MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

Total Repeats: 3018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007779	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	388476125
2	NC_007779	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	388476126
3	NC_007779	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	388476131
4	NC_007779	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	388476132
5	NC_007779	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	388476134
6	NC_007779	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007779	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	388476141
8	NC_007779	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	388476141
9	NC_007779	GATGC	2	10	25714	25723	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007779	CAGTA	2	10	26673	26682	40 %	20 %	20 %	20 %	388476151
11	NC_007779	GCGCT	2	10	28474	28483	0 %	20 %	40 %	40 %	388476153
12	NC_007779	ATTTA	2	10	29230	29239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007779	CGATG	2	10	31527	31536	20 %	20 %	40 %	20 %	388476155
14	NC_007779	GCGAA	2	10	32468	32477	40 %	0 %	40 %	20 %	388476155
15	NC_007779	CCGTT	2	10	33362	33371	0 %	40 %	20 %	40 %	388476155
16	NC_007779	CACGG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	40 %	40 %	388476155
17	NC_007779	CGAAT	2	10	36449	36458	40 %	20 %	20 %	20 %	388476159
18	NC_007779	CCATG	2	10	37987	37996	20 %	20 %	20 %	40 %	388476160
19	NC_007779	TTCAG	2	10	38169	38178	20 %	40 %	20 %	20 %	388476160
20	NC_007779	CCGTA	2	10	39633	39642	20 %	20 %	20 %	40 %	388476161
21	NC_007779	TTAAA	2	10	40371	40380	60 %	40 %	0 %	0 %	388476161
22	NC_007779	ACCCA	2	10	41114	41123	40 %	0 %	0 %	60 %	388476162
23	NC_007779	TGATC	2	10	42741	42750	20 %	40 %	20 %	20 %	388476163
24	NC_007779	CGGCG	2	10	42990	42999	0 %	0 %	60 %	40 %	388476163
25	NC_007779	AATCA	2	10	43272	43281	60 %	20 %	0 %	20 %	388476164
26	NC_007779	CGGTT	2	10	44227	44236	0 %	40 %	40 %	20 %	388476165
27	NC_007779	TGGCG	2	10	45917	45926	0 %	20 %	60 %	20 %	388476167
28	NC_007779	TGCAC	2	10	47679	47688	20 %	20 %	20 %	40 %	388476168
29	NC_007779	AGGGC	2	10	48764	48773	20 %	0 %	60 %	20 %	388476169
30	NC_007779	GGCGC	2	10	48798	48807	0 %	0 %	60 %	40 %	388476169
31	NC_007779	GAAAC	2	10	49611	49620	60 %	0 %	20 %	20 %	388476169
32	NC_007779	AACGT	2	10	51523	51532	40 %	20 %	20 %	20 %	388476172
33	NC_007779	GCGTC	2	10	54507	54516	0 %	20 %	40 %	40 %	388476175
34	NC_007779	ATGTT	2	10	55321	55330	20 %	60 %	20 %	0 %	388476176
35	NC_007779	CTTCG	2	10	55754	55763	0 %	40 %	20 %	40 %	388476176
36	NC_007779	TGCGT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	40 %	20 %	388476176
37	NC_007779	AAAGT	2	10	63165	63174	60 %	20 %	20 %	0 %	388476181
38	NC_007779	GGTGA	2	10	65413	65422	20 %	20 %	60 %	0 %	388476182
39	NC_007779	CAGCG	2	10	66866	66875	20 %	0 %	40 %	40 %	388476184
40	NC_007779	TCGCG	2	10	68136	68145	0 %	20 %	40 %	40 %	388476184
41	NC_007779	GCTGA	2	10	68515	68524	20 %	20 %	40 %	20 %	388476185
42	NC_007779	TAGTG	2	10	75614	75623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007779	GATGG	2	10	76502	76511	20 %	20 %	60 %	0 %	388476191
44	NC_007779	ATTTT	2	10	77330	77339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007779	CTGGA	2	10	78402	78411	20 %	20 %	40 %	20 %	388476192
46	NC_007779	CTGGT	2	10	81695	81704	0 %	40 %	40 %	20 %	388476195
47	NC_007779	GACCG	2	10	82243	82252	20 %	0 %	40 %	40 %	388476196
48	NC_007779	ATGTT	2	10	84792	84801	20 %	60 %	20 %	0 %	388476198
49	NC_007779	AAAAC	2	10	85207	85216	80 %	0 %	0 %	20 %	388476198
50	NC_007779	ATTCC	2	10	85904	85913	20 %	40 %	0 %	40 %	388476199
51	NC_007779	AGTTC	2	10	90997	91006	20 %	40 %	20 %	20 %	388476203
52	NC_007779	CGTGG	2	10	92370	92379	0 %	20 %	60 %	20 %	388476205
53	NC_007779	TATCG	2	10	92877	92886	20 %	40 %	20 %	20 %	388476205
54	NC_007779	GCCTG	2	10	97209	97218	0 %	20 %	40 %	40 %	388476209
55	NC_007779	ACCGT	2	10	99122	99131	20 %	20 %	20 %	40 %	388476210
56	NC_007779	ATCAG	2	10	100895	100904	40 %	20 %	20 %	20 %	388476212
57	NC_007779	AGCCG	2	10	102663	102672	20 %	0 %	40 %	40 %	388476213
58	NC_007779	GCGCA	2	10	104991	105000	20 %	0 %	40 %	40 %	388476215
59	NC_007779	TGGCG	2	10	105985	105994	0 %	20 %	60 %	20 %	388476216
60	NC_007779	CCGGC	2	10	108955	108964	0 %	0 %	40 %	60 %	388476219
61	NC_007779	CGCGG	2	10	112280	112289	0 %	0 %	60 %	40 %	388476222
62	NC_007779	ATCCC	2	10	114524	114533	20 %	20 %	0 %	60 %	388476225
63	NC_007779	CATCG	2	10	114537	114546	20 %	20 %	20 %	40 %	388476225
64	NC_007779	TAACG	2	10	115231	115240	40 %	20 %	20 %	20 %	388476225
65	NC_007779	ATGCC	2	10	115690	115699	20 %	20 %	20 %	40 %	388476225
66	NC_007779	AATGC	2	10	116973	116982	40 %	20 %	20 %	20 %	388476226
67	NC_007779	TCTGT	2	10	117919	117928	0 %	60 %	20 %	20 %	388476228
68	NC_007779	GCATG	2	10	119012	119021	20 %	20 %	40 %	20 %	388476229
69	NC_007779	AGCAG	2	10	120350	120359	40 %	0 %	40 %	20 %	388476231
70	NC_007779	TCAGC	2	10	121218	121227	20 %	20 %	20 %	40 %	388476231
71	NC_007779	CGAAG	2	10	122265	122274	40 %	0 %	40 %	20 %	388476232
72	NC_007779	ACACG	2	10	122398	122407	40 %	0 %	20 %	40 %	388476232
73	NC_007779	TCGCG	2	10	122659	122668	0 %	20 %	40 %	40 %	388476232
74	NC_007779	GCATC	2	10	122749	122758	20 %	20 %	20 %	40 %	388476232
75	NC_007779	GACTG	2	10	124067	124076	20 %	20 %	40 %	20 %	388476233
76	NC_007779	AGAGC	2	10	124477	124486	40 %	0 %	40 %	20 %	388476233
77	NC_007779	AGGCG	2	10	129749	129758	20 %	0 %	60 %	20 %	388476236
78	NC_007779	AGGCG	2	10	129845	129854	20 %	0 %	60 %	20 %	388476236
79	NC_007779	GGTTG	2	10	130502	130511	0 %	40 %	60 %	0 %	388476236
80	NC_007779	TCTGG	2	10	133148	133157	0 %	40 %	40 %	20 %	388476237
81	NC_007779	GGGCA	2	10	134560	134569	20 %	0 %	60 %	20 %	388476238
82	NC_007779	CAGCG	2	10	134839	134848	20 %	0 %	40 %	40 %	388476239
83	NC_007779	GCGCG	2	10	141033	141042	0 %	0 %	60 %	40 %	388476243
84	NC_007779	CCGTC	2	10	141824	141833	0 %	20 %	20 %	60 %	388476244
85	NC_007779	GTGAA	2	10	141834	141843	40 %	20 %	40 %	0 %	388476244
86	NC_007779	GGCAT	2	10	141996	142005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007779	GTTCA	2	10	142221	142230	20 %	40 %	20 %	20 %	388476245
88	NC_007779	ATCCA	2	10	142547	142556	40 %	20 %	0 %	40 %	388476245
89	NC_007779	GTAAG	2	10	142760	142769	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007779	CTTTA	2	10	143810	143819	20 %	60 %	0 %	20 %	388476247
91	NC_007779	TGGCG	2	10	144037	144046	0 %	20 %	60 %	20 %	388476247
92	NC_007779	TCCTC	2	10	144480	144489	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_007779	TTTCA	2	10	146350	146359	20 %	60 %	0 %	20 %	388476250
94	NC_007779	GGGAG	2	10	147675	147684	20 %	0 %	80 %	0 %	388476251
95	NC_007779	GAAAA	2	10	150469	150478	80 %	0 %	20 %	0 %	388476254
96	NC_007779	CAGAC	2	10	150545	150554	40 %	0 %	20 %	40 %	388476254
97	NC_007779	TTTGC	2	10	156615	156624	0 %	60 %	20 %	20 %	388476260
98	NC_007779	AAATT	2	10	157056	157065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007779	GCGAG	2	10	158423	158432	20 %	0 %	60 %	20 %	388476262
100	NC_007779	GGCGT	2	10	158861	158870	0 %	20 %	60 %	20 %	388476262
101	NC_007779	ATCAG	2	10	159499	159508	40 %	20 %	20 %	20 %	388476263
102	NC_007779	ACCAC	2	10	161764	161773	40 %	0 %	0 %	60 %	388476266
103	NC_007779	GGCGT	2	10	163467	163476	0 %	20 %	60 %	20 %	388476267
104	NC_007779	CGACG	2	10	164506	164515	20 %	0 %	40 %	40 %	388476267
105	NC_007779	CTGCG	2	10	166642	166651	0 %	20 %	40 %	40 %	388476268
106	NC_007779	TTATC	2	10	167418	167427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007779	AAAAC	2	10	168493	168502	80 %	0 %	0 %	20 %	388476269
108	NC_007779	TGGTT	2	10	168750	168759	0 %	60 %	40 %	0 %	388476269
109	NC_007779	AACCT	2	10	170831	170840	40 %	20 %	0 %	40 %	388476271
110	NC_007779	TGGTC	2	10	170873	170882	0 %	40 %	40 %	20 %	388476271
111	NC_007779	TGGCG	2	10	172118	172127	0 %	20 %	60 %	20 %	388476272
112	NC_007779	CGGCG	2	10	172748	172757	0 %	0 %	60 %	40 %	388476272
113	NC_007779	CGGCG	2	10	172829	172838	0 %	0 %	60 %	40 %	388476272
114	NC_007779	TTCCA	2	10	173359	173368	20 %	40 %	0 %	40 %	388476272
115	NC_007779	GGTCC	2	10	177805	177814	0 %	20 %	40 %	40 %	388476277
116	NC_007779	ACGGG	2	10	179722	179731	20 %	0 %	60 %	20 %	388476279
117	NC_007779	GTGAT	2	10	181881	181890	20 %	40 %	40 %	0 %	388476280
118	NC_007779	GTGAT	2	10	182172	182181	20 %	40 %	40 %	0 %	388476280
119	NC_007779	TACGT	2	10	182417	182426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007779	TGGCC	2	10	184142	184151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007779	CCACG	2	10	184319	184328	20 %	0 %	20 %	60 %	388476283
122	NC_007779	GCCAG	2	10	186604	186613	20 %	0 %	40 %	40 %	388476285
123	NC_007779	GTTCT	2	10	188045	188054	0 %	60 %	20 %	20 %	388476285
124	NC_007779	CTGAA	2	10	190037	190046	40 %	20 %	20 %	20 %	388476287
125	NC_007779	AAGCG	2	10	190101	190110	40 %	0 %	40 %	20 %	388476287
126	NC_007779	TGGTG	2	10	192007	192016	0 %	40 %	60 %	0 %	388476289
127	NC_007779	TGCAC	2	10	192133	192142	20 %	20 %	20 %	40 %	388476289
128	NC_007779	TGCGC	2	10	192526	192535	0 %	20 %	40 %	40 %	388476289
129	NC_007779	AAATA	2	10	192748	192757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007779	GTCTG	2	10	192833	192842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007779	CATGG	2	10	194369	194378	20 %	20 %	40 %	20 %	388476291
132	NC_007779	CAGAT	2	10	195408	195417	40 %	20 %	20 %	20 %	388476292
133	NC_007779	ACTTT	2	10	195541	195550	20 %	60 %	0 %	20 %	388476292
134	NC_007779	GACGT	2	10	199461	199470	20 %	20 %	40 %	20 %	388476295
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