MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 102245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009801	TCA	2	6	121859	121864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156546
2502	NC_009801	CCG	2	6	121880	121885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156546
2503	NC_009801	CAG	2	6	121893	121898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156546
2504	NC_009801	AGCAG	2	10	121924	121933	40 %	0 %	40 %	20 %	157156546
2505	NC_009801	ATC	2	6	121996	122001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156546
2506	NC_009801	ACC	2	6	122026	122031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2507	NC_009801	TGT	2	6	122176	122181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156546
2508	NC_009801	TGT	2	6	122222	122227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156546
2509	NC_009801	CAGT	2	8	122243	122250	25 %	25 %	25 %	25 %	157156546
2510	NC_009801	CGG	2	6	122324	122329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156546
2511	NC_009801	CTG	2	6	122450	122455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156546
2512	NC_009801	CCA	2	6	122465	122470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2513	NC_009801	ACC	2	6	122478	122483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2514	NC_009801	CAT	3	9	122505	122513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156546
2515	NC_009801	ACC	2	6	122544	122549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2516	NC_009801	GCC	2	6	122583	122588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156546
2517	NC_009801	AGC	2	6	122602	122607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156546
2518	NC_009801	GCC	2	6	122610	122615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156546
2519	NC_009801	GAT	2	6	122619	122624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156546
2520	NC_009801	ACC	2	6	122632	122637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2521	NC_009801	CAC	2	6	122715	122720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2522	NC_009801	CGG	2	6	122729	122734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156546
2523	NC_009801	TCAGC	2	10	122792	122801	20 %	20 %	20 %	40 %	157156546
2524	NC_009801	AGT	2	6	122828	122833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156546
2525	NC_009801	CCAG	2	8	122835	122842	25 %	0 %	25 %	50 %	157156546
2526	NC_009801	TTC	2	6	122907	122912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156546
2527	NC_009801	ACC	2	6	122914	122919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156546
2528	NC_009801	GCT	2	6	123095	123100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156546
2529	NC_009801	CAT	2	6	123120	123125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156546
2530	NC_009801	GGT	2	6	123138	123143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009801	T	7	7	123146	123152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_009801	GT	3	6	123170	123175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_009801	TGT	2	6	123193	123198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_009801	AAG	2	6	123217	123222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_009801	AAT	2	6	123259	123264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_009801	GAAT	2	8	123366	123373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_009801	TAA	2	6	123447	123452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_009801	A	6	6	123458	123463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_009801	TA	3	6	123516	123521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_009801	GTT	2	6	123528	123533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_009801	TCAA	2	8	123557	123564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_009801	CCAA	2	8	123686	123693	50 %	0 %	0 %	50 %	157156176
2543	NC_009801	AGC	2	6	123712	123717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2544	NC_009801	CCT	2	6	123811	123816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157156176
2545	NC_009801	CGAAG	2	10	123839	123848	40 %	0 %	40 %	20 %	157156176
2546	NC_009801	TTG	2	6	123852	123857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156176
2547	NC_009801	TCG	2	6	123860	123865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2548	NC_009801	GGC	2	6	123873	123878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156176
2549	NC_009801	AGC	2	6	123891	123896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2550	NC_009801	TGG	2	6	123922	123927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156176
2551	NC_009801	GCT	2	6	123929	123934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2552	NC_009801	ACACG	2	10	123972	123981	40 %	0 %	20 %	40 %	157156176
2553	NC_009801	CGC	2	6	123995	124000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156176
2554	NC_009801	TTA	2	6	124001	124006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156176
2555	NC_009801	CGC	2	6	124007	124012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156176
2556	NC_009801	GTA	2	6	124018	124023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156176
2557	NC_009801	CCA	2	6	124055	124060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156176
2558	NC_009801	GCA	2	6	124076	124081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2559	NC_009801	TCGCG	2	10	124233	124242	0 %	20 %	40 %	40 %	157156176
2560	NC_009801	TGC	2	6	124246	124251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2561	NC_009801	AGT	2	6	124260	124265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156176
2562	NC_009801	GAA	2	6	124308	124313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156176
2563	NC_009801	GC	3	6	124314	124319	0 %	0 %	50 %	50 %	157156176
2564	NC_009801	GCATC	2	10	124323	124332	20 %	20 %	20 %	40 %	157156176
2565	NC_009801	GAA	2	6	124350	124355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156176
2566	NC_009801	AG	3	6	124379	124384	50 %	0 %	50 %	0 %	157156176
2567	NC_009801	CCG	2	6	124385	124390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156176
2568	NC_009801	CGT	2	6	124404	124409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156176
2569	NC_009801	AGA	2	6	124455	124460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_009801	TGT	2	6	124461	124466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_009801	TTA	2	6	124566	124571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_009801	GATA	2	8	124572	124579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_009801	GAA	2	6	124669	124674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155188
2574	NC_009801	TGCT	2	8	124709	124716	0 %	50 %	25 %	25 %	157155188
2575	NC_009801	GAA	2	6	124789	124794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155188
2576	NC_009801	CTGGAA	2	12	124816	124827	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157155188
2577	NC_009801	CAT	2	6	124860	124865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155188
2578	NC_009801	TGC	2	6	124871	124876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2579	NC_009801	A	6	6	124885	124890	100 %	0 %	0 %	0 %	157155188
2580	NC_009801	GGC	2	6	124903	124908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155188
2581	NC_009801	ATG	2	6	124943	124948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155188
2582	NC_009801	TG	3	6	124947	124952	0 %	50 %	50 %	0 %	157155188
2583	NC_009801	CTT	2	6	124962	124967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155188
2584	NC_009801	GGC	2	6	124990	124995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155188
2585	NC_009801	GTC	2	6	125057	125062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2586	NC_009801	AGC	2	6	125072	125077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155188
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2588	NC_009801	ATC	2	6	125413	125418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155188
2589	NC_009801	GCTG	2	8	125446	125453	0 %	25 %	50 %	25 %	157155188
2590	NC_009801	CTG	2	6	125494	125499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2591	NC_009801	TGA	2	6	125531	125536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155188
2592	NC_009801	CTT	2	6	125601	125606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155188
2593	NC_009801	GCA	2	6	125626	125631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2594	NC_009801	GACTG	2	10	125641	125650	20 %	20 %	40 %	20 %	157155188
2595	NC_009801	GTG	2	6	125675	125680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155188
2596	NC_009801	GAA	2	6	125691	125696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155188
2597	NC_009801	GCGT	2	8	125840	125847	0 %	25 %	50 %	25 %	157155188
2598	NC_009801	GCAC	2	8	125946	125953	25 %	0 %	25 %	50 %	157155188
2599	NC_009801	GC	3	6	126038	126043	0 %	0 %	50 %	50 %	157155188
2600	NC_009801	AGAGC	2	10	126051	126060	40 %	0 %	40 %	20 %	157155188
2601	NC_009801	TCGT	2	8	126086	126093	0 %	50 %	25 %	25 %	157155188
2602	NC_009801	GAA	2	6	126111	126116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155188
2603	NC_009801	ATC	2	6	126145	126150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155188
2604	NC_009801	CGA	2	6	126153	126158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2605	NC_009801	CAG	2	6	126220	126225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155188
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2607	NC_009801	GTT	2	6	126317	126322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155188
2608	NC_009801	CTGG	2	8	126324	126331	0 %	25 %	50 %	25 %	157155188
2609	NC_009801	GCG	2	6	126334	126339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155188
2610	NC_009801	CAA	2	6	126354	126359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157155188
2611	NC_009801	GAT	2	6	126366	126371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155188
2612	NC_009801	GGC	2	6	126429	126434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155188
2613	NC_009801	CGG	2	6	126465	126470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155188
2614	NC_009801	ACC	2	6	126484	126489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155188
2615	NC_009801	GCA	2	6	126507	126512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2616	NC_009801	GCTTAC	2	12	126574	126585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157155188
2617	NC_009801	TAC	3	9	126649	126657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155188
2618	NC_009801	GCT	2	6	126774	126779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155188
2619	NC_009801	CCT	2	6	126869	126874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155188
2620	NC_009801	TGC	2	6	126920	126925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155188
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2622	NC_009801	TGA	2	6	126965	126970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155188
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2875	NC_009801	CGA	2	6	138543	138548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2988	NC_009801	CT	3	6	144352	144357	0 %	50 %	0 %	50 %	157154875
2989	NC_009801	TAAA	2	8	144360	144367	75 %	25 %	0 %	0 %	157154875
2990	NC_009801	CGGG	2	8	144373	144380	0 %	0 %	75 %	25 %	157154875
2991	NC_009801	GCA	2	6	144481	144486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154875
2992	NC_009801	CAGG	2	8	144500	144507	25 %	0 %	50 %	25 %	157154875
2993	NC_009801	TAC	2	6	144509	144514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154875
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2995	NC_009801	AACG	2	8	144587	144594	50 %	0 %	25 %	25 %	157154875
2996	NC_009801	ACT	2	6	144664	144669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154875
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2999	NC_009801	CGC	2	6	144710	144715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154875
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