MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	GA	3	6	50	55	50 %	0 %	50 %	0 %	75994448
2	NC_007414	TG	3	6	401	406	0 %	50 %	50 %	0 %	75994448
3	NC_007414	AG	4	8	576	583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007414	GT	3	6	1087	1092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007414	AT	3	6	1159	1164	50 %	50 %	0 %	0 %	75994450
6	NC_007414	TG	3	6	1200	1205	0 %	50 %	50 %	0 %	75994450
7	NC_007414	TG	4	8	2729	2736	0 %	50 %	50 %	0 %	75994453
8	NC_007414	GC	3	6	3541	3546	0 %	0 %	50 %	50 %	75994455
9	NC_007414	CA	3	6	4312	4317	50 %	0 %	0 %	50 %	75994456
10	NC_007414	CT	3	6	4592	4597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007414	CA	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	75994458
12	NC_007414	TG	4	8	5372	5379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007414	TG	3	6	5855	5860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007414	TG	3	6	6480	6485	0 %	50 %	50 %	0 %	75994460
15	NC_007414	TG	3	6	6863	6868	0 %	50 %	50 %	0 %	75994461
16	NC_007414	TA	3	6	8364	8369	50 %	50 %	0 %	0 %	75994463
17	NC_007414	AT	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	75994463
18	NC_007414	TA	3	6	9876	9881	50 %	50 %	0 %	0 %	75994464
19	NC_007414	AG	4	8	10325	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	75994465
20	NC_007414	GC	3	6	10432	10437	0 %	0 %	50 %	50 %	75994465
21	NC_007414	AC	3	6	11188	11193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007414	CT	3	6	11256	11261	0 %	50 %	0 %	50 %	75994466
23	NC_007414	CA	4	8	11616	11623	50 %	0 %	0 %	50 %	75994466
24	NC_007414	TG	3	6	13013	13018	0 %	50 %	50 %	0 %	75994466
25	NC_007414	AT	3	6	13257	13262	50 %	50 %	0 %	0 %	75994466
26	NC_007414	AT	3	6	13573	13578	50 %	50 %	0 %	0 %	75994466
27	NC_007414	GC	3	6	14099	14104	0 %	0 %	50 %	50 %	75994466
28	NC_007414	CA	4	8	14493	14500	50 %	0 %	0 %	50 %	75994466
29	NC_007414	GA	3	6	15208	15213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007414	TC	3	6	17064	17069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007414	TG	3	6	17247	17252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007414	TG	3	6	18523	18528	0 %	50 %	50 %	0 %	75994473
33	NC_007414	GC	3	6	19383	19388	0 %	0 %	50 %	50 %	75994474
34	NC_007414	TC	3	6	19626	19631	0 %	50 %	0 %	50 %	75994474
35	NC_007414	AG	3	6	19667	19672	50 %	0 %	50 %	0 %	75994474
36	NC_007414	TA	3	6	19728	19733	50 %	50 %	0 %	0 %	75994474
37	NC_007414	TA	3	6	19773	19778	50 %	50 %	0 %	0 %	75994474
38	NC_007414	GA	3	6	20039	20044	50 %	0 %	50 %	0 %	75994474
39	NC_007414	TG	3	6	21291	21296	0 %	50 %	50 %	0 %	75994475
40	NC_007414	GA	3	6	21320	21325	50 %	0 %	50 %	0 %	75994475
41	NC_007414	AC	3	6	22175	22180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007414	CT	3	6	22571	22576	0 %	50 %	0 %	50 %	75994476
43	NC_007414	CA	3	6	22739	22744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007414	AT	3	6	22910	22915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007414	GA	3	6	23034	23039	50 %	0 %	50 %	0 %	75994477
46	NC_007414	AC	3	6	24734	24739	50 %	0 %	0 %	50 %	75994477
47	NC_007414	CA	3	6	25316	25321	50 %	0 %	0 %	50 %	75994477
48	NC_007414	TA	3	6	25702	25707	50 %	50 %	0 %	0 %	75994477
49	NC_007414	GC	3	6	25983	25988	0 %	0 %	50 %	50 %	75994478
50	NC_007414	GC	3	6	29583	29588	0 %	0 %	50 %	50 %	75994480
51	NC_007414	GC	3	6	29720	29725	0 %	0 %	50 %	50 %	75994480
52	NC_007414	CG	3	6	30330	30335	0 %	0 %	50 %	50 %	75994481
53	NC_007414	CG	3	6	30948	30953	0 %	0 %	50 %	50 %	75994481
54	NC_007414	CA	3	6	31243	31248	50 %	0 %	0 %	50 %	75994481
55	NC_007414	AG	3	6	32904	32909	50 %	0 %	50 %	0 %	75994485
56	NC_007414	GC	3	6	33233	33238	0 %	0 %	50 %	50 %	75994485
57	NC_007414	TG	3	6	36085	36090	0 %	50 %	50 %	0 %	75994489
58	NC_007414	AG	3	6	36608	36613	50 %	0 %	50 %	0 %	75994489
59	NC_007414	TA	3	6	37340	37345	50 %	50 %	0 %	0 %	75994490
60	NC_007414	TC	3	6	38367	38372	0 %	50 %	0 %	50 %	75994492
61	NC_007414	AG	3	6	38857	38862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007414	AT	3	6	39151	39156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007414	GA	3	6	39184	39189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007414	TA	3	6	39256	39261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007414	CT	3	6	39435	39440	0 %	50 %	0 %	50 %	75994493
66	NC_007414	AT	3	6	39508	39513	50 %	50 %	0 %	0 %	75994493
67	NC_007414	TA	3	6	39609	39614	50 %	50 %	0 %	0 %	75994493
68	NC_007414	TC	3	6	40214	40219	0 %	50 %	0 %	50 %	75994494
69	NC_007414	AT	3	6	40646	40651	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
70	NC_007414	CT	3	6	41144	41149	0 %	50 %	0 %	50 %	75994494
71	NC_007414	AT	3	6	41285	41290	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
72	NC_007414	AT	3	6	41477	41482	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
73	NC_007414	TA	3	6	41766	41771	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
74	NC_007414	AT	3	6	41986	41991	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
75	NC_007414	TA	3	6	42069	42074	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
76	NC_007414	AG	3	6	42418	42423	50 %	0 %	50 %	0 %	75994494
77	NC_007414	GA	3	6	42580	42585	50 %	0 %	50 %	0 %	75994494
78	NC_007414	TA	3	6	42630	42635	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
79	NC_007414	TA	3	6	42757	42762	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
80	NC_007414	CA	3	6	42785	42790	50 %	0 %	0 %	50 %	75994494
81	NC_007414	CA	4	8	42976	42983	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
82	NC_007414	TA	3	6	43117	43122	50 %	50 %	0 %	0 %	75994495
83	NC_007414	TC	3	6	43514	43519	0 %	50 %	0 %	50 %	75994495
84	NC_007414	GA	3	6	43613	43618	50 %	0 %	50 %	0 %	75994495
85	NC_007414	GA	3	6	44075	44080	50 %	0 %	50 %	0 %	75994495
86	NC_007414	TA	3	6	44422	44427	50 %	50 %	0 %	0 %	75994495
87	NC_007414	CA	3	6	44849	44854	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
88	NC_007414	CA	3	6	44922	44927	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
89	NC_007414	CA	3	6	45070	45075	50 %	0 %	0 %	50 %	75994496
90	NC_007414	GA	3	6	45090	45095	50 %	0 %	50 %	0 %	75994496
91	NC_007414	TA	3	6	46432	46437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007414	AT	3	6	46673	46678	50 %	50 %	0 %	0 %	75994497
93	NC_007414	AT	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	75994498
94	NC_007414	AT	3	6	46938	46943	50 %	50 %	0 %	0 %	75994498
95	NC_007414	TA	3	6	47062	47067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007414	TA	3	6	48284	48289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007414	TA	3	6	48332	48337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007414	CT	3	6	48894	48899	0 %	50 %	0 %	50 %	161367664
99	NC_007414	CA	3	6	49192	49197	50 %	0 %	0 %	50 %	161367664
100	NC_007414	GT	3	6	49614	49619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007414	TC	4	8	50571	50578	0 %	50 %	0 %	50 %	75994505
102	NC_007414	CG	3	6	50921	50926	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
103	NC_007414	CG	3	6	51070	51075	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
104	NC_007414	CG	3	6	51200	51205	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
105	NC_007414	GC	3	6	51820	51825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007414	AT	3	6	51845	51850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007414	AG	4	8	52139	52146	50 %	0 %	50 %	0 %	75994509
108	NC_007414	CT	3	6	52817	52822	0 %	50 %	0 %	50 %	75994510
109	NC_007414	TC	4	8	54039	54046	0 %	50 %	0 %	50 %	75994511
110	NC_007414	TC	3	6	54610	54615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007414	GT	3	6	55101	55106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007414	GC	3	6	56136	56141	0 %	0 %	50 %	50 %	75994514
113	NC_007414	GC	3	6	56680	56685	0 %	0 %	50 %	50 %	75994515
114	NC_007414	TC	3	6	57633	57638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007414	GT	3	6	58066	58071	0 %	50 %	50 %	0 %	75994516
116	NC_007414	GA	3	6	58812	58817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007414	TA	3	6	59188	59193	50 %	50 %	0 %	0 %	75994518
118	NC_007414	AT	3	6	59432	59437	50 %	50 %	0 %	0 %	75994518
119	NC_007414	CA	3	6	59802	59807	50 %	0 %	0 %	50 %	75994518
120	NC_007414	CA	3	6	60502	60507	50 %	0 %	0 %	50 %	75994518
121	NC_007414	AC	3	6	60881	60886	50 %	0 %	0 %	50 %	75994519
122	NC_007414	TG	3	6	61069	61074	0 %	50 %	50 %	0 %	75994519
123	NC_007414	TG	3	6	61086	61091	0 %	50 %	50 %	0 %	75994519
124	NC_007414	CA	3	6	62417	62422	50 %	0 %	0 %	50 %	75994520
125	NC_007414	TG	3	6	62469	62474	0 %	50 %	50 %	0 %	75994520
126	NC_007414	TG	3	6	62680	62685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007414	GC	3	6	63013	63018	0 %	0 %	50 %	50 %	75994521
128	NC_007414	CA	3	6	63273	63278	50 %	0 %	0 %	50 %	75994521
129	NC_007414	TC	3	6	64578	64583	0 %	50 %	0 %	50 %	75994523
130	NC_007414	CG	3	6	65647	65652	0 %	0 %	50 %	50 %	75994525
131	NC_007414	CA	3	6	66107	66112	50 %	0 %	0 %	50 %	75994525
132	NC_007414	GT	3	6	66245	66250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007414	CG	3	6	66951	66956	0 %	0 %	50 %	50 %	75994527
134	NC_007414	GA	3	6	67126	67131	50 %	0 %	50 %	0 %	75994527
135	NC_007414	GC	3	6	68334	68339	0 %	0 %	50 %	50 %	75994528
136	NC_007414	TG	3	6	68525	68530	0 %	50 %	50 %	0 %	75994528
137	NC_007414	CG	3	6	68917	68922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007414	GC	3	6	69928	69933	0 %	0 %	50 %	50 %	75994530
139	NC_007414	GA	3	6	70203	70208	50 %	0 %	50 %	0 %	75994531
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141	NC_007414	CG	3	6	71130	71135	0 %	0 %	50 %	50 %	161367665
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144	NC_007414	AC	3	6	72622	72627	50 %	0 %	0 %	50 %	75994533
145	NC_007414	TG	3	6	73832	73837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_007414	GT	4	8	73979	73986	0 %	50 %	50 %	0 %	75994535
148	NC_007414	GT	3	6	73992	73997	0 %	50 %	50 %	0 %	75994535
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.