MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 102245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009801	GAA	2	6	46786	46791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155244
1002	NC_009801	CAG	2	6	46824	46829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155244
1003	NC_009801	GC	3	6	46933	46938	0 %	0 %	50 %	50 %	157155244
1004	NC_009801	TGG	2	6	46973	46978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155244
1005	NC_009801	GTCG	2	8	46984	46991	0 %	25 %	50 %	25 %	157155244
1006	NC_009801	GCA	2	6	47000	47005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155244
1007	NC_009801	ATGG	2	8	47091	47098	25 %	25 %	50 %	0 %	157155244
1008	NC_009801	TTG	2	6	47270	47275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155244
1009	NC_009801	CAT	2	6	47399	47404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156667
1010	NC_009801	CGGTT	2	10	47423	47432	0 %	40 %	40 %	20 %	157156667
1011	NC_009801	GTTA	2	8	47468	47475	25 %	50 %	25 %	0 %	157156667
1012	NC_009801	CGG	2	6	47513	47518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156667
1013	NC_009801	ATT	2	6	47547	47552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156667
1014	NC_009801	ACT	2	6	47641	47646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156667
1015	NC_009801	GAA	2	6	47730	47735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156667
1016	NC_009801	GC	3	6	47740	47745	0 %	0 %	50 %	50 %	157156667
1017	NC_009801	GTC	2	6	47796	47801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156667
1018	NC_009801	CACC	2	8	48019	48026	25 %	0 %	0 %	75 %	157156667
1019	NC_009801	GCG	2	6	48040	48045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156667
1020	NC_009801	CAT	2	6	48099	48104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156667
1021	NC_009801	A	7	7	48116	48122	100 %	0 %	0 %	0 %	157156667
1022	NC_009801	ACA	2	6	48152	48157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156667
1023	NC_009801	TGG	2	6	48193	48198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156667
1024	NC_009801	TGC	2	6	48238	48243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156667
1025	NC_009801	ATTG	2	8	48266	48273	25 %	50 %	25 %	0 %	157156667
1026	NC_009801	GCC	2	6	48282	48287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156667
1027	NC_009801	GCC	2	6	48339	48344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156667
1028	NC_009801	GCA	2	6	48354	48359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156667
1029	NC_009801	CGA	2	6	48386	48391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156667
1030	NC_009801	TCC	2	6	48589	48594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157156667
1031	NC_009801	TCA	2	6	48616	48621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156667
1032	NC_009801	TTG	2	6	48732	48737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156329
1033	NC_009801	GCT	2	6	48769	48774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156329
1034	NC_009801	AAG	2	6	48803	48808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156329
1035	NC_009801	CTGGGG	2	12	48872	48883	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157156329
1036	NC_009801	CG	3	6	48909	48914	0 %	0 %	50 %	50 %	157156329
1037	NC_009801	CGC	2	6	48965	48970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_009801	A	6	6	48986	48991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009801	CCG	2	6	49051	49056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154973
1040	NC_009801	GGT	2	6	49076	49081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157154973
1041	NC_009801	TGGCG	2	10	49114	49123	0 %	20 %	60 %	20 %	157154973
1042	NC_009801	ATC	2	6	49271	49276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154973
1043	NC_009801	CGA	2	6	49299	49304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154973
1044	NC_009801	TGTT	2	8	49305	49312	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
1045	NC_009801	CGC	2	6	49444	49449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154973
1046	NC_009801	GGC	2	6	49511	49516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157154973
1047	NC_009801	GCG	2	6	49538	49543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157154973
1048	NC_009801	TGTT	2	8	49550	49557	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
1049	NC_009801	TTA	2	6	49601	49606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157154973
1050	NC_009801	GAT	3	9	49636	49644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157154973
1051	NC_009801	AGC	2	6	49680	49685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154973
1052	NC_009801	GCA	2	6	49687	49692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154973
1053	NC_009801	CGC	2	6	49718	49723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154973
1054	NC_009801	TGTT	2	8	49740	49747	0 %	75 %	25 %	0 %	157154973
1055	NC_009801	GCC	2	6	49748	49753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154973
1056	NC_009801	TTG	2	6	49817	49822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157154973
1057	NC_009801	GTG	2	6	49859	49864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157154973
1058	NC_009801	CCG	2	6	49895	49900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157154973
1059	NC_009801	TTG	2	6	49934	49939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157154973
1060	NC_009801	ATG	2	6	49955	49960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157154973
1061	NC_009801	CGCTGG	2	12	49962	49973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157154973
1062	NC_009801	CTGG	2	8	50005	50012	0 %	25 %	50 %	25 %	157154973
1063	NC_009801	AAT	2	6	50186	50191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157154973
1064	NC_009801	TTG	2	6	50243	50248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157154973
1065	NC_009801	TC	3	6	50348	50353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_009801	ATT	2	6	50368	50373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009801	AT	3	6	50391	50396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009801	CAT	2	6	50476	50481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155009
1069	NC_009801	CT	3	6	50541	50546	0 %	50 %	0 %	50 %	157155009
1070	NC_009801	GCC	2	6	50581	50586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155009
1071	NC_009801	AGG	2	6	50591	50596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157155009
1072	NC_009801	GCA	2	6	50625	50630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155009
1073	NC_009801	TCC	2	6	50652	50657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155009
1074	NC_009801	CTC	2	6	50659	50664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155009
1075	NC_009801	GGC	2	6	50713	50718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155009
1076	NC_009801	GAC	2	6	50754	50759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155009
1077	NC_009801	CGG	3	9	50760	50768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155009
1078	NC_009801	TGCAC	2	10	50876	50885	20 %	20 %	20 %	40 %	157155009
1079	NC_009801	GAC	2	6	50896	50901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155009
1080	NC_009801	CTG	2	6	50941	50946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155009
1081	NC_009801	AGG	2	6	50954	50959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157155009
1082	NC_009801	CAT	2	6	50962	50967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155009
1083	NC_009801	ATT	2	6	51083	51088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159263
1084	NC_009801	GTG	2	6	51152	51157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157159263
1085	NC_009801	TAT	2	6	51169	51174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159263
1086	NC_009801	TGCG	2	8	51210	51217	0 %	25 %	50 %	25 %	157159263
1087	NC_009801	CGG	2	6	51226	51231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159263
1088	NC_009801	GCG	2	6	51255	51260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159263
1089	NC_009801	CTG	2	6	51263	51268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1090	NC_009801	ATTG	2	8	51313	51320	25 %	50 %	25 %	0 %	157159263
1091	NC_009801	CTC	2	6	51337	51342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157159263
1092	NC_009801	ATGA	2	8	51365	51372	50 %	25 %	25 %	0 %	157159263
1093	NC_009801	TGC	2	6	51417	51422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1094	NC_009801	TGG	2	6	51450	51455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157159263
1095	NC_009801	GAT	2	6	51457	51462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159263
1096	NC_009801	CGA	3	9	51489	51497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1097	NC_009801	CT	3	6	51510	51515	0 %	50 %	0 %	50 %	157159263
1098	NC_009801	GCTGGT	2	12	51538	51549	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157159263
1099	NC_009801	TGC	2	6	51660	51665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1100	NC_009801	CGATGG	2	12	51684	51695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157159263
1101	NC_009801	GGCG	2	8	51706	51713	0 %	0 %	75 %	25 %	157159263
1102	NC_009801	CTG	2	6	51716	51721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1103	NC_009801	GCT	2	6	51829	51834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1104	NC_009801	TGC	2	6	51861	51866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1105	NC_009801	TCA	3	9	51876	51884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159263
1106	NC_009801	CGT	2	6	51938	51943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1107	NC_009801	GTT	2	6	51955	51960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157159263
1108	NC_009801	AGGGC	2	10	51961	51970	20 %	0 %	60 %	20 %	157159263
1109	NC_009801	GGCGC	2	10	51995	52004	0 %	0 %	60 %	40 %	157159263
1110	NC_009801	GCA	2	6	52070	52075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1111	NC_009801	CTG	2	6	52085	52090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1112	NC_009801	TCT	2	6	52115	52120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159263
1113	NC_009801	CGA	2	6	52150	52155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1114	NC_009801	CG	3	6	52164	52169	0 %	0 %	50 %	50 %	157159263
1115	NC_009801	TGG	2	6	52239	52244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157159263
1116	NC_009801	GGAT	2	8	52320	52327	25 %	25 %	50 %	0 %	157159263
1117	NC_009801	GCG	2	6	52346	52351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159263
1118	NC_009801	CGA	2	6	52378	52383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159263
1119	NC_009801	AACC	2	8	52390	52397	50 %	0 %	0 %	50 %	157159263
1120	NC_009801	ATT	2	6	52442	52447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159263
1121	NC_009801	GCCCGC	2	12	52448	52459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157159263
1122	NC_009801	CAGG	2	8	52487	52494	25 %	0 %	50 %	25 %	157159263
1123	NC_009801	CCG	2	6	52606	52611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157159263
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1125	NC_009801	CG	3	6	52667	52672	0 %	0 %	50 %	50 %	157159263
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