MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	G	6	6	117	122	0 %	0 %	100 %	0 %	209916830
2	NC_011413	G	6	6	724	729	0 %	0 %	100 %	0 %	209916830
3	NC_011413	T	6	6	758	763	0 %	100 %	0 %	0 %	209916830
4	NC_011413	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	209916831
5	NC_011413	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	209916832
6	NC_011413	A	6	6	3944	3949	100 %	0 %	0 %	0 %	209916833
7	NC_011413	A	7	7	3953	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	209916833
8	NC_011413	G	6	6	7340	7345	0 %	0 %	100 %	0 %	209916841
9	NC_011413	T	6	6	8196	8201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011413	T	7	7	8241	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011413	T	7	7	8922	8928	0 %	100 %	0 %	0 %	209916842
12	NC_011413	T	6	6	9234	9239	0 %	100 %	0 %	0 %	209916842
13	NC_011413	A	6	6	9585	9590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011413	A	7	7	10616	10622	100 %	0 %	0 %	0 %	209916843
15	NC_011413	A	6	6	11039	11044	100 %	0 %	0 %	0 %	209916843
16	NC_011413	T	6	6	11733	11738	0 %	100 %	0 %	0 %	209916844
17	NC_011413	C	6	6	12487	12492	0 %	0 %	0 %	100 %	209916845
18	NC_011413	G	6	6	12764	12769	0 %	0 %	100 %	0 %	209916845
19	NC_011413	C	6	6	12934	12939	0 %	0 %	0 %	100 %	209916845
20	NC_011413	T	6	6	15999	16004	0 %	100 %	0 %	0 %	209916848
21	NC_011413	T	6	6	16408	16413	0 %	100 %	0 %	0 %	209916848
22	NC_011413	T	8	8	16691	16698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011413	T	6	6	16735	16740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011413	A	6	6	17501	17506	100 %	0 %	0 %	0 %	209916849
25	NC_011413	T	6	6	18222	18227	0 %	100 %	0 %	0 %	209916850
26	NC_011413	G	6	6	19064	19069	0 %	0 %	100 %	0 %	209916850
27	NC_011413	T	6	6	19795	19800	0 %	100 %	0 %	0 %	209916851
28	NC_011413	T	6	6	19861	19866	0 %	100 %	0 %	0 %	209916851
29	NC_011413	A	6	6	20327	20332	100 %	0 %	0 %	0 %	209916851
30	NC_011413	A	6	6	21522	21527	100 %	0 %	0 %	0 %	209916851
31	NC_011413	T	6	6	22423	22428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011413	A	6	6	23341	23346	100 %	0 %	0 %	0 %	209916854
33	NC_011413	G	6	6	23686	23691	0 %	0 %	100 %	0 %	209916854
34	NC_011413	A	6	6	24356	24361	100 %	0 %	0 %	0 %	209916856
35	NC_011413	A	7	7	26877	26883	100 %	0 %	0 %	0 %	209916860
36	NC_011413	T	7	7	27975	27981	0 %	100 %	0 %	0 %	209916863
37	NC_011413	A	6	6	28776	28781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011413	A	6	6	29283	29288	100 %	0 %	0 %	0 %	209916866
39	NC_011413	A	7	7	29715	29721	100 %	0 %	0 %	0 %	209916866
40	NC_011413	A	6	6	29884	29889	100 %	0 %	0 %	0 %	209916866
41	NC_011413	C	6	6	30520	30525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_011413	G	6	6	30979	30984	0 %	0 %	100 %	0 %	209916867
43	NC_011413	A	6	6	32415	32420	100 %	0 %	0 %	0 %	209916870
44	NC_011413	A	7	7	34643	34649	100 %	0 %	0 %	0 %	209916872
45	NC_011413	A	7	7	37867	37873	100 %	0 %	0 %	0 %	209916879
46	NC_011413	T	8	8	37949	37956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011413	A	6	6	38006	38011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011413	T	6	6	38023	38028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011413	T	6	6	38142	38147	0 %	100 %	0 %	0 %	209916880
50	NC_011413	T	6	6	38897	38902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011413	T	6	6	39817	39822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011413	T	6	6	40063	40068	0 %	100 %	0 %	0 %	209916883
53	NC_011413	A	6	6	40144	40149	100 %	0 %	0 %	0 %	209916883
54	NC_011413	A	6	6	40274	40279	100 %	0 %	0 %	0 %	209916884
55	NC_011413	A	7	7	40297	40303	100 %	0 %	0 %	0 %	209916884
56	NC_011413	T	6	6	40491	40496	0 %	100 %	0 %	0 %	209916884
57	NC_011413	A	6	6	40555	40560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011413	T	6	6	40821	40826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011413	A	6	6	41261	41266	100 %	0 %	0 %	0 %	209916885
60	NC_011413	T	8	8	41445	41452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_011413	A	6	6	42042	42047	100 %	0 %	0 %	0 %	209916887
63	NC_011413	A	6	6	42573	42578	100 %	0 %	0 %	0 %	209916888
64	NC_011413	T	6	6	42857	42862	0 %	100 %	0 %	0 %	209916889
65	NC_011413	A	6	6	43543	43548	100 %	0 %	0 %	0 %	209916890
66	NC_011413	A	6	6	44554	44559	100 %	0 %	0 %	0 %	209916891
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69	NC_011413	A	6	6	45977	45982	100 %	0 %	0 %	0 %	209916893
70	NC_011413	T	6	6	46171	46176	0 %	100 %	0 %	0 %	209916893
71	NC_011413	A	7	7	46734	46740	100 %	0 %	0 %	0 %	209916893
72	NC_011413	T	6	6	47320	47325	0 %	100 %	0 %	0 %	209916893
73	NC_011413	A	6	6	51548	51553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011413	A	6	6	51625	51630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011413	A	6	6	52049	52054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011413	A	6	6	52074	52079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011413	T	6	6	52423	52428	0 %	100 %	0 %	0 %	209916900
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79	NC_011413	T	6	6	57171	57176	0 %	100 %	0 %	0 %	209916905
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81	NC_011413	A	6	6	61422	61427	100 %	0 %	0 %	0 %	209916907
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90	NC_011413	A	7	7	63505	63511	100 %	0 %	0 %	0 %	209916910
91	NC_011413	T	6	6	63560	63565	0 %	100 %	0 %	0 %	209916910
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98	NC_011413	A	8	8	73098	73105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011413	A	7	7	73299	73305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011413	A	6	6	74430	74435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_011413	A	6	6	74725	74730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_011413	A	6	6	80911	80916	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
109	NC_011413	A	6	6	81520	81525	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
110	NC_011413	A	7	7	81556	81562	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
111	NC_011413	A	8	8	81761	81768	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
112	NC_011413	A	7	7	81785	81791	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
113	NC_011413	A	6	6	81803	81808	100 %	0 %	0 %	0 %	209916928
114	NC_011413	T	6	6	82564	82569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011413	T	6	6	82607	82612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011413	T	6	6	83322	83327	0 %	100 %	0 %	0 %	209916930
117	NC_011413	A	6	6	83393	83398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011413	T	6	6	83414	83419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011413	G	8	8	83461	83468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011413	A	6	6	83485	83490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011413	T	6	6	83650	83655	0 %	100 %	0 %	0 %	209916931
122	NC_011413	G	6	6	86135	86140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011413	T	6	6	86316	86321	0 %	100 %	0 %	0 %	209916934
124	NC_011413	A	6	6	86548	86553	100 %	0 %	0 %	0 %	209916934
125	NC_011413	A	8	8	87749	87756	100 %	0 %	0 %	0 %	209916936
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127	NC_011413	G	7	7	88657	88663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011413	A	6	6	88980	88985	100 %	0 %	0 %	0 %	209916937
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131	NC_011413	T	6	6	89499	89504	0 %	100 %	0 %	0 %	209916938
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134	NC_011413	A	6	6	89992	89997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011413	T	8	8	90017	90024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011413	A	6	6	90549	90554	100 %	0 %	0 %	0 %	209916940
137	NC_011413	G	11	11	90680	90690	0 %	0 %	100 %	0 %	209916940
138	NC_011413	T	6	6	91118	91123	0 %	100 %	0 %	0 %	209916941

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.