MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009837	TGCC	2	8	22648	22655	0 %	25 %	25 %	50 %	157418116
502	NC_009837	GCCCG	2	10	22661	22670	0 %	0 %	40 %	60 %	157418116
503	NC_009837	CGC	2	6	22711	22716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418116
504	NC_009837	CCG	2	6	22737	22742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418116
505	NC_009837	CCA	3	9	22773	22781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418116
506	NC_009837	TGG	2	6	22984	22989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418116
507	NC_009837	G	6	6	23047	23052	0 %	0 %	100 %	0 %	157418116
508	NC_009837	GTG	2	6	23178	23183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418116
509	NC_009837	TTG	2	6	23227	23232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418116
510	NC_009837	GC	3	6	23255	23260	0 %	0 %	50 %	50 %	157418116
511	NC_009837	GGC	2	6	23334	23339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418116
512	NC_009837	ACT	2	6	23368	23373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418116
513	NC_009837	GTG	2	6	23436	23441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418116
514	NC_009837	ACGC	2	8	23489	23496	25 %	0 %	25 %	50 %	157418116
515	NC_009837	AGAGC	2	10	23497	23506	40 %	0 %	40 %	20 %	157418116
516	NC_009837	GAA	2	6	23508	23513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418116
517	NC_009837	AGC	2	6	23593	23598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418116
518	NC_009837	GCA	2	6	23615	23620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418116
519	NC_009837	AGGG	2	8	23638	23645	25 %	0 %	75 %	0 %	157418116
520	NC_009837	ATA	2	6	23660	23665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418116
521	NC_009837	GTC	2	6	23667	23672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418117
522	NC_009837	GCC	2	6	23689	23694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418117
523	NC_009837	TGT	2	6	23700	23705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418117
524	NC_009837	TGTT	2	8	23786	23793	0 %	75 %	25 %	0 %	157418117
525	NC_009837	ACA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418117
526	NC_009837	TTC	2	6	23898	23903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418117
527	NC_009837	TTC	2	6	23910	23915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418117
528	NC_009837	CG	3	6	23950	23955	0 %	0 %	50 %	50 %	157418117
529	NC_009837	TGC	2	6	23961	23966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418117
530	NC_009837	ATGT	2	8	24037	24044	25 %	50 %	25 %	0 %	157418117
531	NC_009837	AAATG	2	10	24089	24098	60 %	20 %	20 %	0 %	157418117
532	NC_009837	GGT	2	6	24105	24110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418117
533	NC_009837	GAAG	2	8	24129	24136	50 %	0 %	50 %	0 %	157418117
534	NC_009837	TGA	2	6	24195	24200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418117
535	NC_009837	AACA	2	8	24204	24211	75 %	0 %	0 %	25 %	157418117
536	NC_009837	AAC	2	6	24214	24219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418117
537	NC_009837	TTA	2	6	24252	24257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418118
538	NC_009837	CT	3	6	24263	24268	0 %	50 %	0 %	50 %	157418118
539	NC_009837	GAT	2	6	24290	24295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418118
540	NC_009837	ATGC	2	8	24299	24306	25 %	25 %	25 %	25 %	157418118
541	NC_009837	CTG	2	6	24393	24398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418118
542	NC_009837	TGA	2	6	24405	24410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418118
543	NC_009837	A	7	7	24469	24475	100 %	0 %	0 %	0 %	157418119
544	NC_009837	ATC	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418119
545	NC_009837	GAA	2	6	24645	24650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418119
546	NC_009837	TTTC	2	8	24697	24704	0 %	75 %	0 %	25 %	157418120
547	NC_009837	CTG	2	6	24714	24719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418120
548	NC_009837	TTA	2	6	24726	24731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418120
549	NC_009837	CCA	2	6	24775	24780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418120
550	NC_009837	A	6	6	24825	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	157418120
551	NC_009837	TCCG	2	8	24932	24939	0 %	25 %	25 %	50 %	157418120
552	NC_009837	GCA	2	6	24940	24945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418120
553	NC_009837	CTG	2	6	24978	24983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418120
554	NC_009837	GTT	2	6	25026	25031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418120
555	NC_009837	TCAGT	2	10	25036	25045	20 %	40 %	20 %	20 %	157418120
556	NC_009837	CCT	2	6	25059	25064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418120
557	NC_009837	GCA	2	6	25092	25097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418120
558	NC_009837	ATC	2	6	25135	25140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418120
559	NC_009837	T	6	6	25155	25160	0 %	100 %	0 %	0 %	157418120
560	NC_009837	TTA	2	6	25162	25167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418120
561	NC_009837	ATTA	2	8	25194	25201	50 %	50 %	0 %	0 %	157418120
562	NC_009837	CGG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009837	GGA	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009837	GTGA	2	8	25337	25344	25 %	25 %	50 %	0 %	157418121
565	NC_009837	AAC	2	6	25374	25379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418121
566	NC_009837	AAAT	2	8	25413	25420	75 %	25 %	0 %	0 %	157418121
567	NC_009837	CGG	2	6	25478	25483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418121
568	NC_009837	AGTC	2	8	25558	25565	25 %	25 %	25 %	25 %	157418121
569	NC_009837	CTG	2	6	25844	25849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
570	NC_009837	ATGA	2	8	25886	25893	50 %	25 %	25 %	0 %	157418122
571	NC_009837	CAC	2	6	25894	25899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418122
572	NC_009837	TGC	2	6	25971	25976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
573	NC_009837	CG	3	6	25989	25994	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
574	NC_009837	TGGT	2	8	26031	26038	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
575	NC_009837	TAT	2	6	26117	26122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418122
576	NC_009837	GAA	2	6	26221	26226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418122
577	NC_009837	A	7	7	26225	26231	100 %	0 %	0 %	0 %	157418122
578	NC_009837	TGGAAA	2	12	26247	26258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157418122
579	NC_009837	ATC	2	6	26270	26275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418122
580	NC_009837	CGT	2	6	26280	26285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
581	NC_009837	CAC	2	6	26302	26307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418122
582	NC_009837	GAT	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418122
583	NC_009837	TCTGA	2	10	26408	26417	20 %	40 %	20 %	20 %	157418122
584	NC_009837	GT	3	6	26425	26430	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
585	NC_009837	GGA	2	6	26431	26436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418122
586	NC_009837	CTG	2	6	26585	26590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
587	NC_009837	TGG	3	9	26637	26645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418122
588	NC_009837	CCT	2	6	26712	26717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418122
589	NC_009837	TCCG	2	8	26731	26738	0 %	25 %	25 %	50 %	157418122
590	NC_009837	G	6	6	26760	26765	0 %	0 %	100 %	0 %	157418122
591	NC_009837	TCC	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418122
592	NC_009837	GTG	2	6	26801	26806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418122
593	NC_009837	AAT	2	6	26843	26848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418122
594	NC_009837	CCTG	2	8	26949	26956	0 %	25 %	25 %	50 %	157418122
595	NC_009837	GC	3	6	27013	27018	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
596	NC_009837	AG	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	157418122
597	NC_009837	CTG	2	6	27083	27088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
598	NC_009837	CACC	2	8	27090	27097	25 %	0 %	0 %	75 %	157418122
599	NC_009837	TTC	2	6	27128	27133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418122
600	NC_009837	ACA	2	6	27156	27161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418122
601	NC_009837	GTG	2	6	27248	27253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418122
602	NC_009837	GGAT	2	8	27265	27272	25 %	25 %	50 %	0 %	157418122
603	NC_009837	TG	3	6	27282	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	157418122
604	NC_009837	CTG	2	6	27440	27445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
605	NC_009837	CCT	2	6	27462	27467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418122
606	NC_009837	TGA	2	6	27496	27501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418122
607	NC_009837	GTG	2	6	27503	27508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418122
608	NC_009837	TGC	2	6	27588	27593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
609	NC_009837	TGA	2	6	27640	27645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418122
610	NC_009837	TGG	2	6	27672	27677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418122
611	NC_009837	CCGT	2	8	27703	27710	0 %	25 %	25 %	50 %	157418122
612	NC_009837	CTG	2	6	27713	27718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
613	NC_009837	CGC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418122
614	NC_009837	TGA	2	6	27802	27807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418122
615	NC_009837	CTG	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
616	NC_009837	CCG	2	6	27877	27882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418122
617	NC_009837	CA	3	6	27907	27912	50 %	0 %	0 %	50 %	157418122
618	NC_009837	TCG	2	6	27918	27923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
619	NC_009837	TGC	2	6	27949	27954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
620	NC_009837	CG	3	6	27956	27961	0 %	0 %	50 %	50 %	157418122
621	NC_009837	CTC	2	6	27973	27978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418122
622	NC_009837	CAAC	2	8	28024	28031	50 %	0 %	0 %	50 %	157418122
623	NC_009837	TTCC	2	8	28108	28115	0 %	50 %	0 %	50 %	157418122
624	NC_009837	TGC	2	6	28116	28121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418122
625	NC_009837	TCC	2	6	28136	28141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418122
626	NC_009837	GCA	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418122
627	NC_009837	GAA	2	6	28270	28275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418122
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629	NC_009837	CCG	2	6	28361	28366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418123
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