MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 102245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009801	CCAGA	2	10	244065	244074	40 %	0 %	20 %	40 %	157155738
5002	NC_009801	GCG	2	6	244137	244142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
5003	NC_009801	GAA	2	6	244206	244211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155738
5004	NC_009801	AAT	2	6	244248	244253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157155738
5005	NC_009801	AAT	2	6	244263	244268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157155738
5006	NC_009801	GTT	2	6	244272	244277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155738
5007	NC_009801	TCC	2	6	244285	244290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155738
5008	NC_009801	CTG	2	6	244326	244331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5009	NC_009801	AAG	2	6	244363	244368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155738
5010	NC_009801	CAC	2	6	244452	244457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155738
5011	NC_009801	CCA	2	6	244496	244501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155738
5012	NC_009801	CAC	2	6	244503	244508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155738
5013	NC_009801	CAGC	2	8	244523	244530	25 %	0 %	25 %	50 %	157155738
5014	NC_009801	GCAG	2	8	244555	244562	25 %	0 %	50 %	25 %	157155738
5015	NC_009801	GCT	2	6	244599	244604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5016	NC_009801	CAG	2	6	244674	244679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5017	NC_009801	CTTT	2	8	244726	244733	0 %	75 %	0 %	25 %	157155738
5018	NC_009801	TCC	2	6	244822	244827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155738
5019	NC_009801	AG	3	6	244839	244844	50 %	0 %	50 %	0 %	157155738
5020	NC_009801	TG	3	6	244867	244872	0 %	50 %	50 %	0 %	157155738
5021	NC_009801	GCA	2	6	244880	244885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5022	NC_009801	CGC	2	6	244913	244918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155738
5023	NC_009801	CG	3	6	245052	245057	0 %	0 %	50 %	50 %	157155738
5024	NC_009801	AAC	2	6	245187	245192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157155738
5025	NC_009801	TGT	2	6	245198	245203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155738
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5027	NC_009801	TTCT	2	8	245337	245344	0 %	75 %	0 %	25 %	157155738
5028	NC_009801	CGCC	2	8	245399	245406	0 %	0 %	25 %	75 %	157155738
5029	NC_009801	CAGT	2	8	245422	245429	25 %	25 %	25 %	25 %	157155738
5030	NC_009801	CAC	2	6	245526	245531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155738
5031	NC_009801	TCC	2	6	245554	245559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155738
5032	NC_009801	GCA	2	6	245576	245581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5033	NC_009801	TTC	2	6	245592	245597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157155738
5034	NC_009801	CGG	2	6	245604	245609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
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5036	NC_009801	CGT	2	6	245707	245712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5037	NC_009801	GGC	2	6	245839	245844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
5038	NC_009801	TGA	2	6	245924	245929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155738
5039	NC_009801	GCA	2	6	245930	245935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5040	NC_009801	TGC	2	6	245937	245942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155738
5041	NC_009801	CGC	2	6	245945	245950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155738
5042	NC_009801	GGC	2	6	245972	245977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
5043	NC_009801	CT	3	6	246004	246009	0 %	50 %	0 %	50 %	157155738
5044	NC_009801	CCA	2	6	246077	246082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155738
5045	NC_009801	GGCG	2	8	246122	246129	0 %	0 %	75 %	25 %	157155738
5046	NC_009801	AT	3	6	246143	246148	50 %	50 %	0 %	0 %	157155738
5047	NC_009801	CATC	2	8	246149	246156	25 %	25 %	0 %	50 %	157155738
5048	NC_009801	GCA	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
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5050	NC_009801	ATTC	2	8	246339	246346	25 %	50 %	0 %	25 %	157155738
5051	NC_009801	TCA	2	6	246391	246396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155738
5052	NC_009801	CGG	2	6	246409	246414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
5053	NC_009801	ATCGC	2	10	246433	246442	20 %	20 %	20 %	40 %	157155738
5054	NC_009801	CTGT	2	8	246447	246454	0 %	50 %	25 %	25 %	157155738
5055	NC_009801	GGC	2	6	246471	246476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
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5057	NC_009801	CGG	2	6	246589	246594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155738
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5059	NC_009801	GC	5	10	246657	246666	0 %	0 %	50 %	50 %	157155738
5060	NC_009801	CAGC	2	8	246675	246682	25 %	0 %	25 %	50 %	157155738
5061	NC_009801	GTT	2	6	246800	246805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155738
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5063	NC_009801	CGGA	2	8	246842	246849	25 %	0 %	50 %	25 %	157155738
5064	NC_009801	GCA	2	6	246860	246865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
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5067	NC_009801	GCA	2	6	246956	246961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155738
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5088	NC_009801	CAG	2	6	247833	247838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156439
5089	NC_009801	CTG	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156439
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5103	NC_009801	CTGG	2	8	248388	248395	0 %	25 %	50 %	25 %	157156439
5104	NC_009801	T	6	6	248403	248408	0 %	100 %	0 %	0 %	157156439
5105	NC_009801	GCG	2	6	248423	248428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156439
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5107	NC_009801	CAG	2	6	248511	248516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156439
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5109	NC_009801	CAG	2	6	248703	248708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156439
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5111	NC_009801	CGG	2	6	248835	248840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157081
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5117	NC_009801	CAG	2	6	249274	249279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157081
5118	NC_009801	CCG	2	6	249319	249324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157081
5119	NC_009801	CGG	2	6	249361	249366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157081
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5244	NC_009801	GCG	2	6	254611	254616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158389
5245	NC_009801	GTC	2	6	254657	254662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158389
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5355	NC_009801	GCC	2	6	261868	261873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5356	NC_009801	AAAAT	2	10	261886	261895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5358	NC_009801	TCA	2	6	261906	261911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5361	NC_009801	TAT	2	6	262026	262031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5363	NC_009801	T	7	7	262053	262059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_009801	TA	3	6	262076	262081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_009801	TTA	2	6	262088	262093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5367	NC_009801	TA	3	6	262123	262128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_009801	CTGA	2	8	267462	267469	25 %	25 %	25 %	25 %	157158534
5492	NC_009801	TGACC	2	10	267509	267518	20 %	20 %	20 %	40 %	157158534
5493	NC_009801	CA	3	6	267527	267532	50 %	0 %	0 %	50 %	157158534
5494	NC_009801	ATG	2	6	267631	267636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158534
5495	NC_009801	ACC	2	6	267651	267656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158534
5496	NC_009801	ACG	2	6	267703	267708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158534
5497	NC_009801	GCC	2	6	267715	267720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158534
5498	NC_009801	CTG	2	6	267765	267770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158534
5499	NC_009801	GCA	2	6	267773	267778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158534
5500	NC_009801	GCC	2	6	267839	267844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158534

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