MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_3

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010487	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010487	TTG	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010487	TAT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
4	NC_010487	ATC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650758
5	NC_010487	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
6	NC_010487	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
7	NC_010487	TGA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
8	NC_010487	AAC	2	6	463	468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650758
9	NC_010487	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
10	NC_010487	ATG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650758
11	NC_010487	ATA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170650758
12	NC_010487	TTA	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650758
13	NC_010487	TAA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010487	GCA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010487	TGA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010487	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010487	TGA	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010487	ACA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010487	GTG	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010487	GAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010487	TAA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010487	CTA	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010487	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010487	ATA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010487	CAT	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010487	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650759
27	NC_010487	ACC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170650759
28	NC_010487	ATG	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
29	NC_010487	ATG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650759
30	NC_010487	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650759
31	NC_010487	ATT	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010487	TAA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010487	CTG	2	6	2431	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010487	AGA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010487	TGT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010487	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650757
37	NC_010487	CCG	2	6	2780	2785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650757
38	NC_010487	GTG	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010487	CTG	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010487	GCA	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010487	ACC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010487	AAG	2	6	3362	3367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010487	AAC	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010487	ATA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010487	TCA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.