MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 44082

< Previous12...77787980818283848586878889Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_006831	ATA	2	6	1497110	1497115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44002	NC_006831	TAA	2	6	1497126	1497131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44003	NC_006831	T	6	6	1497148	1497153	0 %	100 %	0 %	0 %	58617676
44004	NC_006831	GTAAT	2	10	1497197	1497206	40 %	40 %	20 %	0 %	58617676
44005	NC_006831	AAG	2	6	1497215	1497220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617676
44006	NC_006831	TCAA	2	8	1497239	1497246	50 %	25 %	0 %	25 %	58617676
44007	NC_006831	TAA	2	6	1497267	1497272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44008	NC_006831	GT	3	6	1497277	1497282	0 %	50 %	50 %	0 %	58617676
44009	NC_006831	TTA	2	6	1497455	1497460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44010	NC_006831	TAG	2	6	1497524	1497529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58617676
44011	NC_006831	TAA	2	6	1497542	1497547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44012	NC_006831	A	6	6	1497546	1497551	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44013	NC_006831	TTG	2	6	1497647	1497652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58617676
44014	NC_006831	TCA	2	6	1497688	1497693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58617676
44015	NC_006831	TAA	2	6	1497695	1497700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44016	NC_006831	AGC	2	6	1497711	1497716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58617676
44017	NC_006831	TTA	2	6	1497789	1497794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44018	NC_006831	TTA	2	6	1497843	1497848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44019	NC_006831	GAA	2	6	1497989	1497994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617676
44020	NC_006831	AAT	2	6	1498005	1498010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44021	NC_006831	ATA	2	6	1498028	1498033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44022	NC_006831	TAG	2	6	1498091	1498096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58617676
44023	NC_006831	AAGA	2	8	1498110	1498117	75 %	0 %	25 %	0 %	58617676
44024	NC_006831	A	8	8	1498144	1498151	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44025	NC_006831	AAT	2	6	1498197	1498202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44026	NC_006831	AGA	2	6	1498224	1498229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617676
44027	NC_006831	TTA	2	6	1498232	1498237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44028	NC_006831	TAA	2	6	1498266	1498271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44029	NC_006831	A	7	7	1498284	1498290	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44030	NC_006831	AAT	2	6	1498338	1498343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44031	NC_006831	ATA	2	6	1498364	1498369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44032	NC_006831	TAA	2	6	1498370	1498375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44033	NC_006831	TTA	2	6	1498388	1498393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44034	NC_006831	ATA	2	6	1498399	1498404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44035	NC_006831	CAA	2	6	1498427	1498432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58617676
44036	NC_006831	GAA	2	6	1498435	1498440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617676
44037	NC_006831	TA	3	6	1498448	1498453	50 %	50 %	0 %	0 %	58617676
44038	NC_006831	TA	3	6	1498461	1498466	50 %	50 %	0 %	0 %	58617676
44039	NC_006831	A	6	6	1498482	1498487	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44040	NC_006831	A	6	6	1498494	1498499	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44041	NC_006831	A	6	6	1498501	1498506	100 %	0 %	0 %	0 %	58617676
44042	NC_006831	GTT	2	6	1498541	1498546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58617676
44043	NC_006831	ATA	2	6	1498565	1498570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44044	NC_006831	AACA	2	8	1498587	1498594	75 %	0 %	0 %	25 %	58617676
44045	NC_006831	TA	3	6	1498601	1498606	50 %	50 %	0 %	0 %	58617676
44046	NC_006831	TTA	2	6	1498622	1498627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617676
44047	NC_006831	TAA	2	6	1498665	1498670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58617676
44048	NC_006831	TAAG	2	8	1498686	1498693	50 %	25 %	25 %	0 %	58617676
44049	NC_006831	AT	3	6	1498714	1498719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44050	NC_006831	GAA	2	6	1498811	1498816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617677
44051	NC_006831	A	7	7	1498819	1498825	100 %	0 %	0 %	0 %	58617677
44052	NC_006831	ATC	2	6	1498851	1498856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58617677
44053	NC_006831	AGA	2	6	1498885	1498890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617677
44054	NC_006831	ATG	2	6	1498917	1498922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58617677
44055	NC_006831	GATA	2	8	1498927	1498934	50 %	25 %	25 %	0 %	58617677
44056	NC_006831	AGC	2	6	1498945	1498950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58617677
44057	NC_006831	GATA	2	8	1498955	1498962	50 %	25 %	25 %	0 %	58617677
44058	NC_006831	TGGAAG	2	12	1498984	1498995	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58617677
44059	NC_006831	AGG	2	6	1498996	1499001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58617677
44060	NC_006831	AT	3	6	1499040	1499045	50 %	50 %	0 %	0 %	58617677
44061	NC_006831	GGA	3	9	1499060	1499068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58617677
44062	NC_006831	GAA	2	6	1499079	1499084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617677
44063	NC_006831	TGG	2	6	1499104	1499109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58617677
44064	NC_006831	GGA	2	6	1499152	1499157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58617677
44065	NC_006831	ACA	2	6	1499293	1499298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58617677
44066	NC_006831	AGAA	2	8	1499314	1499321	75 %	0 %	25 %	0 %	58617677
44067	NC_006831	ATGT	2	8	1499328	1499335	25 %	50 %	25 %	0 %	58617677
44068	NC_006831	GA	3	6	1499346	1499351	50 %	0 %	50 %	0 %	58617677
44069	NC_006831	TTA	2	6	1499411	1499416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617677
44070	NC_006831	AG	3	6	1499437	1499442	50 %	0 %	50 %	0 %	58617677
44071	NC_006831	GTG	2	6	1499499	1499504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58617677
44072	NC_006831	A	7	7	1499527	1499533	100 %	0 %	0 %	0 %	58617677
44073	NC_006831	GAT	2	6	1499587	1499592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58617677
44074	NC_006831	AGG	2	6	1499605	1499610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58617677
44075	NC_006831	TTA	2	6	1499715	1499720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58617677
44076	NC_006831	AAG	2	6	1499728	1499733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617677
44077	NC_006831	AACAA	2	10	1499779	1499788	80 %	0 %	0 %	20 %	58617677
44078	NC_006831	CTT	2	6	1499798	1499803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58617677
44079	NC_006831	AAG	2	6	1499804	1499809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58617677
44080	NC_006831	TGA	2	6	1499812	1499817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58617677
44081	NC_006831	T	6	6	1499858	1499863	0 %	100 %	0 %	0 %	58617677
44082	NC_006831	TAA	2	6	1499915	1499920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...77787980818283848586878889Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.