MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011416	AGTCAT	2	12	48542	48553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209921930
1002	NC_011416	CT	4	8	48633	48640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_011416	AGC	2	6	48702	48707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011416	TGGGC	2	10	48741	48750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_011416	CAC	2	6	48833	48838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921931
1006	NC_011416	ATC	2	6	48878	48883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921931
1007	NC_011416	CTC	2	6	48886	48891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921931
1008	NC_011416	GGA	2	6	48909	48914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921931
1009	NC_011416	GCC	2	6	48934	48939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921931
1010	NC_011416	CGC	2	6	48946	48951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921931
1011	NC_011416	GCTG	2	8	48974	48981	0 %	25 %	50 %	25 %	209921931
1012	NC_011416	TGA	2	6	48986	48991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921931
1013	NC_011416	TAT	2	6	49053	49058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011416	AT	3	6	49157	49162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011416	CT	3	6	49169	49174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_011416	ATAC	2	8	49186	49193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011416	CAT	2	6	49221	49226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921932
1018	NC_011416	T	6	6	49226	49231	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
1019	NC_011416	A	6	6	49264	49269	100 %	0 %	0 %	0 %	209921932
1020	NC_011416	T	6	6	49288	49293	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
1021	NC_011416	AT	3	6	49314	49319	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
1022	NC_011416	C	7	7	49337	49343	0 %	0 %	0 %	100 %	209921932
1023	NC_011416	TGA	2	6	49392	49397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921932
1024	NC_011416	AAGT	2	8	49427	49434	50 %	25 %	25 %	0 %	209921932
1025	NC_011416	AT	3	6	49461	49466	50 %	50 %	0 %	0 %	209921932
1026	NC_011416	GTT	2	6	49471	49476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921932
1027	NC_011416	TCTT	2	8	49483	49490	0 %	75 %	0 %	25 %	209921932
1028	NC_011416	T	6	6	49538	49543	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
1029	NC_011416	AGT	2	6	49554	49559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921932
1030	NC_011416	C	6	6	49629	49634	0 %	0 %	0 %	100 %	209921932
1031	NC_011416	ATATT	2	10	49727	49736	40 %	60 %	0 %	0 %	209921932
1032	NC_011416	GGA	2	6	49742	49747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921932
1033	NC_011416	GACAG	2	10	49752	49761	40 %	0 %	40 %	20 %	209921932
1034	NC_011416	TC	3	6	49772	49777	0 %	50 %	0 %	50 %	209921932
1035	NC_011416	AGG	2	6	49792	49797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921932
1036	NC_011416	T	6	6	49810	49815	0 %	100 %	0 %	0 %	209921932
1037	NC_011416	TTG	2	6	49881	49886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921932
1038	NC_011416	ACAT	2	8	49895	49902	50 %	25 %	0 %	25 %	209921932
1039	NC_011416	TCTT	2	8	49958	49965	0 %	75 %	0 %	25 %	209921932
1040	NC_011416	AAAT	2	8	49966	49973	75 %	25 %	0 %	0 %	209921932
1041	NC_011416	CTG	2	6	49988	49993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921932
1042	NC_011416	TCT	2	6	50033	50038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921932
1043	NC_011416	TCC	2	6	50098	50103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_011416	CAA	2	6	50135	50140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011416	TA	3	6	50158	50163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011416	TACTTC	2	12	50193	50204	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011416	A	6	6	50222	50227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011416	GAA	2	6	50242	50247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011416	CA	3	6	50292	50297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_011416	GT	3	6	50300	50305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011416	AAT	2	6	50308	50313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011416	A	6	6	50357	50362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011416	AGAC	2	8	50396	50403	50 %	0 %	25 %	25 %	209921933
1054	NC_011416	ATT	2	6	50418	50423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921933
1055	NC_011416	ATA	2	6	50437	50442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921933
1056	NC_011416	AT	3	6	50530	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
1057	NC_011416	ATAC	2	8	50546	50553	50 %	25 %	0 %	25 %	209921933
1058	NC_011416	AGA	2	6	50556	50561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921933
1059	NC_011416	AGC	2	6	50573	50578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921933
1060	NC_011416	GATA	2	8	50609	50616	50 %	25 %	25 %	0 %	209921933
1061	NC_011416	A	7	7	50667	50673	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
1062	NC_011416	ACAGAA	2	12	50698	50709	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209921933
1063	NC_011416	ATT	2	6	50710	50715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921933
1064	NC_011416	CTTA	2	8	50725	50732	25 %	50 %	0 %	25 %	209921933
1065	NC_011416	C	6	6	50735	50740	0 %	0 %	0 %	100 %	209921933
1066	NC_011416	TA	3	6	50946	50951	50 %	50 %	0 %	0 %	209921933
1067	NC_011416	CAA	3	9	50953	50961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921933
1068	NC_011416	A	6	6	50960	50965	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
1069	NC_011416	A	6	6	50982	50987	100 %	0 %	0 %	0 %	209921933
1070	NC_011416	T	6	6	51044	51049	0 %	100 %	0 %	0 %	209921933
1071	NC_011416	CA	3	6	51100	51105	50 %	0 %	0 %	50 %	209921933
1072	NC_011416	AAT	2	6	51159	51164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921933
1073	NC_011416	TAC	2	6	51180	51185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921933
1074	NC_011416	GTA	2	6	51203	51208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921933
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1076	NC_011416	GGA	2	6	51306	51311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921934
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1079	NC_011416	AGGAT	2	10	51430	51439	40 %	20 %	40 %	0 %	209921934
1080	NC_011416	AAT	2	6	51446	51451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921934
1081	NC_011416	T	6	6	51461	51466	0 %	100 %	0 %	0 %	209921934
1082	NC_011416	A	7	7	51488	51494	100 %	0 %	0 %	0 %	209921934
1083	NC_011416	ATC	2	6	51563	51568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921934
1084	NC_011416	TTTG	2	8	51589	51596	0 %	75 %	25 %	0 %	209921934
1085	NC_011416	GGATAT	2	12	51633	51644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921934
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1087	NC_011416	A	9	9	51801	51809	100 %	0 %	0 %	0 %	209921934
1088	NC_011416	TC	3	6	51847	51852	0 %	50 %	0 %	50 %	209921934
1089	NC_011416	ATTCC	2	10	51859	51868	20 %	40 %	0 %	40 %	209921934
1090	NC_011416	T	6	6	51893	51898	0 %	100 %	0 %	0 %	209921934
1091	NC_011416	CTT	2	6	51931	51936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921934
1092	NC_011416	TA	3	6	51982	51987	50 %	50 %	0 %	0 %	209921934
1093	NC_011416	TGG	2	6	52008	52013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921934
1094	NC_011416	TAT	2	6	52052	52057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921934
1095	NC_011416	CAACT	2	10	52062	52071	40 %	20 %	0 %	40 %	209921934
1096	NC_011416	T	6	6	52075	52080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011416	AC	3	6	52167	52172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_011416	G	9	9	52217	52225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011416	ACA	2	6	52451	52456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011416	TGAA	2	8	52478	52485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011416	TAC	2	6	52815	52820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011416	CCTGA	2	10	52839	52848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_011416	TGG	3	9	52936	52944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011416	AGT	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011416	T	7	7	53107	53113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011416	TTTTA	2	10	53116	53125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011416	GTAG	2	8	53152	53159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011416	CCA	2	6	53198	53203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_011416	GTA	2	6	53225	53230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011416	TTG	2	6	53245	53250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011416	TAG	2	6	53282	53287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011416	TCA	2	6	53297	53302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011416	CCT	2	6	53357	53362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_011416	CCCAT	2	10	53372	53381	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1115	NC_011416	TAT	2	6	53430	53435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011416	CTGT	2	8	53447	53454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_011416	TAT	2	6	53550	53555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011416	CTTT	2	8	53679	53686	0 %	75 %	0 %	25 %	209921935
1119	NC_011416	CGT	2	6	53812	53817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1120	NC_011416	GT	3	6	53816	53821	0 %	50 %	50 %	0 %	209921935
1121	NC_011416	CTG	2	6	53837	53842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1122	NC_011416	CAATT	2	10	53915	53924	40 %	40 %	0 %	20 %	209921935
1123	NC_011416	T	7	7	53961	53967	0 %	100 %	0 %	0 %	209921935
1124	NC_011416	TAT	2	6	54004	54009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921935
1125	NC_011416	CATT	2	8	54028	54035	25 %	50 %	0 %	25 %	209921935
1126	NC_011416	GCA	2	6	54075	54080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1127	NC_011416	CGC	2	6	54109	54114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921935
1128	NC_011416	C	6	6	54182	54187	0 %	0 %	0 %	100 %	209921935
1129	NC_011416	ACTG	2	8	54202	54209	25 %	25 %	25 %	25 %	209921935
1130	NC_011416	TGT	2	6	54338	54343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921935
1131	NC_011416	TTA	2	6	54354	54359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921935
1132	NC_011416	TGC	2	6	54394	54399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1133	NC_011416	CTG	2	6	54538	54543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1134	NC_011416	AC	3	6	54592	54597	50 %	0 %	0 %	50 %	209921935
1135	NC_011416	CGAC	2	8	54598	54605	25 %	0 %	25 %	50 %	209921935
1136	NC_011416	CTC	2	6	54698	54703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921935
1137	NC_011416	TGA	2	6	54854	54859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921935
1138	NC_011416	GCC	2	6	54903	54908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921935
1139	NC_011416	AAC	2	6	55002	55007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921935
1140	NC_011416	TGCC	2	8	55109	55116	0 %	25 %	25 %	50 %	209921935
1141	NC_011416	CTTT	2	8	55140	55147	0 %	75 %	0 %	25 %	209921935
1142	NC_011416	GCC	2	6	55178	55183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921935
1143	NC_011416	TCA	2	6	55191	55196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921935
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1145	NC_011416	GCC	2	6	55314	55319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921935
1146	NC_011416	GAA	2	6	55338	55343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921935
1147	NC_011416	TGA	2	6	55484	55489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921935
1148	NC_011416	TGC	2	6	55564	55569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1149	NC_011416	TGG	2	6	55624	55629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921935
1150	NC_011416	GTTT	2	8	55940	55947	0 %	75 %	25 %	0 %	209921935
1151	NC_011416	AT	4	8	55997	56004	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
1152	NC_011416	AT	3	6	56010	56015	50 %	50 %	0 %	0 %	209921935
1153	NC_011416	TGC	2	6	56123	56128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921935
1154	NC_011416	AGAC	2	8	56132	56139	50 %	0 %	25 %	25 %	209921935
1155	NC_011416	TAA	2	6	56300	56305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921936
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1160	NC_011416	TAA	2	6	56404	56409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921936
1161	NC_011416	CTT	2	6	56425	56430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921936
1162	NC_011416	TGA	2	6	56549	56554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921936
1163	NC_011416	ATAA	2	8	56581	56588	75 %	25 %	0 %	0 %	209921936
1164	NC_011416	ATC	2	6	56603	56608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921936
1165	NC_011416	T	7	7	56666	56672	0 %	100 %	0 %	0 %	209921936
1166	NC_011416	CAA	2	6	56752	56757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921936
1167	NC_011416	TGTTT	2	10	56762	56771	0 %	80 %	20 %	0 %	209921936
1168	NC_011416	GAG	2	6	56793	56798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921936
1169	NC_011416	CAGC	2	8	56869	56876	25 %	0 %	25 %	50 %	209921936
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1172	NC_011416	CAG	2	6	56912	56917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921936
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1175	NC_011416	CCA	2	6	56977	56982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921937
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1178	NC_011416	TGT	2	6	57088	57093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921937
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1181	NC_011416	CTTT	2	8	57334	57341	0 %	75 %	0 %	25 %	209921937
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1184	NC_011416	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921937
1185	NC_011416	CCG	2	6	57467	57472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921937
1186	NC_011416	ATG	2	6	57613	57618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921937
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1189	NC_011416	TC	3	6	58039	58044	0 %	50 %	0 %	50 %	209921938
1190	NC_011416	CCA	2	6	58059	58064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921938
1191	NC_011416	ACA	2	6	58074	58079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921938
1192	NC_011416	CTG	2	6	58141	58146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921938
1193	NC_011416	AAAG	2	8	58158	58165	75 %	0 %	25 %	0 %	209921938
1194	NC_011416	CAG	2	6	58166	58171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921938
1195	NC_011416	TAA	2	6	58219	58224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1196	NC_011416	ACC	2	6	58270	58275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921939
1197	NC_011416	CAG	2	6	58287	58292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921939
1198	NC_011416	T	6	6	58393	58398	0 %	100 %	0 %	0 %	209921939
1199	NC_011416	TGT	2	6	58408	58413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921939
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1203	NC_011416	CAGT	2	8	58565	58572	25 %	25 %	25 %	25 %	209921939
1204	NC_011416	ATTT	2	8	58693	58700	25 %	75 %	0 %	0 %	209921939
1205	NC_011416	GCA	2	6	58730	58735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921939
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1209	NC_011416	ATC	3	9	58914	58922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921940
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1213	NC_011416	T	6	6	59158	59163	0 %	100 %	0 %	0 %	209921940
1214	NC_011416	TGA	2	6	59165	59170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921940
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1216	NC_011416	A	6	6	59293	59298	100 %	0 %	0 %	0 %	209921940
1217	NC_011416	TGC	2	6	59306	59311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921940
1218	NC_011416	ATT	2	6	59312	59317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921940
1219	NC_011416	AAT	2	6	59420	59425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921940
1220	NC_011416	GTC	3	9	59469	59477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921940
1221	NC_011416	AACAAA	2	12	59484	59495	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	209921940
1222	NC_011416	TCA	2	6	59546	59551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1223	NC_011416	TA	3	6	59584	59589	50 %	50 %	0 %	0 %	209921941
1224	NC_011416	CAA	2	6	59614	59619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921941
1225	NC_011416	ACC	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921941
1226	NC_011416	ATTA	2	8	59720	59727	50 %	50 %	0 %	0 %	209921941
1227	NC_011416	GTCA	2	8	59762	59769	25 %	25 %	25 %	25 %	209921941
1228	NC_011416	CTA	2	6	59779	59784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921941
1229	NC_011416	CTG	2	6	59900	59905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921941
1230	NC_011416	CTG	2	6	59920	59925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921941
1231	NC_011416	CTG	2	6	59944	59949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921941
1232	NC_011416	TGC	2	6	60044	60049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921941
1233	NC_011416	CAGAA	2	10	60077	60086	60 %	0 %	20 %	20 %	209921941
1234	NC_011416	TAAT	2	8	60139	60146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_011416	TAAT	2	8	60176	60183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1236	NC_011416	ATA	2	6	60217	60222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1237	NC_011416	CATG	2	8	60295	60302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1238	NC_011416	TCTTTA	2	12	60325	60336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1239	NC_011416	ACT	2	6	60364	60369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1240	NC_011416	GCC	2	6	60397	60402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1241	NC_011416	T	6	6	60457	60462	0 %	100 %	0 %	0 %	209921942
1242	NC_011416	GTT	2	6	60465	60470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921942
1243	NC_011416	A	9	9	60495	60503	100 %	0 %	0 %	0 %	209921942

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