MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 3189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	218556941
2	NC_011742	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	218556942
3	NC_011742	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	218556947
4	NC_011742	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	218556947
5	NC_011742	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	218556948
6	NC_011742	CGCGC	2	10	10831	10840	0 %	0 %	40 %	60 %	218556950
7	NC_011742	GTTTC	2	10	11727	11736	0 %	60 %	20 %	20 %	218556951
8	NC_011742	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011742	CTGGA	2	10	18097	18106	20 %	20 %	40 %	20 %	218556956
10	NC_011742	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011742	ACCAC	2	10	18936	18945	40 %	0 %	0 %	60 %	218556957
12	NC_011742	TCCTT	2	10	19775	19784	0 %	60 %	0 %	40 %	218556957
13	NC_011742	CCGAT	2	10	20467	20476	20 %	20 %	20 %	40 %	218556958
14	NC_011742	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011742	GCGAA	2	10	34359	34368	40 %	0 %	40 %	20 %	218556971
16	NC_011742	CCGTT	2	10	35253	35262	0 %	40 %	20 %	40 %	218556971
17	NC_011742	CACGG	2	10	35630	35639	20 %	0 %	40 %	40 %	218556971
18	NC_011742	GATGC	2	10	37332	37341	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011742	CGAAT	2	10	39083	39092	40 %	20 %	20 %	20 %	218556977
20	NC_011742	CCATG	2	10	40620	40629	20 %	20 %	20 %	40 %	218556978
21	NC_011742	CCGTA	2	10	42265	42274	20 %	20 %	20 %	40 %	218556979
22	NC_011742	TTAAA	2	10	43003	43012	60 %	40 %	0 %	0 %	218556979
23	NC_011742	ACCCA	2	10	43746	43755	40 %	0 %	0 %	60 %	218556980
24	NC_011742	TTTGA	2	10	45372	45381	20 %	60 %	20 %	0 %	218556981
25	NC_011742	CGGCG	2	10	45623	45632	0 %	0 %	60 %	40 %	218556981
26	NC_011742	AATCA	2	10	45905	45914	60 %	20 %	0 %	20 %	218556982
27	NC_011742	CGGTT	2	10	46860	46869	0 %	40 %	40 %	20 %	218556983
28	NC_011742	TGGCG	2	10	48552	48561	0 %	20 %	60 %	20 %	218556985
29	NC_011742	TGCAC	2	10	50314	50323	20 %	20 %	20 %	40 %	218556986
30	NC_011742	AACGT	2	10	54720	54729	40 %	20 %	20 %	20 %	218556991
31	NC_011742	GCGTC	2	10	57704	57713	0 %	20 %	40 %	40 %	218556994
32	NC_011742	ATGTT	2	10	58518	58527	20 %	60 %	20 %	0 %	218556995
33	NC_011742	TGCGT	2	10	59237	59246	0 %	40 %	40 %	20 %	218556995
34	NC_011742	AAAGT	2	10	65004	65013	60 %	20 %	20 %	0 %	218556998
35	NC_011742	CAGCG	2	10	68704	68713	20 %	0 %	40 %	40 %	218557001
36	NC_011742	TCGCG	2	10	69974	69983	0 %	20 %	40 %	40 %	218557001
37	NC_011742	TTTTC	2	10	74394	74403	0 %	80 %	0 %	20 %	218557004
38	NC_011742	AAAGC	2	10	74698	74707	60 %	0 %	20 %	20 %	218557005
39	NC_011742	CAGCA	2	10	75335	75344	40 %	0 %	20 %	40 %	218557006
40	NC_011742	TAGTG	2	10	79280	79289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011742	TTGCT	2	10	79432	79441	0 %	60 %	20 %	20 %	218557010
42	NC_011742	GATGG	2	10	80168	80177	20 %	20 %	60 %	0 %	218557010
43	NC_011742	ATTTT	2	10	80996	81005	20 %	80 %	0 %	0 %	218557011
44	NC_011742	GGGAG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	80 %	0 %	218557011
45	NC_011742	CGCCA	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_011742	ACCGG	2	10	82165	82174	20 %	0 %	40 %	40 %	218557013
47	NC_011742	CCTGG	2	10	82421	82430	0 %	20 %	40 %	40 %	218557013
48	NC_011742	ATGCG	2	10	83866	83875	20 %	20 %	40 %	20 %	218557014
49	NC_011742	GACCG	2	10	84688	84697	20 %	0 %	40 %	40 %	218557015
50	NC_011742	ATGTT	2	10	87234	87243	20 %	60 %	20 %	0 %	218557017
51	NC_011742	AAAAC	2	10	87649	87658	80 %	0 %	0 %	20 %	218557017
52	NC_011742	TGCAT	2	10	88176	88185	20 %	40 %	20 %	20 %	218557018
53	NC_011742	ATTCC	2	10	88346	88355	20 %	40 %	0 %	40 %	218557018
54	NC_011742	AGTTC	2	10	93439	93448	20 %	40 %	20 %	20 %	218557022
55	NC_011742	TGCCT	2	10	93539	93548	0 %	40 %	20 %	40 %	218557023
56	NC_011742	CGTGG	2	10	94812	94821	0 %	20 %	60 %	20 %	218557024
57	NC_011742	TATCG	2	10	95319	95328	20 %	40 %	20 %	20 %	218557024
58	NC_011742	GGGCT	2	10	99191	99200	0 %	20 %	60 %	20 %	218557027
59	NC_011742	GCCTG	2	10	99651	99660	0 %	20 %	40 %	40 %	218557028
60	NC_011742	TCTGG	2	10	100898	100907	0 %	40 %	40 %	20 %	218557029
61	NC_011742	ACCGT	2	10	101564	101573	20 %	20 %	20 %	40 %	218557029
62	NC_011742	ATCAG	2	10	103337	103346	40 %	20 %	20 %	20 %	218557031
63	NC_011742	AGCCG	2	10	105105	105114	20 %	0 %	40 %	40 %	218557032
64	NC_011742	GCGCA	2	10	107433	107442	20 %	0 %	40 %	40 %	218557034
65	NC_011742	CCGGC	2	10	111397	111406	0 %	0 %	40 %	60 %	218557038
66	NC_011742	TGGTC	2	10	111551	111560	0 %	40 %	40 %	20 %	218557038
67	NC_011742	CGCGG	2	10	114603	114612	0 %	0 %	60 %	40 %	218557041
68	NC_011742	CATCG	2	10	116860	116869	20 %	20 %	20 %	40 %	218557044
69	NC_011742	TAACG	2	10	117554	117563	40 %	20 %	20 %	20 %	218557044
70	NC_011742	ATGCC	2	10	118013	118022	20 %	20 %	20 %	40 %	218557044
71	NC_011742	AATGC	2	10	119296	119305	40 %	20 %	20 %	20 %	218557045
72	NC_011742	TCTGT	2	10	120243	120252	0 %	60 %	20 %	20 %	218557047
73	NC_011742	GCAGG	2	10	122675	122684	20 %	0 %	60 %	20 %	218557050
74	NC_011742	GTGTT	2	10	123884	123893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011742	TCATT	2	10	127715	127724	20 %	60 %	0 %	20 %	218557054
76	NC_011742	AATTG	2	10	128041	128050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011742	CGAAG	2	10	128494	128503	40 %	0 %	40 %	20 %	218557055
78	NC_011742	ACACG	2	10	128627	128636	40 %	0 %	20 %	40 %	218557055
79	NC_011742	TCGCG	2	10	128888	128897	0 %	20 %	40 %	40 %	218557055
80	NC_011742	GCATC	2	10	128978	128987	20 %	20 %	20 %	40 %	218557055
81	NC_011742	GACTG	2	10	130296	130305	20 %	20 %	40 %	20 %	218557057
82	NC_011742	AGAGC	2	10	130706	130715	40 %	0 %	40 %	20 %	218557057
83	NC_011742	CTTCT	2	10	135967	135976	0 %	60 %	0 %	40 %	218557060
84	NC_011742	TCTGG	2	10	139334	139343	0 %	40 %	40 %	20 %	218557061
85	NC_011742	GGGCA	2	10	140745	140754	20 %	0 %	60 %	20 %	218557062
86	NC_011742	CAGCG	2	10	141024	141033	20 %	0 %	40 %	40 %	218557063
87	NC_011742	ACGAC	2	10	142304	142313	40 %	0 %	20 %	40 %	218557064
88	NC_011742	GCGCG	2	10	147063	147072	0 %	0 %	60 %	40 %	218557067
89	NC_011742	CCGTC	2	10	147854	147863	0 %	20 %	20 %	60 %	218557068
90	NC_011742	GTGAA	2	10	147864	147873	40 %	20 %	40 %	0 %	218557068
91	NC_011742	GTTCA	2	10	148251	148260	20 %	40 %	20 %	20 %	218557069
92	NC_011742	ATCCA	2	10	148577	148586	40 %	20 %	0 %	40 %	218557069
93	NC_011742	GTAAG	2	10	148790	148799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011742	CTTTA	2	10	149840	149849	20 %	60 %	0 %	20 %	218557071
95	NC_011742	TCCTC	2	10	150510	150519	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_011742	TGGTG	2	10	153681	153690	0 %	40 %	60 %	0 %	218557075
97	NC_011742	GGGAG	2	10	153705	153714	20 %	0 %	80 %	0 %	218557075
98	NC_011742	CGCCA	2	10	156482	156491	20 %	0 %	20 %	60 %	218557078
99	NC_011742	ATTTT	2	10	156655	156664	20 %	80 %	0 %	0 %	218557078
100	NC_011742	GTTGG	2	10	156776	156785	0 %	40 %	60 %	0 %	218557078
101	NC_011742	CTGTA	2	10	157393	157402	20 %	40 %	20 %	20 %	218557079
102	NC_011742	TCCTG	2	10	157553	157562	0 %	40 %	20 %	40 %	218557079
103	NC_011742	ATTTT	2	10	157985	157994	20 %	80 %	0 %	0 %	218557080
104	NC_011742	CATAA	2	10	158252	158261	60 %	20 %	0 %	20 %	218557080
105	NC_011742	TTGTT	2	10	159064	159073	0 %	80 %	20 %	0 %	218557082
106	NC_011742	TTCAA	2	10	159214	159223	40 %	40 %	0 %	20 %	218557082
107	NC_011742	AATTT	2	10	163113	163122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011742	TATAT	2	10	163199	163208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011742	GCGAG	2	10	164468	164477	20 %	0 %	60 %	20 %	218557086
110	NC_011742	TGGCG	2	10	164905	164914	0 %	20 %	60 %	20 %	218557086
111	NC_011742	ACCAC	2	10	167809	167818	40 %	0 %	0 %	60 %	218557090
112	NC_011742	GGCGT	2	10	169512	169521	0 %	20 %	60 %	20 %	218557091
113	NC_011742	CGACG	2	10	170551	170560	20 %	0 %	40 %	40 %	218557091
114	NC_011742	AAAAC	2	10	174436	174445	80 %	0 %	0 %	20 %	218557093
115	NC_011742	TGGTT	2	10	174693	174702	0 %	60 %	40 %	0 %	218557093
116	NC_011742	TGGTC	2	10	176816	176825	0 %	40 %	40 %	20 %	218557095
117	NC_011742	TGGCG	2	10	178061	178070	0 %	20 %	60 %	20 %	218557096
118	NC_011742	CGGCG	2	10	178691	178700	0 %	0 %	60 %	40 %	218557096
119	NC_011742	TTCCA	2	10	179302	179311	20 %	40 %	0 %	40 %	218557096
120	NC_011742	GACCG	2	10	179827	179836	20 %	0 %	40 %	40 %	218557097
121	NC_011742	GGTCC	2	10	183625	183634	0 %	20 %	40 %	40 %	218557101
122	NC_011742	ACGGG	2	10	185542	185551	20 %	0 %	60 %	20 %	218557103
123	NC_011742	TGCGC	2	10	187249	187258	0 %	20 %	40 %	40 %	218557104
124	NC_011742	GTGAT	2	10	187701	187710	20 %	40 %	40 %	0 %	218557104
125	NC_011742	GTGAT	2	10	187992	188001	20 %	40 %	40 %	0 %	218557104
126	NC_011742	TACGT	2	10	188237	188246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011742	TGGCC	2	10	189923	189932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011742	GCCAG	2	10	191669	191678	20 %	0 %	40 %	40 %	218557108
129	NC_011742	GGCGT	2	10	192507	192516	0 %	20 %	60 %	20 %	218557108
130	NC_011742	GTTCT	2	10	193110	193119	0 %	60 %	20 %	20 %	218557108
131	NC_011742	CTGAA	2	10	195102	195111	40 %	20 %	20 %	20 %	218557110
132	NC_011742	AAGCG	2	10	195166	195175	40 %	0 %	40 %	20 %	218557110
133	NC_011742	TGGTG	2	10	196949	196958	0 %	40 %	60 %	0 %	218557112
134	NC_011742	TGCAC	2	10	197075	197084	20 %	20 %	20 %	40 %	218557112
135	NC_011742	TGCGC	2	10	197468	197477	0 %	20 %	40 %	40 %	218557112
136	NC_011742	GTCTG	2	10	197633	197642	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011742	CATGG	2	10	199169	199178	20 %	20 %	40 %	20 %	218557114
138	NC_011742	CAGAT	2	10	200208	200217	40 %	20 %	20 %	20 %	218557115
139	NC_011742	ACTTT	2	10	200341	200350	20 %	60 %	0 %	20 %	218557115
140	NC_011742	GACGT	2	10	204261	204270	20 %	20 %	40 %	20 %	218557118
141	NC_011742	ATGCC	2	10	208656	208665	20 %	20 %	20 %	40 %	218557123
142	NC_011742	TGGCC	2	10	209982	209991	0 %	20 %	40 %	40 %	218557125
143	NC_011742	ACCGC	2	10	209995	210004	20 %	0 %	20 %	60 %	218557125
144	NC_011742	GTAAC	2	10	210725	210734	40 %	20 %	20 %	20 %	218557125
145	NC_011742	AGCCG	2	10	211353	211362	20 %	0 %	40 %	40 %	218557125
146	NC_011742	GGTGG	2	10	211462	211471	0 %	20 %	80 %	0 %	218557125
147	NC_011742	TGCGC	2	10	220815	220824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_011742	ACGGT	2	10	222471	222480	20 %	20 %	40 %	20 %	218557136
149	NC_011742	AGCTC	2	10	223159	223168	20 %	20 %	20 %	40 %	218557136
150	NC_011742	TGATT	2	10	225312	225321	20 %	60 %	20 %	0 %	218557139
151	NC_011742	CGGTT	2	10	228275	228284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_011742	GGTGA	2	10	230581	230590	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011742	GTGAA	2	10	237138	237147	40 %	20 %	40 %	0 %	218557146
154	NC_011742	TAATT	2	10	237322	237331	40 %	60 %	0 %	0 %	218557146
155	NC_011742	CGCGG	2	10	241304	241313	0 %	0 %	60 %	40 %	218557151
156	NC_011742	TGATC	2	10	243790	243799	20 %	40 %	20 %	20 %	218557153
157	NC_011742	GGTTC	2	10	243944	243953	0 %	40 %	40 %	20 %	218557154
158	NC_011742	CCAGA	2	10	245564	245573	40 %	0 %	20 %	40 %	218557155
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161	NC_011742	TGCGG	2	10	249955	249964	0 %	20 %	60 %	20 %	218557156
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170	NC_011742	TACCT	2	10	267512	267521	20 %	40 %	0 %	40 %	218557170
171	NC_011742	ACAGT	2	10	267731	267740	40 %	20 %	20 %	20 %	218557171
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173	NC_011742	TCAGA	2	10	268214	268223	40 %	20 %	20 %	20 %	218557171
174	NC_011742	GGGAA	2	10	268816	268825	40 %	0 %	60 %	0 %	218557171
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176	NC_011742	AGATA	2	10	270293	270302	60 %	20 %	20 %	0 %	218557174
177	NC_011742	CATCC	2	10	270928	270937	20 %	20 %	0 %	60 %	218557175
178	NC_011742	TGTTA	2	10	271154	271163	20 %	60 %	20 %	0 %	218557176
179	NC_011742	TTGGT	2	10	271486	271495	0 %	60 %	40 %	0 %	218557176
180	NC_011742	TGAAC	2	10	276064	276073	40 %	20 %	20 %	20 %	218557180
181	NC_011742	AAACG	2	10	278249	278258	60 %	0 %	20 %	20 %	218557182
182	NC_011742	TGCAT	2	10	279717	279726	20 %	40 %	20 %	20 %	218557184
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185	NC_011742	CGATG	2	10	282507	282516	20 %	20 %	40 %	20 %	218557186
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187	NC_011742	AATGG	2	10	285336	285345	40 %	20 %	40 %	0 %	218557191
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194	NC_011742	AATCA	2	10	297254	297263	60 %	20 %	0 %	20 %	218557201
195	NC_011742	CCGGA	2	10	297273	297282	20 %	0 %	40 %	40 %	218557201
196	NC_011742	GTCAG	2	10	298128	298137	20 %	20 %	40 %	20 %	218557201
197	NC_011742	CTGAC	2	10	299097	299106	20 %	20 %	20 %	40 %	218557201
198	NC_011742	TTTTA	2	10	301168	301177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_011742	ACCAT	2	10	301212	301221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
200	NC_011742	ACCAA	2	10	302533	302542	60 %	0 %	0 %	40 %	218557204
201	NC_011742	CTGGT	2	10	302653	302662	0 %	40 %	40 %	20 %	218557204
202	NC_011742	ACATT	2	10	302780	302789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_011742	GCAAT	2	10	303796	303805	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_011742	TTCTC	2	10	306778	306787	0 %	60 %	0 %	40 %	218557207
205	NC_011742	CGCAG	2	10	308683	308692	20 %	0 %	40 %	40 %	218557208
206	NC_011742	TGTGT	2	10	311637	311646	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
207	NC_011742	TGTTA	2	10	312745	312754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
208	NC_011742	TTGAT	2	10	313635	313644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
209	NC_011742	TCAAT	2	10	313955	313964	40 %	40 %	0 %	20 %	218557213
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213	NC_011742	TTTCA	2	10	315903	315912	20 %	60 %	0 %	20 %	218557214
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215	NC_011742	GTCTG	2	10	317510	317519	0 %	40 %	40 %	20 %	218557216
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223	NC_011742	AGGGT	2	10	324888	324897	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
224	NC_011742	TACCG	2	10	325178	325187	20 %	20 %	20 %	40 %	218557220
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227	NC_011742	ATGTT	2	10	333256	333265	20 %	60 %	20 %	0 %	218557228
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233	NC_011742	GGTTT	2	10	338983	338992	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
234	NC_011742	AGCGA	2	10	340478	340487	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
235	NC_011742	GCAGG	2	10	341626	341635	20 %	0 %	60 %	20 %	218557236
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250	NC_011742	CCGGG	2	10	363571	363580	0 %	0 %	60 %	40 %	218557255
251	NC_011742	CACGG	2	10	366051	366060	20 %	0 %	40 %	40 %	218557258
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254	NC_011742	GTGGC	2	10	372313	372322	0 %	20 %	60 %	20 %	218557263
255	NC_011742	GGCAA	2	10	374209	374218	40 %	0 %	40 %	20 %	218557264
256	NC_011742	TGATG	2	10	374616	374625	20 %	40 %	40 %	0 %	218557264
257	NC_011742	TGCGC	2	10	376258	376267	0 %	20 %	40 %	40 %	218557265
258	NC_011742	AATTC	2	10	378720	378729	40 %	40 %	0 %	20 %	218557268
259	NC_011742	CGCAG	2	10	378738	378747	20 %	0 %	40 %	40 %	218557268
260	NC_011742	AGACC	2	10	379734	379743	40 %	0 %	20 %	40 %	218557268
261	NC_011742	TGACC	2	10	380457	380466	20 %	20 %	20 %	40 %	218557268
262	NC_011742	TTTTC	2	10	381783	381792	0 %	80 %	0 %	20 %	218557269
263	NC_011742	CTTAC	2	10	382974	382983	20 %	40 %	0 %	40 %	218557270
264	NC_011742	TGTGT	2	10	385223	385232	0 %	60 %	40 %	0 %	218557272
265	NC_011742	ACACC	2	10	387876	387885	40 %	0 %	0 %	60 %	218557276
266	NC_011742	ATCAT	2	10	389180	389189	40 %	40 %	0 %	20 %	218557277
267	NC_011742	TTATT	2	10	389679	389688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_011742	GACCG	2	10	390928	390937	20 %	0 %	40 %	40 %	218557278
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398	NC_011742	TTGAT	2	10	605862	605871	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
399	NC_011742	GATTT	2	10	609574	609583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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