 %	40 %	218693578
71	NC_011748	CGAAG	2	10	122569	122578	40 %	0 %	40 %	20 %	218693579
72	NC_011748	ACACG	2	10	122702	122711	40 %	0 %	20 %	40 %	218693579
73	NC_011748	TCGCG	2	10	122963	122972	0 %	20 %	40 %	40 %	218693579
74	NC_011748	GCATC	2	10	123053	123062	20 %	20 %	20 %	40 %	218693579
75	NC_011748	AGAGC	2	10	124781	124790	40 %	0 %	40 %	20 %	218693580
76	NC_011748	AGGCG	2	10	130053	130062	20 %	0 %	60 %	20 %	218693583
77	NC_011748	GGTTG	2	10	130710	130719	0 %	40 %	60 %	0 %	218693583
78	NC_011748	TCTGG	2	10	133356	133365	0 %	40 %	40 %	20 %	218693584
79	NC_011748	GGGCA	2	10	134768	134777	20 %	0 %	60 %	20 %	218693585
80	NC_011748	CAGCG	2	10	135047	135056	20 %	0 %	40 %	40 %	218693586
81	NC_011748	GGCTG	2	10	137758	137767	0 %	20 %	60 %	20 %	218693589
82	NC_011748	CCGTC	2	10	141877	141886	0 %	20 %	20 %	60 %	218693591
83	NC_011748	GTGAA	2	10	141887	141896	40 %	20 %	40 %	0 %	218693591
84	NC_011748	GGCAT	2	10	142049	142058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011748	GTTCA	2	10	142274	142283	20 %	40 %	20 %	20 %	218693592
86	NC_011748	ATCCA	2	10	142600	142609	40 %	20 %	0 %	40 %	218693592
87	NC_011748	GTAAG	2	10	142813	142822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011748	CTTTA	2	10	143863	143872	20 %	60 %	0 %	20 %	218693594
89	NC_011748	TGGCG	2	10	144090	144099	0 %	20 %	60 %	20 %	218693594
90	NC_011748	TCCTC	2	10	144533	144542	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_011748	CGGGC	2	10	145278	145287	0 %	0 %	60 %	40 %	218693596
92	NC_011748	TTTCA	2	10	146403	146412	20 %	60 %	0 %	20 %	218693597
93	NC_011748	GGGAG	2	10	147728	147737	20 %	0 %	80 %	0 %	218693598
94	NC_011748	TGAAG	2	10	149626	149635	40 %	20 %	40 %	0 %	218693600
95	NC_011748	ACCGC	2	10	149731	149740	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_011748	GCGGT	2	10	149750	149759	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011748	TTTGC	2	10	156716	156725	0 %	60 %	20 %	20 %	218693607
98	NC_011748	AAATT	2	10	157157	157166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011748	GCGAG	2	10	158524	158533	20 %	0 %	60 %	20 %	218693609
100	NC_011748	GGCGT	2	10	158962	158971	0 %	20 %	60 %	20 %	218693609
101	NC_011748	ATCAG	2	10	159600	159609	40 %	20 %	20 %	20 %	218693610
102	NC_011748	ACCAC	2	10	161865	161874	40 %	0 %	0 %	60 %	218693613
103	NC_011748	GGCGT	2	10	163568	163577	0 %	20 %	60 %	20 %	218693614
104	NC_011748	CGACG	2	10	164607	164616	20 %	0 %	40 %	40 %	218693614
105	NC_011748	TTATC	2	10	167519	167528	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011748	AAAAC	2	10	168594	168603	80 %	0 %	0 %	20 %	218693616
107	NC_011748	TGGTT	2	10	168851	168860	0 %	60 %	40 %	0 %	218693616
108	NC_011748	AACCT	2	10	170932	170941	40 %	20 %	0 %	40 %	218693618
109	NC_011748	TGGTC	2	10	170974	170983	0 %	40 %	40 %	20 %	218693618
110	NC_011748	TGGCG	2	10	172219	172228	0 %	20 %	60 %	20 %	218693619
111	NC_011748	CGGCG	2	10	172849	172858	0 %	0 %	60 %	40 %	218693619
112	NC_011748	TGGTG	2	10	172861	172870	0 %	40 %	60 %	0 %	218693619
113	NC_011748	TTCCA	2	10	173460	173469	20 %	40 %	0 %	40 %	218693619
114	NC_011748	GGTCC	2	10	177783	177792	0 %	20 %	40 %	40 %	218693624
115	NC_011748	ACGGG	2	10	179700	179709	20 %	0 %	60 %	20 %	218693626
116	NC_011748	GTGAT	2	10	181859	181868	20 %	40 %	40 %	0 %	218693627
117	NC_011748	GTGAT	2	10	182150	182159	20 %	40 %	40 %	0 %	218693627
118	NC_011748	TACGT	2	10	182395	182404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011748	TGGCC	2	10	184120	184129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011748	GCCAG	2	10	185869	185878	20 %	0 %	40 %	40 %	218693631
121	NC_011748	GTTCT	2	10	187310	187319	0 %	60 %	20 %	20 %	218693631
122	NC_011748	CTGAA	2	10	189302	189311	40 %	20 %	20 %	20 %	218693634
123	NC_011748	AAGCG	2	10	189366	189375	40 %	0 %	40 %	20 %	218693634
124	NC_011748	TGGTG	2	10	191272	191281	0 %	40 %	60 %	0 %	218693636
125	NC_011748	TGCAC	2	10	191398	191407	20 %	20 %	20 %	40 %	218693636
126	NC_011748	TGCGC	2	10	191791	191800	0 %	20 %	40 %	40 %	218693636
127	NC_011748	AAATA	2	10	192013	192022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011748	GTCTG	2	10	192098	192107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011748	CATGG	2	10	193634	193643	20 %	20 %	40 %	20 %	218693638
130	NC_011748	CAGAT	2	10	194673	194682	40 %	20 %	20 %	20 %	218693639
131	NC_011748	ACTTT	2	10	194806	194815	20 %	60 %	0 %	20 %	218693639
132	NC_011748	GACGT	2	10	198726	198735	20 %	20 %	40 %	20 %	218693642
133	NC_011748	CGACG	2	10	200553	200562	20 %	0 %	40 %	40 %	218693644
134	NC_011748	ATGCC	2	10	203121	203130	20 %	20 %	20 %	40 %	218693647
135	NC_011748	GGATG	2	10	203383	203392	20 %	20 %	60 %	0 %	218693647
136	NC_011748	TGGCC	2	10	204447	204456	0 %	20 %	40 %	40 %	218693649
137	NC_011748	ACCGC	2	10	204460	204469	20 %	0 %	20 %	60 %	218693649
138	NC_011748	GTAAC	2	10	205190	205199	40 %	20 %	20 %	20 %	218693649
139	NC_011748	AGCCG	2	10	205818	205827	20 %	0 %	40 %	40 %	218693649
140	NC_011748	GGTGG	2	10	205927	205936	0 %	20 %	80 %	0 %	218693649
141	NC_011748	TTAAC	2	10	214070	214079	40 %	40 %	0 %	20 %	218693656
142	NC_011748	TGCGC	2	10	215282	215291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_011748	GAAAG	2	10	216360	216369	60 %	0 %	40 %	0 %	218693659
144	NC_011748	ACGGT	2	10	218215	218224	20 %	20 %	40 %	20 %	218693660
145	NC_011748	TGATT	2	10	221057	221066	20 %	60 %	20 %	0 %	218693663
146	NC_011748	CGGTT	2	10	224020	224029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011748	TTAAG	2	10	230641	230650	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011748	AACAT	2	10	230877	230886	60 %	20 %	0 %	20 %	218693669
149	NC_011748	ACACC	2	10	231171	231180	40 %	0 %	0 %	60 %	218693669
150	NC_011748	CAATC	2	10	231379	231388	40 %	20 %	0 %	40 %	218693669
151	NC_011748	TAATT	2	10	234546	234555	40 %	60 %	0 %	0 %	218693672
152	NC_011748	ACTTA	2	10	236516	236525	40 %	40 %	0 %	20 %	218693674
153	NC_011748	ACTGG	2	10	237484	237493	20 %	20 %	40 %	20 %	218693675
154	NC_011748	CGCGG	2	10	238529	238538	0 %	0 %	60 %	40 %	218693677
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156	NC_011748	TGATC	2	10	242260	242269	20 %	40 %	20 %	20 %	218693680
157	NC_011748	GCGCG	2	10	243965	243974	0 %	0 %	60 %	40 %	218693682
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162	NC_011748	GCGCA	2	10	250733	250742	20 %	0 %	40 %	40 %	218693685
163	NC_011748	GGTCA	2	10	253448	253457	20 %	20 %	40 %	20 %	218693687
164	NC_011748	GGGCA	2	10	253479	253488	20 %	0 %	60 %	20 %	218693687
165	NC_011748	ATTTC	2	10	253989	253998	20 %	60 %	0 %	20 %	218693687
166	NC_011748	CCAGC	2	10	256221	256230	20 %	0 %	20 %	60 %	218693690
167	NC_011748	CCAGG	2	10	256878	256887	20 %	0 %	40 %	40 %	218693690
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172	NC_011748	CTAAT	2	10	262073	262082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_011748	ACTGT	2	10	263128	263137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_011748	AAGGC	2	10	265141	265150	40 %	0 %	40 %	20 %	218693698
175	NC_011748	GCCCG	2	10	265617	265626	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
176	NC_011748	ACGCG	2	10	267089	267098	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_011748	TGACC	2	10	267483	267492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_011748	AGCAA	2	10	269035	269044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_011748	GGGCA	2	10	269600	269609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
180	NC_011748	AAAAG	2	10	270078	270087	80 %	0 %	20 %	0 %	218693700
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182	NC_011748	ATATT	2	10	270561	270570	40 %	60 %	0 %	0 %	218693701
183	NC_011748	GATGC	2	10	276887	276896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_011748	AAACG	2	10	278458	278467	60 %	0 %	20 %	20 %	218693708
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194	NC_011748	GATGC	2	10	291268	291277	20 %	20 %	40 %	20 %	218693722
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196	NC_011748	TGCTT	2	10	293653	293662	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
197	NC_011748	GTGAT	2	10	294471	294480	20 %	40 %	40 %	0 %	218693725
198	NC_011748	TCGCT	2	10	295244	295253	0 %	40 %	20 %	40 %	218693726
199	NC_011748	GCCAA	2	10	296499	296508	40 %	0 %	20 %	40 %	218693727
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222	NC_011748	ATGTT	2	10	340768	340777	20 %	60 %	20 %	0 %	218693767
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231	NC_011748	ATTTT	2	10	348493	348502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_011748	TCTGA	2	10	352892	352901	20 %	40 %	20 %	20 %	218693774
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234	NC_011748	ATGGC	2	10	357397	357406	20 %	20 %	40 %	20 %	218693779
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245	NC_011748	CGCTT	2	10	370622	370631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
246	NC_011748	CACGG	2	10	372220	372229	20 %	0 %	40 %	40 %	218693793
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253	NC_011748	TGATG	2	10	382164	382173	20 %	40 %	40 %	0 %	218693800
254	NC_011748	TGCGC	2	10	383806	383815	0 %	20 %	40 %	40 %	218693801
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258	NC_011748	TGACC	2	10	391383	391392	20 %	20 %	20 %	40 %	218693808
259	NC_011748	TTGCG	2	10	392596	392605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_011748	TTTTC	2	10	392709	392718	0 %	80 %	0 %	20 %	218693809
261	NC_011748	TACGT	2	10	395893	395902	20 %	40 %	20 %	20 %	218693811
262	NC_011748	GCGAA	2	10	396012	396021	40 %	0 %	40 %	20 %	218693811
263	NC_011748	GTGAC	2	10	396075	396084	20 %	20 %	40 %	20 %	218693811
264	NC_011748	GCGCA	2	10	399932	399941	20 %	0 %	40 %	40 %	218693815
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