MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 102245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009801	CAT	2	6	144760	144765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154875
3002	NC_009801	CAC	2	6	144769	144774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157154875
3003	NC_009801	AC	3	6	144773	144778	50 %	0 %	0 %	50 %	157154875
3004	NC_009801	GAA	2	6	144785	144790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157154875
3005	NC_009801	ATT	2	6	144818	144823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157154875
3006	NC_009801	TGG	2	6	144837	144842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157154875
3007	NC_009801	GCT	2	6	144862	144867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157154875
3008	NC_009801	TGC	2	6	144981	144986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157154875
3009	NC_009801	TGTT	2	8	145080	145087	0 %	75 %	25 %	0 %	157154875
3010	NC_009801	ATG	2	6	145120	145125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157154875
3011	NC_009801	GCC	2	6	145206	145211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157883
3012	NC_009801	TCA	2	6	145214	145219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157883
3013	NC_009801	CTTTA	2	10	145228	145237	20 %	60 %	0 %	20 %	157157883
3014	NC_009801	ATG	2	6	145321	145326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157883
3015	NC_009801	TCA	2	6	145360	145365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157883
3016	NC_009801	T	6	6	145366	145371	0 %	100 %	0 %	0 %	157157883
3017	NC_009801	GCT	2	6	145401	145406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157883
3018	NC_009801	ATT	2	6	145432	145437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157157883
3019	NC_009801	CGG	2	6	145449	145454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157883
3020	NC_009801	TGGCG	2	10	145455	145464	0 %	20 %	60 %	20 %	157157883
3021	NC_009801	TGTT	2	8	145472	145479	0 %	75 %	25 %	0 %	157157883
3022	NC_009801	T	6	6	145507	145512	0 %	100 %	0 %	0 %	157157883
3023	NC_009801	CGG	2	6	145565	145570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157883
3024	NC_009801	TGT	2	6	145571	145576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157157883
3025	NC_009801	GT	3	6	145601	145606	0 %	50 %	50 %	0 %	157157883
3026	NC_009801	TGGG	2	8	145670	145677	0 %	25 %	75 %	0 %	157157883
3027	NC_009801	GCC	2	6	145701	145706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157883
3028	NC_009801	ATG	2	6	145784	145789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157883
3029	NC_009801	ACT	2	6	145801	145806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157883
3030	NC_009801	TGG	2	6	145817	145822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157157883
3031	NC_009801	ACGTGG	2	12	145866	145877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157157883
3032	NC_009801	TCCTC	2	10	145898	145907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3033	NC_009801	GAG	2	6	145921	145926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009801	CAA	2	6	145950	145955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_009801	AGG	2	6	145983	145988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009801	A	6	6	146058	146063	100 %	0 %	0 %	0 %	157159200
3037	NC_009801	CTT	2	6	146073	146078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159200
3038	NC_009801	ATG	2	6	146133	146138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159200
3039	NC_009801	TCT	2	6	146179	146184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159200
3040	NC_009801	ATT	2	6	146225	146230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159200
3041	NC_009801	GAT	2	6	146291	146296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159200
3042	NC_009801	TGGG	2	8	146350	146357	0 %	25 %	75 %	0 %	157159200
3043	NC_009801	AGT	2	6	146367	146372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159200
3044	NC_009801	CAA	3	9	146382	146390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159200
3045	NC_009801	A	7	7	146389	146395	100 %	0 %	0 %	0 %	157159200
3046	NC_009801	GTT	2	6	146473	146478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009801	T	6	6	146492	146497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009801	ACAA	2	8	146503	146510	75 %	0 %	0 %	25 %	157156843
3049	NC_009801	CTG	2	6	146523	146528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156843
3050	NC_009801	TGC	2	6	146591	146596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156843
3051	NC_009801	CGGGC	2	10	146643	146652	0 %	0 %	60 %	40 %	157156843
3052	NC_009801	TTA	2	6	146684	146689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156843
3053	NC_009801	CAA	2	6	146786	146791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156843
3054	NC_009801	GC	3	6	146977	146982	0 %	0 %	50 %	50 %	157156843
3055	NC_009801	GAA	2	6	147042	147047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156843
3056	NC_009801	CGA	2	6	147070	147075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156843
3057	NC_009801	GAA	2	6	147167	147172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156843
3058	NC_009801	GGT	2	6	147197	147202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156843
3059	NC_009801	TGA	2	6	147212	147217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156843
3060	NC_009801	TGT	2	6	147287	147292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156843
3061	NC_009801	T	6	6	147407	147412	0 %	100 %	0 %	0 %	157156843
3062	NC_009801	CGC	2	6	147492	147497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156843
3063	NC_009801	GCA	2	6	147573	147578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156843
3064	NC_009801	GTT	2	6	147644	147649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156843
3065	NC_009801	TTTCA	2	10	147768	147777	20 %	60 %	0 %	20 %	157157631
3066	NC_009801	CTT	2	6	147821	147826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157157631
3067	NC_009801	GAT	2	6	147852	147857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157631
3068	NC_009801	GCC	2	6	147886	147891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157631
3069	NC_009801	AAT	2	6	147906	147911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157157631
3070	NC_009801	GCA	2	6	148094	148099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157631
3071	NC_009801	TGA	2	6	148195	148200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155804
3072	NC_009801	CAG	2	6	148229	148234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155804
3073	NC_009801	GCT	2	6	148296	148301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_009801	GGC	2	6	148318	148323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_009801	GAC	2	6	148325	148330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_009801	GC	3	6	148332	148337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_009801	ACA	2	6	148365	148370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_009801	GATG	2	8	148385	148392	25 %	25 %	50 %	0 %	157156067
3079	NC_009801	ATGC	2	8	148437	148444	25 %	25 %	25 %	25 %	157156067
3080	NC_009801	AG	3	6	148544	148549	50 %	0 %	50 %	0 %	157156067
3081	NC_009801	TGT	2	6	148616	148621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156067
3082	NC_009801	AAGC	2	8	148634	148641	50 %	0 %	25 %	25 %	157156067
3083	NC_009801	ATG	2	6	148665	148670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156067
3084	NC_009801	TGC	2	6	148682	148687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156067
3085	NC_009801	TGG	2	6	148729	148734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156067
3086	NC_009801	AT	3	6	148795	148800	50 %	50 %	0 %	0 %	157156067
3087	NC_009801	ACG	2	6	148820	148825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156067
3088	NC_009801	TGG	2	6	148849	148854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156067
3089	NC_009801	CGG	2	6	148893	148898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156067
3090	NC_009801	ACT	2	6	148913	148918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156067
3091	NC_009801	AGTT	2	8	149005	149012	25 %	50 %	25 %	0 %	157156067
3092	NC_009801	TGC	2	6	149029	149034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156067
3093	NC_009801	GA	3	6	149078	149083	50 %	0 %	50 %	0 %	157156067
3094	NC_009801	GGGAG	2	10	149093	149102	20 %	0 %	80 %	0 %	157156067
3095	NC_009801	ATG	2	6	149106	149111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156067
3096	NC_009801	CAG	2	6	149157	149162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156067
3097	NC_009801	AGG	2	6	149170	149175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157156067
3098	NC_009801	TCT	2	6	149198	149203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156067
3099	NC_009801	TAA	2	6	149324	149329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009801	TGT	2	6	149382	149387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158388
3101	NC_009801	GGC	2	6	149413	149418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158388
3102	NC_009801	ATC	2	6	149488	149493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158388
3103	NC_009801	TTCA	2	8	149509	149516	25 %	50 %	0 %	25 %	157158388
3104	NC_009801	TAA	2	6	149535	149540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157158388
3105	NC_009801	GTT	2	6	149622	149627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158388
3106	NC_009801	CCG	2	6	149628	149633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158388
3107	NC_009801	GC	3	6	149675	149680	0 %	0 %	50 %	50 %	157158388
3108	NC_009801	CGC	2	6	149826	149831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158388
3109	NC_009801	GTTT	2	8	149961	149968	0 %	75 %	25 %	0 %	157158388
3110	NC_009801	TCC	2	6	149981	149986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157158388
3111	NC_009801	GAC	3	9	150055	150063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158388
3112	NC_009801	TCG	2	6	150086	150091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158388
3113	NC_009801	TAG	2	6	150126	150131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158388
3114	NC_009801	GGC	2	6	150165	150170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158388
3115	NC_009801	GCA	2	6	150183	150188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158388
3116	NC_009801	TTC	2	6	150240	150245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158907
3117	NC_009801	CG	3	6	150294	150299	0 %	0 %	50 %	50 %	157158907
3118	NC_009801	CCG	2	6	150349	150354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158907
3119	NC_009801	CGT	2	6	150368	150373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158907
3120	NC_009801	GCCAAT	2	12	150411	150422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157158907
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3122	NC_009801	CGC	2	6	150551	150556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158907
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3246	NC_009801	GTA	2	6	157109	157114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156746
3247	NC_009801	ATCC	2	8	157210	157217	25 %	25 %	0 %	50 %	157156746
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3251	NC_009801	GCTG	2	8	157358	157365	0 %	25 %	50 %	25 %	157156746
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3332	NC_009801	ATC	2	6	161009	161014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159053
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3357	NC_009801	CTT	2	6	162061	162066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158209
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3359	NC_009801	TTAC	2	8	162236	162243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3360	NC_009801	TAC	2	6	162246	162251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156627
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3364	NC_009801	GC	3	6	162377	162382	0 %	0 %	50 %	50 %	157156627
3365	NC_009801	GCA	2	6	162409	162414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156627
3366	NC_009801	TCA	2	6	162457	162462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156627
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3490	NC_009801	CGT	2	6	167858	167863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158219
3491	NC_009801	TGG	2	6	167889	167894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158219
3492	NC_009801	CTGC	2	8	167951	167958	0 %	25 %	25 %	50 %	157158219
3493	NC_009801	TGC	2	6	168021	168026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158219
3494	NC_009801	GCG	2	6	168084	168089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158219
3495	NC_009801	GGC	2	6	168190	168195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158219
3496	NC_009801	GCA	2	6	168217	168222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158219
3497	NC_009801	GGT	2	6	168223	168228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158219
3498	NC_009801	GTC	2	6	168243	168248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158219
3499	NC_009801	CAA	2	6	168301	168306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158219
3500	NC_009801	GCA	2	6	168339	168344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158219

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