MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli HS

Total Repeats: 2942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009800	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	157159469
2	NC_009800	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	157159470
3	NC_009800	TGCGT	2	10	4986	4995	0 %	40 %	40 %	20 %	157159471
4	NC_009800	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	157159475
5	NC_009800	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	157159476
6	NC_009800	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	157159478
7	NC_009800	CCGAT	2	10	17840	17849	20 %	20 %	20 %	40 %	157159485
8	NC_009800	AGCGA	2	10	18228	18237	40 %	0 %	40 %	20 %	157159485
9	NC_009800	GTTTT	2	10	20645	20654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009800	ATTGC	2	10	23022	23031	20 %	40 %	20 %	20 %	157159489
11	NC_009800	TTAAT	2	10	23657	23666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009800	ATTTA	2	10	32489	32498	40 %	60 %	0 %	0 %	157159499
13	NC_009800	GCGAA	2	10	35727	35736	40 %	0 %	40 %	20 %	157159501
14	NC_009800	CCGTT	2	10	36621	36630	0 %	40 %	20 %	40 %	157159501
15	NC_009800	CACGG	2	10	36998	37007	20 %	0 %	40 %	40 %	157159501
16	NC_009800	CGAAT	2	10	39707	39716	40 %	20 %	20 %	20 %	157159506
17	NC_009800	CCATG	2	10	41245	41254	20 %	20 %	20 %	40 %	157159507
18	NC_009800	CCGTA	2	10	42891	42900	20 %	20 %	20 %	40 %	157159508
19	NC_009800	GTACA	2	10	43381	43390	40 %	20 %	20 %	20 %	157159508
20	NC_009800	TTAAA	2	10	43629	43638	60 %	40 %	0 %	0 %	157159508
21	NC_009800	ACCCA	2	10	44372	44381	40 %	0 %	0 %	60 %	157159509
22	NC_009800	TTTGA	2	10	45999	46008	20 %	60 %	20 %	0 %	157159512
23	NC_009800	CGGCG	2	10	46250	46259	0 %	0 %	60 %	40 %	157159512
24	NC_009800	AATCA	2	10	46532	46541	60 %	20 %	0 %	20 %	157159513
25	NC_009800	CGGTT	2	10	47487	47496	0 %	40 %	40 %	20 %	157159514
26	NC_009800	TGGCG	2	10	49179	49188	0 %	20 %	60 %	20 %	157159516
27	NC_009800	TGCAC	2	10	50941	50950	20 %	20 %	20 %	40 %	157159517
28	NC_009800	AGGGC	2	10	52026	52035	20 %	0 %	60 %	20 %	157159518
29	NC_009800	GGCGC	2	10	52060	52069	0 %	0 %	60 %	40 %	157159518
30	NC_009800	GAAAC	2	10	52873	52882	60 %	0 %	20 %	20 %	157159518
31	NC_009800	AACGT	2	10	54785	54794	40 %	20 %	20 %	20 %	157159521
32	NC_009800	GCGTC	2	10	57769	57778	0 %	20 %	40 %	40 %	157159524
33	NC_009800	ATGTT	2	10	58583	58592	20 %	60 %	20 %	0 %	157159525
34	NC_009800	CTTCG	2	10	59016	59025	0 %	40 %	20 %	40 %	157159525
35	NC_009800	TGCGT	2	10	59302	59311	0 %	40 %	40 %	20 %	157159525
36	NC_009800	AAAGT	2	10	65036	65045	60 %	20 %	20 %	0 %	157159528
37	NC_009800	AGTCG	2	10	66005	66014	20 %	20 %	40 %	20 %	157159529
38	NC_009800	GGTGA	2	10	67284	67293	20 %	20 %	60 %	0 %	157159529
39	NC_009800	TCGCG	2	10	69891	69900	0 %	20 %	40 %	40 %	157159531
40	NC_009800	TAGTG	2	10	77369	77378	20 %	40 %	40 %	0 %	157159538
41	NC_009800	GATGG	2	10	78257	78266	20 %	20 %	60 %	0 %	157159539
42	NC_009800	ATTTT	2	10	79085	79094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009800	CTGGA	2	10	80157	80166	20 %	20 %	40 %	20 %	157159540
44	NC_009800	CTGGT	2	10	83450	83459	0 %	40 %	40 %	20 %	157159543
45	NC_009800	GACCG	2	10	83998	84007	20 %	0 %	40 %	40 %	157159544
46	NC_009800	ATGTT	2	10	86547	86556	20 %	60 %	20 %	0 %	157159546
47	NC_009800	TGCAT	2	10	87489	87498	20 %	40 %	20 %	20 %	157159548
48	NC_009800	ATTCC	2	10	87659	87668	20 %	40 %	0 %	40 %	157159548
49	NC_009800	AGTTC	2	10	92752	92761	20 %	40 %	20 %	20 %	157159553
50	NC_009800	CGTGG	2	10	94125	94134	0 %	20 %	60 %	20 %	157159555
51	NC_009800	TATCG	2	10	94632	94641	20 %	40 %	20 %	20 %	157159555
52	NC_009800	GCCTG	2	10	98964	98973	0 %	20 %	40 %	40 %	157159559
53	NC_009800	ACCGT	2	10	100877	100886	20 %	20 %	20 %	40 %	157159560
54	NC_009800	ATCAG	2	10	102650	102659	40 %	20 %	20 %	20 %	157159562
55	NC_009800	AGCCG	2	10	104418	104427	20 %	0 %	40 %	40 %	157159563
56	NC_009800	GCGCA	2	10	106746	106755	20 %	0 %	40 %	40 %	157159565
57	NC_009800	TGGCG	2	10	107740	107749	0 %	20 %	60 %	20 %	157159566
58	NC_009800	CCGGC	2	10	110710	110719	0 %	0 %	40 %	60 %	157159569
59	NC_009800	CGCGG	2	10	113919	113928	0 %	0 %	60 %	40 %	157159572
60	NC_009800	ATCCC	2	10	116163	116172	20 %	20 %	0 %	60 %	157159575
61	NC_009800	CATCG	2	10	116176	116185	20 %	20 %	20 %	40 %	157159575
62	NC_009800	TAACG	2	10	116870	116879	40 %	20 %	20 %	20 %	157159575
63	NC_009800	ATGCC	2	10	117329	117338	20 %	20 %	20 %	40 %	157159575
64	NC_009800	AATGC	2	10	118612	118621	40 %	20 %	20 %	20 %	157159576
65	NC_009800	TCTGT	2	10	119558	119567	0 %	60 %	20 %	20 %	157159577
66	NC_009800	GCATG	2	10	120651	120660	20 %	20 %	40 %	20 %	157159578
67	NC_009800	AGCAG	2	10	121989	121998	40 %	0 %	40 %	20 %	157159580
68	NC_009800	TCAGC	2	10	122857	122866	20 %	20 %	20 %	40 %	157159580
69	NC_009800	CGAAG	2	10	123904	123913	40 %	0 %	40 %	20 %	157159581
70	NC_009800	ACACG	2	10	124037	124046	40 %	0 %	20 %	40 %	157159581
71	NC_009800	TCGCG	2	10	124298	124307	0 %	20 %	40 %	40 %	157159581
72	NC_009800	GCATC	2	10	124388	124397	20 %	20 %	20 %	40 %	157159581
73	NC_009800	GACTG	2	10	125706	125715	20 %	20 %	40 %	20 %	157159582
74	NC_009800	AGAGC	2	10	126116	126125	40 %	0 %	40 %	20 %	157159582
75	NC_009800	AGGCG	2	10	131388	131397	20 %	0 %	60 %	20 %	157159585
76	NC_009800	GGTTG	2	10	132141	132150	0 %	40 %	60 %	0 %	157159585
77	NC_009800	TCTGG	2	10	134787	134796	0 %	40 %	40 %	20 %	157159586
78	NC_009800	GGGCA	2	10	136199	136208	20 %	0 %	60 %	20 %	157159587
79	NC_009800	CAGCG	2	10	136478	136487	20 %	0 %	40 %	40 %	157159588
80	NC_009800	GGCTG	2	10	139189	139198	0 %	20 %	60 %	20 %	157159591
81	NC_009800	CCGTC	2	10	143308	143317	0 %	20 %	20 %	60 %	157159593
82	NC_009800	GTGAA	2	10	143318	143327	40 %	20 %	40 %	0 %	157159593
83	NC_009800	GGCAT	2	10	143480	143489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009800	GTTCA	2	10	143705	143714	20 %	40 %	20 %	20 %	157159594
85	NC_009800	ATCCA	2	10	144031	144040	40 %	20 %	0 %	40 %	157159594
86	NC_009800	GTAAG	2	10	144244	144253	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009800	CTTTA	2	10	145294	145303	20 %	60 %	0 %	20 %	157159596
88	NC_009800	TGGCG	2	10	145521	145530	0 %	20 %	60 %	20 %	157159596
89	NC_009800	TCCTC	2	10	145964	145973	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_009800	TTTCA	2	10	147834	147843	20 %	60 %	0 %	20 %	157159599
91	NC_009800	GGGAG	2	10	149158	149167	20 %	0 %	80 %	0 %	157159600
92	NC_009800	TGAAG	2	10	151056	151065	40 %	20 %	40 %	0 %	157159602
93	NC_009800	ACCGC	2	10	151161	151170	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_009800	GCGGT	2	10	151180	151189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009800	CTGTC	2	10	153955	153964	0 %	40 %	20 %	40 %	157159605
96	NC_009800	TTTGC	2	10	155663	155672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009800	AAATT	2	10	156104	156113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009800	GCGAG	2	10	157471	157480	20 %	0 %	60 %	20 %	157159609
99	NC_009800	GGCGT	2	10	157909	157918	0 %	20 %	60 %	20 %	157159609
100	NC_009800	ATCAG	2	10	158547	158556	40 %	20 %	20 %	20 %	157159610
101	NC_009800	ACCAC	2	10	160812	160821	40 %	0 %	0 %	60 %	157159613
102	NC_009800	GGCGT	2	10	162515	162524	0 %	20 %	60 %	20 %	157159614
103	NC_009800	CGACG	2	10	163554	163563	20 %	0 %	40 %	40 %	157159614
104	NC_009800	TTATC	2	10	166466	166475	20 %	60 %	0 %	20 %	157159616
105	NC_009800	TGAAA	2	10	167539	167548	60 %	20 %	20 %	0 %	157159617
106	NC_009800	GGAAT	2	10	167875	167884	40 %	20 %	40 %	0 %	157159617
107	NC_009800	AACCT	2	10	169825	169834	40 %	20 %	0 %	40 %	157159619
108	NC_009800	TGGTC	2	10	169867	169876	0 %	40 %	40 %	20 %	157159619
109	NC_009800	TGGCG	2	10	171112	171121	0 %	20 %	60 %	20 %	157159620
110	NC_009800	CGGCG	2	10	171823	171832	0 %	0 %	60 %	40 %	157159620
111	NC_009800	TTCCA	2	10	172353	172362	20 %	40 %	0 %	40 %	157159620
112	NC_009800	GGTCC	2	10	176676	176685	0 %	20 %	40 %	40 %	157159625
113	NC_009800	ACGGG	2	10	178593	178602	20 %	0 %	60 %	20 %	157159627
114	NC_009800	GTGAT	2	10	180752	180761	20 %	40 %	40 %	0 %	157159628
115	NC_009800	GTGAT	2	10	181043	181052	20 %	40 %	40 %	0 %	157159628
116	NC_009800	TACGT	2	10	181288	181297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009800	TGGCC	2	10	183013	183022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009800	GCCAG	2	10	184762	184771	20 %	0 %	40 %	40 %	157159632
119	NC_009800	GTTCT	2	10	186203	186212	0 %	60 %	20 %	20 %	157159632
120	NC_009800	CTGAA	2	10	188195	188204	40 %	20 %	20 %	20 %	157159634
121	NC_009800	AAGCG	2	10	188259	188268	40 %	0 %	40 %	20 %	157159634
122	NC_009800	TGGTG	2	10	190165	190174	0 %	40 %	60 %	0 %	157159636
123	NC_009800	TGCAC	2	10	190291	190300	20 %	20 %	20 %	40 %	157159636
124	NC_009800	TGCGC	2	10	190684	190693	0 %	20 %	40 %	40 %	157159636
125	NC_009800	AAATA	2	10	190906	190915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009800	GTCTG	2	10	190991	191000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009800	CATGG	2	10	192527	192536	20 %	20 %	40 %	20 %	157159638
128	NC_009800	CAGAT	2	10	193565	193574	40 %	20 %	20 %	20 %	157159639
129	NC_009800	ACTTT	2	10	193698	193707	20 %	60 %	0 %	20 %	157159639
130	NC_009800	GACGT	2	10	197618	197627	20 %	20 %	40 %	20 %	157159642
131	NC_009800	CGACG	2	10	199445	199454	20 %	0 %	40 %	40 %	157159644
132	NC_009800	ATGCC	2	10	202013	202022	20 %	20 %	20 %	40 %	157159647
133	NC_009800	GGATG	2	10	202275	202284	20 %	20 %	60 %	0 %	157159647
134	NC_009800	TGGCC	2	10	203339	203348	0 %	20 %	40 %	40 %	157159649
135	NC_009800	GTAAC	2	10	204082	204091	40 %	20 %	20 %	20 %	157159649
136	NC_009800	AGCCG	2	10	204710	204719	20 %	0 %	40 %	40 %	157159649
137	NC_009800	GGTGG	2	10	204819	204828	0 %	20 %	80 %	0 %	157159649
138	NC_009800	TTAAC	2	10	212962	212971	40 %	40 %	0 %	20 %	157159656
139	NC_009800	TGCGC	2	10	214174	214183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009800	GAAAG	2	10	215252	215261	60 %	0 %	40 %	0 %	157159659
141	NC_009800	ACGGT	2	10	217109	217118	20 %	20 %	40 %	20 %	157159661
142	NC_009800	TGATT	2	10	219951	219960	20 %	60 %	20 %	0 %	157159664
143	NC_009800	CGGTT	2	10	222914	222923	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009800	TAATT	2	10	231953	231962	40 %	60 %	0 %	0 %	157159671
145	NC_009800	ACTGG	2	10	234891	234900	20 %	20 %	40 %	20 %	157159674
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148	NC_009800	TGATC	2	10	239667	239676	20 %	40 %	20 %	20 %	157159680
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151	NC_009800	ATCGC	2	10	243809	243818	20 %	20 %	20 %	40 %	157159682
152	NC_009800	GCGCA	2	10	248149	248158	20 %	0 %	40 %	40 %	157159685
153	NC_009800	GGTCA	2	10	250864	250873	20 %	20 %	40 %	20 %	157159687
154	NC_009800	GGGCA	2	10	250895	250904	20 %	0 %	60 %	20 %	157159687
155	NC_009800	ATTTC	2	10	251405	251414	20 %	60 %	0 %	20 %	157159687
156	NC_009800	CCAGC	2	10	253637	253646	20 %	0 %	20 %	60 %	157159690
157	NC_009800	CCAGG	2	10	254294	254303	20 %	0 %	40 %	40 %	157159690
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162	NC_009800	CTAAT	2	10	259489	259498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_009800	ACTGT	2	10	260544	260553	20 %	40 %	20 %	20 %	157159698
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166	NC_009800	ACGGT	2	10	264237	264246	20 %	20 %	40 %	20 %	157159700
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172	NC_009800	AAACG	2	10	275310	275319	60 %	0 %	20 %	20 %	157159707
173	NC_009800	TTGCT	2	10	276315	276324	0 %	60 %	20 %	20 %	157159710
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182	NC_009800	TTGAG	2	10	296338	296347	20 %	40 %	40 %	0 %	157159733
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232	NC_009800	TTCCC	2	10	375231	375240	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
233	NC_009800	ATAAA	2	10	375911	375920	80 %	20 %	0 %	0 %	157159815
234	NC_009800	AAAAT	2	10	375973	375982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_009800	GACAA	2	10	379966	379975	60 %	0 %	20 %	20 %	157159818
236	NC_009800	GGTTT	2	10	380227	380236	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
237	NC_009800	TAAAA	2	10	382471	382480	80 %	20 %	0 %	0 %	157159821
238	NC_009800	AGCGA	2	10	382485	382494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
239	NC_009800	GCAGG	2	10	383633	383642	20 %	0 %	60 %	20 %	157159823
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242	NC_009800	ATTTT	2	10	388989	388998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009800	TCTGA	2	10	393388	393397	20 %	40 %	20 %	20 %	157159827
244	NC_009800	TTATT	2	10	397647	397656	20 %	80 %	0 %	0 %	157159833
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251	NC_009800	GCGCT	2	10	404399	404408	0 %	20 %	40 %	40 %	157159839
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254	NC_009800	AACTC	2	10	408527	408536	40 %	20 %	0 %	40 %	157159842
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256	NC_009800	CGCTT	2	10	411118	411127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_009800	CACGG	2	10	412715	412724	20 %	0 %	40 %	40 %	157159847
258	NC_009800	CAGTT	2	10	412844	412853	20 %	40 %	20 %	20 %	157159848
259	NC_009800	TGGCG	2	10	414813	414822	0 %	20 %	60 %	20 %	157159849
260	NC_009800	GTGGC	2	10	418977	418986	0 %	20 %	60 %	20 %	157159852
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262	NC_009800	TGATG	2	10	421192	421201	20 %	40 %	40 %	0 %	157159853
263	NC_009800	TGCGC	2	10	422834	422843	0 %	20 %	40 %	40 %	157159854
264	NC_009800	GGTGG	2	10	425490	425499	0 %	20 %	80 %	0 %	157159858
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266	NC_009800	CGCAG	2	10	427991	428000	20 %	0 %	40 %	40 %	157159860
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398	NC_009800	GGCGC	2	10	659467	659476	0 %	0 %	60 %	40 %	157160087
399	NC_009800	ATTTG	2	10	660027	660036	20 %	60 %	20 %	0 %	157160088
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