MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	CG	3	6	37	42	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011747	TA	3	6	890	895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011747	TA	3	6	938	943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011747	CT	3	6	1500	1505	0 %	50 %	0 %	50 %	218534479
5	NC_011747	AT	3	6	1677	1682	50 %	50 %	0 %	0 %	218534479
6	NC_011747	CA	3	6	1798	1803	50 %	0 %	0 %	50 %	218534479
7	NC_011747	GT	3	6	2220	2225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011747	CA	3	6	2531	2536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011747	TG	3	6	2738	2743	0 %	50 %	50 %	0 %	218534480
10	NC_011747	AG	3	6	2889	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	218534481
11	NC_011747	GA	3	6	3206	3211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011747	CA	3	6	3556	3561	50 %	0 %	0 %	50 %	218534483
13	NC_011747	AG	3	6	4846	4851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011747	TG	3	6	6738	6743	0 %	50 %	50 %	0 %	218534486
15	NC_011747	AT	3	6	8133	8138	50 %	50 %	0 %	0 %	218534487
16	NC_011747	CA	3	6	8369	8374	50 %	0 %	0 %	50 %	218534487
17	NC_011747	TA	3	6	9427	9432	50 %	50 %	0 %	0 %	218534488
18	NC_011747	GA	3	6	9850	9855	50 %	0 %	50 %	0 %	218534488
19	NC_011747	CG	3	6	11036	11041	0 %	0 %	50 %	50 %	218534489
20	NC_011747	GA	3	6	13006	13011	50 %	0 %	50 %	0 %	218534490
21	NC_011747	AG	3	6	13810	13815	50 %	0 %	50 %	0 %	218534491
22	NC_011747	CA	3	6	14436	14441	50 %	0 %	0 %	50 %	218534491
23	NC_011747	AG	3	6	14762	14767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011747	AT	3	6	15054	15059	50 %	50 %	0 %	0 %	218534492
25	NC_011747	GC	3	6	15810	15815	0 %	0 %	50 %	50 %	218534494
26	NC_011747	AC	3	6	16164	16169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011747	CT	3	6	16494	16499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011747	GC	3	6	16707	16712	0 %	0 %	50 %	50 %	218534495
29	NC_011747	AG	3	6	16846	16851	50 %	0 %	50 %	0 %	218534495
30	NC_011747	GA	3	6	17869	17874	50 %	0 %	50 %	0 %	218534496
31	NC_011747	AT	3	6	18124	18129	50 %	50 %	0 %	0 %	218534496
32	NC_011747	AT	3	6	18262	18267	50 %	50 %	0 %	0 %	218534496
33	NC_011747	CG	3	6	18554	18559	0 %	0 %	50 %	50 %	218534497
34	NC_011747	TG	3	6	19061	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	218534497
35	NC_011747	GC	3	6	19254	19259	0 %	0 %	50 %	50 %	218534498
36	NC_011747	AG	3	6	21162	21167	50 %	0 %	50 %	0 %	218534501
37	NC_011747	AT	3	6	21648	21653	50 %	50 %	0 %	0 %	218534501
38	NC_011747	AT	3	6	21687	21692	50 %	50 %	0 %	0 %	218534501
39	NC_011747	GA	3	6	22482	22487	50 %	0 %	50 %	0 %	218534503
40	NC_011747	TA	3	6	22911	22916	50 %	50 %	0 %	0 %	218534504
41	NC_011747	AT	3	6	23782	23787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011747	TA	3	6	23835	23840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011747	TA	4	8	24134	24141	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
44	NC_011747	TA	3	6	24174	24179	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
45	NC_011747	AT	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
46	NC_011747	AT	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
47	NC_011747	TA	3	6	24618	24623	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
48	NC_011747	TC	3	6	25112	25117	0 %	50 %	0 %	50 %	218534505
49	NC_011747	TA	3	6	25923	25928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011747	GA	3	6	26083	26088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011747	CG	3	6	27122	27127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011747	GC	3	6	28161	28166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011747	GC	3	6	29114	29119	0 %	0 %	50 %	50 %	218534509
54	NC_011747	GC	3	6	29658	29663	0 %	0 %	50 %	50 %	218534510
55	NC_011747	AG	3	6	30479	30484	50 %	0 %	50 %	0 %	218534510
56	NC_011747	TG	3	6	31084	31089	0 %	50 %	50 %	0 %	218534511
57	NC_011747	TC	3	6	31560	31565	0 %	50 %	0 %	50 %	218534512
58	NC_011747	CA	3	6	31691	31696	50 %	0 %	0 %	50 %	218534513
59	NC_011747	TG	4	8	32096	32103	0 %	50 %	50 %	0 %	218534513
60	NC_011747	TA	3	6	33327	33332	50 %	50 %	0 %	0 %	218534514
61	NC_011747	GT	4	8	33976	33983	0 %	50 %	50 %	0 %	218534515
62	NC_011747	AC	3	6	34430	34435	50 %	0 %	0 %	50 %	218534516
63	NC_011747	CG	3	6	35205	35210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011747	CA	3	6	35654	35659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011747	CG	3	6	36498	36503	0 %	0 %	50 %	50 %	218534519
66	NC_011747	GA	3	6	36673	36678	50 %	0 %	50 %	0 %	218534519
67	NC_011747	GC	3	6	37882	37887	0 %	0 %	50 %	50 %	218534520
68	NC_011747	TG	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	218534520
69	NC_011747	CG	3	6	38352	38357	0 %	0 %	50 %	50 %	218534520
70	NC_011747	CG	3	6	38465	38470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011747	CG	3	6	38776	38781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011747	GC	3	6	39439	39444	0 %	0 %	50 %	50 %	218534521
73	NC_011747	GA	3	6	39800	39805	50 %	0 %	50 %	0 %	218534521
74	NC_011747	AG	3	6	40044	40049	50 %	0 %	50 %	0 %	218534522
75	NC_011747	AT	3	6	40104	40109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011747	GT	3	6	40338	40343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011747	CT	3	6	40617	40622	0 %	50 %	0 %	50 %	218534523
78	NC_011747	CT	3	6	42451	42456	0 %	50 %	0 %	50 %	218534524
79	NC_011747	CA	3	6	42572	42577	50 %	0 %	0 %	50 %	218534524
80	NC_011747	CG	3	6	43311	43316	0 %	0 %	50 %	50 %	218534525
81	NC_011747	TG	4	8	43866	43873	0 %	50 %	50 %	0 %	218534525
82	NC_011747	TG	3	6	44588	44593	0 %	50 %	50 %	0 %	218534525
83	NC_011747	AC	3	6	44803	44808	50 %	0 %	0 %	50 %	218534526
84	NC_011747	TG	3	6	45373	45378	0 %	50 %	50 %	0 %	218534527
85	NC_011747	AG	3	6	45786	45791	50 %	0 %	50 %	0 %	218534527
86	NC_011747	TG	3	6	46014	46019	0 %	50 %	50 %	0 %	218534528
87	NC_011747	AG	4	8	47174	47181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011747	AT	4	8	48587	48594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011747	TG	4	8	48656	48663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011747	CT	3	6	49391	49396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011747	GT	3	6	49523	49528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011747	TC	3	6	49904	49909	0 %	50 %	0 %	50 %	218534533
93	NC_011747	AG	3	6	50406	50411	50 %	0 %	50 %	0 %	218534534
94	NC_011747	TA	3	6	50703	50708	50 %	50 %	0 %	0 %	218534534
95	NC_011747	AT	3	6	50748	50753	50 %	50 %	0 %	0 %	218534534
96	NC_011747	CT	3	6	52220	52225	0 %	50 %	0 %	50 %	218534538
97	NC_011747	AT	3	6	52432	52437	50 %	50 %	0 %	0 %	218534538
98	NC_011747	GC	3	6	53376	53381	0 %	0 %	50 %	50 %	218534539
99	NC_011747	GC	3	6	54439	54444	0 %	0 %	50 %	50 %	218534540
100	NC_011747	CG	3	6	55134	55139	0 %	0 %	50 %	50 %	218534541
101	NC_011747	CT	3	6	55447	55452	0 %	50 %	0 %	50 %	218534542
102	NC_011747	CG	3	6	57173	57178	0 %	0 %	50 %	50 %	218534546
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104	NC_011747	GC	3	6	58197	58202	0 %	0 %	50 %	50 %	218534546
105	NC_011747	AG	3	6	58203	58208	50 %	0 %	50 %	0 %	218534546
106	NC_011747	TG	3	6	58466	58471	0 %	50 %	50 %	0 %	218534546
107	NC_011747	CA	3	6	63199	63204	50 %	0 %	0 %	50 %	218534551
108	NC_011747	TG	3	6	65193	65198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011747	CA	3	6	65423	65428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011747	TC	3	6	65758	65763	0 %	50 %	0 %	50 %	218534554
111	NC_011747	AT	3	6	66497	66502	50 %	50 %	0 %	0 %	218534556
112	NC_011747	CA	3	6	66717	66722	50 %	0 %	0 %	50 %	218534557
113	NC_011747	AC	3	6	67475	67480	50 %	0 %	0 %	50 %	218534557
114	NC_011747	CG	3	6	68828	68833	0 %	0 %	50 %	50 %	218534558
115	NC_011747	GT	3	6	69265	69270	0 %	50 %	50 %	0 %	218534558
116	NC_011747	CA	3	6	69449	69454	50 %	0 %	0 %	50 %	218534558
117	NC_011747	TA	3	6	71007	71012	50 %	50 %	0 %	0 %	218534559
118	NC_011747	CT	3	6	71034	71039	0 %	50 %	0 %	50 %	218534559
119	NC_011747	AT	3	6	72617	72622	50 %	50 %	0 %	0 %	218534561
120	NC_011747	AC	3	6	73237	73242	50 %	0 %	0 %	50 %	218534561
121	NC_011747	GT	3	6	73576	73581	0 %	50 %	50 %	0 %	218534561
122	NC_011747	AC	3	6	74941	74946	50 %	0 %	0 %	50 %	218534562
123	NC_011747	AG	3	6	76258	76263	50 %	0 %	50 %	0 %	218534562
124	NC_011747	CA	3	6	76849	76854	50 %	0 %	0 %	50 %	218534562
125	NC_011747	GA	3	6	77348	77353	50 %	0 %	50 %	0 %	218534562
126	NC_011747	GC	3	6	77392	77397	0 %	0 %	50 %	50 %	218534562
127	NC_011747	CA	3	6	77470	77475	50 %	0 %	0 %	50 %	218534562
128	NC_011747	CG	3	6	77555	77560	0 %	0 %	50 %	50 %	218534562
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132	NC_011747	AT	3	6	81774	81779	50 %	50 %	0 %	0 %	218534566
133	NC_011747	AC	3	6	82281	82286	50 %	0 %	0 %	50 %	218534567
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137	NC_011747	TA	3	6	84451	84456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011747	TA	3	6	84462	84467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011747	CT	3	6	85555	85560	0 %	50 %	0 %	50 %	218534571
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142	NC_011747	AC	3	6	86457	86462	50 %	0 %	0 %	50 %	218534572
143	NC_011747	GA	3	6	86539	86544	50 %	0 %	50 %	0 %	218534572
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.