MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 103315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011742	GCG	3	9	144534	144542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557066
3002	NC_011742	ATG	2	6	144585	144590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557066
3003	NC_011742	CTG	2	6	144771	144776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557066
3004	NC_011742	GAT	2	6	144794	144799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557066
3005	NC_011742	TC	3	6	144847	144852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_011742	CAT	2	6	144873	144878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557067
3007	NC_011742	CAC	2	6	144949	144954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3008	NC_011742	ACC	2	6	144997	145002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3009	NC_011742	TGT	2	6	145044	145049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218557067
3010	NC_011742	GC	3	6	145052	145057	0 %	0 %	50 %	50 %	218557067
3011	NC_011742	GCG	2	6	145076	145081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557067
3012	NC_011742	CCG	2	6	145098	145103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557067
3013	NC_011742	GCCC	2	8	145113	145120	0 %	0 %	25 %	75 %	218557067
3014	NC_011742	GCG	2	6	145182	145187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557067
3015	NC_011742	CAC	2	6	145207	145212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3016	NC_011742	GCTG	2	8	145253	145260	0 %	25 %	50 %	25 %	218557067
3017	NC_011742	AAAC	2	8	145413	145420	75 %	0 %	0 %	25 %	218557067
3018	NC_011742	GGC	2	6	145532	145537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557067
3019	NC_011742	TGG	2	6	145562	145567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557067
3020	NC_011742	TGG	2	6	145599	145604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557067
3021	NC_011742	TCG	2	6	145635	145640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3022	NC_011742	GCA	2	6	145694	145699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3023	NC_011742	ACC	2	6	145730	145735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3024	NC_011742	CGA	2	6	145748	145753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3025	NC_011742	GTG	2	6	145870	145875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557067
3026	NC_011742	TAAAGG	2	12	146061	146072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218557067
3027	NC_011742	CAG	2	6	146128	146133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3028	NC_011742	CGG	2	6	146239	146244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557067
3029	NC_011742	GAC	2	6	146361	146366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3030	NC_011742	CAT	2	6	146367	146372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557067
3031	NC_011742	GAA	2	6	146379	146384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218557067
3032	NC_011742	ACG	2	6	146389	146394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3033	NC_011742	GGC	2	6	146530	146535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557067
3034	NC_011742	GCT	2	6	146634	146639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3035	NC_011742	CTT	2	6	146667	146672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218557067
3036	NC_011742	GTG	2	6	146709	146714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557067
3037	NC_011742	AGGC	2	8	146745	146752	25 %	0 %	50 %	25 %	218557067
3038	NC_011742	CTG	2	6	146784	146789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3039	NC_011742	ACC	2	6	146857	146862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3040	NC_011742	CAG	2	6	146869	146874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3041	NC_011742	ACC	2	6	146879	146884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557067
3042	NC_011742	GAA	2	6	146956	146961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218557067
3043	NC_011742	AGC	2	6	147038	147043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557067
3044	NC_011742	GCGCG	2	10	147063	147072	0 %	0 %	60 %	40 %	218557067
3045	NC_011742	GTA	2	6	147127	147132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557067
3046	NC_011742	GCC	2	6	147139	147144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557067
3047	NC_011742	CCAG	2	8	147153	147160	25 %	0 %	25 %	50 %	218557067
3048	NC_011742	CGC	2	6	147227	147232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557067
3049	NC_011742	TAG	2	6	147287	147292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011742	AATT	2	8	147294	147301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011742	TG	3	6	147315	147320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011742	TCA	2	6	147325	147330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_011742	TTA	2	6	147342	147347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011742	GAAT	2	8	147359	147366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011742	TTG	2	6	147398	147403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011742	GTC	2	6	147525	147530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557068
3057	NC_011742	TGG	2	6	147573	147578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557068
3058	NC_011742	CTG	2	6	147581	147586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557068
3059	NC_011742	TTTATG	2	12	147596	147607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218557068
3060	NC_011742	CCA	2	6	147684	147689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557068
3061	NC_011742	TTG	2	6	147750	147755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218557068
3062	NC_011742	ATC	2	6	147761	147766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557068
3063	NC_011742	GCT	2	6	147841	147846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557068
3064	NC_011742	CCGTC	2	10	147854	147863	0 %	20 %	20 %	60 %	218557068
3065	NC_011742	GTGAA	2	10	147864	147873	40 %	20 %	40 %	0 %	218557068
3066	NC_011742	TGG	2	6	147918	147923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557068
3067	NC_011742	CTG	2	6	147983	147988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557068
3068	NC_011742	ATTT	2	8	148036	148043	25 %	75 %	0 %	0 %	218557069
3069	NC_011742	TGAT	2	8	148045	148052	25 %	50 %	25 %	0 %	218557069
3070	NC_011742	GCA	2	6	148136	148141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557069
3071	NC_011742	CGT	2	6	148145	148150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557069
3072	NC_011742	TGG	2	6	148214	148219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557069
3073	NC_011742	GTTCA	2	10	148251	148260	20 %	40 %	20 %	20 %	218557069
3074	NC_011742	CA	3	6	148259	148264	50 %	0 %	0 %	50 %	218557069
3075	NC_011742	GCA	2	6	148337	148342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557069
3076	NC_011742	GTT	2	6	148347	148352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218557069
3077	NC_011742	CGC	3	9	148391	148399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557069
3078	NC_011742	ATA	2	6	148417	148422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218557069
3079	NC_011742	ATCCA	2	10	148577	148586	40 %	20 %	0 %	40 %	218557069
3080	NC_011742	A	6	6	148623	148628	100 %	0 %	0 %	0 %	218557069
3081	NC_011742	CCA	2	6	148643	148648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557069
3082	NC_011742	TTG	2	6	148669	148674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218557069
3083	NC_011742	TGA	2	6	148676	148681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557069
3084	NC_011742	AAT	2	6	148723	148728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011742	GTAAG	2	10	148790	148799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011742	A	7	7	148839	148845	100 %	0 %	0 %	0 %	218557070
3087	NC_011742	GGC	2	6	148854	148859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557070
3088	NC_011742	TAT	2	6	148955	148960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218557070
3089	NC_011742	CT	3	6	148964	148969	0 %	50 %	0 %	50 %	218557070
3090	NC_011742	TAAA	2	8	148972	148979	75 %	25 %	0 %	0 %	218557070
3091	NC_011742	CGGG	2	8	148985	148992	0 %	0 %	75 %	25 %	218557070
3092	NC_011742	GCA	2	6	149093	149098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557070
3093	NC_011742	CAGG	2	8	149112	149119	25 %	0 %	50 %	25 %	218557070
3094	NC_011742	TAC	2	6	149121	149126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557070
3095	NC_011742	AAG	2	6	149140	149145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218557070
3096	NC_011742	AAC	2	6	149173	149178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218557070
3097	NC_011742	AACG	2	8	149199	149206	50 %	0 %	25 %	25 %	218557070
3098	NC_011742	ACT	2	6	149276	149281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557070
3099	NC_011742	CGA	2	6	149288	149293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218557070
3100	NC_011742	ACCG	2	8	149294	149301	25 %	0 %	25 %	50 %	218557070
3101	NC_011742	CGC	2	6	149322	149327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557070
3102	NC_011742	CAC	2	6	149366	149371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557070
3103	NC_011742	CAT	2	6	149372	149377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557070
3104	NC_011742	CAC	2	6	149381	149386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218557070
3105	NC_011742	GAA	2	6	149397	149402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218557070
3106	NC_011742	ATT	2	6	149430	149435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218557070
3107	NC_011742	TGG	2	6	149449	149454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557070
3108	NC_011742	GCT	2	6	149474	149479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557070
3109	NC_011742	TGC	2	6	149593	149598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557070
3110	NC_011742	TGTT	2	8	149692	149699	0 %	75 %	25 %	0 %	218557070
3111	NC_011742	ATG	2	6	149732	149737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557070
3112	NC_011742	GCC	2	6	149818	149823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218557071
3113	NC_011742	TCA	2	6	149826	149831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557071
3114	NC_011742	CTTTA	2	10	149840	149849	20 %	60 %	0 %	20 %	218557071
3115	NC_011742	ATG	2	6	149933	149938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557071
3116	NC_011742	TCA	2	6	149972	149977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557071
3117	NC_011742	T	6	6	149978	149983	0 %	100 %	0 %	0 %	218557071
3118	NC_011742	GCT	2	6	150013	150018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557071
3119	NC_011742	ATT	2	6	150044	150049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218557071
3120	NC_011742	GGT	2	6	150062	150067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218557071
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3122	NC_011742	T	6	6	150119	150124	0 %	100 %	0 %	0 %	218557071
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3126	NC_011742	ACGTGG	2	12	150478	150489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218557071
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3142	NC_011742	ACAA	2	8	151115	151122	75 %	0 %	0 %	25 %	218557073
3143	NC_011742	CTG	2	6	151135	151140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557073
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3241	NC_011742	T	6	6	156433	156438	0 %	100 %	0 %	0 %	218557078
3242	NC_011742	TTG	2	6	156448	156453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218557078
3243	NC_011742	CGCCA	2	10	156482	156491	20 %	0 %	20 %	60 %	218557078
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3353	NC_011742	ACT	2	6	161932	161937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218557083
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3357	NC_011742	TGA	2	6	162172	162177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218557083
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3360	NC_011742	AATT	2	8	162254	162261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_011742	AAT	2	6	162271	162276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_011742	TA	3	6	162311	162316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_011742	GTAA	2	8	162352	162359	50 %	25 %	25 %	0 %	218557084
3364	NC_011742	GCT	2	6	162398	162403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557084
3365	NC_011742	TTGC	2	8	162404	162411	0 %	50 %	25 %	25 %	218557084
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3489	NC_011742	TCCG	2	8	167878	167885	0 %	25 %	25 %	50 %	218557090
3490	NC_011742	TTCTCT	2	12	167904	167915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218557090
3491	NC_011742	CGG	2	6	167959	167964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218557090
3492	NC_011742	GT	3	6	167993	167998	0 %	50 %	50 %	0 %	218557090
3493	NC_011742	GC	3	6	168000	168005	0 %	0 %	50 %	50 %	218557090
3494	NC_011742	GAA	2	6	168122	168127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_011742	GTC	2	6	168152	168157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557091
3496	NC_011742	TGC	2	6	168167	168172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557091
3497	NC_011742	TGC	2	6	168191	168196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557091
3498	NC_011742	TTA	2	6	168219	168224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218557091
3499	NC_011742	CTG	2	6	168270	168275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557091
3500	NC_011742	CTG	2	6	168306	168311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218557091

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