MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	TA	3	6	13	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010488	GA	3	6	203	208	50 %	0 %	50 %	0 %	170650844
3	NC_010488	TG	3	6	482	487	0 %	50 %	50 %	0 %	170650844
4	NC_010488	CT	4	8	2126	2133	0 %	50 %	0 %	50 %	170650796
5	NC_010488	TG	3	6	2191	2196	0 %	50 %	50 %	0 %	170650796
6	NC_010488	AT	3	6	3819	3824	50 %	50 %	0 %	0 %	170650855
7	NC_010488	AT	3	6	3867	3872	50 %	50 %	0 %	0 %	170650855
8	NC_010488	CA	3	6	3938	3943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010488	CA	3	6	4628	4633	50 %	0 %	0 %	50 %	170650904
10	NC_010488	GA	3	6	7292	7297	50 %	0 %	50 %	0 %	170650784
11	NC_010488	TG	3	6	8123	8128	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
12	NC_010488	CT	3	6	8244	8249	0 %	50 %	0 %	50 %	170650784
13	NC_010488	TG	3	6	8744	8749	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
14	NC_010488	CT	3	6	9335	9340	0 %	50 %	0 %	50 %	170650784
15	NC_010488	GC	4	8	10049	10056	0 %	0 %	50 %	50 %	170650784
16	NC_010488	GT	3	6	10652	10657	0 %	50 %	50 %	0 %	170650784
17	NC_010488	AG	4	8	11617	11624	50 %	0 %	50 %	0 %	170650889
18	NC_010488	CA	3	6	12034	12039	50 %	0 %	0 %	50 %	170650889
19	NC_010488	AT	3	6	12994	12999	50 %	50 %	0 %	0 %	170650889
20	NC_010488	GA	3	6	14577	14582	50 %	0 %	50 %	0 %	170650886
21	NC_010488	TA	3	6	14605	14610	50 %	50 %	0 %	0 %	170650886
22	NC_010488	TG	3	6	16159	16164	0 %	50 %	50 %	0 %	170650902
23	NC_010488	AC	3	6	16343	16348	50 %	0 %	0 %	50 %	170650902
24	NC_010488	CG	3	6	16780	16785	0 %	0 %	50 %	50 %	170650902
25	NC_010488	GT	3	6	18133	18138	0 %	50 %	50 %	0 %	170650800
26	NC_010488	TG	3	6	18891	18896	0 %	50 %	50 %	0 %	170650800
27	NC_010488	AT	3	6	19111	19116	50 %	50 %	0 %	0 %	170650880
28	NC_010488	GA	3	6	19850	19855	50 %	0 %	50 %	0 %	170650781
29	NC_010488	TG	3	6	20185	20190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010488	TG	3	6	22409	22414	0 %	50 %	50 %	0 %	170650771
31	NC_010488	AT	3	6	24076	24081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010488	TC	3	6	24121	24126	0 %	50 %	0 %	50 %	170650862
33	NC_010488	AC	3	6	24464	24469	50 %	0 %	0 %	50 %	170650862
34	NC_010488	CG	3	6	27456	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
35	NC_010488	TG	3	6	27505	27510	0 %	50 %	50 %	0 %	170650779
36	NC_010488	GC	3	6	27924	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
37	NC_010488	CA	3	6	28130	28135	50 %	0 %	0 %	50 %	170650779
38	NC_010488	CT	3	6	28393	28398	0 %	50 %	0 %	50 %	170650779
39	NC_010488	GC	3	6	28399	28404	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
40	NC_010488	AC	3	6	28987	28992	50 %	0 %	0 %	50 %	170650779
41	NC_010488	TG	3	6	29107	29112	0 %	50 %	50 %	0 %	170650779
42	NC_010488	CG	3	6	29423	29428	0 %	0 %	50 %	50 %	170650779
43	NC_010488	GC	3	6	32254	32259	0 %	0 %	50 %	50 %	170650812
44	NC_010488	GC	3	6	33317	33322	0 %	0 %	50 %	50 %	170650906
45	NC_010488	AT	3	6	34261	34266	50 %	50 %	0 %	0 %	170650797
46	NC_010488	AG	3	6	34473	34478	50 %	0 %	50 %	0 %	170650797
47	NC_010488	CT	3	6	35325	35330	0 %	50 %	0 %	50 %	170650869
48	NC_010488	TA	3	6	36107	36112	50 %	50 %	0 %	0 %	170650783
49	NC_010488	CT	3	6	36114	36119	0 %	50 %	0 %	50 %	170650783
50	NC_010488	CA	3	6	36301	36306	50 %	0 %	0 %	50 %	170650783
51	NC_010488	TC	3	6	36548	36553	0 %	50 %	0 %	50 %	170650851
52	NC_010488	GA	3	6	36612	36617	50 %	0 %	50 %	0 %	170650851
53	NC_010488	AT	3	6	37022	37027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010488	CA	4	8	37858	37865	50 %	0 %	0 %	50 %	170650793
55	NC_010488	TA	4	8	37926	37933	50 %	50 %	0 %	0 %	170650793
56	NC_010488	GA	3	6	39024	39029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010488	CT	4	8	39345	39352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010488	GC	3	6	40073	40078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010488	AC	3	6	40366	40371	50 %	0 %	0 %	50 %	170650845
60	NC_010488	AC	4	8	40377	40384	50 %	0 %	0 %	50 %	170650845
61	NC_010488	CA	3	6	40531	40536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010488	CT	3	6	40759	40764	0 %	50 %	0 %	50 %	170650870
63	NC_010488	GA	3	6	41591	41596	50 %	0 %	50 %	0 %	170650814
64	NC_010488	CA	3	6	41957	41962	50 %	0 %	0 %	50 %	170650892
65	NC_010488	CG	3	6	43234	43239	0 %	0 %	50 %	50 %	170650892
66	NC_010488	TG	3	6	43382	43387	0 %	50 %	50 %	0 %	170650892
67	NC_010488	CG	3	6	43896	43901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010488	CT	3	6	43910	43915	0 %	50 %	0 %	50 %	170650898
69	NC_010488	TC	3	6	44154	44159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010488	GC	3	6	44503	44508	0 %	0 %	50 %	50 %	170650901
71	NC_010488	GC	3	6	45561	45566	0 %	0 %	50 %	50 %	170650786
72	NC_010488	CG	3	6	45675	45680	0 %	0 %	50 %	50 %	170650791
73	NC_010488	CA	3	6	45954	45959	50 %	0 %	0 %	50 %	170650791
74	NC_010488	GC	3	6	46145	46150	0 %	0 %	50 %	50 %	170650791
75	NC_010488	TC	3	6	47352	47357	0 %	50 %	0 %	50 %	170650805
76	NC_010488	CG	3	6	47527	47532	0 %	0 %	50 %	50 %	170650805
77	NC_010488	GT	3	6	48370	48375	0 %	50 %	50 %	0 %	170650821
78	NC_010488	CG	3	6	48820	48825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010488	GT	3	6	49595	49600	0 %	50 %	50 %	0 %	170650827
80	NC_010488	AC	4	8	50047	50054	50 %	0 %	0 %	50 %	170650837
81	NC_010488	TA	3	6	50698	50703	50 %	50 %	0 %	0 %	170650843
82	NC_010488	TG	3	6	52409	52414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010488	GA	3	6	52540	52545	50 %	0 %	50 %	0 %	170650903
84	NC_010488	CA	3	6	53016	53021	50 %	0 %	0 %	50 %	170650858
85	NC_010488	TC	3	6	53706	53711	0 %	50 %	0 %	50 %	170650790
86	NC_010488	CG	3	6	54527	54532	0 %	0 %	50 %	50 %	170650790
87	NC_010488	GC	3	6	55072	55077	0 %	0 %	50 %	50 %	170650895
88	NC_010488	CG	3	6	56024	56029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010488	GA	3	6	57205	57210	50 %	0 %	50 %	0 %	170650830
90	NC_010488	TA	3	6	57699	57704	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
91	NC_010488	AT	3	6	57811	57816	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
92	NC_010488	AT	3	6	58006	58011	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
93	NC_010488	TA	3	6	58143	58148	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
94	NC_010488	TA	4	8	58181	58188	50 %	50 %	0 %	0 %	170650830
95	NC_010488	AT	3	6	58481	58486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010488	AT	3	6	58535	58540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010488	TA	3	6	59389	59394	50 %	50 %	0 %	0 %	170650905
98	NC_010488	TC	3	6	59818	59823	0 %	50 %	0 %	50 %	170650861
99	NC_010488	AT	3	6	60613	60618	50 %	50 %	0 %	0 %	170650834
100	NC_010488	AT	3	6	60652	60657	50 %	50 %	0 %	0 %	170650834
101	NC_010488	AC	3	6	60962	60967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010488	CT	3	6	61292	61297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010488	AG	3	6	61644	61649	50 %	0 %	50 %	0 %	170650804
104	NC_010488	GA	3	6	62667	62672	50 %	0 %	50 %	0 %	170650819
105	NC_010488	AT	3	6	62922	62927	50 %	50 %	0 %	0 %	170650819
106	NC_010488	AT	3	6	63060	63065	50 %	50 %	0 %	0 %	170650819
107	NC_010488	CG	3	6	63352	63357	0 %	0 %	50 %	50 %	170650876
108	NC_010488	TG	3	6	63859	63864	0 %	50 %	50 %	0 %	170650876
109	NC_010488	GC	3	6	64052	64057	0 %	0 %	50 %	50 %	170650778
110	NC_010488	TG	3	6	66390	66395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010488	CT	3	6	66739	66744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010488	CT	3	6	67057	67062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010488	AC	3	6	67207	67212	50 %	0 %	0 %	50 %	170650841
114	NC_010488	GC	4	8	67836	67843	0 %	0 %	50 %	50 %	170650872
115	NC_010488	TG	3	6	68676	68681	0 %	50 %	50 %	0 %	170650816
116	NC_010488	AC	3	6	68987	68992	50 %	0 %	0 %	50 %	170650881
117	NC_010488	TG	3	6	69409	69414	0 %	50 %	50 %	0 %	170650788
118	NC_010488	AT	3	6	69530	69535	50 %	50 %	0 %	0 %	170650788
119	NC_010488	AG	3	6	69707	69712	50 %	0 %	50 %	0 %	170650788
120	NC_010488	TA	3	6	70269	70274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010488	TA	3	6	70317	70322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010488	GT	3	6	70548	70553	0 %	50 %	50 %	0 %	170650826
123	NC_010488	GC	3	6	71169	71174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010488	CA	3	6	71538	71543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010488	AT	3	6	71611	71616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010488	TA	3	6	71735	71740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010488	AT	3	6	71844	71849	50 %	50 %	0 %	0 %	170650860
128	NC_010488	AT	3	6	72146	72151	50 %	50 %	0 %	0 %	170650860
129	NC_010488	TC	3	6	72197	72202	0 %	50 %	0 %	50 %	170650860
130	NC_010488	TA	3	6	72686	72691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010488	AT	3	6	73081	73086	50 %	50 %	0 %	0 %	170650913
132	NC_010488	AG	3	6	73179	73184	50 %	0 %	50 %	0 %	170650913
133	NC_010488	AG	3	6	73919	73924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010488	GT	3	6	73980	73985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010488	AT	3	6	74353	74358	50 %	50 %	0 %	0 %	170650768
136	NC_010488	TA	3	6	74627	74632	50 %	50 %	0 %	0 %	170650768
137	NC_010488	AT	4	8	76030	76037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010488	AC	3	6	77780	77785	50 %	0 %	0 %	50 %	170650767
139	NC_010488	AT	3	6	79292	79297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010488	AT	3	6	79572	79577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010488	AT	4	8	79588	79595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010488	CA	4	8	80496	80503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010488	GT	3	6	80520	80525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010488	AG	3	6	81985	81990	50 %	0 %	50 %	0 %	170650857
145	NC_010488	TA	3	6	82483	82488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010488	AT	4	8	82620	82627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010488	TA	4	8	82643	82650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.