MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	GCTT	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009788	CTGC	2	8	2803	2810	0 %	25 %	25 %	50 %	157149470
3	NC_009788	CCGT	2	8	3137	3144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009788	ACGA	2	8	3734	3741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009788	GCCA	2	8	4432	4439	25 %	0 %	25 %	50 %	157149449
6	NC_009788	ACTG	2	8	4502	4509	25 %	25 %	25 %	25 %	157149449
7	NC_009788	TCAT	2	8	5389	5396	25 %	50 %	0 %	25 %	157149446
8	NC_009788	CTGC	2	8	5638	5645	0 %	25 %	25 %	50 %	157149435
9	NC_009788	GCCC	2	8	6520	6527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009788	GCCA	2	8	6679	6686	25 %	0 %	25 %	50 %	157149483
11	NC_009788	TGAA	2	8	6801	6808	50 %	25 %	25 %	0 %	157149483
12	NC_009788	CAGC	2	8	7214	7221	25 %	0 %	25 %	50 %	157149483
13	NC_009788	TTTA	2	8	8716	8723	25 %	75 %	0 %	0 %	157149477
14	NC_009788	GATC	2	8	9204	9211	25 %	25 %	25 %	25 %	157149477
15	NC_009788	TGTT	2	8	9871	9878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009788	TACC	2	8	10308	10315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009788	AGCG	2	8	11133	11140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009788	GATG	2	8	11296	11303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009788	CCTG	2	8	11666	11673	0 %	25 %	25 %	50 %	157149457
20	NC_009788	GCTG	2	8	11728	11735	0 %	25 %	50 %	25 %	157149457
21	NC_009788	CTCA	2	8	12276	12283	25 %	25 %	0 %	50 %	157149451
22	NC_009788	CATC	2	8	12592	12599	25 %	25 %	0 %	50 %	157149447
23	NC_009788	GAAA	2	8	12943	12950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009788	GAGC	2	8	13178	13185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009788	AGAT	2	8	14387	14394	50 %	25 %	25 %	0 %	157149473
26	NC_009788	GCAG	2	8	14511	14518	25 %	0 %	50 %	25 %	157149473
27	NC_009788	CTGA	2	8	14549	14556	25 %	25 %	25 %	25 %	157149473
28	NC_009788	TGTT	2	8	14910	14917	0 %	75 %	25 %	0 %	157149473
29	NC_009788	TCAA	2	8	15074	15081	50 %	25 %	0 %	25 %	157149473
30	NC_009788	ACTG	2	8	15771	15778	25 %	25 %	25 %	25 %	157149473
31	NC_009788	GGAT	2	8	17009	17016	25 %	25 %	50 %	0 %	157149433
32	NC_009788	GTCA	2	8	17176	17183	25 %	25 %	25 %	25 %	157149433
33	NC_009788	GCCG	2	8	17280	17287	0 %	0 %	50 %	50 %	157149433
34	NC_009788	GCGA	2	8	18413	18420	25 %	0 %	50 %	25 %	157149460
35	NC_009788	GGAT	2	8	18845	18852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009788	GCTG	2	8	19147	19154	0 %	25 %	50 %	25 %	157149441
37	NC_009788	GGCT	2	8	19280	19287	0 %	25 %	50 %	25 %	157149441
38	NC_009788	GCCG	2	8	19337	19344	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
39	NC_009788	CCTG	2	8	19548	19555	0 %	25 %	25 %	50 %	157149441
40	NC_009788	CAGT	2	8	20765	20772	25 %	25 %	25 %	25 %	157149436
41	NC_009788	CAAA	2	8	21525	21532	75 %	0 %	0 %	25 %	157149456
42	NC_009788	GAAA	2	8	21830	21837	75 %	0 %	25 %	0 %	157149456
43	NC_009788	GGCT	2	8	22311	22318	0 %	25 %	50 %	25 %	157149486
44	NC_009788	CATT	2	8	23683	23690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009788	CTTC	2	8	23978	23985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009788	TCAT	2	8	24022	24029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009788	TATT	2	8	24591	24598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009788	AATC	2	8	25087	25094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009788	TTCA	2	8	25968	25975	25 %	50 %	0 %	25 %	157149462
50	NC_009788	CAAA	2	8	26280	26287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009788	CCCT	2	8	26303	26310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009788	AGAA	2	8	26463	26470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009788	AAGC	2	8	26503	26510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009788	ATAG	2	8	26551	26558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009788	TCCT	2	8	27357	27364	0 %	50 %	0 %	50 %	157149440
56	NC_009788	TCCA	2	8	27894	27901	25 %	25 %	0 %	50 %	157149440
57	NC_009788	TCCA	2	8	28020	28027	25 %	25 %	0 %	50 %	157149440
58	NC_009788	AATG	2	8	28533	28540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009788	CAGT	2	8	28696	28703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009788	AGGA	2	8	29000	29007	50 %	0 %	50 %	0 %	157149469
61	NC_009788	TGGA	2	8	29274	29281	25 %	25 %	50 %	0 %	157149455
62	NC_009788	GAAA	2	8	29528	29535	75 %	0 %	25 %	0 %	157149455
63	NC_009788	TCGC	2	8	29996	30003	0 %	25 %	25 %	50 %	157149455
64	NC_009788	TGAA	2	8	30303	30310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009788	CCTG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009788	AGGC	2	8	30584	30591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009788	GTTT	2	8	30915	30922	0 %	75 %	25 %	0 %	157149450
68	NC_009788	TTCA	2	8	31843	31850	25 %	50 %	0 %	25 %	157149450
69	NC_009788	TGCA	2	8	31933	31940	25 %	25 %	25 %	25 %	157149430
70	NC_009788	GTAA	2	8	32150	32157	50 %	25 %	25 %	0 %	157149430
71	NC_009788	ATTT	2	8	32251	32258	25 %	75 %	0 %	0 %	157149430
72	NC_009788	GGCT	2	8	32278	32285	0 %	25 %	50 %	25 %	157149430
73	NC_009788	TAAA	2	8	32308	32315	75 %	25 %	0 %	0 %	157149430
74	NC_009788	GCCT	2	8	33374	33381	0 %	25 %	25 %	50 %	157149430
75	NC_009788	AATT	2	8	33952	33959	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
76	NC_009788	TATG	2	8	33967	33974	25 %	50 %	25 %	0 %	157149430
77	NC_009788	TGTT	2	8	34099	34106	0 %	75 %	25 %	0 %	157149430
78	NC_009788	AATG	2	8	35112	35119	50 %	25 %	25 %	0 %	157149448
79	NC_009788	CTTG	2	8	35139	35146	0 %	50 %	25 %	25 %	157149448
80	NC_009788	GATA	2	8	35226	35233	50 %	25 %	25 %	0 %	157149448
81	NC_009788	ATTT	2	8	35451	35458	25 %	75 %	0 %	0 %	157149448
82	NC_009788	CCCT	2	8	35605	35612	0 %	25 %	0 %	75 %	157149448
83	NC_009788	AAAC	2	8	35853	35860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009788	AAAT	3	12	35875	35886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009788	CCAG	2	8	36459	36466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009788	CGTA	2	8	36924	36931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009788	TATT	2	8	36940	36947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009788	CAAC	2	8	37576	37583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009788	TCAA	2	8	37773	37780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009788	GCCA	2	8	37836	37843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009788	AAGC	2	8	38400	38407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009788	TTTC	2	8	38576	38583	0 %	75 %	0 %	25 %	157149479
93	NC_009788	CGAT	2	8	39308	39315	25 %	25 %	25 %	25 %	157149439
94	NC_009788	CTGG	2	8	39318	39325	0 %	25 %	50 %	25 %	157149439
95	NC_009788	CTGA	2	8	39594	39601	25 %	25 %	25 %	25 %	157149494
96	NC_009788	CAAC	2	8	40639	40646	50 %	0 %	0 %	50 %	157149494
97	NC_009788	GAAG	2	8	41117	41124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009788	CTGG	2	8	41520	41527	0 %	25 %	50 %	25 %	157149463
99	NC_009788	ACCC	2	8	41993	42000	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009788	CCAG	2	8	42149	42156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009788	TTTG	2	8	42541	42548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009788	CAGC	2	8	42749	42756	25 %	0 %	25 %	50 %	157149471
103	NC_009788	GGCA	2	8	42882	42889	25 %	0 %	50 %	25 %	157149471
104	NC_009788	CGGA	2	8	43401	43408	25 %	0 %	50 %	25 %	157149471
105	NC_009788	CGTT	2	8	43431	43438	0 %	50 %	25 %	25 %	157149471
106	NC_009788	AAGA	2	8	43900	43907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009788	GGCA	2	8	44797	44804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009788	ACCT	2	8	45079	45086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009788	CGTT	2	8	45155	45162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009788	AAGA	2	8	45774	45781	75 %	0 %	25 %	0 %	157149464
111	NC_009788	TGGC	2	8	46039	46046	0 %	25 %	50 %	25 %	157149464
112	NC_009788	GAAA	2	8	46309	46316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009788	GGCC	2	8	46357	46364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009788	TTCT	2	8	47188	47195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009788	AATT	2	8	47809	47816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009788	GCCT	2	8	48101	48108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009788	AATA	2	8	48515	48522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009788	CGGA	2	8	48658	48665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009788	GTCA	2	8	49095	49102	25 %	25 %	25 %	25 %	157149485
120	NC_009788	GGCA	2	8	49547	49554	25 %	0 %	50 %	25 %	157149485
121	NC_009788	GGCA	2	8	50209	50216	25 %	0 %	50 %	25 %	157149492
122	NC_009788	GGAA	2	8	51030	51037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009788	TTAC	2	8	51209	51216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009788	GGGC	2	8	51234	51241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009788	GTCT	2	8	51265	51272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009788	GCAA	2	8	51645	51652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009788	CAGG	2	8	51696	51703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009788	GCTG	2	8	51757	51764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009788	TGGC	2	8	51973	51980	0 %	25 %	50 %	25 %	157149465
130	NC_009788	CTGG	2	8	53127	53134	0 %	25 %	50 %	25 %	157149465
131	NC_009788	GTAT	2	8	53666	53673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009788	GTGG	2	8	53846	53853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009788	GACA	2	8	54860	54867	50 %	0 %	25 %	25 %	157149444
134	NC_009788	AGAT	2	8	55073	55080	50 %	25 %	25 %	0 %	157149444
135	NC_009788	TTGA	2	8	55090	55097	25 %	50 %	25 %	0 %	157149444
136	NC_009788	CTTC	2	8	55856	55863	0 %	50 %	0 %	50 %	157149495
137	NC_009788	TTGT	2	8	55966	55973	0 %	75 %	25 %	0 %	157149495
138	NC_009788	CAGC	2	8	56691	56698	25 %	0 %	25 %	50 %	157149495
139	NC_009788	CAAA	2	8	56733	56740	75 %	0 %	0 %	25 %	157149495
140	NC_009788	CTTT	2	8	56996	57003	0 %	75 %	0 %	25 %	157149495
141	NC_009788	GCCA	2	8	57159	57166	25 %	0 %	25 %	50 %	157149495
142	NC_009788	CCAT	2	8	57596	57603	25 %	25 %	0 %	50 %	157149495
143	NC_009788	GTTT	2	8	57737	57744	0 %	75 %	25 %	0 %	157149495
144	NC_009788	GGCA	2	8	57870	57877	25 %	0 %	50 %	25 %	157149495
145	NC_009788	CGAA	2	8	58404	58411	50 %	0 %	25 %	25 %	157149495
146	NC_009788	AACA	2	8	58559	58566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.