MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 25723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
2	NC_006832	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
3	NC_006832	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
4	NC_006832	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
5	NC_006832	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
6	NC_006832	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
7	NC_006832	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
8	NC_006832	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
9	NC_006832	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
10	NC_006832	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578665
11	NC_006832	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
12	NC_006832	TAT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006832	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
14	NC_006832	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578666
15	NC_006832	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
16	NC_006832	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578666
17	NC_006832	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
18	NC_006832	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578666
19	NC_006832	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
20	NC_006832	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578666
21	NC_006832	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578666
22	NC_006832	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578666
23	NC_006832	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
24	NC_006832	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578666
25	NC_006832	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
26	NC_006832	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
27	NC_006832	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
28	NC_006832	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578667
29	NC_006832	TTC	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578667
30	NC_006832	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
31	NC_006832	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
32	NC_006832	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
33	NC_006832	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578667
34	NC_006832	ATT	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006832	TAT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006832	TAA	2	6	2186	2191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006832	CAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578668
38	NC_006832	TCT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578668
39	NC_006832	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
40	NC_006832	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578668
41	NC_006832	GTA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
42	NC_006832	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
43	NC_006832	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578668
44	NC_006832	AGT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
45	NC_006832	CTA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578669
46	NC_006832	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
47	NC_006832	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
48	NC_006832	CTT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
49	NC_006832	TAT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
50	NC_006832	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
51	NC_006832	TAT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
52	NC_006832	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
53	NC_006832	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578669
54	NC_006832	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
55	NC_006832	TGT	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578669
56	NC_006832	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
57	NC_006832	GCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578669
58	NC_006832	CCT	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_006832	TAT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006832	GTT	2	6	4194	4199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006832	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006832	TCT	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006832	TAA	2	6	4429	4434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006832	TTA	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006832	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
66	NC_006832	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
67	NC_006832	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
68	NC_006832	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
69	NC_006832	TCC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578670
70	NC_006832	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
71	NC_006832	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
72	NC_006832	TAG	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
73	NC_006832	GAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
74	NC_006832	ATA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
75	NC_006832	AGA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578670
76	NC_006832	GGT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
77	NC_006832	GTG	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
78	NC_006832	GAT	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
79	NC_006832	ATG	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
80	NC_006832	TTC	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
81	NC_006832	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
82	NC_006832	TAG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
83	NC_006832	TAG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
84	NC_006832	TAT	3	9	5855	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
85	NC_006832	ACA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578671
86	NC_006832	TTA	2	6	5934	5939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
87	NC_006832	TGT	3	9	6065	6073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006832	TGT	2	6	6163	6168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006832	AAT	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006832	TGT	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006832	ATT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006832	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006832	TAT	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006832	GTG	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
95	NC_006832	AGC	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598458
96	NC_006832	ATT	2	6	6543	6548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
97	NC_006832	AAT	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
98	NC_006832	GTA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
99	NC_006832	TAT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
100	NC_006832	TGG	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
101	NC_006832	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161598458
102	NC_006832	TAA	2	6	6771	6776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
103	NC_006832	GTC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
104	NC_006832	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
105	NC_006832	GCT	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
106	NC_006832	TTA	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
107	NC_006832	TAT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
108	NC_006832	AAT	2	6	7134	7139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
109	NC_006832	TAA	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
110	NC_006832	TTA	2	6	7186	7191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
111	NC_006832	ATC	2	6	7198	7203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161598458
112	NC_006832	TAT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
113	NC_006832	GAT	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
114	NC_006832	ATA	2	6	7354	7359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
115	NC_006832	TGC	3	9	7368	7376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
116	NC_006832	CAG	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598458
117	NC_006832	AAG	2	6	7537	7542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161598458
118	NC_006832	GTT	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006832	AGT	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006832	GTT	2	6	7652	7657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006832	ATG	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006832	TAT	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
123	NC_006832	TGC	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578673
124	NC_006832	ATA	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
125	NC_006832	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
126	NC_006832	TTA	2	6	8141	8146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
127	NC_006832	TGG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578673
128	NC_006832	AAT	2	6	8272	8277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
129	NC_006832	GGA	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578673
130	NC_006832	GTT	2	6	8299	8304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578673
131	NC_006832	TAA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
132	NC_006832	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
133	NC_006832	TAA	2	6	8585	8590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006832	TGA	2	6	8593	8598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578674
135	NC_006832	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578674
136	NC_006832	ATT	2	6	8674	8679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
137	NC_006832	ACA	2	6	8754	8759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578674
138	NC_006832	ATT	2	6	8811	8816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
139	NC_006832	TTC	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578674
140	NC_006832	GAA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578674
141	NC_006832	TTA	2	6	9216	9221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
142	NC_006832	CTG	2	6	9268	9273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578674
143	NC_006832	GAA	2	6	9306	9311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578674
144	NC_006832	CTT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578674
145	NC_006832	TAA	2	6	9395	9400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578674
146	NC_006832	ATT	2	6	9543	9548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006832	GTT	2	6	9601	9606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006832	TCA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578675
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151	NC_006832	TAA	3	9	10088	10096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006832	ATT	2	6	10161	10166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006832	ATG	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
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157	NC_006832	GAA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
158	NC_006832	ATC	2	6	10507	10512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578676
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161	NC_006832	GAA	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
162	NC_006832	AGT	2	6	10677	10682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578676
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167	NC_006832	GAA	2	6	10794	10799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
168	NC_006832	GAA	2	6	10818	10823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
169	NC_006832	ACA	2	6	10838	10843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578676
170	NC_006832	GTG	2	6	10876	10881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578676
171	NC_006832	GAA	2	6	10893	10898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
172	NC_006832	GAA	2	6	10917	10922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
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174	NC_006832	GTG	2	6	10975	10980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578676
175	NC_006832	GAA	2	6	10992	10997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578676
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193	NC_006832	TAT	2	6	11568	11573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_006832	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_006832	AAT	2	6	11761	11766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_006832	TAA	2	6	11856	11861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_006832	ATT	2	6	11898	11903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_006832	ATA	2	6	11925	11930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_006832	TAT	2	6	14244	14249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578677
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253	NC_006832	TAA	2	6	14525	14530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_006832	GAT	2	6	14618	14623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578678
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259	NC_006832	GAT	2	6	14946	14951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578678
260	NC_006832	GTT	2	6	15035	15040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578678
261	NC_006832	ACC	2	6	15055	15060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578678
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263	NC_006832	TAA	2	6	15127	15132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578678
264	NC_006832	GGA	2	6	15278	15283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578678
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