MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	GCAG	2	8	1386	1393	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
2	NC_009786	GCTG	2	8	1664	1671	0 %	25 %	50 %	25 %	157149386
3	NC_009786	GATT	2	8	1971	1978	25 %	50 %	25 %	0 %	157149386
4	NC_009786	GACG	2	8	2277	2284	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
5	NC_009786	TGAG	2	8	2360	2367	25 %	25 %	50 %	0 %	157149386
6	NC_009786	CCGT	2	8	2392	2399	0 %	25 %	25 %	50 %	157149386
7	NC_009786	CTGT	2	8	2687	2694	0 %	50 %	25 %	25 %	157149386
8	NC_009786	CGGC	2	8	3436	3443	0 %	0 %	50 %	50 %	157149388
9	NC_009786	TTTA	2	8	3477	3484	25 %	75 %	0 %	0 %	157149388
10	NC_009786	GCAT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	157149388
11	NC_009786	GTAG	2	8	4034	4041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009786	TTAT	2	8	4145	4152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009786	GCCA	2	8	4421	4428	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
14	NC_009786	GCCA	2	8	4916	4923	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
15	NC_009786	TTCT	2	8	4936	4943	0 %	75 %	0 %	25 %	157149373
16	NC_009786	ATCC	2	8	5212	5219	25 %	25 %	0 %	50 %	157149373
17	NC_009786	ACTG	2	8	5448	5455	25 %	25 %	25 %	25 %	157149373
18	NC_009786	GAAA	2	8	5599	5606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009786	CTTT	2	8	5739	5746	0 %	75 %	0 %	25 %	157149387
20	NC_009786	CCAG	2	8	5911	5918	25 %	0 %	25 %	50 %	157149387
21	NC_009786	CAAT	2	8	6529	6536	50 %	25 %	0 %	25 %	157149387
22	NC_009786	ATTG	2	8	7019	7026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009786	AACC	2	8	7455	7462	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
24	NC_009786	ATTA	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
25	NC_009786	AATG	2	8	7874	7881	50 %	25 %	25 %	0 %	157149363
26	NC_009786	GTAT	2	8	8062	8069	25 %	50 %	25 %	0 %	157149363
27	NC_009786	TAAT	2	8	8078	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
28	NC_009786	TTGT	2	8	8148	8155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009786	GAAA	2	8	8278	8285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009786	TTCA	2	8	9766	9773	25 %	50 %	0 %	25 %	157149359
31	NC_009786	GCAA	2	8	9943	9950	50 %	0 %	25 %	25 %	157149359
32	NC_009786	GATT	2	8	10083	10090	25 %	50 %	25 %	0 %	157149357
33	NC_009786	TGTC	2	8	10182	10189	0 %	50 %	25 %	25 %	157149357
34	NC_009786	TTTC	2	8	11375	11382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009786	GACC	2	8	11923	11930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009786	TGCC	2	8	12138	12145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009786	TTAT	2	8	12192	12199	25 %	75 %	0 %	0 %	157149340
38	NC_009786	AATC	2	8	12898	12905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009786	ACCG	2	8	13294	13301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009786	CCAC	2	8	13464	13471	25 %	0 %	0 %	75 %	157149335
41	NC_009786	ATAC	2	8	13644	13651	50 %	25 %	0 %	25 %	157149335
42	NC_009786	GCCA	2	8	14182	14189	25 %	0 %	25 %	50 %	157149350
43	NC_009786	CAGC	2	8	15335	15342	25 %	0 %	25 %	50 %	157149350
44	NC_009786	GCCA	2	8	15551	15558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009786	CCTG	2	8	15614	15621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009786	CTTG	2	8	15664	15671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009786	CAGA	2	8	16044	16051	50 %	0 %	25 %	25 %	157149347
48	NC_009786	GCCC	2	8	16076	16083	0 %	0 %	25 %	75 %	157149347
49	NC_009786	GTAA	2	8	16101	16108	50 %	25 %	25 %	0 %	157149347
50	NC_009786	CCAC	2	8	16115	16122	25 %	0 %	0 %	75 %	157149347
51	NC_009786	CTTT	2	8	16498	16505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009786	TGAT	2	8	17102	17109	25 %	50 %	25 %	0 %	157149353
53	NC_009786	ATCA	2	8	17342	17349	50 %	25 %	0 %	25 %	157149353
54	NC_009786	TCAG	2	8	17379	17386	25 %	25 %	25 %	25 %	157149353
55	NC_009786	TTTA	2	8	17444	17451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009786	GGCA	2	8	17576	17583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009786	TCTG	2	8	18866	18873	0 %	50 %	25 %	25 %	157149384
58	NC_009786	TAAG	2	8	20594	20601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009786	CCTG	2	8	20900	20907	0 %	25 %	25 %	50 %	157149342
60	NC_009786	GAAC	2	8	21671	21678	50 %	0 %	25 %	25 %	157149342
61	NC_009786	ACGC	2	8	21968	21975	25 %	0 %	25 %	50 %	157149342
62	NC_009786	TCAG	2	8	22237	22244	25 %	25 %	25 %	25 %	157149342
63	NC_009786	CTGG	2	8	22546	22553	0 %	25 %	50 %	25 %	157149342
64	NC_009786	CAGA	2	8	23555	23562	50 %	0 %	25 %	25 %	157149352
65	NC_009786	CCGT	2	8	23775	23782	0 %	25 %	25 %	50 %	157149352
66	NC_009786	GTCT	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	157149356
67	NC_009786	AGTG	2	8	24124	24131	25 %	25 %	50 %	0 %	157149356
68	NC_009786	GGCG	2	8	24507	24514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009786	CTGT	2	8	24808	24815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009786	GGGC	2	8	24861	24868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009786	TGCC	2	8	25081	25088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009786	ACTG	2	8	25150	25157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009786	GTGG	2	8	26021	26028	0 %	25 %	75 %	0 %	157149337
74	NC_009786	GCCT	2	8	26170	26177	0 %	25 %	25 %	50 %	157149337
75	NC_009786	CAGC	2	8	26806	26813	25 %	0 %	25 %	50 %	157149366
76	NC_009786	TGAA	2	8	26853	26860	50 %	25 %	25 %	0 %	157149366
77	NC_009786	CAGC	2	8	27075	27082	25 %	0 %	25 %	50 %	157149366
78	NC_009786	ATGC	2	8	27201	27208	25 %	25 %	25 %	25 %	157149366
79	NC_009786	TGCC	2	8	27808	27815	0 %	25 %	25 %	50 %	229220657
80	NC_009786	CCTC	2	8	27956	27963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_009786	GAAA	2	8	28015	28022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009786	AATG	2	8	28079	28086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009786	TGGA	2	8	28173	28180	25 %	25 %	50 %	0 %	157149362
84	NC_009786	GGAA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	50 %	0 %	157149362
85	NC_009786	TAAA	2	8	28287	28294	75 %	25 %	0 %	0 %	157149362
86	NC_009786	ACCG	2	8	28502	28509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009786	TCAC	2	8	28567	28574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009786	CAGA	2	8	28880	28887	50 %	0 %	25 %	25 %	157149379
89	NC_009786	TGTC	2	8	29525	29532	0 %	50 %	25 %	25 %	157149391
90	NC_009786	GCCA	2	8	29896	29903	25 %	0 %	25 %	50 %	157149391
91	NC_009786	AGGC	2	8	29953	29960	25 %	0 %	50 %	25 %	157149391
92	NC_009786	CAGA	2	8	30315	30322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009786	TGGC	2	8	30631	30638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009786	TACC	2	8	31256	31263	25 %	25 %	0 %	50 %	157149394
95	NC_009786	CCGA	2	8	31299	31306	25 %	0 %	25 %	50 %	157149394
96	NC_009786	ACAG	2	8	31396	31403	50 %	0 %	25 %	25 %	157149394
97	NC_009786	CAGA	2	8	31491	31498	50 %	0 %	25 %	25 %	157149394
98	NC_009786	GCAG	2	8	31542	31549	25 %	0 %	50 %	25 %	157149394
99	NC_009786	CATT	2	8	32034	32041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009786	GACA	2	8	32075	32082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009786	GGGT	2	8	32460	32467	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009786	CGAA	2	8	33164	33171	50 %	0 %	25 %	25 %	157149336
103	NC_009786	AATC	2	8	33888	33895	50 %	25 %	0 %	25 %	157149370
104	NC_009786	TGAT	2	8	34408	34415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009786	GCTG	2	8	34820	34827	0 %	25 %	50 %	25 %	157149355
106	NC_009786	CTGA	2	8	35324	35331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009786	ACTG	2	8	35455	35462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009786	AATC	2	8	35537	35544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009786	AGCA	2	8	35775	35782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009786	GCCC	2	8	35880	35887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009786	TGAA	2	8	35918	35925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009786	ACTG	2	8	36385	36392	25 %	25 %	25 %	25 %	157149376
113	NC_009786	CAAC	2	8	37490	37497	50 %	0 %	0 %	50 %	157149369
114	NC_009786	CATT	2	8	37510	37517	25 %	50 %	0 %	25 %	157149369
115	NC_009786	GCCA	2	8	37611	37618	25 %	0 %	25 %	50 %	157149369
116	NC_009786	TCCT	2	8	37712	37719	0 %	50 %	0 %	50 %	157149369
117	NC_009786	CATT	2	8	38304	38311	25 %	50 %	0 %	25 %	157149338
118	NC_009786	ATAA	2	8	38328	38335	75 %	25 %	0 %	0 %	157149338
119	NC_009786	CTCC	2	8	38978	38985	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_009786	AGTA	2	8	39013	39020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009786	TTTA	2	8	39233	39240	25 %	75 %	0 %	0 %	157149364
122	NC_009786	GCGG	2	8	39473	39480	0 %	0 %	75 %	25 %	157149364
123	NC_009786	CAGC	2	8	39723	39730	25 %	0 %	25 %	50 %	157149364
124	NC_009786	CATT	2	8	39857	39864	25 %	50 %	0 %	25 %	157149349
125	NC_009786	CATC	2	8	40031	40038	25 %	25 %	0 %	50 %	157149349
126	NC_009786	AGTC	2	8	40270	40277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009786	AGTG	2	8	41252	41259	25 %	25 %	50 %	0 %	157149395
128	NC_009786	GCCA	2	8	41450	41457	25 %	0 %	25 %	50 %	157149395
129	NC_009786	CAGC	2	8	41504	41511	25 %	0 %	25 %	50 %	157149395
130	NC_009786	CAGG	2	8	41566	41573	25 %	0 %	50 %	25 %	157149395
131	NC_009786	CTGA	2	8	42387	42394	25 %	25 %	25 %	25 %	157149346
132	NC_009786	ATCA	2	8	42681	42688	50 %	25 %	0 %	25 %	157149346
133	NC_009786	AACA	2	8	42778	42785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009786	GATG	2	8	43134	43141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009786	GCTT	2	8	43729	43736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009786	CAGG	2	8	44059	44066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009786	TGAA	2	8	44358	44365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009786	GTCT	2	8	44519	44526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009786	CGGT	2	8	44987	44994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009786	TGAT	2	8	45382	45389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009786	TCTG	2	8	45628	45635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009786	GAAC	2	8	46330	46337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009786	GCCA	2	8	46361	46368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009786	CGTC	2	8	46539	46546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009786	TCAA	2	8	46990	46997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009786	CTGG	2	8	47308	47315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.