MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 1678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58578666
2	NC_006832	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58578667
3	NC_006832	ACTAA	2	10	5562	5571	60 %	20 %	0 %	20 %	58578671
4	NC_006832	TAATT	2	10	6029	6038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006832	TAAAA	2	10	6126	6135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006832	TTGAT	2	10	6201	6210	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006832	CTATA	2	10	6962	6971	40 %	40 %	0 %	20 %	161598458
8	NC_006832	TTTAT	2	10	7699	7708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006832	TTTGT	2	10	8370	8379	0 %	80 %	20 %	0 %	58578673
10	NC_006832	ATATA	2	10	8475	8484	60 %	40 %	0 %	0 %	58578673
11	NC_006832	CTTAT	2	10	9638	9647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006832	ATGTA	2	10	11258	11267	40 %	40 %	20 %	0 %	58578676
13	NC_006832	TATAA	2	10	11983	11992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006832	GTAGA	2	10	14757	14766	40 %	20 %	40 %	0 %	58578678
15	NC_006832	TGGTA	2	10	15004	15013	20 %	40 %	40 %	0 %	58578678
16	NC_006832	TTTAT	2	10	17271	17280	20 %	80 %	0 %	0 %	58578680
17	NC_006832	TTGAC	2	10	17788	17797	20 %	40 %	20 %	20 %	58578681
18	NC_006832	CTATC	2	10	17846	17855	20 %	40 %	0 %	40 %	58578681
19	NC_006832	TTATT	2	10	18871	18880	20 %	80 %	0 %	0 %	58578682
20	NC_006832	TTAAT	2	10	19875	19884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006832	ATGTA	2	10	21730	21739	40 %	40 %	20 %	0 %	58578683
22	NC_006832	GTGTT	2	10	22110	22119	0 %	60 %	40 %	0 %	58578683
23	NC_006832	TGCCT	2	10	22228	22237	0 %	40 %	20 %	40 %	58578683
24	NC_006832	ATTTT	2	10	22447	22456	20 %	80 %	0 %	0 %	58578683
25	NC_006832	TTTAA	2	10	22573	22582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006832	ATACT	2	10	22940	22949	40 %	40 %	0 %	20 %	58578684
27	NC_006832	ATTTT	2	10	23030	23039	20 %	80 %	0 %	0 %	58578684
28	NC_006832	AATCA	2	10	24671	24680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006832	TAAAT	2	10	25306	25315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006832	TAGTT	2	10	27060	27069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006832	GATAC	2	10	27158	27167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006832	ATCAA	2	10	28441	28450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_006832	TTCTT	2	10	28638	28647	0 %	80 %	0 %	20 %	58578688
34	NC_006832	TATAA	2	10	28666	28675	60 %	40 %	0 %	0 %	58578688
35	NC_006832	TTTTA	2	10	28766	28775	20 %	80 %	0 %	0 %	58578688
36	NC_006832	TTTTA	2	10	28853	28862	20 %	80 %	0 %	0 %	58578688
37	NC_006832	TCTAT	2	10	30702	30711	20 %	60 %	0 %	20 %	58578691
38	NC_006832	ATTCT	2	10	30733	30742	20 %	60 %	0 %	20 %	58578691
39	NC_006832	CAAGC	2	10	32745	32754	40 %	0 %	20 %	40 %	58578693
40	NC_006832	TTTAT	2	10	33782	33791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006832	TATGA	2	10	34699	34708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006832	TTGAT	2	10	35959	35968	20 %	60 %	20 %	0 %	58578694
43	NC_006832	TTAAT	2	10	37582	37591	40 %	60 %	0 %	0 %	58578695
44	NC_006832	TAATA	2	10	38685	38694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006832	TGTAA	2	10	38960	38969	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006832	TGTAA	2	10	39214	39223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006832	TGTAA	2	10	39469	39478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006832	ATTTT	2	10	39694	39703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006832	ATGGT	2	10	40793	40802	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006832	ATTTC	2	10	41934	41943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006832	ATTTC	2	10	43883	43892	20 %	60 %	0 %	20 %	58578698
52	NC_006832	ATAGT	2	10	44102	44111	40 %	40 %	20 %	0 %	58578698
53	NC_006832	TTTTA	2	10	44317	44326	20 %	80 %	0 %	0 %	58578699
54	NC_006832	AGTTT	2	10	44849	44858	20 %	60 %	20 %	0 %	58578699
55	NC_006832	TTATA	2	10	44859	44868	40 %	60 %	0 %	0 %	58578699
56	NC_006832	TAACG	2	10	46052	46061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006832	TTTTG	2	10	46440	46449	0 %	80 %	20 %	0 %	58578701
58	NC_006832	TATGA	2	10	46786	46795	40 %	40 %	20 %	0 %	58578701
59	NC_006832	TTGTT	2	10	48297	48306	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006832	TTTAT	2	10	48762	48771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006832	TGGAG	2	10	49967	49976	20 %	20 %	60 %	0 %	58578703
62	NC_006832	ATGTA	2	10	52595	52604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006832	TGTAT	2	10	53021	53030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006832	AAACA	2	10	53777	53786	80 %	0 %	0 %	20 %	58578704
65	NC_006832	AAAAG	2	10	55532	55541	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006832	ATGCT	2	10	57797	57806	20 %	40 %	20 %	20 %	58578708
67	NC_006832	TTGAT	2	10	58381	58390	20 %	60 %	20 %	0 %	58578708
68	NC_006832	TTATA	2	10	59914	59923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006832	GTATG	2	10	61394	61403	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006832	AAGAT	2	10	61843	61852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006832	ATATT	2	10	62526	62535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006832	TGTAT	2	10	63682	63691	20 %	60 %	20 %	0 %	58578713
73	NC_006832	AATTT	2	10	64434	64443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006832	AAGTG	2	10	64706	64715	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006832	ACGAT	2	10	65015	65024	40 %	20 %	20 %	20 %	58578714
76	NC_006832	ACCAA	2	10	65680	65689	60 %	0 %	0 %	40 %	58578714
77	NC_006832	TTAAT	2	10	66917	66926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006832	TCTGA	2	10	69607	69616	20 %	40 %	20 %	20 %	58578716
79	NC_006832	ATTAC	2	10	69910	69919	40 %	40 %	0 %	20 %	58578716
80	NC_006832	AAATC	2	10	73462	73471	60 %	20 %	0 %	20 %	58578720
81	NC_006832	GTAAT	2	10	75470	75479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006832	GTTTT	2	10	76032	76041	0 %	80 %	20 %	0 %	58578722
83	NC_006832	TATGT	2	10	76373	76382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006832	ATATA	2	10	76539	76548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006832	TTATT	2	10	79048	79057	20 %	80 %	0 %	0 %	58578724
86	NC_006832	GAAAA	2	10	79589	79598	80 %	0 %	20 %	0 %	58578724
87	NC_006832	CATTA	2	10	80352	80361	40 %	40 %	0 %	20 %	58578724
88	NC_006832	TATGA	2	10	81684	81693	40 %	40 %	20 %	0 %	58578724
89	NC_006832	TCATA	2	10	82160	82169	40 %	40 %	0 %	20 %	58578724
90	NC_006832	AAAAT	2	10	82558	82567	80 %	20 %	0 %	0 %	58578724
91	NC_006832	AGTTT	2	10	83103	83112	20 %	60 %	20 %	0 %	58578724
92	NC_006832	ATCAC	2	10	83832	83841	40 %	20 %	0 %	40 %	58578724
93	NC_006832	AAGTA	2	10	84701	84710	60 %	20 %	20 %	0 %	58578724
94	NC_006832	TGTAT	2	10	85465	85474	20 %	60 %	20 %	0 %	58578724
95	NC_006832	ACTTT	2	10	85586	85595	20 %	60 %	0 %	20 %	58578724
96	NC_006832	GAACA	2	10	86257	86266	60 %	0 %	20 %	20 %	58578724
97	NC_006832	AAAAT	2	10	89113	89122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006832	AATCA	2	10	90739	90748	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_006832	TTATA	2	10	91474	91483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006832	TGTAA	2	10	92175	92184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006832	AAATT	2	10	93405	93414	60 %	40 %	0 %	0 %	58578726
102	NC_006832	GAGCA	2	10	93868	93877	40 %	0 %	40 %	20 %	58578726
103	NC_006832	GTATA	2	10	94111	94120	40 %	40 %	20 %	0 %	58578726
104	NC_006832	TAATG	2	10	94708	94717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006832	TAATT	2	10	94977	94986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006832	AGATT	2	10	95086	95095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006832	GGAAA	2	10	95583	95592	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006832	TTATT	2	10	98397	98406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006832	CTACC	2	10	99855	99864	20 %	20 %	0 %	60 %	58578728
110	NC_006832	TACTA	2	10	100022	100031	40 %	40 %	0 %	20 %	58578728
111	NC_006832	AGACT	2	10	100659	100668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_006832	AGTCA	2	10	101083	101092	40 %	20 %	20 %	20 %	58578730
113	NC_006832	ATGGC	2	10	101844	101853	20 %	20 %	40 %	20 %	58578730
114	NC_006832	AGATG	2	10	102014	102023	40 %	20 %	40 %	0 %	58578730
115	NC_006832	AAACT	2	10	102511	102520	60 %	20 %	0 %	20 %	58578730
116	NC_006832	GTTAT	2	10	103710	103719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006832	AGCTG	2	10	104072	104081	20 %	20 %	40 %	20 %	58578731
118	NC_006832	AATAA	2	10	104289	104298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006832	AGTTA	2	10	104440	104449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006832	TAATC	2	10	106568	106577	40 %	40 %	0 %	20 %	58578732
121	NC_006832	GATAT	2	10	108822	108831	40 %	40 %	20 %	0 %	58578733
122	NC_006832	CTTAT	2	10	109171	109180	20 %	60 %	0 %	20 %	58578733
123	NC_006832	TGCTA	2	10	110684	110693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_006832	ATTAT	2	10	111760	111769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006832	TATAT	2	10	111801	111810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006832	TAGTT	2	10	112542	112551	20 %	60 %	20 %	0 %	58578734
127	NC_006832	CATAT	2	10	115073	115082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_006832	TGTTA	2	10	115111	115120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006832	CATAT	2	10	115211	115220	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_006832	CATAT	2	10	115348	115357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006832	TGTTA	2	10	115386	115395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006832	ATAAA	2	10	115939	115948	80 %	20 %	0 %	0 %	58578735
133	NC_006832	AACAT	2	10	116776	116785	60 %	20 %	0 %	20 %	58578735
134	NC_006832	GGTAT	2	10	117125	117134	20 %	40 %	40 %	0 %	58578735
135	NC_006832	TATAT	2	10	119656	119665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006832	TAGTA	2	10	121561	121570	40 %	40 %	20 %	0 %	58578739
137	NC_006832	TTATA	2	10	125173	125182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006832	CTAAT	2	10	126807	126816	40 %	40 %	0 %	20 %	58578744
139	NC_006832	TACAA	2	10	128822	128831	60 %	20 %	0 %	20 %	58578746
140	NC_006832	TGTAT	2	10	129785	129794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006832	CTTAT	2	10	131109	131118	20 %	60 %	0 %	20 %	58578747
142	NC_006832	AAATA	2	10	131670	131679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006832	TGGAA	2	10	134079	134088	40 %	20 %	40 %	0 %	58578748
144	NC_006832	TTATG	2	10	136241	136250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_006832	TTATT	2	10	240386	240395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_006832	AATTA	2	10	240836	240845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_006832	GATAA	2	10	243607	243616	60 %	20 %	20 %	0 %	58578812
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270	NC_006832	ATTAA	2	10	246115	246124	60 %	40 %	0 %	0 %	58578815
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273	NC_006832	TTACT	2	10	247766	247775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_006832	TATAT	2	10	247782	247791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_006832	ATATA	2	10	250251	250260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_006832	CTTAT	2	10	251505	251514	20 %	60 %	0 %	20 %	58578818
279	NC_006832	TGTAT	2	10	252497	252506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_006832	TGTAT	2	10	252794	252803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_006832	AATTA	2	10	253330	253339	60 %	40 %	0 %	0 %	58578819
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284	NC_006832	GTATT	2	10	255530	255539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_006832	ATTGA	2	10	364248	364257	40 %	40 %	20 %	0 %	58578890
404	NC_006832	ATTAT	2	10	364654	364663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_006832	TTATG	2	10	365164	365173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
406	NC_006832	ATTAT	2	10	365378	365387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_006832	AAGAT	2	10	371811	371820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
412	NC_006832	AAGAT	2	10	372141	372150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
413	NC_006832	TTATG	2	10	372164	372173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
414	NC_006832	TATAA	2	10	372712	372721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_006832	GCATA	2	10	373062	373071	40 %	20 %	20 %	20 %	58578894
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417	NC_006832	TACTA	2	10	374264	374273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
418	NC_006832	TTTTG	2	10	374482	374491	0 %	80 %	20 %	0 %	58578895
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420	NC_006832	AGGTA	2	10	375486	375495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_006832	TAATT	2	10	376901	376910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_006832	TAGTA	2	10	376999	377008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
424	NC_006832	CATTG	2	10	377430	377439	20 %	40 %	20 %	20 %	58578897
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434	NC_006832	ATTAT	2	10	384715	384724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_006832	ATAAA	2	10	385387	385396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_006832	AAATA	2	10	392235	392244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_006832	ATTTT	2	10	403169	403178	20 %	80 %	0 %	0 %	58578914
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461	NC_006832	TGTGT	2	10	407691	407700	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
462	NC_006832	TTTAA	2	10	407951	407960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_006832	TATAA	2	10	412811	412820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_006832	ACCAT	2	10	415720	415729	40 %	20 %	0 %	40 %	58578919
470	NC_006832	ATATA	2	10	419243	419252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_006832	TAATA	2	10	420193	420202	60 %	40 %	0 %	0 %	58578922
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473	NC_006832	AATGT	2	10	420851	420860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
474	NC_006832	TATTG	2	10	420907	420916	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_006832	TACTA	2	10	430558	430567	40 %	40 %	0 %	20 %	58578929
483	NC_006832	TGTTA	2	10	430723	430732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
484	NC_006832	TAGTA	2	10	430960	430969	40 %	40 %	20 %	0 %	58578930
485	NC_006832	ATAGA	2	10	431325	431334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_006832	TCATG	2	10	437596	437605	20 %	40 %	20 %	20 %	58578932
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499	NC_006832	TATAG	2	10	438463	438472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_006832	AGTAT	2	10	438876	438885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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