MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 12352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	CAGA	2	8	137	144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008563	CAGG	2	8	400	407	25 %	0 %	50 %	25 %	229775982
3	NC_008563	ACCA	2	8	446	453	50 %	0 %	0 %	50 %	229775982
4	NC_008563	CCAG	2	8	1983	1990	25 %	0 %	25 %	50 %	229775982
5	NC_008563	GCAA	2	8	3010	3017	50 %	0 %	25 %	25 %	117622297
6	NC_008563	ATGA	2	8	3108	3115	50 %	25 %	25 %	0 %	117622297
7	NC_008563	TTCA	2	8	3408	3415	25 %	50 %	0 %	25 %	117622297
8	NC_008563	AGCG	2	8	3545	3552	25 %	0 %	50 %	25 %	117622297
9	NC_008563	CTGA	2	8	3831	3838	25 %	25 %	25 %	25 %	117622298
10	NC_008563	GATG	2	8	4613	4620	25 %	25 %	50 %	0 %	117622298
11	NC_008563	AGCC	2	8	4623	4630	25 %	0 %	25 %	50 %	117622298
12	NC_008563	CAGT	2	8	5633	5640	25 %	25 %	25 %	25 %	117622300
13	NC_008563	AGCG	2	8	6137	6144	25 %	0 %	50 %	25 %	117622300
14	NC_008563	ACGC	2	8	6477	6484	25 %	0 %	25 %	50 %	117622301
15	NC_008563	GCCA	2	8	7094	7101	25 %	0 %	25 %	50 %	117622301
16	NC_008563	CAGG	2	8	7167	7174	25 %	0 %	50 %	25 %	117622301
17	NC_008563	GCAT	2	8	7823	7830	25 %	25 %	25 %	25 %	117622301
18	NC_008563	GGCG	2	8	7954	7961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008563	CAAC	2	8	8202	8209	50 %	0 %	0 %	50 %	162317588
20	NC_008563	TTGA	2	8	8255	8262	25 %	50 %	25 %	0 %	162317588
21	NC_008563	CGAC	2	8	8322	8329	25 %	0 %	25 %	50 %	162317588
22	NC_008563	AAGA	2	8	8678	8685	75 %	0 %	25 %	0 %	162317588
23	NC_008563	CTGT	2	8	9107	9114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008563	AGAT	2	8	10032	10039	50 %	25 %	25 %	0 %	117622304
25	NC_008563	AGAA	2	8	10306	10313	75 %	0 %	25 %	0 %	117622304
26	NC_008563	GAAT	2	8	10553	10560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008563	GCAG	2	8	10709	10716	25 %	0 %	50 %	25 %	117622305
28	NC_008563	CATT	2	8	11387	11394	25 %	50 %	0 %	25 %	117622305
29	NC_008563	CAGT	2	8	11534	11541	25 %	25 %	25 %	25 %	117622306
30	NC_008563	AAAT	2	8	11606	11613	75 %	25 %	0 %	0 %	117622306
31	NC_008563	ATTC	2	8	11944	11951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008563	AGTG	2	8	12086	12093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008563	ATGG	2	8	12249	12256	25 %	25 %	50 %	0 %	117622307
34	NC_008563	TGGT	2	8	12340	12347	0 %	50 %	50 %	0 %	117622307
35	NC_008563	ACCG	2	8	12707	12714	25 %	0 %	25 %	50 %	117622307
36	NC_008563	CAAC	2	8	12853	12860	50 %	0 %	0 %	50 %	117622307
37	NC_008563	AAGA	2	8	12927	12934	75 %	0 %	25 %	0 %	117622307
38	NC_008563	CCAT	2	8	13504	13511	25 %	25 %	0 %	50 %	117622307
39	NC_008563	GACA	2	8	15717	15724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008563	AATC	2	8	15814	15821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008563	CTTT	2	8	16509	16516	0 %	75 %	0 %	25 %	117622309
42	NC_008563	AATC	2	8	16637	16644	50 %	25 %	0 %	25 %	117622309
43	NC_008563	ACAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	117622309
44	NC_008563	CGGG	2	8	17226	17233	0 %	0 %	75 %	25 %	117622310
45	NC_008563	GGCT	2	8	17529	17536	0 %	25 %	50 %	25 %	117622310
46	NC_008563	CTGG	2	8	17606	17613	0 %	25 %	50 %	25 %	117622310
47	NC_008563	ATTT	2	8	17746	17753	25 %	75 %	0 %	0 %	117622310
48	NC_008563	GGAT	2	8	17960	17967	25 %	25 %	50 %	0 %	117622310
49	NC_008563	ATCG	2	8	18279	18286	25 %	25 %	25 %	25 %	117622310
50	NC_008563	AAAG	2	8	19052	19059	75 %	0 %	25 %	0 %	117622311
51	NC_008563	TTAC	2	8	19298	19305	25 %	50 %	0 %	25 %	117622311
52	NC_008563	GTTG	2	8	20314	20321	0 %	50 %	50 %	0 %	117622312
53	NC_008563	CTGG	2	8	20777	20784	0 %	25 %	50 %	25 %	117622312
54	NC_008563	CGTT	2	8	21238	21245	0 %	50 %	25 %	25 %	117622312
55	NC_008563	TTTA	2	8	21410	21417	25 %	75 %	0 %	0 %	117622313
56	NC_008563	CGAT	2	8	21779	21786	25 %	25 %	25 %	25 %	117622313
57	NC_008563	CCTG	2	8	21877	21884	0 %	25 %	25 %	50 %	117622313
58	NC_008563	CATA	2	8	22932	22939	50 %	25 %	0 %	25 %	117622314
59	NC_008563	TGCG	2	8	23188	23195	0 %	25 %	50 %	25 %	117622314
60	NC_008563	GCGT	2	8	23396	23403	0 %	25 %	50 %	25 %	117622314
61	NC_008563	CCGC	2	8	23819	23826	0 %	0 %	25 %	75 %	117622314
62	NC_008563	CTGG	2	8	24176	24183	0 %	25 %	50 %	25 %	117622315
63	NC_008563	CTGC	2	8	24637	24644	0 %	25 %	25 %	50 %	117622315
64	NC_008563	TGCG	2	8	25187	25194	0 %	25 %	50 %	25 %	117622315
65	NC_008563	GCTG	2	8	26746	26753	0 %	25 %	50 %	25 %	117622316
66	NC_008563	ATGG	2	8	27626	27633	25 %	25 %	50 %	0 %	117622317
67	NC_008563	TTGA	2	8	28497	28504	25 %	50 %	25 %	0 %	117622318
68	NC_008563	TGGC	2	8	29040	29047	0 %	25 %	50 %	25 %	117622319
69	NC_008563	TGCG	2	8	29118	29125	0 %	25 %	50 %	25 %	117622319
70	NC_008563	CTGG	2	8	29500	29507	0 %	25 %	50 %	25 %	117622319
71	NC_008563	TCTG	2	8	29827	29834	0 %	50 %	25 %	25 %	117622320
72	NC_008563	ATTT	2	8	29915	29922	25 %	75 %	0 %	0 %	117622320
73	NC_008563	TCCC	2	8	30136	30143	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_008563	TGGC	2	8	30177	30184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008563	CGTG	2	8	30876	30883	0 %	25 %	50 %	25 %	117622321
76	NC_008563	CATG	2	8	31346	31353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008563	AGTG	2	8	31496	31503	25 %	25 %	50 %	0 %	117622322
78	NC_008563	TCCT	2	8	31658	31665	0 %	50 %	0 %	50 %	117622322
79	NC_008563	CTTA	2	8	31686	31693	25 %	50 %	0 %	25 %	117622322
80	NC_008563	AGCC	2	8	32588	32595	25 %	0 %	25 %	50 %	117622322
81	NC_008563	GACC	2	8	32854	32861	25 %	0 %	25 %	50 %	117622323
82	NC_008563	CGCA	2	8	33854	33861	25 %	0 %	25 %	50 %	117622323
83	NC_008563	CTGT	2	8	34028	34035	0 %	50 %	25 %	25 %	117622323
84	NC_008563	GCGT	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
85	NC_008563	CGTC	2	8	34832	34839	0 %	25 %	25 %	50 %	117622323
86	NC_008563	TGGC	2	8	35295	35302	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
87	NC_008563	GCTG	2	8	35308	35315	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
88	NC_008563	GTAA	2	8	36586	36593	50 %	25 %	25 %	0 %	117622324
89	NC_008563	TATT	2	8	36695	36702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008563	GGTG	2	8	36950	36957	0 %	25 %	75 %	0 %	117622325
91	NC_008563	AAGA	2	8	37185	37192	75 %	0 %	25 %	0 %	117622325
92	NC_008563	TCAC	2	8	37551	37558	25 %	25 %	0 %	50 %	117622326
93	NC_008563	CCAT	2	8	37671	37678	25 %	25 %	0 %	50 %	117622326
94	NC_008563	CAAT	2	8	37909	37916	50 %	25 %	0 %	25 %	117622326
95	NC_008563	ATTT	2	8	38885	38892	25 %	75 %	0 %	0 %	117622328
96	NC_008563	TTCT	2	8	38897	38904	0 %	75 %	0 %	25 %	117622328
97	NC_008563	TTCA	2	8	39028	39035	25 %	50 %	0 %	25 %	117622328
98	NC_008563	AGCC	2	8	39242	39249	25 %	0 %	25 %	50 %	117622328
99	NC_008563	GCCC	2	8	39403	39410	0 %	0 %	25 %	75 %	117622328
100	NC_008563	TCGG	2	8	39876	39883	0 %	25 %	50 %	25 %	117622328
101	NC_008563	GGCG	2	8	40155	40162	0 %	0 %	75 %	25 %	117622328
102	NC_008563	GGGC	2	8	40473	40480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008563	TGAC	2	8	40496	40503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008563	CCAT	2	8	40688	40695	25 %	25 %	0 %	50 %	117622329
105	NC_008563	TGAT	2	8	40710	40717	25 %	50 %	25 %	0 %	117622329
106	NC_008563	AGGC	2	8	41241	41248	25 %	0 %	50 %	25 %	117622329
107	NC_008563	CCGA	2	8	42326	42333	25 %	0 %	25 %	50 %	117622330
108	NC_008563	CCCG	2	8	42722	42729	0 %	0 %	25 %	75 %	117622330
109	NC_008563	TCCA	2	8	42774	42781	25 %	25 %	0 %	50 %	117622330
110	NC_008563	TTAA	2	8	43027	43034	50 %	50 %	0 %	0 %	117622331
111	NC_008563	TATC	2	8	43420	43427	25 %	50 %	0 %	25 %	117622331
112	NC_008563	CACG	2	8	43510	43517	25 %	0 %	25 %	50 %	117622331
113	NC_008563	CACC	2	8	43571	43578	25 %	0 %	0 %	75 %	117622331
114	NC_008563	AGCC	2	8	44138	44145	25 %	0 %	25 %	50 %	117622331
115	NC_008563	CCAG	2	8	44338	44345	25 %	0 %	25 %	50 %	117622331
116	NC_008563	ATTT	2	8	44572	44579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008563	GTTT	2	8	44589	44596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008563	GTGC	2	8	45041	45048	0 %	25 %	50 %	25 %	117622332
119	NC_008563	TGAT	2	8	45277	45284	25 %	50 %	25 %	0 %	117622332
120	NC_008563	CTGC	2	8	45537	45544	0 %	25 %	25 %	50 %	117622332
121	NC_008563	ATGG	2	8	46510	46517	25 %	25 %	50 %	0 %	117622333
122	NC_008563	GTTA	2	8	46887	46894	25 %	50 %	25 %	0 %	117622334
123	NC_008563	CGAG	2	8	46896	46903	25 %	0 %	50 %	25 %	117622334
124	NC_008563	CACC	2	8	47438	47445	25 %	0 %	0 %	75 %	117622334
125	NC_008563	ATTG	2	8	47685	47692	25 %	50 %	25 %	0 %	117622334
126	NC_008563	TGTT	2	8	49160	49167	0 %	75 %	25 %	0 %	117622335
127	NC_008563	CTGG	2	8	49425	49432	0 %	25 %	50 %	25 %	117622335
128	NC_008563	TGCG	2	8	50630	50637	0 %	25 %	50 %	25 %	117622337
129	NC_008563	ATGA	2	8	50785	50792	50 %	25 %	25 %	0 %	117622337
130	NC_008563	GGCG	2	8	50949	50956	0 %	0 %	75 %	25 %	117622337
131	NC_008563	GGCG	2	8	51126	51133	0 %	0 %	75 %	25 %	117622337
132	NC_008563	GGAT	2	8	51740	51747	25 %	25 %	50 %	0 %	117622337
133	NC_008563	AACC	2	8	51810	51817	50 %	0 %	0 %	50 %	117622337
134	NC_008563	CAGG	2	8	51907	51914	25 %	0 %	50 %	25 %	117622337
135	NC_008563	TGGC	2	8	52173	52180	0 %	25 %	50 %	25 %	117622337
136	NC_008563	TGTT	2	8	52283	52290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008563	CCTG	2	8	52508	52515	0 %	25 %	25 %	50 %	117622338
138	NC_008563	TAAA	2	8	52546	52553	75 %	25 %	0 %	0 %	117622338
139	NC_008563	CTCA	2	8	53574	53581	25 %	25 %	0 %	50 %	117622339
140	NC_008563	GCAG	2	8	53633	53640	25 %	0 %	50 %	25 %	117622339
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