MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 12277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009801	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	157158747
3	NC_009801	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	157158747
4	NC_009801	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	157158747
5	NC_009801	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	157158747
6	NC_009801	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	157158747
7	NC_009801	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	157158747
8	NC_009801	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	157158747
9	NC_009801	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	157158096
10	NC_009801	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	157158096
11	NC_009801	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	157158096
12	NC_009801	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	157158096
13	NC_009801	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	157158096
14	NC_009801	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	157158096
15	NC_009801	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	157157451
16	NC_009801	CTGC	2	8	5639	5646	0 %	25 %	25 %	50 %	157156558
17	NC_009801	GGTT	2	8	5776	5783	0 %	50 %	50 %	0 %	157156558
18	NC_009801	GCTG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	157156183
19	NC_009801	GTCA	2	8	6028	6035	25 %	25 %	25 %	25 %	157156183
20	NC_009801	CAGT	2	8	7044	7051	25 %	25 %	25 %	25 %	157155229
21	NC_009801	AGCG	2	8	7548	7555	25 %	0 %	50 %	25 %	157155229
22	NC_009801	GCCA	2	8	8505	8512	25 %	0 %	25 %	50 %	157154855
23	NC_009801	GGCG	2	8	9365	9372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009801	CAAC	2	8	9613	9620	50 %	0 %	0 %	50 %	157158697
25	NC_009801	TTGA	2	8	9666	9673	25 %	50 %	25 %	0 %	157158697
26	NC_009801	CGAC	2	8	9733	9740	25 %	0 %	25 %	50 %	157158697
27	NC_009801	AAGA	2	8	10089	10096	75 %	0 %	25 %	0 %	157158697
28	NC_009801	GCTG	2	8	10268	10275	0 %	25 %	50 %	25 %	157158697
29	NC_009801	CTGT	2	8	10518	10525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009801	AGAT	2	8	11273	11280	50 %	25 %	25 %	0 %	157157506
31	NC_009801	AGAA	2	8	11547	11554	75 %	0 %	25 %	0 %	157157506
32	NC_009801	GAAT	2	8	11794	11801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009801	GCAG	2	8	11950	11957	25 %	0 %	50 %	25 %	157156853
34	NC_009801	CATT	2	8	12628	12635	25 %	50 %	0 %	25 %	157156853
35	NC_009801	CAGT	2	8	12775	12782	25 %	25 %	25 %	25 %	157157943
36	NC_009801	GGAT	2	8	13094	13101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009801	ATTC	2	8	13190	13197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009801	AGTG	2	8	13332	13339	25 %	25 %	50 %	0 %	157157283
39	NC_009801	ATGG	2	8	13495	13502	25 %	25 %	50 %	0 %	157159098
40	NC_009801	TGGT	2	8	13586	13593	0 %	50 %	50 %	0 %	157159098
41	NC_009801	ACCG	2	8	13953	13960	25 %	0 %	25 %	50 %	157159098
42	NC_009801	AAGA	2	8	14173	14180	75 %	0 %	25 %	0 %	157159098
43	NC_009801	CCAT	2	8	14750	14757	25 %	25 %	0 %	50 %	157159098
44	NC_009801	ACTG	2	8	15144	15151	25 %	25 %	25 %	25 %	157159098
45	NC_009801	GACA	2	8	16962	16969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009801	AACA	2	8	17152	17159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009801	AATT	2	8	17176	17183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009801	TAAT	2	8	17195	17202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009801	GGTT	2	8	17564	17571	0 %	50 %	50 %	0 %	157155398
50	NC_009801	GTGG	2	8	18188	18195	0 %	25 %	75 %	0 %	157155398
51	NC_009801	CGTT	2	8	18560	18567	0 %	50 %	25 %	25 %	157155398
52	NC_009801	TTTA	2	8	18732	18739	25 %	75 %	0 %	0 %	157158018
53	NC_009801	CCAC	2	8	19035	19042	25 %	0 %	0 %	75 %	157158018
54	NC_009801	AATA	2	8	19666	19673	75 %	25 %	0 %	0 %	157157508
55	NC_009801	CTTC	2	8	19688	19695	0 %	50 %	0 %	50 %	157157508
56	NC_009801	GTTG	2	8	20350	20357	0 %	50 %	50 %	0 %	157157508
57	NC_009801	TGTT	2	8	20961	20968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009801	TGGC	2	8	21422	21429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009801	TAAA	2	8	22848	22855	75 %	25 %	0 %	0 %	157159091
60	NC_009801	TATT	2	8	23487	23494	25 %	75 %	0 %	0 %	157157495
61	NC_009801	CATA	2	8	24639	24646	50 %	25 %	0 %	25 %	157156528
62	NC_009801	TGCG	2	8	24895	24902	0 %	25 %	50 %	25 %	157156528
63	NC_009801	GCGT	2	8	25103	25110	0 %	25 %	50 %	25 %	157156528
64	NC_009801	CCGC	2	8	25526	25533	0 %	0 %	25 %	75 %	157156528
65	NC_009801	CTGG	2	8	25883	25890	0 %	25 %	50 %	25 %	157154999
66	NC_009801	CTGC	2	8	26344	26351	0 %	25 %	25 %	50 %	157154999
67	NC_009801	TGCG	2	8	26894	26901	0 %	25 %	50 %	25 %	157154999
68	NC_009801	TGGT	2	8	27306	27313	0 %	50 %	50 %	0 %	157154999
69	NC_009801	GTGG	2	8	28099	28106	0 %	25 %	75 %	0 %	157154999
70	NC_009801	GCTG	2	8	28453	28460	0 %	25 %	50 %	25 %	157155523
71	NC_009801	ATGG	2	8	29330	29337	25 %	25 %	50 %	0 %	157158699
72	NC_009801	TTGA	2	8	30201	30208	25 %	50 %	25 %	0 %	157155637
73	NC_009801	TGGC	2	8	30744	30751	0 %	25 %	50 %	25 %	157156462
74	NC_009801	CTGG	2	8	31204	31211	0 %	25 %	50 %	25 %	157156462
75	NC_009801	TCAT	2	8	31428	31435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009801	TCCC	2	8	31458	31465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009801	TGGC	2	8	31499	31506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009801	GCTG	2	8	31721	31728	0 %	25 %	50 %	25 %	157156976
79	NC_009801	CGTG	2	8	32198	32205	0 %	25 %	50 %	25 %	157156976
80	NC_009801	CATG	2	8	32668	32675	25 %	25 %	25 %	25 %	157157922
81	NC_009801	AGTG	2	8	32818	32825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009801	TCCT	2	8	32980	32987	0 %	50 %	0 %	50 %	157158284
83	NC_009801	CTTA	2	8	33008	33015	25 %	50 %	0 %	25 %	157158284
84	NC_009801	AGCC	2	8	33910	33917	25 %	0 %	25 %	50 %	157158284
85	NC_009801	GACC	2	8	34176	34183	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
86	NC_009801	CGCA	2	8	35176	35183	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
87	NC_009801	CTGT	2	8	35350	35357	0 %	50 %	25 %	25 %	157159012
88	NC_009801	GGCG	2	8	35526	35533	0 %	0 %	75 %	25 %	157159012
89	NC_009801	ACCG	2	8	35680	35687	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
90	NC_009801	CGTC	2	8	36154	36161	0 %	25 %	25 %	50 %	157159012
91	NC_009801	GGCG	2	8	36363	36370	0 %	0 %	75 %	25 %	157159012
92	NC_009801	TGGC	2	8	36617	36624	0 %	25 %	50 %	25 %	157159012
93	NC_009801	GCTG	2	8	36630	36637	0 %	25 %	50 %	25 %	157159012
94	NC_009801	GGTG	2	8	37561	37568	0 %	25 %	75 %	0 %	157155895
95	NC_009801	AAGA	2	8	37796	37803	75 %	0 %	25 %	0 %	157155895
96	NC_009801	CCAT	2	8	38249	38256	25 %	25 %	0 %	50 %	157156306
97	NC_009801	ATTT	2	8	39463	39470	25 %	75 %	0 %	0 %	157155167
98	NC_009801	TTCT	2	8	39475	39482	0 %	75 %	0 %	25 %	157155167
99	NC_009801	TTCA	2	8	39606	39613	25 %	50 %	0 %	25 %	157155167
100	NC_009801	AGCC	2	8	39820	39827	25 %	0 %	25 %	50 %	157155167
101	NC_009801	CCCG	2	8	39982	39989	0 %	0 %	25 %	75 %	157155167
102	NC_009801	TCGG	2	8	40454	40461	0 %	25 %	50 %	25 %	157155167
103	NC_009801	GGCG	2	8	40733	40740	0 %	0 %	75 %	25 %	157155167
104	NC_009801	GGGC	2	8	41052	41059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009801	CCAT	2	8	41267	41274	25 %	25 %	0 %	50 %	157156920
106	NC_009801	TGAT	2	8	41289	41296	25 %	50 %	25 %	0 %	157156920
107	NC_009801	AGGC	2	8	41820	41827	25 %	0 %	50 %	25 %	157156920
108	NC_009801	CCGA	2	8	42906	42913	25 %	0 %	25 %	50 %	157156236
109	NC_009801	CCCG	2	8	43302	43309	0 %	0 %	25 %	75 %	157156236
110	NC_009801	TCCA	2	8	43354	43361	25 %	25 %	0 %	50 %	157156236
111	NC_009801	TTAA	2	8	43607	43614	50 %	50 %	0 %	0 %	157157828
112	NC_009801	TATC	2	8	44000	44007	25 %	50 %	0 %	25 %	157157828
113	NC_009801	CACC	2	8	44151	44158	25 %	0 %	0 %	75 %	157157828
114	NC_009801	AGCC	2	8	44718	44725	25 %	0 %	25 %	50 %	157157828
115	NC_009801	CCAG	2	8	44918	44925	25 %	0 %	25 %	50 %	157157828
116	NC_009801	AACC	2	8	44926	44933	50 %	0 %	0 %	50 %	157157828
117	NC_009801	ATTT	2	8	45152	45159	25 %	75 %	0 %	0 %	157159271
118	NC_009801	GTTT	2	8	45169	45176	0 %	75 %	25 %	0 %	157159271
119	NC_009801	GTGC	2	8	45622	45629	0 %	25 %	50 %	25 %	157158533
120	NC_009801	TGAT	2	8	45858	45865	25 %	50 %	25 %	0 %	157158533
121	NC_009801	CTGC	2	8	46118	46125	0 %	25 %	25 %	50 %	157158533
122	NC_009801	GTCG	2	8	46984	46991	0 %	25 %	50 %	25 %	157155244
123	NC_009801	ATGG	2	8	47091	47098	25 %	25 %	50 %	0 %	157155244
124	NC_009801	GTTA	2	8	47468	47475	25 %	50 %	25 %	0 %	157156667
125	NC_009801	CACC	2	8	48019	48026	25 %	0 %	0 %	75 %	157156667
126	NC_009801	ATTG	2	8	48266	48273	25 %	50 %	25 %	0 %	157156667
127	NC_009801	TGTT	2	8	49305	49312	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
128	NC_009801	TGTT	2	8	49550	49557	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
129	NC_009801	TGTT	2	8	49740	49747	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
130	NC_009801	CTGG	2	8	50005	50012	0 %	25 %	50 %	25 %	157154973
131	NC_009801	TGCG	2	8	51210	51217	0 %	25 %	50 %	25 %	157159263
132	NC_009801	ATTG	2	8	51313	51320	25 %	50 %	25 %	0 %	157159263
133	NC_009801	ATGA	2	8	51365	51372	50 %	25 %	25 %	0 %	157159263
134	NC_009801	GGCG	2	8	51706	51713	0 %	0 %	75 %	25 %	157159263
135	NC_009801	GGAT	2	8	52320	52327	25 %	25 %	50 %	0 %	157159263
136	NC_009801	AACC	2	8	52390	52397	50 %	0 %	0 %	50 %	157159263
137	NC_009801	CAGG	2	8	52487	52494	25 %	0 %	50 %	25 %	157159263
138	NC_009801	TGGC	2	8	52753	52760	0 %	25 %	50 %	25 %	157159263
139	NC_009801	TGTT	2	8	52863	52870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009801	CCTG	2	8	53088	53095	0 %	25 %	25 %	50 %	157158756
141	NC_009801	TAAA	2	8	53126	53133	75 %	25 %	0 %	0 %	157158756
142	NC_009801	AATC	2	8	53162	53169	50 %	25 %	0 %	25 %	157158756
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