MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

Total Repeats: 1229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007799	TATAA	2	10	975	984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007799	TATCA	2	10	1160	1169	40 %	40 %	0 %	20 %	88658505
3	NC_007799	ACTAT	2	10	1843	1852	40 %	40 %	0 %	20 %	88658005
4	NC_007799	TAATA	2	10	3674	3683	60 %	40 %	0 %	0 %	88657649
5	NC_007799	GAAAA	2	10	4043	4052	80 %	0 %	20 %	0 %	88657649
6	NC_007799	GGCAA	2	10	4296	4305	40 %	0 %	40 %	20 %	88657649
7	NC_007799	AATGA	2	10	5645	5654	60 %	20 %	20 %	0 %	88658160
8	NC_007799	AAAAT	2	10	6124	6133	80 %	20 %	0 %	0 %	88658160
9	NC_007799	AGTGA	2	10	6220	6229	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007799	TACCA	2	10	7218	7227	40 %	20 %	0 %	40 %	88657820
11	NC_007799	TGTCT	2	10	7693	7702	0 %	60 %	20 %	20 %	88657571
12	NC_007799	CAAAA	2	10	7829	7838	80 %	0 %	0 %	20 %	88657571
13	NC_007799	CTTTT	2	10	8354	8363	0 %	80 %	0 %	20 %	88657571
14	NC_007799	TTATA	2	10	8738	8747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007799	CAAAG	2	10	9982	9991	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007799	CTGCA	2	10	11652	11661	20 %	20 %	20 %	40 %	88657880
17	NC_007799	GTTAT	2	10	13008	13017	20 %	60 %	20 %	0 %	88657800
18	NC_007799	ACAAT	2	10	17139	17148	60 %	20 %	0 %	20 %	88657937
19	NC_007799	AGCAA	2	10	17641	17650	60 %	0 %	20 %	20 %	88657937
20	NC_007799	CATGT	2	10	22384	22393	20 %	40 %	20 %	20 %	88657578
21	NC_007799	ATATC	2	10	23219	23228	40 %	40 %	0 %	20 %	88658330
22	NC_007799	GAAAA	2	10	24499	24508	80 %	0 %	20 %	0 %	88658210
23	NC_007799	TGTAA	2	10	26775	26784	40 %	40 %	20 %	0 %	88657828
24	NC_007799	ACTAA	2	10	28356	28365	60 %	20 %	0 %	20 %	88657926
25	NC_007799	AGAAT	2	10	29331	29340	60 %	20 %	20 %	0 %	88658099
26	NC_007799	ATCAT	2	10	29707	29716	40 %	40 %	0 %	20 %	88658099
27	NC_007799	TAATA	2	10	30221	30230	60 %	40 %	0 %	0 %	88657644
28	NC_007799	AATAT	2	10	31031	31040	60 %	40 %	0 %	0 %	88658129
29	NC_007799	AGAAA	2	10	31635	31644	80 %	0 %	20 %	0 %	88657840
30	NC_007799	TCATT	2	10	31791	31800	20 %	60 %	0 %	20 %	88657840
31	NC_007799	ATCAT	2	10	32243	32252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007799	TACTG	2	10	32659	32668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007799	ATCAG	2	10	33742	33751	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
34	NC_007799	ATCAG	2	10	33982	33991	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
35	NC_007799	ATCAG	2	10	34222	34231	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
36	NC_007799	ATCAG	2	10	34462	34471	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
37	NC_007799	TTTAT	2	10	35028	35037	20 %	80 %	0 %	0 %	88658043
38	NC_007799	TTACT	2	10	35047	35056	20 %	60 %	0 %	20 %	88658043
39	NC_007799	TGAAT	2	10	36045	36054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007799	ATCCA	2	10	37550	37559	40 %	20 %	0 %	40 %	88657566
41	NC_007799	ATACT	2	10	37944	37953	40 %	40 %	0 %	20 %	88657566
42	NC_007799	TATTT	2	10	40186	40195	20 %	80 %	0 %	0 %	88658039
43	NC_007799	ACAAA	2	10	45527	45536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007799	TTTTA	2	10	45877	45886	20 %	80 %	0 %	0 %	88658257
45	NC_007799	ATAGT	2	10	47691	47700	40 %	40 %	20 %	0 %	88658071
46	NC_007799	GTTGT	2	10	48436	48445	0 %	60 %	40 %	0 %	88658248
47	NC_007799	TTGAT	2	10	49479	49488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007799	TTATT	2	10	49530	49539	20 %	80 %	0 %	0 %	88657931
49	NC_007799	TAAAG	2	10	49989	49998	60 %	20 %	20 %	0 %	88657931
50	NC_007799	AAGTA	2	10	52348	52357	60 %	20 %	20 %	0 %	88657848
51	NC_007799	ATTTT	2	10	54357	54366	20 %	80 %	0 %	0 %	88658181
52	NC_007799	GAAAA	2	10	55232	55241	80 %	0 %	20 %	0 %	88658514
53	NC_007799	CTATA	2	10	55749	55758	40 %	40 %	0 %	20 %	88658514
54	NC_007799	GTAAG	2	10	56041	56050	40 %	20 %	40 %	0 %	88658514
55	NC_007799	AATGT	2	10	56089	56098	40 %	40 %	20 %	0 %	88658514
56	NC_007799	ATTTT	2	10	57258	57267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007799	AGCAA	2	10	57551	57560	60 %	0 %	20 %	20 %	88658323
58	NC_007799	GTAAA	2	10	57757	57766	60 %	20 %	20 %	0 %	88658323
59	NC_007799	AATTA	2	10	61563	61572	60 %	40 %	0 %	0 %	88658657
60	NC_007799	TTATT	2	10	61982	61991	20 %	80 %	0 %	0 %	88658044
61	NC_007799	TATGA	2	10	62226	62235	40 %	40 %	20 %	0 %	88658044
62	NC_007799	CTTTA	2	10	63475	63484	20 %	60 %	0 %	20 %	88658635
63	NC_007799	TTGTT	2	10	63549	63558	0 %	80 %	20 %	0 %	88658635
64	NC_007799	TGAAC	2	10	64081	64090	40 %	20 %	20 %	20 %	88658635
65	NC_007799	TATAG	2	10	64216	64225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007799	ATATT	2	10	64256	64265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007799	GTATA	2	10	64390	64399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007799	CTTTA	2	10	64681	64690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007799	TTTAA	2	10	64917	64926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007799	TATGC	2	10	66309	66318	20 %	40 %	20 %	20 %	88657868
71	NC_007799	TGTTT	2	10	67250	67259	0 %	80 %	20 %	0 %	88658291
72	NC_007799	TGCTT	2	10	67672	67681	0 %	60 %	20 %	20 %	88658291
73	NC_007799	ATGTA	2	10	67821	67830	40 %	40 %	20 %	0 %	88658291
74	NC_007799	TAATA	2	10	68346	68355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007799	TCCAA	2	10	69130	69139	40 %	20 %	0 %	40 %	88658104
76	NC_007799	CTGTG	2	10	69246	69255	0 %	40 %	40 %	20 %	88658104
77	NC_007799	TCTAT	2	10	72691	72700	20 %	60 %	0 %	20 %	88658019
78	NC_007799	TTTGG	2	10	73023	73032	0 %	60 %	40 %	0 %	88658019
79	NC_007799	ATTGG	2	10	73568	73577	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007799	ATGTA	2	10	73724	73733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007799	TAAAA	2	10	75232	75241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007799	ATTAT	2	10	76097	76106	40 %	60 %	0 %	0 %	88658302
83	NC_007799	AATTT	2	10	76687	76696	40 %	60 %	0 %	0 %	88658167
84	NC_007799	TGTAT	2	10	76757	76766	20 %	60 %	20 %	0 %	88658167
85	NC_007799	CTTGT	2	10	77487	77496	0 %	60 %	20 %	20 %	88658224
86	NC_007799	TGTAT	2	10	78369	78378	20 %	60 %	20 %	0 %	88658224
87	NC_007799	TGTAT	2	10	78646	78655	20 %	60 %	20 %	0 %	88658224
88	NC_007799	ATTTT	2	10	79956	79965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007799	AGTGT	2	10	79998	80007	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007799	ATTTT	2	10	80266	80275	20 %	80 %	0 %	0 %	88658390
91	NC_007799	AAATA	2	10	80940	80949	80 %	20 %	0 %	0 %	88658390
92	NC_007799	TATTT	2	10	86124	86133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007799	CCTAG	2	10	86300	86309	20 %	20 %	20 %	40 %	161486751
94	NC_007799	AAATA	2	10	87269	87278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007799	AATTG	2	10	87528	87537	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007799	ATATT	2	10	89572	89581	40 %	60 %	0 %	0 %	88658267
97	NC_007799	AAGAT	2	10	90883	90892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007799	AAGGC	2	10	91174	91183	40 %	0 %	40 %	20 %	88658533
99	NC_007799	TGTTT	2	10	92597	92606	0 %	80 %	20 %	0 %	88657757
100	NC_007799	AATAG	2	10	92656	92665	60 %	20 %	20 %	0 %	88657757
101	NC_007799	TAATG	2	10	93375	93384	40 %	40 %	20 %	0 %	88657757
102	NC_007799	AAGGG	2	10	95210	95219	40 %	0 %	60 %	0 %	88657565
103	NC_007799	AGAGA	2	10	95742	95751	60 %	0 %	40 %	0 %	88657565
104	NC_007799	TGGTT	2	10	97887	97896	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007799	TAAAT	3	15	98480	98494	60 %	40 %	0 %	0 %	88658262
106	NC_007799	AAGAG	2	10	99136	99145	60 %	0 %	40 %	0 %	88657907
107	NC_007799	TGTAA	2	10	100752	100761	40 %	40 %	20 %	0 %	88657907
108	NC_007799	CCAGA	2	10	104381	104390	40 %	0 %	20 %	40 %	88657659
109	NC_007799	TGTAG	2	10	107786	107795	20 %	40 %	40 %	0 %	88658059
110	NC_007799	ACTTC	2	10	108978	108987	20 %	40 %	0 %	40 %	88658055
111	NC_007799	TGTAG	2	10	109920	109929	20 %	40 %	40 %	0 %	88658530
112	NC_007799	ATTAC	2	10	111600	111609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007799	TTATT	2	10	112743	112752	20 %	80 %	0 %	0 %	88657897
114	NC_007799	TATGG	2	10	114092	114101	20 %	40 %	40 %	0 %	88658400
115	NC_007799	TTTAT	2	10	114264	114273	20 %	80 %	0 %	0 %	88658400
116	NC_007799	TAATG	2	10	114460	114469	40 %	40 %	20 %	0 %	88658400
117	NC_007799	TGATA	2	10	116328	116337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007799	GTAAT	2	10	117168	117177	40 %	40 %	20 %	0 %	88658053
119	NC_007799	AAGGG	2	10	118737	118746	40 %	0 %	60 %	0 %	88658307
120	NC_007799	TAAAG	2	10	120396	120405	60 %	20 %	20 %	0 %	88658063
121	NC_007799	AGGTG	2	10	120816	120825	20 %	20 %	60 %	0 %	88657691
122	NC_007799	GTTGG	2	10	121096	121105	0 %	40 %	60 %	0 %	88657691
123	NC_007799	ATACT	2	10	123212	123221	40 %	40 %	0 %	20 %	88658144
124	NC_007799	GTATT	2	10	123597	123606	20 %	60 %	20 %	0 %	88658487
125	NC_007799	AAGTC	2	10	123618	123627	40 %	20 %	20 %	20 %	88658487
126	NC_007799	TTTTA	2	10	124439	124448	20 %	80 %	0 %	0 %	88658365
127	NC_007799	TGAAT	2	10	124545	124554	40 %	40 %	20 %	0 %	88658365
128	NC_007799	TTCTA	2	10	127319	127328	20 %	60 %	0 %	20 %	88657620
129	NC_007799	GTTGG	2	10	131042	131051	0 %	40 %	60 %	0 %	88658320
130	NC_007799	ATGTA	2	10	134484	134493	40 %	40 %	20 %	0 %	88658293
131	NC_007799	ATGCA	2	10	134633	134642	40 %	20 %	20 %	20 %	88658293
132	NC_007799	TTTAT	2	10	134858	134867	20 %	80 %	0 %	0 %	88658597
133	NC_007799	TTTAT	2	10	135263	135272	20 %	80 %	0 %	0 %	88658597
134	NC_007799	ATCAT	2	10	135284	135293	40 %	40 %	0 %	20 %	88658597
135	NC_007799	TATTT	2	10	140935	140944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007799	GTTGT	2	10	141810	141819	0 %	60 %	40 %	0 %	88658341
137	NC_007799	TAGTG	2	10	142147	142156	20 %	40 %	40 %	0 %	88658341
138	NC_007799	GTTTG	2	10	143596	143605	0 %	60 %	40 %	0 %	88658109
139	NC_007799	TTTAA	2	10	144828	144837	40 %	60 %	0 %	0 %	88658109
140	NC_007799	TACAT	2	10	145694	145703	40 %	40 %	0 %	20 %	88658475
141	NC_007799	TAAAT	2	10	146370	146379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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