MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008563	CAT	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622315
502	NC_008563	A	6	6	24031	24036	100 %	0 %	0 %	0 %	117622315
503	NC_008563	A	7	7	24040	24046	100 %	0 %	0 %	0 %	117622315
504	NC_008563	ATG	2	6	24059	24064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622315
505	NC_008563	CCT	2	6	24067	24072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622315
506	NC_008563	CTGG	2	8	24176	24183	0 %	25 %	50 %	25 %	117622315
507	NC_008563	CCG	2	6	24251	24256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622315
508	NC_008563	CAT	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622315
509	NC_008563	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
510	NC_008563	ATC	2	6	24412	24417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622315
511	NC_008563	ACC	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622315
512	NC_008563	CTGC	2	8	24637	24644	0 %	25 %	25 %	50 %	117622315
513	NC_008563	GAC	2	6	24919	24924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622315
514	NC_008563	GTT	2	6	25053	25058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622315
515	NC_008563	TGC	2	6	25111	25116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
516	NC_008563	ATC	2	6	25135	25140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622315
517	NC_008563	CG	3	6	25144	25149	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
518	NC_008563	CGC	2	6	25151	25156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622315
519	NC_008563	TGCG	2	8	25187	25194	0 %	25 %	50 %	25 %	117622315
520	NC_008563	TC	3	6	25289	25294	0 %	50 %	0 %	50 %	117622315
521	NC_008563	AGA	2	6	25344	25349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622315
522	NC_008563	GAA	2	6	25378	25383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622315
523	NC_008563	GTG	2	6	25419	25424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622315
524	NC_008563	CGA	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622315
525	NC_008563	GTT	2	6	25528	25533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622315
526	NC_008563	TGA	2	6	25619	25624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622315
527	NC_008563	CGC	2	6	25733	25738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622315
528	NC_008563	TGA	2	6	25745	25750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622315
529	NC_008563	TGC	2	6	25839	25844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
530	NC_008563	TCG	2	6	25854	25859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
531	NC_008563	CG	3	6	25872	25877	0 %	0 %	50 %	50 %	117622315
532	NC_008563	CTG	2	6	25882	25887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
533	NC_008563	TGG	2	6	25940	25945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622315
534	NC_008563	CAT	2	6	26085	26090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622315
535	NC_008563	CGT	2	6	26131	26136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
536	NC_008563	TGA	2	6	26211	26216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622315
537	NC_008563	GGC	2	6	26395	26400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622315
538	NC_008563	GGC	2	6	26442	26447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622315
539	NC_008563	ACG	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622315
540	NC_008563	CTG	2	6	26528	26533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
541	NC_008563	CAG	2	6	26539	26544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622315
542	NC_008563	GCT	2	6	26606	26611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622315
543	NC_008563	CGGTGA	2	12	26685	26696	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117622315
544	NC_008563	TGA	2	6	26713	26718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622315
545	NC_008563	GCTG	2	8	26746	26753	0 %	25 %	50 %	25 %	117622316
546	NC_008563	TGG	2	6	26758	26763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622316
547	NC_008563	GCA	2	6	26788	26793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622316
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549	NC_008563	GCG	2	6	26905	26910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622316
550	NC_008563	TGA	2	6	26968	26973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622316
551	NC_008563	ATT	2	6	27024	27029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622316
552	NC_008563	GGC	2	6	27030	27035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622316
553	NC_008563	T	6	6	27179	27184	0 %	100 %	0 %	0 %	117622316
554	NC_008563	A	6	6	27198	27203	100 %	0 %	0 %	0 %	117622316
555	NC_008563	AAT	2	6	27205	27210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622316
556	NC_008563	GATGC	2	10	27222	27231	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_008563	TGC	2	6	27258	27263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008563	GAT	2	6	27374	27379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622317
559	NC_008563	CAC	2	6	27382	27387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622317
560	NC_008563	CAA	2	6	27403	27408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622317
561	NC_008563	CTG	2	6	27470	27475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622317
562	NC_008563	ACC	2	6	27497	27502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622317
563	NC_008563	GCG	2	6	27521	27526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622317
564	NC_008563	CCG	2	6	27565	27570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622317
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569	NC_008563	CGT	2	6	28098	28103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622318
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573	NC_008563	TGG	2	6	28420	28425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622318
574	NC_008563	CTC	2	6	28439	28444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622318
575	NC_008563	GC	3	6	28487	28492	0 %	0 %	50 %	50 %	117622318
576	NC_008563	TTGA	2	8	28497	28504	25 %	50 %	25 %	0 %	117622318
577	NC_008563	CTG	2	6	28561	28566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622318
578	NC_008563	CAG	2	6	28614	28619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622318
579	NC_008563	GAA	2	6	28656	28661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622318
580	NC_008563	AGC	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008563	T	6	6	28767	28772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008563	GCC	2	6	28841	28846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622319
583	NC_008563	TGA	2	6	28878	28883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622319
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585	NC_008563	CTG	2	6	28937	28942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622319
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591	NC_008563	CTG	2	6	29238	29243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622319
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593	NC_008563	ACG	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622319
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595	NC_008563	CTGGAT	2	12	29636	29647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	117622319
596	NC_008563	TAA	3	9	29696	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622319
597	NC_008563	TCTG	2	8	29827	29834	0 %	50 %	25 %	25 %	117622320
598	NC_008563	TGG	2	6	29850	29855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622320
599	NC_008563	T	8	8	29893	29900	0 %	100 %	0 %	0 %	117622320
600	NC_008563	ATTT	2	8	29915	29922	25 %	75 %	0 %	0 %	117622320
601	NC_008563	GTG	2	6	29993	29998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622320
602	NC_008563	TGC	2	6	30051	30056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622320
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604	NC_008563	TGGC	2	8	30177	30184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_008563	ATG	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622321
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621	NC_008563	TGT	2	6	31213	31218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008563	T	6	6	31249	31254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008563	TCT	2	6	31278	31283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008563	TGC	2	6	31284	31289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008563	CATG	2	8	31346	31353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_008563	ATA	2	6	31363	31368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_008563	GCC	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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754	NC_008563	CAA	2	6	37642	37647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622326
755	NC_008563	CT	3	6	37650	37655	0 %	50 %	0 %	50 %	117622326
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