MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B chromosome

Total Repeats: 3053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010473	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	170079665
2	NC_010473	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	170079666
3	NC_010473	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	170079671
4	NC_010473	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	170079672
5	NC_010473	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	170079674
6	NC_010473	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010473	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	170079682
8	NC_010473	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	170079682
9	NC_010473	GATGC	2	10	25713	25722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010473	CAGTA	2	10	26672	26681	40 %	20 %	20 %	20 %	170079692
11	NC_010473	GCGCT	2	10	28473	28482	0 %	20 %	40 %	40 %	170079694
12	NC_010473	ATTTA	2	10	29229	29238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010473	CGATG	2	10	31526	31535	20 %	20 %	40 %	20 %	170079696
14	NC_010473	GCGAA	2	10	32467	32476	40 %	0 %	40 %	20 %	170079696
15	NC_010473	CCGTT	2	10	33361	33370	0 %	40 %	20 %	40 %	170079696
16	NC_010473	CACGG	2	10	33738	33747	20 %	0 %	40 %	40 %	170079696
17	NC_010473	CGAAT	2	10	36448	36457	40 %	20 %	20 %	20 %	170079700
18	NC_010473	CCATG	2	10	37986	37995	20 %	20 %	20 %	40 %	170079701
19	NC_010473	TTCAG	2	10	38168	38177	20 %	40 %	20 %	20 %	170079701
20	NC_010473	CCGTA	2	10	39632	39641	20 %	20 %	20 %	40 %	170079702
21	NC_010473	TTAAA	2	10	40370	40379	60 %	40 %	0 %	0 %	170079702
22	NC_010473	ACCCA	2	10	41113	41122	40 %	0 %	0 %	60 %	170079703
23	NC_010473	TGATC	2	10	42740	42749	20 %	40 %	20 %	20 %	170079704
24	NC_010473	CGGCG	2	10	42989	42998	0 %	0 %	60 %	40 %	170079704
25	NC_010473	AATCA	2	10	43271	43280	60 %	20 %	0 %	20 %	170079705
26	NC_010473	CGGTT	2	10	44226	44235	0 %	40 %	40 %	20 %	170079706
27	NC_010473	TGGCG	2	10	45916	45925	0 %	20 %	60 %	20 %	170079708
28	NC_010473	TGCAC	2	10	47678	47687	20 %	20 %	20 %	40 %	170079709
29	NC_010473	AGGGC	2	10	48763	48772	20 %	0 %	60 %	20 %	170079710
30	NC_010473	GGCGC	2	10	48797	48806	0 %	0 %	60 %	40 %	170079710
31	NC_010473	GAAAC	2	10	49610	49619	60 %	0 %	20 %	20 %	170079710
32	NC_010473	AACGT	2	10	51522	51531	40 %	20 %	20 %	20 %	170079713
33	NC_010473	GCGTC	2	10	54506	54515	0 %	20 %	40 %	40 %	170079716
34	NC_010473	ATGTT	2	10	55320	55329	20 %	60 %	20 %	0 %	170079717
35	NC_010473	CTTCG	2	10	55753	55762	0 %	40 %	20 %	40 %	170079717
36	NC_010473	TGCGT	2	10	56039	56048	0 %	40 %	40 %	20 %	170079717
37	NC_010473	AGTTC	2	10	65100	65109	20 %	40 %	20 %	20 %	170079721
38	NC_010473	CGTGG	2	10	66473	66482	0 %	20 %	60 %	20 %	170079723
39	NC_010473	TATCG	2	10	66980	66989	20 %	40 %	20 %	20 %	170079723
40	NC_010473	GCCTG	2	10	71312	71321	0 %	20 %	40 %	40 %	170079727
41	NC_010473	ACCGT	2	10	73225	73234	20 %	20 %	20 %	40 %	170079728
42	NC_010473	ATCAG	2	10	74998	75007	40 %	20 %	20 %	20 %	170079730
43	NC_010473	AGCCG	2	10	76766	76775	20 %	0 %	40 %	40 %	170079731
44	NC_010473	GCGCA	2	10	79094	79103	20 %	0 %	40 %	40 %	170079733
45	NC_010473	TGGCG	2	10	80088	80097	0 %	20 %	60 %	20 %	170079734
46	NC_010473	CCGGC	2	10	83058	83067	0 %	0 %	40 %	60 %	170079737
47	NC_010473	CGCGG	2	10	86383	86392	0 %	0 %	60 %	40 %	170079740
48	NC_010473	ATCCC	2	10	88627	88636	20 %	20 %	0 %	60 %	170079743
49	NC_010473	CATCG	2	10	88640	88649	20 %	20 %	20 %	40 %	170079743
50	NC_010473	TAACG	2	10	89334	89343	40 %	20 %	20 %	20 %	170079743
51	NC_010473	ATGCC	2	10	89793	89802	20 %	20 %	20 %	40 %	170079743
52	NC_010473	AATGC	2	10	91076	91085	40 %	20 %	20 %	20 %	170079744
53	NC_010473	TCTGT	2	10	92022	92031	0 %	60 %	20 %	20 %	170079746
54	NC_010473	GCATG	2	10	93115	93124	20 %	20 %	40 %	20 %	170079747
55	NC_010473	AGCAG	2	10	94453	94462	40 %	0 %	40 %	20 %	170079749
56	NC_010473	TCAGC	2	10	95321	95330	20 %	20 %	20 %	40 %	170079749
57	NC_010473	CGAAG	2	10	96368	96377	40 %	0 %	40 %	20 %	170079750
58	NC_010473	ACACG	2	10	96501	96510	40 %	0 %	20 %	40 %	170079750
59	NC_010473	TCGCG	2	10	96762	96771	0 %	20 %	40 %	40 %	170079750
60	NC_010473	GCATC	2	10	96852	96861	20 %	20 %	20 %	40 %	170079750
61	NC_010473	GACTG	2	10	98170	98179	20 %	20 %	40 %	20 %	170079751
62	NC_010473	AGAGC	2	10	98580	98589	40 %	0 %	40 %	20 %	170079751
63	NC_010473	AGGCG	2	10	103852	103861	20 %	0 %	60 %	20 %	170079754
64	NC_010473	AGGCG	2	10	103948	103957	20 %	0 %	60 %	20 %	170079754
65	NC_010473	GGTTG	2	10	104605	104614	0 %	40 %	60 %	0 %	170079754
66	NC_010473	TCTGG	2	10	107251	107260	0 %	40 %	40 %	20 %	170079755
67	NC_010473	GGGCA	2	10	108663	108672	20 %	0 %	60 %	20 %	170079756
68	NC_010473	CAGCG	2	10	108942	108951	20 %	0 %	40 %	40 %	170079757
69	NC_010473	GCGCG	2	10	115136	115145	0 %	0 %	60 %	40 %	170079761
70	NC_010473	CCGTC	2	10	115927	115936	0 %	20 %	20 %	60 %	170079762
71	NC_010473	GTGAA	2	10	115937	115946	40 %	20 %	40 %	0 %	170079762
72	NC_010473	GGCAT	2	10	116099	116108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010473	GTTCA	2	10	116324	116333	20 %	40 %	20 %	20 %	170079763
74	NC_010473	ATCCA	2	10	116650	116659	40 %	20 %	0 %	40 %	170079763
75	NC_010473	GTAAG	2	10	116863	116872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010473	CTTTA	2	10	117913	117922	20 %	60 %	0 %	20 %	170079765
77	NC_010473	TGGCG	2	10	118140	118149	0 %	20 %	60 %	20 %	170079765
78	NC_010473	TCCTC	2	10	118583	118592	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_010473	TTTCA	2	10	120453	120462	20 %	60 %	0 %	20 %	170079768
80	NC_010473	GGGAG	2	10	121778	121787	20 %	0 %	80 %	0 %	170079769
81	NC_010473	GAAAA	2	10	124572	124581	80 %	0 %	20 %	0 %	170079772
82	NC_010473	CAGAC	2	10	124648	124657	40 %	0 %	20 %	40 %	170079772
83	NC_010473	TTTGC	2	10	130718	130727	0 %	60 %	20 %	20 %	170079778
84	NC_010473	AAATT	2	10	131159	131168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010473	GCGAG	2	10	132526	132535	20 %	0 %	60 %	20 %	170079780
86	NC_010473	GGCGT	2	10	132964	132973	0 %	20 %	60 %	20 %	170079780
87	NC_010473	ATCAG	2	10	133602	133611	40 %	20 %	20 %	20 %	170079781
88	NC_010473	ACCAC	2	10	135867	135876	40 %	0 %	0 %	60 %	170079784
89	NC_010473	GGCGT	2	10	137570	137579	0 %	20 %	60 %	20 %	170079785
90	NC_010473	CGACG	2	10	138609	138618	20 %	0 %	40 %	40 %	170079785
91	NC_010473	CTGCG	2	10	140745	140754	0 %	20 %	40 %	40 %	170079786
92	NC_010473	TTATC	2	10	141521	141530	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010473	AAAAC	2	10	142595	142604	80 %	0 %	0 %	20 %	170079787
94	NC_010473	TGGTT	2	10	142852	142861	0 %	60 %	40 %	0 %	170079787
95	NC_010473	AACCT	2	10	144933	144942	40 %	20 %	0 %	40 %	170079789
96	NC_010473	TGGTC	2	10	144975	144984	0 %	40 %	40 %	20 %	170079789
97	NC_010473	TGGCG	2	10	146220	146229	0 %	20 %	60 %	20 %	170079790
98	NC_010473	CGGCG	2	10	146850	146859	0 %	0 %	60 %	40 %	170079790
99	NC_010473	CGGCG	2	10	146931	146940	0 %	0 %	60 %	40 %	170079790
100	NC_010473	TTCCA	2	10	147461	147470	20 %	40 %	0 %	40 %	170079790
101	NC_010473	GGTCC	2	10	151907	151916	0 %	20 %	40 %	40 %	170079795
102	NC_010473	ACGGG	2	10	153824	153833	20 %	0 %	60 %	20 %	170079797
103	NC_010473	GTGAT	2	10	155983	155992	20 %	40 %	40 %	0 %	170079798
104	NC_010473	GTGAT	2	10	156274	156283	20 %	40 %	40 %	0 %	170079798
105	NC_010473	TACGT	2	10	156519	156528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010473	TGGCC	2	10	158244	158253	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010473	CCACG	2	10	158421	158430	20 %	0 %	20 %	60 %	170079801
108	NC_010473	GCCAG	2	10	160706	160715	20 %	0 %	40 %	40 %	170079803
109	NC_010473	GTTCT	2	10	162147	162156	0 %	60 %	20 %	20 %	170079803
110	NC_010473	CTGAA	2	10	164139	164148	40 %	20 %	20 %	20 %	170079805
111	NC_010473	AAGCG	2	10	164203	164212	40 %	0 %	40 %	20 %	170079805
112	NC_010473	TGGTG	2	10	166109	166118	0 %	40 %	60 %	0 %	170079807
113	NC_010473	TGCAC	2	10	166235	166244	20 %	20 %	20 %	40 %	170079807
114	NC_010473	TGCGC	2	10	166628	166637	0 %	20 %	40 %	40 %	170079807
115	NC_010473	AAATA	2	10	166850	166859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010473	GTCTG	2	10	166935	166944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010473	CATGG	2	10	168471	168480	20 %	20 %	40 %	20 %	170079809
118	NC_010473	CAGAT	2	10	169510	169519	40 %	20 %	20 %	20 %	170079810
119	NC_010473	ACTTT	2	10	169643	169652	20 %	60 %	0 %	20 %	170079810
120	NC_010473	GACGT	2	10	173563	173572	20 %	20 %	40 %	20 %	170079813
121	NC_010473	CGACG	2	10	175390	175399	20 %	0 %	40 %	40 %	170079815
122	NC_010473	ATGCC	2	10	177958	177967	20 %	20 %	20 %	40 %	170079818
123	NC_010473	GGATG	2	10	178220	178229	20 %	20 %	60 %	0 %	170079818
124	NC_010473	TGGCC	2	10	179284	179293	0 %	20 %	40 %	40 %	170079820
125	NC_010473	GTAAC	2	10	180027	180036	40 %	20 %	20 %	20 %	170079820
126	NC_010473	AGCCG	2	10	180655	180664	20 %	0 %	40 %	40 %	170079820
127	NC_010473	GGTGG	2	10	180764	180773	0 %	20 %	80 %	0 %	170079820
128	NC_010473	ACGGT	2	10	191820	191829	20 %	20 %	40 %	20 %	170079831
129	NC_010473	TGATT	2	10	194662	194671	20 %	60 %	20 %	0 %	170079834
130	NC_010473	CGGTT	2	10	197625	197634	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010473	TAATT	2	10	206456	206465	40 %	60 %	0 %	0 %	170079841
132	NC_010473	CGCGG	2	10	210439	210448	0 %	0 %	60 %	40 %	170079846
133	NC_010473	TTTAA	2	10	212816	212825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010473	CCTTT	2	10	221699	221708	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010473	AGGGC	2	10	223233	223242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010473	AGGGA	2	10	223796	223805	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010473	CGATG	2	10	224611	224620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010473	CAAAA	2	10	226414	226423	80 %	0 %	0 %	20 %	170079860
139	NC_010473	AATGG	2	10	227568	227577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010473	GATGC	2	10	231238	231247	20 %	20 %	40 %	20 %	170079864
141	NC_010473	TCGCG	2	10	231423	231432	0 %	20 %	40 %	40 %	170079864
142	NC_010473	GTGAT	2	10	234441	234450	20 %	40 %	40 %	0 %	170079867
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144	NC_010473	TCGCT	2	10	235214	235223	0 %	40 %	20 %	40 %	170079868
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149	NC_010473	TCATT	2	10	247324	247333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010473	TGTGC	2	10	249898	249907	0 %	40 %	40 %	20 %	170079884
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152	NC_010473	AGCGC	2	10	251013	251022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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154	NC_010473	AACAA	2	10	255245	255254	80 %	0 %	0 %	20 %	170079892
155	NC_010473	CTTCC	2	10	255499	255508	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
156	NC_010473	TTTAC	2	10	259521	259530	20 %	60 %	0 %	20 %	170079895
157	NC_010473	GGCGG	2	10	259846	259855	0 %	0 %	80 %	20 %	170079895
158	NC_010473	TTCTG	2	10	259937	259946	0 %	60 %	20 %	20 %	170079895
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163	NC_010473	CTGAT	2	10	267842	267851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_010473	TTCAT	2	10	268374	268383	20 %	60 %	0 %	20 %	170079902
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172	NC_010473	CGTGA	2	10	276791	276800	20 %	20 %	40 %	20 %	170079910
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175	NC_010473	TGTTA	2	10	287560	287569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010473	TTGAT	2	10	288449	288458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010473	GCGTG	2	10	289190	289199	0 %	20 %	60 %	20 %	170079922
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181	NC_010473	AATGC	2	10	298846	298855	40 %	20 %	20 %	20 %	170079932
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232	NC_010473	GTTTT	2	10	393414	393423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_010473	GAAGA	2	10	399994	400003	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_010473	TCAGG	2	10	407405	407414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_010473	CAACA	2	10	414047	414056	60 %	0 %	0 %	40 %	170080039
243	NC_010473	TGCTG	2	10	414126	414135	0 %	40 %	40 %	20 %	170080039
244	NC_010473	TCCGG	2	10	414629	414638	0 %	20 %	40 %	40 %	170080040
245	NC_010473	CAGGT	2	10	415041	415050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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247	NC_010473	TGACA	2	10	420632	420641	40 %	20 %	20 %	20 %	170080047
248	NC_010473	TTAAG	2	10	422974	422983	40 %	40 %	20 %	0 %	170080048
249	NC_010473	TCAAC	2	10	426360	426369	40 %	20 %	0 %	40 %	170080050
250	NC_010473	CGCTG	2	10	431976	431985	0 %	20 %	40 %	40 %	170080055
251	NC_010473	TTGAT	2	10	438063	438072	20 %	60 %	20 %	0 %	170080061
252	NC_010473	AAATA	2	10	438258	438267	80 %	20 %	0 %	0 %	170080061
253	NC_010473	CTTCT	2	10	440562	440571	0 %	60 %	0 %	40 %	170080063
254	NC_010473	CCAGC	2	10	441456	441465	20 %	0 %	20 %	60 %	170080063
255	NC_010473	TCAGG	2	10	443448	443457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_010473	GGCGT	2	10	443485	443494	0 %	20 %	60 %	20 %	170080065
257	NC_010473	GAAGC	2	10	444049	444058	40 %	0 %	40 %	20 %	170080065
258	NC_010473	AGGTG	2	10	445098	445107	20 %	20 %	60 %	0 %	170080065
259	NC_010473	ATCGG	2	10	445367	445376	20 %	20 %	40 %	20 %	170080066
260	NC_010473	GCCAC	2	10	449140	449149	20 %	0 %	20 %	60 %	170080069
261	NC_010473	AGACG	2	10	452957	452966	40 %	0 %	40 %	20 %	170080073
262	NC_010473	CAGCG	2	10	456038	456047	20 %	0 %	40 %	40 %	170080077
263	NC_010473	CAGGC	2	10	458168	458177	20 %	0 %	40 %	40 %	170080079
264	NC_010473	GCTGG	2	10	460228	460237	0 %	20 %	60 %	20 %	170080081
265	NC_010473	TATTT	2	10	460826	460835	20 %	80 %	0 %	0 %	170080081
266	NC_010473	ATTTT	2	10	461754	461763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010473	GGCGT	2	10	461910	461919	0 %	20 %	60 %	20 %	170080082
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385	NC_010473	AAACA	2	10	636225	636234	80 %	0 %	0 %	20 %	170080244
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397	NC_010473	GTCAG	2	10	661186	661195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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