MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 103315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011742	CAT	2	6	24034	24039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
502	NC_011742	A	6	6	24050	24055	100 %	0 %	0 %	0 %	218556963
503	NC_011742	A	7	7	24059	24065	100 %	0 %	0 %	0 %	218556963
504	NC_011742	ATG	2	6	24078	24083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
505	NC_011742	CCT	2	6	24086	24091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218556963
506	NC_011742	CTGG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	218556963
507	NC_011742	CCG	2	6	24270	24275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556963
508	NC_011742	CAT	2	6	24409	24414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
509	NC_011742	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	218556963
510	NC_011742	ATC	2	6	24431	24436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
511	NC_011742	ACC	2	6	24638	24643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556963
512	NC_011742	CTGC	2	8	24656	24663	0 %	25 %	25 %	50 %	218556963
513	NC_011742	GAC	2	6	24938	24943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556963
514	NC_011742	GTT	2	6	25072	25077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556963
515	NC_011742	TGC	2	6	25130	25135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
516	NC_011742	ATC	2	6	25154	25159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
517	NC_011742	CG	3	6	25163	25168	0 %	0 %	50 %	50 %	218556963
518	NC_011742	CGC	2	6	25170	25175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556963
519	NC_011742	TGCG	2	8	25206	25213	0 %	25 %	50 %	25 %	218556963
520	NC_011742	TC	3	6	25308	25313	0 %	50 %	0 %	50 %	218556963
521	NC_011742	AGA	2	6	25363	25368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556963
522	NC_011742	GAA	2	6	25397	25402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556963
523	NC_011742	GTG	2	6	25438	25443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556963
524	NC_011742	CGA	2	6	25471	25476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556963
525	NC_011742	GTT	2	6	25547	25552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556963
526	NC_011742	TGA	2	6	25638	25643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
527	NC_011742	CGC	2	6	25752	25757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556963
528	NC_011742	TGA	2	6	25764	25769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
529	NC_011742	TGC	2	6	25858	25863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
530	NC_011742	TCG	2	6	25873	25878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
531	NC_011742	CG	3	6	25891	25896	0 %	0 %	50 %	50 %	218556963
532	NC_011742	CTG	2	6	25901	25906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
533	NC_011742	TGG	2	6	25959	25964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556963
534	NC_011742	CAT	2	6	26104	26109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218556963
535	NC_011742	CGT	2	6	26150	26155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
536	NC_011742	TGA	2	6	26230	26235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
537	NC_011742	GGC	2	6	26414	26419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556963
538	NC_011742	GGC	2	6	26461	26466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556963
539	NC_011742	ACG	2	6	26538	26543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556963
540	NC_011742	CTG	2	6	26547	26552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
541	NC_011742	CAG	2	6	26558	26563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556963
542	NC_011742	GCT	2	6	26625	26630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556963
543	NC_011742	CGGTGA	2	12	26704	26715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218556963
544	NC_011742	TGA	2	6	26732	26737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556963
545	NC_011742	GCTG	2	8	26765	26772	0 %	25 %	50 %	25 %	218556964
546	NC_011742	TGG	2	6	26777	26782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556964
547	NC_011742	GCA	2	6	26807	26812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556964
548	NC_011742	TCC	2	6	26822	26827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218556964
549	NC_011742	GCG	2	6	26924	26929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556964
550	NC_011742	TGA	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556964
551	NC_011742	ATT	2	6	27043	27048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218556964
552	NC_011742	GGC	2	6	27049	27054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556964
553	NC_011742	T	6	6	27198	27203	0 %	100 %	0 %	0 %	218556964
554	NC_011742	A	6	6	27217	27222	100 %	0 %	0 %	0 %	218556964
555	NC_011742	AAT	2	6	27224	27229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556964
556	NC_011742	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_011742	TGC	2	6	27277	27282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011742	GAT	2	6	27393	27398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556965
559	NC_011742	CAC	2	6	27401	27406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556965
560	NC_011742	CAA	2	6	27422	27427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218556965
561	NC_011742	CTG	2	6	27489	27494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556965
562	NC_011742	ACC	2	6	27516	27521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556965
563	NC_011742	GCG	2	6	27540	27545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218556965
564	NC_011742	CCG	2	6	27584	27589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556965
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567	NC_011742	AT	3	6	27883	27888	50 %	50 %	0 %	0 %	218556966
568	NC_011742	GTG	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556966
569	NC_011742	CGT	2	6	28117	28122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556966
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571	NC_011742	TG	3	6	28233	28238	0 %	50 %	50 %	0 %	218556966
572	NC_011742	AGT	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556966
573	NC_011742	TGG	2	6	28439	28444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556966
574	NC_011742	CTC	2	6	28458	28463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218556966
575	NC_011742	GC	3	6	28506	28511	0 %	0 %	50 %	50 %	218556966
576	NC_011742	TTGA	2	8	28516	28523	25 %	50 %	25 %	0 %	218556966
577	NC_011742	CTG	2	6	28580	28585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556966
578	NC_011742	CAG	2	6	28633	28638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556966
579	NC_011742	GAA	2	6	28675	28680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218556966
580	NC_011742	AGC	2	6	28744	28749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011742	T	6	6	28786	28791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011742	GCC	2	6	28860	28865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218556967
583	NC_011742	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556967
584	NC_011742	ACC	2	6	28935	28940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218556967
585	NC_011742	CTG	2	6	28956	28961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556967
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588	NC_011742	TTG	2	6	29074	29079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556967
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590	NC_011742	TGG	2	6	29161	29166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556967
591	NC_011742	CTG	2	6	29257	29262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556967
592	NC_011742	CTGG	2	8	29519	29526	0 %	25 %	50 %	25 %	218556967
593	NC_011742	ACG	2	6	29598	29603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218556967
594	NC_011742	GTT	2	6	29604	29609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218556967
595	NC_011742	CTGGAT	2	12	29655	29666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218556967
596	NC_011742	TAA	3	9	29715	29723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218556967
597	NC_011742	TCTG	2	8	29846	29853	0 %	50 %	25 %	25 %	218556968
598	NC_011742	TGG	2	6	29869	29874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556968
599	NC_011742	T	8	8	29912	29919	0 %	100 %	0 %	0 %	218556968
600	NC_011742	ATTT	2	8	29934	29941	25 %	75 %	0 %	0 %	218556968
601	NC_011742	GTG	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218556968
602	NC_011742	TGC	2	6	30070	30075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218556968
603	NC_011742	TCCC	2	8	30155	30162	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
604	NC_011742	TGGC	2	8	30196	30203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_011742	ATG	2	6	30270	30275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218556969
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620	NC_011742	ACA	2	6	31115	31120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011742	TGT	2	6	31232	31237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011742	T	6	6	31268	31273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011742	TCT	2	6	31297	31302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011742	TGC	2	6	31303	31308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011742	CATG	2	8	31365	31372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_011742	ATA	2	6	31382	31387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_011742	TCG	2	6	31455	31460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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