MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008563	GCC	2	6	49168	49173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622335
1003	NC_008563	GTG	2	6	49279	49284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622335
1004	NC_008563	CCG	2	6	49315	49320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622335
1005	NC_008563	TTG	2	6	49354	49359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622335
1006	NC_008563	ATG	2	6	49375	49380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622335
1007	NC_008563	CGCTGG	2	12	49382	49393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117622335
1008	NC_008563	CTGG	2	8	49425	49432	0 %	25 %	50 %	25 %	117622335
1009	NC_008563	AAT	2	6	49606	49611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622335
1010	NC_008563	TTG	2	6	49663	49668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622335
1011	NC_008563	TC	3	6	49768	49773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_008563	ATT	2	6	49788	49793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008563	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008563	ATT	2	6	49897	49902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622336
1015	NC_008563	CT	3	6	49961	49966	0 %	50 %	0 %	50 %	117622336
1016	NC_008563	GCC	2	6	50001	50006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622336
1017	NC_008563	AGG	2	6	50011	50016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622336
1018	NC_008563	GCA	2	6	50045	50050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622336
1019	NC_008563	CTT	2	6	50079	50084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622336
1020	NC_008563	CGG	2	6	50132	50137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622336
1021	NC_008563	GAC	2	6	50174	50179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622336
1022	NC_008563	CGG	2	6	50180	50185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622336
1023	NC_008563	TGCAC	2	10	50296	50305	20 %	20 %	20 %	40 %	117622336
1024	NC_008563	GAC	2	6	50316	50321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622336
1025	NC_008563	CTG	2	6	50361	50366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622336
1026	NC_008563	AGG	2	6	50374	50379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622336
1027	NC_008563	CAT	2	6	50382	50387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622336
1028	NC_008563	CGG	2	6	50429	50434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1029	NC_008563	CAT	2	6	50502	50507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622337
1030	NC_008563	GTG	2	6	50572	50577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622337
1031	NC_008563	TAT	2	6	50589	50594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622337
1032	NC_008563	TGCG	2	8	50630	50637	0 %	25 %	50 %	25 %	117622337
1033	NC_008563	CGG	2	6	50646	50651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1034	NC_008563	GCG	2	6	50675	50680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1035	NC_008563	CTG	2	6	50683	50688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1036	NC_008563	TCA	2	6	50758	50763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622337
1037	NC_008563	ATGA	2	8	50785	50792	50 %	25 %	25 %	0 %	117622337
1038	NC_008563	TGC	2	6	50837	50842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1039	NC_008563	TGG	2	6	50870	50875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622337
1040	NC_008563	GAT	2	6	50877	50882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622337
1041	NC_008563	CGA	3	9	50909	50917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1042	NC_008563	TC	3	6	50931	50936	0 %	50 %	0 %	50 %	117622337
1043	NC_008563	GGCG	2	8	50949	50956	0 %	0 %	75 %	25 %	117622337
1044	NC_008563	CGCTGG	2	12	50957	50968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117622337
1045	NC_008563	TTG	2	6	51011	51016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622337
1046	NC_008563	TGC	2	6	51080	51085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1047	NC_008563	CGATGG	2	12	51104	51115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117622337
1048	NC_008563	GGCG	2	8	51126	51133	0 %	0 %	75 %	25 %	117622337
1049	NC_008563	CTG	2	6	51136	51141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1050	NC_008563	TGC	2	6	51197	51202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1051	NC_008563	TGC	2	6	51281	51286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1052	NC_008563	TCA	3	9	51296	51304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622337
1053	NC_008563	GTA	2	6	51406	51411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622337
1054	NC_008563	GCG	2	6	51418	51423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1055	NC_008563	GGC	2	6	51489	51494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1056	NC_008563	CTG	2	6	51505	51510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1057	NC_008563	TCT	2	6	51535	51540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622337
1058	NC_008563	CGA	2	6	51570	51575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1059	NC_008563	TGG	2	6	51659	51664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622337
1060	NC_008563	GGAT	2	8	51740	51747	25 %	25 %	50 %	0 %	117622337
1061	NC_008563	GCG	2	6	51766	51771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1062	NC_008563	CGA	2	6	51798	51803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622337
1063	NC_008563	AACC	2	8	51810	51817	50 %	0 %	0 %	50 %	117622337
1064	NC_008563	ATT	2	6	51862	51867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622337
1065	NC_008563	GCCCGC	2	12	51868	51879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622337
1066	NC_008563	CAGG	2	8	51907	51914	25 %	0 %	50 %	25 %	117622337
1067	NC_008563	CCG	2	6	52026	52031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622337
1068	NC_008563	TGG	2	6	52046	52051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622337
1069	NC_008563	GCG	2	6	52090	52095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622337
1070	NC_008563	TGGC	2	8	52173	52180	0 %	25 %	50 %	25 %	117622337
1071	NC_008563	GAA	2	6	52189	52194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622337
1072	NC_008563	TAA	2	6	52246	52251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622337
1073	NC_008563	TGTT	2	8	52283	52290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008563	GCG	2	6	52307	52312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622338
1075	NC_008563	GA	3	6	52321	52326	50 %	0 %	50 %	0 %	117622338
1076	NC_008563	CAG	2	6	52339	52344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622338
1077	NC_008563	CAT	2	6	52364	52369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622338
1078	NC_008563	CGA	2	6	52382	52387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622338
1079	NC_008563	T	8	8	52418	52425	0 %	100 %	0 %	0 %	117622338
1080	NC_008563	GCG	2	6	52455	52460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622338
1081	NC_008563	CCTG	2	8	52508	52515	0 %	25 %	25 %	50 %	117622338
1082	NC_008563	TAAA	2	8	52546	52553	75 %	25 %	0 %	0 %	117622338
1083	NC_008563	GCC	2	6	52567	52572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622338
1084	NC_008563	GTC	2	6	52591	52596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622338
1085	NC_008563	CAG	2	6	52625	52630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622338
1086	NC_008563	GCG	2	6	52686	52691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622338
1087	NC_008563	GGC	2	6	52722	52727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622338
1088	NC_008563	ACG	2	6	52861	52866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622338
1089	NC_008563	GCG	2	6	52910	52915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622338
1090	NC_008563	CA	3	6	53022	53027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_008563	ACCGTC	2	12	53035	53046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_008563	A	6	6	53128	53133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008563	GCA	2	6	53137	53142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008563	TGA	2	6	53196	53201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008563	TGA	2	6	53217	53222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008563	CGC	2	6	53276	53281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008563	TTG	2	6	53314	53319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008563	CCA	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_008563	GC	3	6	53501	53506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_008563	CTCA	2	8	53574	53581	25 %	25 %	0 %	50 %	117622339
1101	NC_008563	GCAG	2	8	53633	53640	25 %	0 %	50 %	25 %	117622339
1102	NC_008563	ACC	2	6	53649	53654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622339
1103	NC_008563	CAG	3	9	53656	53664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1104	NC_008563	TGT	2	6	53735	53740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622339
1105	NC_008563	GAA	2	6	53949	53954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622339
1106	NC_008563	CG	4	8	53990	53997	0 %	0 %	50 %	50 %	117622339
1107	NC_008563	GCG	2	6	54026	54031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622339
1108	NC_008563	GCA	2	6	54077	54082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1109	NC_008563	AGC	2	6	54106	54111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1110	NC_008563	TCG	2	6	54112	54117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1111	NC_008563	CAG	2	6	54132	54137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1112	NC_008563	CAG	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1113	NC_008563	CG	4	8	54278	54285	0 %	0 %	50 %	50 %	117622339
1114	NC_008563	GCA	2	6	54341	54346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622339
1115	NC_008563	AAC	2	6	54365	54370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622339
1116	NC_008563	AATG	2	8	54410	54417	50 %	25 %	25 %	0 %	117622340
1117	NC_008563	GCCATT	2	12	54615	54626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117622340
1118	NC_008563	CAA	2	6	54648	54653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622340
1119	NC_008563	AACGT	2	10	54702	54711	40 %	20 %	20 %	20 %	117622340
1120	NC_008563	AC	3	6	54762	54767	50 %	0 %	0 %	50 %	117622340
1121	NC_008563	ATC	2	6	54781	54786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622340
1122	NC_008563	ACG	2	6	54944	54949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622341
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1124	NC_008563	ACG	2	6	55035	55040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622341
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1126	NC_008563	CGG	2	6	55076	55081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622341
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1249	NC_008563	CAG	2	6	61314	61319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622345
1250	NC_008563	AGC	2	6	61336	61341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622345
1251	NC_008563	AGC	2	6	61425	61430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_008563	GCG	2	6	61460	61465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_008563	CAA	2	6	61586	61591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622346
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1257	NC_008563	GCTCGC	2	12	61894	61905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	117622346
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1273	NC_008563	CTG	2	6	62440	62445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622347
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1361	NC_008563	GCA	2	6	66901	66906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622348
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1368	NC_008563	GGCG	2	8	67269	67276	0 %	0 %	75 %	25 %	117622348
1369	NC_008563	TCA	2	6	67330	67335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622348
1370	NC_008563	GCG	2	6	67399	67404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622348
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