MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	CGG	2	6	93	98	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921876
2	NC_011416	ACA	2	6	116	121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921876
3	NC_011416	TAA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921876
4	NC_011416	AAT	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921876
5	NC_011416	TGA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921876
6	NC_011416	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921876
7	NC_011416	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921876
8	NC_011416	ACA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921876
9	NC_011416	ATG	2	6	758	763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921876
10	NC_011416	ACG	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921876
11	NC_011416	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921876
12	NC_011416	TAT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921876
13	NC_011416	CTG	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
14	NC_011416	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921877
15	NC_011416	GCT	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
16	NC_011416	TGG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921877
17	NC_011416	CGG	2	6	1398	1403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921877
18	NC_011416	TCG	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
19	NC_011416	GCA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921877
20	NC_011416	TTG	3	9	1661	1669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921877
21	NC_011416	TCC	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921877
22	NC_011416	TGA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921877
23	NC_011416	GTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921877
24	NC_011416	TGA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921878
25	NC_011416	GGC	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921878
26	NC_011416	CTG	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921878
27	NC_011416	ACC	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921878
28	NC_011416	TGA	2	6	2167	2172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921878
29	NC_011416	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921878
30	NC_011416	CAC	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921878
31	NC_011416	AGG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921878
32	NC_011416	ATT	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921878
33	NC_011416	TCA	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921878
34	NC_011416	CCG	2	6	2877	2882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921878
35	NC_011416	TAT	3	9	2935	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011416	GAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011416	CAC	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011416	GCT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011416	AAC	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011416	GTC	3	9	3426	3434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011416	GTA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011416	CTC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011416	CCT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011416	TTC	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921879
45	NC_011416	TCA	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921879
46	NC_011416	CAC	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921879
47	NC_011416	GCA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921879
48	NC_011416	TTG	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011416	GTG	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011416	AAT	2	6	4112	4117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011416	CCA	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011416	GAA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011416	TTC	2	6	4293	4298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011416	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011416	TCA	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011416	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921880
57	NC_011416	CAG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921880
58	NC_011416	AGC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921880
59	NC_011416	CTG	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921880
60	NC_011416	GCC	2	6	4835	4840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921880
61	NC_011416	GTT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921880
62	NC_011416	TGC	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921880
63	NC_011416	CTC	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921880
64	NC_011416	AAG	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921880
65	NC_011416	GCC	2	6	5096	5101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921881
66	NC_011416	GTC	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
67	NC_011416	TGA	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921881
68	NC_011416	TCG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
69	NC_011416	GCT	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
70	NC_011416	CTG	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
71	NC_011416	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921881
72	NC_011416	CGC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921881
73	NC_011416	GAA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921881
74	NC_011416	CGG	2	6	5639	5644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921881
75	NC_011416	GCA	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921881
76	NC_011416	GCA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921882
77	NC_011416	ACT	2	6	5905	5910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011416	CTT	2	6	6137	6142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011416	TTC	2	6	6151	6156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011416	TAA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011416	TGC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921883
82	NC_011416	TAA	2	6	6362	6367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
83	NC_011416	TAA	2	6	6407	6412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
84	NC_011416	ATT	2	6	6457	6462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921883
85	NC_011416	AAT	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
86	NC_011416	AGA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921883
87	NC_011416	CAT	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921883
88	NC_011416	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921883
89	NC_011416	CAA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921883
90	NC_011416	ATA	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
91	NC_011416	TAA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
92	NC_011416	AAT	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
93	NC_011416	AAG	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011416	ATA	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011416	GAT	2	6	7429	7434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011416	ATA	2	6	7482	7487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011416	TTA	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011416	TGT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011416	GCC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011416	AGC	2	6	7928	7933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921884
101	NC_011416	GGA	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011416	ACC	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011416	ATA	2	6	8140	8145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921885
104	NC_011416	TTA	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921885
105	NC_011416	CCA	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011416	ATC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011416	AAT	2	6	8536	8541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011416	TGC	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011416	GAA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921886
110	NC_011416	CTG	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
111	NC_011416	CTT	2	6	8817	8822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921886
112	NC_011416	TGT	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921886
113	NC_011416	GAT	2	6	9056	9061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921886
114	NC_011416	CAC	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921886
115	NC_011416	CGT	3	9	9075	9083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
116	NC_011416	CGA	2	6	9104	9109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921886
117	NC_011416	CGC	2	6	9184	9189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921886
118	NC_011416	TGC	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
119	NC_011416	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011416	ATA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011416	TCA	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921887
122	NC_011416	AGA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921887
123	NC_011416	GCT	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921887
124	NC_011416	GTA	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921887
125	NC_011416	CAA	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921887
126	NC_011416	TTC	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921887
127	NC_011416	GTT	2	6	10613	10618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921887
128	NC_011416	GAC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921887
129	NC_011416	CCT	2	6	10710	10715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011416	TAT	2	6	11071	11076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011416	GCG	2	6	11166	11171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011416	GGT	2	6	11327	11332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011416	GCT	2	6	11335	11340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011416	CGC	2	6	11438	11443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011416	TGA	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921888
136	NC_011416	GGT	2	6	11471	11476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921888
137	NC_011416	GCT	2	6	11483	11488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921888
138	NC_011416	AGA	2	6	11497	11502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921888
139	NC_011416	ATT	2	6	11553	11558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921888
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141	NC_011416	GCT	2	6	11627	11632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921888
142	NC_011416	ATG	2	6	11701	11706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921888
143	NC_011416	GCT	2	6	11744	11749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921888
144	NC_011416	CCG	2	6	11774	11779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921888
145	NC_011416	AAT	2	6	12011	12016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011416	CAT	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011416	GAA	2	6	12091	12096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011416	GTA	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921889
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156	NC_011416	CTT	2	6	12977	12982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921890
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