MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	CG	3	6	222	227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009788	CG	3	6	884	889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009788	CT	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	157149467
4	NC_009788	GC	3	6	1493	1498	0 %	0 %	50 %	50 %	157149468
5	NC_009788	CA	3	6	2073	2078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009788	CG	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009788	GC	3	6	2863	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	157149470
8	NC_009788	GC	3	6	3462	3467	0 %	0 %	50 %	50 %	157149453
9	NC_009788	GT	3	6	4819	4824	0 %	50 %	50 %	0 %	157149445
10	NC_009788	GC	3	6	5078	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	157149445
11	NC_009788	GC	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	157149446
12	NC_009788	GT	3	6	5673	5678	0 %	50 %	50 %	0 %	157149435
13	NC_009788	CA	3	6	7003	7008	50 %	0 %	0 %	50 %	157149483
14	NC_009788	GT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	50 %	0 %	157149483
15	NC_009788	TG	4	8	7797	7804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009788	AT	3	6	8657	8662	50 %	50 %	0 %	0 %	157149477
17	NC_009788	TC	3	6	9133	9138	0 %	50 %	0 %	50 %	157149477
18	NC_009788	CA	3	6	9694	9699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009788	TA	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009788	CT	3	6	10155	10160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009788	AT	3	6	10274	10279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009788	GC	3	6	11411	11416	0 %	0 %	50 %	50 %	157149457
23	NC_009788	GC	3	6	11909	11914	0 %	0 %	50 %	50 %	157149457
24	NC_009788	TG	3	6	12888	12893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009788	CA	3	6	13007	13012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009788	CA	3	6	13034	13039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009788	GA	3	6	13089	13094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009788	CT	3	6	15346	15351	0 %	50 %	0 %	50 %	157149473
29	NC_009788	AG	3	6	15626	15631	50 %	0 %	50 %	0 %	157149473
30	NC_009788	CT	3	6	15694	15699	0 %	50 %	0 %	50 %	157149473
31	NC_009788	CT	3	6	17669	17674	0 %	50 %	0 %	50 %	157149433
32	NC_009788	CT	3	6	18470	18475	0 %	50 %	0 %	50 %	157149460
33	NC_009788	GC	3	6	19249	19254	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
34	NC_009788	GC	3	6	19297	19302	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
35	NC_009788	AT	3	6	20181	20186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009788	CG	3	6	20791	20796	0 %	0 %	50 %	50 %	157149436
37	NC_009788	AT	3	6	21031	21036	50 %	50 %	0 %	0 %	157149456
38	NC_009788	AT	3	6	21154	21159	50 %	50 %	0 %	0 %	157149456
39	NC_009788	CT	3	6	21954	21959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009788	TA	3	6	22072	22077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009788	AT	3	6	23622	23627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009788	TC	3	6	23900	23905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009788	TA	4	8	24085	24092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009788	TG	3	6	25235	25240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009788	AT	3	6	25779	25784	50 %	50 %	0 %	0 %	157149462
46	NC_009788	AT	3	6	25926	25931	50 %	50 %	0 %	0 %	157149462
47	NC_009788	CT	3	6	26042	26047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009788	AT	3	6	26099	26104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009788	TA	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009788	AT	3	6	26612	26617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009788	CT	3	6	26723	26728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009788	GA	3	6	27238	27243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009788	CA	3	6	28881	28886	50 %	0 %	0 %	50 %	157149469
54	NC_009788	GA	4	8	29584	29591	50 %	0 %	50 %	0 %	157149455
55	NC_009788	AG	3	6	29861	29866	50 %	0 %	50 %	0 %	157149455
56	NC_009788	TA	4	8	30786	30793	50 %	50 %	0 %	0 %	157149450
57	NC_009788	TA	3	6	31706	31711	50 %	50 %	0 %	0 %	157149450
58	NC_009788	AT	3	6	32100	32105	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
59	NC_009788	AG	3	6	32499	32504	50 %	0 %	50 %	0 %	157149430
60	NC_009788	TG	3	6	33150	33155	0 %	50 %	50 %	0 %	157149430
61	NC_009788	GA	3	6	33188	33193	50 %	0 %	50 %	0 %	157149430
62	NC_009788	AT	3	6	33648	33653	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
63	NC_009788	TC	3	6	34021	34026	0 %	50 %	0 %	50 %	157149430
64	NC_009788	AT	3	6	34461	34466	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
65	NC_009788	AT	3	6	35416	35421	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
66	NC_009788	TA	3	6	35683	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
67	NC_009788	AT	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
68	NC_009788	AC	3	6	35888	35893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009788	GA	3	6	36586	36591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009788	TC	3	6	37393	37398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009788	TC	3	6	38582	38587	0 %	50 %	0 %	50 %	157149479
72	NC_009788	CT	3	6	38650	38655	0 %	50 %	0 %	50 %	157149479
73	NC_009788	TC	3	6	38934	38939	0 %	50 %	0 %	50 %	157149439
74	NC_009788	CA	3	6	39746	39751	50 %	0 %	0 %	50 %	157149494
75	NC_009788	TA	3	6	40539	40544	50 %	50 %	0 %	0 %	157149494
76	NC_009788	CT	3	6	40710	40715	0 %	50 %	0 %	50 %	157149494
77	NC_009788	AG	3	6	41295	41300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009788	TA	3	6	41844	41849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009788	TA	3	6	41855	41860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009788	TG	3	6	42279	42284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009788	CG	3	6	42342	42347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009788	GC	3	6	42907	42912	0 %	0 %	50 %	50 %	157149471
83	NC_009788	TG	3	6	43336	43341	0 %	50 %	50 %	0 %	157149471
84	NC_009788	AT	3	6	45363	45368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009788	GA	3	6	46384	46389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009788	TG	3	6	47853	47858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009788	GT	3	6	48024	48029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009788	TA	3	6	48234	48239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009788	TG	3	6	48249	48254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009788	AC	3	6	48397	48402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009788	TA	3	6	48617	48622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009788	TA	3	6	48719	48724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009788	AT	3	6	50254	50259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009788	AG	4	8	50954	50961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009788	GC	3	6	51061	51066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009788	AC	3	6	53683	53688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009788	GT	3	6	54234	54239	0 %	50 %	50 %	0 %	157149444
98	NC_009788	TC	3	6	54453	54458	0 %	50 %	0 %	50 %	157149444
99	NC_009788	TG	3	6	56496	56501	0 %	50 %	50 %	0 %	157149495
100	NC_009788	TG	3	6	56939	56944	0 %	50 %	50 %	0 %	157149495
101	NC_009788	GA	3	6	58015	58020	50 %	0 %	50 %	0 %	157149495
102	NC_009788	GA	3	6	58723	58728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009788	GA	3	6	59015	59020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009788	GA	3	6	59234	59239	50 %	0 %	50 %	0 %	157149438
105	NC_009788	GC	3	6	60152	60157	0 %	0 %	50 %	50 %	157149493
106	NC_009788	TC	3	6	60504	60509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009788	AC	3	6	60633	60638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009788	GA	3	6	62928	62933	50 %	0 %	50 %	0 %	157149431
109	NC_009788	CA	3	6	63242	63247	50 %	0 %	0 %	50 %	157149452
110	NC_009788	TG	3	6	63831	63836	0 %	50 %	50 %	0 %	157149466
111	NC_009788	GC	3	6	65568	65573	0 %	0 %	50 %	50 %	157149459
112	NC_009788	AG	3	6	65870	65875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009788	AC	3	6	66670	66675	50 %	0 %	0 %	50 %	157149476
114	NC_009788	GA	3	6	69188	69193	50 %	0 %	50 %	0 %	157149480
115	NC_009788	GT	3	6	69520	69525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009788	CA	3	6	69554	69559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009788	AC	4	8	70273	70280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.