MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	CCGG	2	8	402	409	0 %	0 %	50 %	50 %	209921953
2	NC_011419	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	209921953
3	NC_011419	CTGC	2	8	919	926	0 %	25 %	25 %	50 %	209921953
4	NC_011419	GCTG	2	8	1053	1060	0 %	25 %	50 %	25 %	209921953
5	NC_011419	CAAA	2	8	1261	1268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011419	AACA	2	8	1386	1393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011419	CCCG	2	8	1576	1583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_011419	ATCA	2	8	1825	1832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011419	CTGA	2	8	3040	3047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011419	CCCG	2	8	3533	3540	0 %	0 %	25 %	75 %	209921958
11	NC_011419	GAAA	2	8	3676	3683	75 %	0 %	25 %	0 %	209921958
12	NC_011419	GGCG	2	8	4636	4643	0 %	0 %	75 %	25 %	209921960
13	NC_011419	CAGC	2	8	4953	4960	25 %	0 %	25 %	50 %	209921960
14	NC_011419	GCTG	2	8	5445	5452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011419	CCGA	2	8	5566	5573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011419	CATC	2	8	5833	5840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011419	TCGT	2	8	6534	6541	0 %	50 %	25 %	25 %	209921962
18	NC_011419	CTCG	2	8	6586	6593	0 %	25 %	25 %	50 %	209921962
19	NC_011419	TGCA	2	8	6910	6917	25 %	25 %	25 %	25 %	209921962
20	NC_011419	GAAC	2	8	6929	6936	50 %	0 %	25 %	25 %	209921962
21	NC_011419	ACGC	2	8	7012	7019	25 %	0 %	25 %	50 %	209921962
22	NC_011419	GCTG	2	8	7044	7051	0 %	25 %	50 %	25 %	209921962
23	NC_011419	TGCA	2	8	7730	7737	25 %	25 %	25 %	25 %	209921963
24	NC_011419	CAGG	2	8	8229	8236	25 %	0 %	50 %	25 %	209921963
25	NC_011419	TCGC	2	8	8269	8276	0 %	25 %	25 %	50 %	209921963
26	NC_011419	CAAT	2	8	8498	8505	50 %	25 %	0 %	25 %	209921964
27	NC_011419	AACC	2	8	8531	8538	50 %	0 %	0 %	50 %	209921964
28	NC_011419	GAAT	2	8	8690	8697	50 %	25 %	25 %	0 %	209921965
29	NC_011419	AACC	2	8	8851	8858	50 %	0 %	0 %	50 %	209921965
30	NC_011419	GCCG	2	8	9213	9220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011419	CGCC	2	8	9374	9381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_011419	GGCG	2	8	9810	9817	0 %	0 %	75 %	25 %	209921968
33	NC_011419	CAGC	2	8	10127	10134	25 %	0 %	25 %	50 %	209921968
34	NC_011419	GGGA	2	8	10313	10320	25 %	0 %	75 %	0 %	209921969
35	NC_011419	CTGG	2	8	10354	10361	0 %	25 %	50 %	25 %	209921969
36	NC_011419	GGCT	2	8	10554	10561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011419	ATAA	2	8	10760	10767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011419	ATTC	2	8	10773	10780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011419	TACT	2	8	10858	10865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011419	AAAG	2	8	11931	11938	75 %	0 %	25 %	0 %	209921970
41	NC_011419	GCAG	2	8	12932	12939	25 %	0 %	50 %	25 %	209921971
42	NC_011419	TGCT	2	8	13129	13136	0 %	50 %	25 %	25 %	209921971
43	NC_011419	ATCA	2	8	13815	13822	50 %	25 %	0 %	25 %	209921971
44	NC_011419	AATT	2	8	13877	13884	50 %	50 %	0 %	0 %	209921971
45	NC_011419	TGAT	2	8	14353	14360	25 %	50 %	25 %	0 %	209921971
46	NC_011419	TAAA	2	8	14400	14407	75 %	25 %	0 %	0 %	209921971
47	NC_011419	ACAG	2	8	14431	14438	50 %	0 %	25 %	25 %	209921972
48	NC_011419	AGAA	2	8	14454	14461	75 %	0 %	25 %	0 %	209921972
49	NC_011419	AGCA	2	8	14514	14521	50 %	0 %	25 %	25 %	209921972
50	NC_011419	CTTT	2	8	14772	14779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011419	CTTC	2	8	15364	15371	0 %	50 %	0 %	50 %	209921974
52	NC_011419	CGTC	2	8	15605	15612	0 %	25 %	25 %	50 %	209921974
53	NC_011419	CAGC	2	8	15654	15661	25 %	0 %	25 %	50 %	209921974
54	NC_011419	CAGC	2	8	15788	15795	25 %	0 %	25 %	50 %	209921974
55	NC_011419	CATT	2	8	15922	15929	25 %	50 %	0 %	25 %	209921975
56	NC_011419	ATCC	2	8	16103	16110	25 %	25 %	0 %	50 %	209921975
57	NC_011419	ATTT	2	8	18044	18051	25 %	75 %	0 %	0 %	209921979
58	NC_011419	ATTT	2	8	18919	18926	25 %	75 %	0 %	0 %	209921979
59	NC_011419	TCAT	2	8	19778	19785	25 %	50 %	0 %	25 %	209921980
60	NC_011419	TCAT	2	8	20189	20196	25 %	50 %	0 %	25 %	209921980
61	NC_011419	CTGA	2	8	20751	20758	25 %	25 %	25 %	25 %	209921981
62	NC_011419	CTGT	2	8	20849	20856	0 %	50 %	25 %	25 %	209921981
63	NC_011419	GCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	50 %	25 %	209921981
64	NC_011419	GAAT	2	8	20931	20938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011419	TCAG	2	8	21204	21211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011419	TGTC	2	8	23171	23178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011419	ATCC	2	8	23411	23418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011419	CCGG	2	8	23680	23687	0 %	0 %	50 %	50 %	209921984
69	NC_011419	CGGC	2	8	23844	23851	0 %	0 %	50 %	50 %	209921985
70	NC_011419	CGTC	2	8	23996	24003	0 %	25 %	25 %	50 %	209921985
71	NC_011419	CGGC	2	8	24266	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	209921985
72	NC_011419	CGTG	2	8	24350	24357	0 %	25 %	50 %	25 %	209921985
73	NC_011419	CTCA	2	8	24945	24952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011419	ATCC	2	8	25487	25494	25 %	25 %	0 %	50 %	209921986
75	NC_011419	GCTG	2	8	25563	25570	0 %	25 %	50 %	25 %	209921986
76	NC_011419	ATAC	2	8	25594	25601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011419	TACA	2	8	25865	25872	50 %	25 %	0 %	25 %	209921987
78	NC_011419	TCCC	2	8	26202	26209	0 %	25 %	0 %	75 %	209921987
79	NC_011419	AGGA	2	8	26802	26809	50 %	0 %	50 %	0 %	209921988
80	NC_011419	CAGC	2	8	26865	26872	25 %	0 %	25 %	50 %	209921988
81	NC_011419	CAGG	2	8	26927	26934	25 %	0 %	50 %	25 %	209921988
82	NC_011419	CTGA	2	8	27750	27757	25 %	25 %	25 %	25 %	209921989
83	NC_011419	ATCA	2	8	28044	28051	50 %	25 %	0 %	25 %	209921989
84	NC_011419	AACA	2	8	28065	28072	75 %	0 %	0 %	25 %	209921989
85	NC_011419	AACA	2	8	28141	28148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011419	TGTT	2	8	28843	28850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011419	GAAA	3	12	29242	29253	75 %	0 %	25 %	0 %	209921991
88	NC_011419	AAAT	2	8	29869	29876	75 %	25 %	0 %	0 %	209921992
89	NC_011419	GTTA	2	8	29989	29996	25 %	50 %	25 %	0 %	209921992
90	NC_011419	CAGC	2	8	30503	30510	25 %	0 %	25 %	50 %	209921993
91	NC_011419	GTGA	2	8	31580	31587	25 %	25 %	50 %	0 %	209921994
92	NC_011419	AGAA	2	8	31815	31822	75 %	0 %	25 %	0 %	209921994
93	NC_011419	CAGC	2	8	31996	32003	25 %	0 %	25 %	50 %	209921995
94	NC_011419	GTAT	2	8	32648	32655	25 %	50 %	25 %	0 %	209921997
95	NC_011419	TTCA	2	8	33286	33293	25 %	50 %	0 %	25 %	209921997
96	NC_011419	TGGC	2	8	33408	33415	0 %	25 %	50 %	25 %	209921997
97	NC_011419	CGGG	2	8	33566	33573	0 %	0 %	75 %	25 %	209921998
98	NC_011419	GCAG	2	8	34450	34457	25 %	0 %	50 %	25 %	209921999
99	NC_011419	ATGA	2	8	34699	34706	50 %	25 %	25 %	0 %	209922000
100	NC_011419	CAGT	2	8	35593	35600	25 %	25 %	25 %	25 %	209922002
101	NC_011419	AGTG	2	8	35942	35949	25 %	25 %	50 %	0 %	209922002
102	NC_011419	ACGG	2	8	36958	36965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011419	GGCA	2	8	37291	37298	25 %	0 %	50 %	25 %	209922005
104	NC_011419	TGCC	2	8	37671	37678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011419	GTAA	2	8	38892	38899	50 %	25 %	25 %	0 %	209922009
106	NC_011419	AAGC	2	8	38998	39005	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
107	NC_011419	GAAC	2	8	39971	39978	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
108	NC_011419	ACGC	2	8	40268	40275	25 %	0 %	25 %	50 %	209922010
109	NC_011419	GAAG	2	8	40436	40443	50 %	0 %	50 %	0 %	209922010
110	NC_011419	TCAG	2	8	40537	40544	25 %	25 %	25 %	25 %	209922010
111	NC_011419	CAGA	2	8	40872	40879	50 %	0 %	25 %	25 %	209922010
112	NC_011419	TCAC	2	8	41068	41075	25 %	25 %	0 %	50 %	209922011
113	NC_011419	CTTT	2	8	41532	41539	0 %	75 %	0 %	25 %	209922012
114	NC_011419	TGGC	2	8	41636	41643	0 %	25 %	50 %	25 %	209922012
115	NC_011419	CCGT	2	8	41723	41730	0 %	25 %	25 %	50 %	209922012
116	NC_011419	GCCT	2	8	43745	43752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011419	CTAT	2	8	44917	44924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011419	CTGG	2	8	45681	45688	0 %	25 %	50 %	25 %	209922019
119	NC_011419	GCTG	2	8	45960	45967	0 %	25 %	50 %	25 %	209922019
120	NC_011419	ATAA	2	8	46752	46759	75 %	25 %	0 %	0 %	209922022
121	NC_011419	TGCC	2	8	46963	46970	0 %	25 %	25 %	50 %	209922022
122	NC_011419	TGAC	2	8	47463	47470	25 %	25 %	25 %	25 %	209922023
123	NC_011419	TGAT	2	8	47712	47719	25 %	50 %	25 %	0 %	209922023
124	NC_011419	CCTG	2	8	48225	48232	0 %	25 %	25 %	50 %	209922024
125	NC_011419	AGTG	2	8	48762	48769	25 %	25 %	50 %	0 %	209922025
126	NC_011419	AAGA	2	8	48780	48787	75 %	0 %	25 %	0 %	209922025
127	NC_011419	TGTT	2	8	48992	48999	0 %	75 %	25 %	0 %	209922025
128	NC_011419	TTCG	2	8	49147	49154	0 %	50 %	25 %	25 %	209922026
129	NC_011419	TGCC	2	8	49681	49688	0 %	25 %	25 %	50 %	209922026
130	NC_011419	GATG	2	8	49954	49961	25 %	25 %	50 %	0 %	209922026
131	NC_011419	AAAG	2	8	50555	50562	75 %	0 %	25 %	0 %	209922026
132	NC_011419	TTTG	2	8	50818	50825	0 %	75 %	25 %	0 %	209922026
133	NC_011419	ACAA	2	8	51585	51592	75 %	0 %	0 %	25 %	209922026
134	NC_011419	GAAG	2	8	51695	51702	50 %	0 %	50 %	0 %	209922026
135	NC_011419	GGTT	2	8	51868	51875	0 %	50 %	50 %	0 %	209922027
136	NC_011419	TCAA	2	8	52461	52468	50 %	25 %	0 %	25 %	209922027
137	NC_011419	CGGT	2	8	54430	54437	0 %	25 %	50 %	25 %	209922028
138	NC_011419	GGCT	2	8	54507	54514	0 %	25 %	50 %	25 %	209922028
139	NC_011419	CAGG	2	8	54535	54542	25 %	0 %	50 %	25 %	209922028
140	NC_011419	GTTC	2	8	54562	54569	0 %	50 %	25 %	25 %	209922028
141	NC_011419	GCAG	2	8	54950	54957	25 %	0 %	50 %	25 %	209922028
142	NC_011419	ATCA	2	8	55002	55009	50 %	25 %	0 %	25 %	209922028
143	NC_011419	ATTT	2	8	56471	56478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011419	ATCA	2	8	56631	56638	50 %	25 %	0 %	25 %	209922030
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.