MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-1

Total Repeats: 1344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011419	GAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
2	NC_011419	CCA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921953
3	NC_011419	ATC	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921953
4	NC_011419	TCG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
5	NC_011419	CCT	2	6	420	425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921953
6	NC_011419	CTG	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
7	NC_011419	GAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
8	NC_011419	CAG	3	9	730	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
9	NC_011419	CAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
10	NC_011419	CGT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921953
11	NC_011419	GAA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921953
12	NC_011419	CAG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921953
13	NC_011419	GCC	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921953
14	NC_011419	ATC	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011419	TCA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011419	GTT	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011419	AAG	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011419	ATT	2	6	1325	1330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011419	CGC	2	6	1349	1354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011419	ACC	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011419	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011419	GCA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011419	GCC	2	6	1570	1575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011419	AAC	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011419	TGT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011419	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011419	CGG	2	6	1854	1859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011419	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011419	GCC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011419	ATT	2	6	1916	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011419	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921954
32	NC_011419	GCC	2	6	2068	2073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921954
33	NC_011419	AGG	3	9	2132	2140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921954
34	NC_011419	GCC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921955
35	NC_011419	GTT	2	6	2417	2422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921955
36	NC_011419	ATT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011419	AAT	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011419	GCA	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921956
39	NC_011419	AAT	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921956
40	NC_011419	TAC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011419	GTT	2	6	3016	3021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011419	ACT	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011419	GCG	2	6	3084	3089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011419	TTA	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921957
45	NC_011419	ATC	3	9	3386	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921957
46	NC_011419	TTC	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921958
47	NC_011419	CTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921958
48	NC_011419	AAG	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921958
49	NC_011419	AAG	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921958
50	NC_011419	GTA	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921958
51	NC_011419	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921958
52	NC_011419	TCT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921958
53	NC_011419	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921959
54	NC_011419	CGG	2	6	4112	4117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921959
55	NC_011419	CCA	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921959
56	NC_011419	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921960
57	NC_011419	TGG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921960
58	NC_011419	GTT	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921960
59	NC_011419	TGA	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921960
60	NC_011419	CTT	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921960
61	NC_011419	GTT	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921960
62	NC_011419	ACG	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921960
63	NC_011419	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921960
64	NC_011419	ATG	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921960
65	NC_011419	GAT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011419	CAC	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011419	GCA	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921961
68	NC_011419	CGT	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921961
69	NC_011419	TCA	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921961
70	NC_011419	GCC	2	6	5302	5307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011419	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011419	GCT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011419	GCC	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011419	TCG	3	9	5423	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011419	CGC	2	6	5495	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011419	CCG	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011419	CAC	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011419	TGT	2	6	5655	5660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011419	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011419	TCA	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011419	GAC	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011419	GTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011419	CAG	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011419	TGG	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011419	AGT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011419	ATG	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011419	GCC	2	6	6107	6112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011419	GGA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011419	GAA	2	6	6354	6359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011419	ACC	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011419	GCC	2	6	6492	6497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011419	TTC	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921962
93	NC_011419	CCG	2	6	6564	6569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921962
94	NC_011419	ATG	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921962
95	NC_011419	GGT	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921962
96	NC_011419	CTC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921962
97	NC_011419	TGC	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
98	NC_011419	GCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921962
99	NC_011419	GTC	3	9	6941	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
100	NC_011419	CGT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
101	NC_011419	CGT	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921962
102	NC_011419	ATC	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011419	TGC	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
104	NC_011419	GCC	3	9	7466	7474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
105	NC_011419	TGG	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921963
106	NC_011419	GCG	3	9	7747	7755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
107	NC_011419	CTA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921963
108	NC_011419	GCT	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
109	NC_011419	TCG	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921963
110	NC_011419	TCT	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921963
111	NC_011419	CGA	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921963
112	NC_011419	CCA	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921963
113	NC_011419	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
114	NC_011419	TTC	2	6	8177	8182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921963
115	NC_011419	CGG	2	6	8190	8195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921963
116	NC_011419	GAC	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921963
117	NC_011419	GCC	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
118	NC_011419	GCC	2	6	8377	8382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921963
119	NC_011419	CGG	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011419	CAC	2	6	8477	8482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011419	CAG	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921964
122	NC_011419	CTG	3	9	8726	8734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921965
123	NC_011419	CAA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921965
124	NC_011419	TGC	2	6	8820	8825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921965
125	NC_011419	ACA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921966
126	NC_011419	CTG	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921966
127	NC_011419	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921966
128	NC_011419	GCC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921966
129	NC_011419	TCA	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011419	CGG	2	6	9249	9254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011419	GCC	2	6	9305	9310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011419	AGC	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011419	TCG	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011419	GCA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921967
135	NC_011419	ATA	2	6	9582	9587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921968
136	NC_011419	TGG	2	6	9641	9646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921968
137	NC_011419	GTT	2	6	9726	9731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921968
138	NC_011419	TGA	2	6	9830	9835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921968
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140	NC_011419	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921968
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154	NC_011419	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_011419	TGT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_011419	CAC	2	6	20837	20842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921981
259	NC_011419	GTC	2	6	20980	20985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_011419	GAA	2	6	20995	21000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_011419	CAA	2	6	21233	21238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_011419	CAA	2	6	21250	21255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_011419	AAT	2	6	21282	21287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_011419	TCA	2	6	21341	21346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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